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        miR-378初始體rs1076064多態(tài)性與中國漢族人群乳腺癌的關(guān)聯(lián)研究

        2020-12-25 03:20:40趙敏君錢瑞儀陳科潤楊瑞卿司馬秀田
        中國實驗診斷學(xué) 2020年12期
        關(guān)鍵詞:乳腺癌研究

        趙敏君,錢瑞儀,黃 鑫,楊 陽,陳科潤,易 維,楊瑞卿,司馬秀田

        (1.四川大學(xué)華西醫(yī)院 a.全科醫(yī)學(xué)科;b.神經(jīng)外科,四川 成都610041;2.四川大學(xué)華西臨床醫(yī)學(xué)院,四川 成都610041;3.樂山市人民醫(yī)院 檢驗科,四川 樂山614000)

        乳腺癌發(fā)病高居我國女性惡性腫瘤的首位,2015年新發(fā)病例約27.2萬,死亡病例約7萬[1]。隨著篩查技術(shù)的廣泛應(yīng)用,乳腺癌5年生存率有所提高,但是約3-10%的乳腺癌患者在確診時即有遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移[2]。乳腺癌的發(fā)病與多種因素有關(guān),包括環(huán)境因素和遺傳因素等。研究組前期發(fā)現(xiàn)CD44相關(guān)位點rs13347多態(tài)性與乳腺癌的轉(zhuǎn)移有一定相關(guān)性[3]。然而,迄今為止,其準(zhǔn)確發(fā)病原因仍未完全闡明。

        MiRNA是生物體內(nèi)廣泛存在的一類具有調(diào)控功能的非編碼RNA分子,由基因組轉(zhuǎn)錄,經(jīng)過miRNA初始體(pri-mRNA)、前體miRNA等步驟的加工最終形成成熟體miRNA。人類基因組中存在上千種miRNA,其中,miR-378在乳腺癌中異常高表達[4-6]。單核苷酸多態(tài)性(SNP)rs1076064位于miR-378初始體區(qū),有文獻報道該位點多態(tài)性與肝細(xì)胞癌和前列腺癌的發(fā)病密切相關(guān)[7,8]。本研究擬探討miR-378初始體rs1076064多態(tài)性與中國漢族女性乳腺癌發(fā)病的關(guān)系。

        1 材料與方法

        1.1 臨床樣本采集

        病例組:共133例,來自2013-2015年樂山市人民醫(yī)院住院的乳腺癌患者。納入標(biāo)準(zhǔn):①女性患者;②病理組織學(xué)確診為乳腺癌;③無合并其他部位原發(fā)性腫瘤。排除標(biāo)準(zhǔn):①乳腺良性腫瘤;②有骨髓移植史患者。平均年齡 50.72±9.61歲。

        對照組:共216例,來自同時期在樂山市人民醫(yī)院體檢的健康女性。排除具有乳腺癌家族史的個體。平均年齡41.21±10.13歲。

        入選病例組和對照組樣本均為無關(guān)漢族個體。

        1.2 儀器與試劑

        聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)擴增儀為杭州朗基科學(xué)儀器有限公司產(chǎn)品;Ion torrent PGM測序儀為美國Thermo Fisher Scientific公司產(chǎn)品;臺式離心機為德國eppendorf公司儀器;全基因組DNA提取試劑盒購自天根生化科技有限公司;Taq I限制性內(nèi)切酶購自美國NEB公司;擴增引物由上海生工生物有限公司合成。

        1.3 方法

        1.3.1DNA提取 運用試劑盒提取外周靜脈血中全基因組DNA,按照試劑盒操作說明進行。運用紫外分光光度計檢測提取DNA的濃度和純度。

        1.3.2基因分型 rs1076064位點PCR擴增引物如下:5’-CGGCAAAGATCACCAGAAGA-3’(上游),5’-CAGGTGTTTGCAGGAGCAGT-3’(下游)。經(jīng)過3輪PCR,電泳割膠純化后,置于Ion torrent PGM測序儀上測序,操作步驟按照說明書進行。

        1.4 統(tǒng)計學(xué)處理

        直接計數(shù)法計算rs1076064不同基因型在病例組和對照組中的分布,運用χ2檢驗分析基因型分布是否符合Handy-Weinberg遺傳平衡,并比較兩組的相關(guān)性,以比值比(OR)和95%置信區(qū)間(CI)表示相對風(fēng)險。所有數(shù)據(jù)均采用SPSS 25.0處理,P<0.05被認(rèn)為差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        rs1076064多態(tài)性在乳腺癌和對照組中的分布頻率見表1,在共顯性、顯性、隱性和過顯性遺傳模型中,兩組差異均無統(tǒng)計學(xué)意義(P均>0.05)。根據(jù)腫瘤大小和有無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移進行分層分析,亦未發(fā)現(xiàn)rs1076064多態(tài)性與上述臨床特征之間的相關(guān)性(表2和表3)。

        表1 乳腺癌組和對照組rs1076064多態(tài)性比較

        表2 rs1076064與乳腺癌腫瘤大小的關(guān)聯(lián)

        表3 rs1076064與乳腺癌淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的關(guān)聯(lián)

        3 討論

        miRNA在腫瘤演變過程中的調(diào)控作用得到了廣泛的認(rèn)識。已經(jīng)證實,乳腺癌中多種miRNA分子差異性表達,包括miR-378[4-6]。Yin等[4]報道乳腺癌中miR-378顯著高表達,用于乳腺癌診斷的曲線下面積為0.807。體外轉(zhuǎn)染miR-378可使腫瘤細(xì)胞獲得干性特征,包括促進細(xì)胞集落形成和自我更新等[5]。異位表達miR-378可通過結(jié)合于Runx1基因3’非翻譯區(qū)抑制乳腺癌細(xì)胞侵襲和遷移[9]。長鏈非編碼RNA GAS5通過靶向miR-378a-5p/Hedgehog信號通路成員SuFu促進三陰乳腺癌細(xì)胞凋亡[10]。此外,miR-378(*)通過抑制轉(zhuǎn)錄因子PGC-1β的兩個伴侶ERRγ和GABPA的表達調(diào)節(jié)并誘導(dǎo)乳腺癌細(xì)胞的代謝轉(zhuǎn)移,從而導(dǎo)致三羧酸循環(huán)基因表達和氧氣消耗的減少,以及乳酸生成和細(xì)胞增殖的增加[11]。以上研究提示,miR-378有望成為乳腺癌治療的潛在靶點。

        既往研究顯示,位于miRNA初始體的SNP可能作為乳腺癌的生物學(xué)標(biāo)記物[12,13]。例如,攜帶miR-125a初始體的多態(tài)位點rs12976445CT和CC基因型患者中miR-125a表達較低,而原癌基因人類表皮生長因子受體2表達較高[12]。位于miR-182初始體的多態(tài)位點rs4541843-T等位基因增加了乳腺癌的發(fā)病風(fēng)險[13]。最近,有報道位于miR-378初始體的多態(tài)位點rs1076064G等位基因具有較高的啟動子活性,預(yù)示著更好的肝癌預(yù)后[7]和前列腺癌疾病進展[8]?;谝陨涎芯拷Y(jié)果,推測rs1076064可能參與了乳腺癌的發(fā)生發(fā)展。本研究運用病例-對照研究分析了rs1076064與中國漢族女性乳腺癌的相關(guān)關(guān)系,并評估了該多態(tài)位點與乳腺癌臨床特征的關(guān)聯(lián)。

        然而,本研究并未發(fā)現(xiàn)miR-378初始體rs1076064多態(tài)性與中國漢族女性乳腺癌發(fā)病、腫瘤大小和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移存在明確的相關(guān)關(guān)系。造成該陰性結(jié)果的可能原因如下:第一,本研究納入的樣本例數(shù)較少,僅有133例乳腺癌患者,無法排除假陰性結(jié)果;第二,研究設(shè)計為病例-對照研究,無法排除入選偏倚。第三,乳腺癌的發(fā)病是多因素交互作用的結(jié)果,由于本研究是回顧性分析,未考慮環(huán)境等因素的影響。因此,未來有必要進行大樣本前瞻性研究驗證本研究結(jié)果。有文獻顯示,雖然單一的rs4245739基因分型與雌激素受體陰性乳腺癌發(fā)病無關(guān),但是rs4245739A等位基因聯(lián)合miR-184、miR-191、miR-193a、miR-378表達譜能夠區(qū)分乳腺癌的腫瘤大小和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移數(shù)目[14],提示rs1076064多態(tài)性聯(lián)合多個miRNAs表達可能作為乳腺癌的風(fēng)險標(biāo)記物。

        綜上所述,miR-378初始體rs1076064多態(tài)性與中國漢族女性乳腺癌發(fā)生和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移無關(guān)。未來有待進一步開展不同種族的大樣本驗證性研究及基因-基因、基因-環(huán)境交互作用和SNP-miRNA表達譜聯(lián)合分析,以期明確rs1076064- miRNAs的多因素綜合作用對乳腺癌發(fā)病的影響,為乳腺癌的早期診斷及個體化精準(zhǔn)治療提供理論依據(jù)。

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