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        長鏈非編碼RNA在肺纖維化中的作用研究進展

        2020-12-23 11:06:16孫鑫鑫
        實用臨床醫(yī)學 2020年3期
        關(guān)鍵詞:端粒肺纖維化纖維細胞

        孫鑫鑫,舒 靜,許 萍

        (南昌大學第四附屬醫(yī)院呼吸內(nèi)科,南昌 330003)

        肺纖維化是肺損傷、間質(zhì)性肺疾病等多種肺部疾病終末期的病理過程。肺組織的纖維化導致正常肺組織結(jié)構(gòu)改變、功能喪失,患者由缺氧最終進展為呼吸衰竭、死亡。近年來對肺纖維化的發(fā)病機制及過程的深入研究不斷為疾病的治療提供至關(guān)重要的新思路。文章總結(jié)了長鏈非編碼RNA(lncRNA)在促進和抑制肺纖維化過程中的調(diào)節(jié)機制研究進展。

        1 lncRNA及肺纖維化的概述

        1.1 lncRNA

        隨著對人類基因組的復雜性逐漸深入的了解,研究者們認識到RNA調(diào)控潛力。lncRNA被廣泛定義為長度超過200個核苷酸的非編碼RNA分子,參與多種疾病的發(fā)生與發(fā)展。lncRNAs通過廣泛的功能調(diào)節(jié)基因表達,包括:直接轉(zhuǎn)錄的影響;染色質(zhì)修飾復合物的調(diào)節(jié);通過信使RNA(mRNA)加工和穩(wěn)定性調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié);作為海綿作用于微小RNA(miRNA)以防止它們發(fā)揮作用[1]。lncRNA與多種器官纖維化有關(guān),如:lncRNA APTR促進肝星狀細胞的活化和肝纖維化的進展[2];lncRNA CYP4B1-PS1-001與腎臟纖維化緊密相關(guān)[3];lncRNA MIAT及H19促進心肌纖維化[4-5];lncRNA H19還能促進膽汁淤積性肝纖維化的發(fā)生[6]。順著這樣的思路,近年來探尋lncRNA在肺纖維化的發(fā)生或進展過程中的作用成為研究熱點。

        1.2 肺纖維化

        肺纖維化是以成纖維細胞增殖及大量細胞外基質(zhì)(ECM)聚集并伴炎癥損傷、組織結(jié)構(gòu)破壞為特征的一大類肺疾病的終末期改變。絕大部分肺纖維化患者病因不明。近年來,有研究[7-8]表明口服吡非尼酮和尼達尼布克可緩解肺纖維化進展,為患者帶來新希望,但仍不足以降低肺纖維化的高致死率,需要新的治療方式和思路。隨著非編碼人類轉(zhuǎn)錄組越來越多的作用被發(fā)掘,研究者們開始從中探索新的治療策略,尋求新的機遇。

        2 lncRNA在肺纖維化中的雙重調(diào)控作用

        2.1 lncRNA抑制纖維化的調(diào)控

        lncRNA可能參與抑制纖維化的調(diào)控。LIU等[9]發(fā)現(xiàn)lncRNA前列腺癌相關(guān)轉(zhuǎn)錄物29(lncRNA PCAT29)可抑制肺成纖維細胞中miRNA-221介導的轉(zhuǎn)化生長因子β1(TGF-β1)下游的RASAL1/ERK1/2信號通路,從而抑制某些與肺纖維化息息相關(guān)的炎性細胞因子(如N4bp2和Plxna4)的表達,最終抑制肺纖維化的進程。巨噬細胞活化在許多病理生理過程中起關(guān)鍵作用。CUI等[10]發(fā)現(xiàn)在博來霉素誘導的肺纖維化的小鼠中,肺泡巨噬細胞是聚合體,由定植的肺泡巨噬細胞和從肺間質(zhì)浸潤的肺泡巨噬細胞(通常也稱為動員的肺泡巨噬細胞)組成,其中博來霉素處理的小鼠的定植肺泡巨噬細胞和動員巨噬細胞中,肺腺癌轉(zhuǎn)移相關(guān)轉(zhuǎn)錄本1(MALAT1)水平降低。CUI等[10]通過對肺膠原的Masson三色染色,肺組織學檢查以及α平滑肌肌動蛋白(α-SMA)和纖維連接蛋白的免疫組織化學分析均證實巨噬細胞-Malat1-消融小鼠中博來霉素誘導的肺纖維化的嚴重程度增加;博來霉素處理的對照小鼠的肺泡巨噬細胞中精氨酸酶1(Arg-1)、巨噬細胞清道夫受體1(MSR1)、過氧化物酶體增殖物激活受體γ(PPARγ)和Krüppel樣因子4(KLF4)的表達升高,更重要的是,這些分子在Malat1消融的肺泡巨噬細胞中進一步增多。這些研究表明,巨噬細胞Malat1對肺纖維化的發(fā)展過程具有重要的阻斷作用。

        2.2 lncRNA促進纖維化的調(diào)控

        lncRNA更多地參與了促進肺纖維化的調(diào)控。肺纖維化的特征之一在于ECM的異常沉積,其主要由膠原組成。肺纖維化的發(fā)展與成纖維細胞增殖,及向病理性肌成纖維細胞分化和增加的膠原蛋白含量有關(guān)。lncRNA參與促進肺纖維化的過程與miRNAs調(diào)控、TGF-β1相關(guān)傳導通路、內(nèi)皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EndMT)、端粒相關(guān)的凋亡系統(tǒng)等多種因素有關(guān)。

        2.2.1 lncRNA與miRNAs調(diào)控

        miRNA被廣泛地認為是特發(fā)性肺纖維化(IPF)發(fā)病機制的關(guān)鍵因素。有研究[11]發(fā)現(xiàn)miR-26a可以減輕TGF-β1誘導的MRC-5細胞中結(jié)締組織生長因子(CTGF)上調(diào),從而抑制纖維化。ZHAO等[12]發(fā)現(xiàn)lncRNA NONMMUT065582,即肺纖維化相關(guān)RNA(PFAR),通過作為miR-138的分子海綿調(diào)節(jié)YAP1-Twist軸,從而促進肺纖維化;而沉默PFAR可減少TGF-β1誘導的膠原蛋白1和膠原蛋白3的上調(diào),并減少肺成纖維細胞中的遷移、增殖和肌成纖維細胞的形成,從而減輕肺纖維化。最新研究[13]發(fā)現(xiàn),誘導PFAR的表達可促進成纖維細胞-肌成纖維細胞轉(zhuǎn)變,再誘導miR-15a過表達后,這一過程顯著減輕;相反,沉默PFAR可抑制TGF-β1誘導的成纖維細胞-肌成纖維細胞分化,這種作用可以被miR-15a抑制劑逆轉(zhuǎn),表明PFAR可通過miR-15a調(diào)節(jié)TGF-β1誘導的成纖維細胞分化。

        2.2.2 lncRNA與TGF-β1相關(guān)傳導通路

        在對TGF-β1相關(guān)通路的研究中,SONG等[14]發(fā)現(xiàn)一種在IPF中上調(diào)的新型轉(zhuǎn)錄本并將其命名為lncRNA-ITPF,證實其為一種真正的lncRNA,通過實時細胞遷移分析系統(tǒng)檢測活化成纖維細胞的遷移,發(fā)現(xiàn)與對照組相比,lncRNA-ITPF降低了遷移,而lncITPF過表達促進遷移。通過各種實驗室技術(shù)驗證:lncRNA-ITPF通過影響啟動子去H3和H4組蛋白乙酰化,調(diào)控其宿主基因整合素β樣1(ITGBL1),從而發(fā)揮其促纖維化的功能;經(jīng)過熒光素酶活性途徑抑制劑和ChIP-qPCR顯示smad2/3與lncITPF啟動子結(jié)合,以及TGF-β1-smad2/3是纖維化途徑的上游誘導物。TGF-β1相關(guān)通路與miRNA的調(diào)節(jié)息息相關(guān),SAVARY等[15]通過研究TGF-β刺激的肺成纖維細胞轉(zhuǎn)錄組的整個非編碼部分,在肺纖維化的小鼠模型和IPF患者組織樣本中,驗證了lncRNA發(fā)動蛋白3相反鏈(DNM3OS)及其相關(guān)miRNA的差異表達,其認為DNM3OS通過產(chǎn)生3種促纖維化成熟miRNA(即miR-199a-5p/3p和miR-214-3p),反式調(diào)節(jié)TGF-β誘導的肺成纖維細胞向肌成纖維細胞轉(zhuǎn)化,DNM3OS作為下游效應物影響samd和TGF-β信號傳導的非samd組分。

        2.2.3 lncRNA與EndMT

        EndMT是內(nèi)皮細胞失去其特性并轉(zhuǎn)化為成纖維細胞樣細胞的過程,而TGF-β信號是EndMT的主要誘導物[16]。MALAT1和GATA6反義RNA(GATA6-AS)是典型的特異性的與EndMT相關(guān)的lncRNA。ZBE1(也稱為TCF8或δEF1)是轉(zhuǎn)錄抑制因子復雜網(wǎng)絡(luò)中的重要調(diào)節(jié)因子。QIAN等[17]的實驗表明lncRNA ZEB1反義RNA 1(ZEB1-AS1)通過充當miR-141-3p的內(nèi)源競爭RNA(ceRNA),增加ZBE1的表達,從而促進成纖維細胞活化和肺纖維化,其認為ZEB1-AS1/miR-141-3p/ZEB1軸參與了TGF-β1介導的肺泡Ⅱ型上皮細胞EndMT。有研究[18]表明在二氧化硅暴露情況下,lncRNA的調(diào)節(jié)和表達會受到影響,參與硅相關(guān)性肺纖維化(如矽肺)。LIU等[19]發(fā)現(xiàn)lncRNA-ATB,即由TGF-β激活的lncRNA,可通過充當miR-200c海綿促進EndMT;lncRNA-ATB在肺上皮細胞的EndMT期間大量表達;二氧化硅刺激的巨噬細胞共同分泌TGF-β1,誘導上皮細胞中的lncRNA-ATB與miR-200c結(jié)合并釋放ZEB1,從而促進上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化(EMT)。

        2.2.4 lncRNA與端粒損傷

        端粒是與特定蛋白質(zhì)復合物相關(guān)的遠端染色體區(qū)域,其作用是保護染色體不被降解和發(fā)生畸變。端粒的維持能力是健康細胞群的重要指標,在細胞的惡性轉(zhuǎn)化、凋亡或衰老等過程中均出現(xiàn)了端粒損傷。有研究[20]發(fā)現(xiàn)短端粒是IPF的危險因素。Shelterin是一種多蛋白復合物,由6種蛋白組成,包括端粒重復結(jié)合因子(TRF)1和2、TRF1相互作用蛋白2(Tin2)、三肽基肽酶1(TPP1)、阻遏蛋白激活蛋白1(Rap1)和端粒保護蛋白1(POT1)。Shelterin蛋白與端粒DNA序列結(jié)合,對端粒長度維持和端粒完整性至關(guān)重要[21];其表達的變化與端粒功能障礙有關(guān)。lncRNAs是RNA轉(zhuǎn)錄本,不作為蛋白質(zhì)模板,而是與其他非編碼RNA亞型一起參與表觀遺傳調(diào)控[22]。含端粒重復RNA(TERRA)是一種含有端粒重復的lncRNA,對端粒穩(wěn)定性非常重要,TERRA與非轉(zhuǎn)化細胞中的Shelterin復合物結(jié)合,調(diào)節(jié)端粒酶復制活性[23]。GAO等[24]發(fā)現(xiàn),與氧化應激易感性和凋亡相關(guān)的TERRA在間質(zhì)性肺病患者和博來霉素誘導的纖維化小鼠肺泡上皮2型細胞中的表達增加,TERRA的失活改善了博萊霉素誘導的纖維化小鼠的細胞反應。

        3 小結(jié)和展望

        lncRNA在介導肺纖維化過程的基因表達和細胞功能的改變中起關(guān)鍵作用,既有對肺纖維化進展的抑制作用,也有促進作用,而后者似乎更加突出。雖然有諸多因素的影響,但大多數(shù)都無法提供具體的解決策略。lncRNA對不止一種miRNA有競爭或影響作用,是否意味著上游還有更加具體的調(diào)控基因,或者能在不同lncRNA中找到交集,其在肺纖維化中具體的作用機制尚不清楚。EndMT的表觀遺傳調(diào)控代表了一個非常有希望但尚未充分研究的領(lǐng)域,具有終止靶向EndMT相關(guān)肺纖維化的潛力。如何將EndMT的表觀遺傳調(diào)控與肺纖維化相關(guān)信號通路的作用聯(lián)系起來,在lncRNA調(diào)控下統(tǒng)一發(fā)揮控制纖維化進程、乃至逆轉(zhuǎn)纖維化的作用,尚無臨床研究。但可以樂觀地認為該研究領(lǐng)域的發(fā)展前景充滿希望。lncRNA在肺纖維化中的作用研究,將是未來研究和治療肺纖維化這一目前不可治愈疾病的新希望。

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