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        CircRNA在婦科腫瘤中的研究進展

        2020-12-19 15:18:53郝辰珺李智陳彥竹梁偉國李艷秋黃超友
        分子診斷與治療雜志 2020年3期
        關(guān)鍵詞:水平研究

        郝辰珺 李智 陳彥竹 梁偉國 李艷秋★ 黃超友

        近年來,隨著分子生物學技術(shù)在臨床疾病診斷和生物制品的研發(fā)需求的不斷加深,研究者對腫瘤的作用機理、細胞層面、分子水平的變化進行了深入挖掘。CircRNA 是一種非編碼RNA,其發(fā)現(xiàn)改變了傳統(tǒng)的非編碼RNA(non-coding RNA,ncRNA)在機體蛋白編碼的認知觀點[1]。CircRNA與傳統(tǒng)的mRNA 最大的區(qū)別在于其存在的閉環(huán)可抵抗RNA 酶的降解,這個閉環(huán)是由RNA 分子的3′和5′端的磷酸基團共價偶聯(lián)而成,從而保障了CircRNA分子的穩(wěn)定性和進化保護[2]。隨著CircRNA分子在不同生物體中不斷發(fā)現(xiàn),研究者對其進行了相應(yīng)的信息網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建,截止目前國際上已經(jīng)完成了近20萬種不同CircRNA的信息庫,由此進一步證明CircRNA 是生物界廣泛存在的,但是由于CircRNA分子的發(fā)現(xiàn)較晚導致目前其對各種細胞的作用機理及作用途徑了解較少。通過CircRNA分子的生物學特征及分類研究發(fā)現(xiàn),CircRNA分子廣泛參與蛋白質(zhì)的翻譯和表達,同時其還具有miRNA 海綿分子功能以及RNA 連接蛋白(RNA banding protein,RBP)功能[3]。同時大量研究發(fā)現(xiàn),CircRNA 參與了表觀遺傳學的調(diào)控,對生殖干細胞定向發(fā)育以及胚胎的成熟均起到重要影響[4]。在疾病診斷上目前大量研究證實CircRNA 可以與miRNA 產(chǎn)生復雜的相互作用從而影響腫瘤細胞的發(fā)育、轉(zhuǎn)移及凋亡等[5]。本研究以CircRNA在婦科腫瘤中的變化為研究思路,綜合國內(nèi)外研究報道,深入總結(jié)CircRNA的生物學特征以及其對婦科腫瘤的發(fā)生及在診斷中的價值。

        1 CircRNA的概述

        1.1 CircRNA 簡介

        CircRNA是RNA家族中發(fā)現(xiàn)的最新成員,屬于非編碼RNA,其主要存在于轉(zhuǎn)錄的拼接過程中,由單鏈RNA的3′和5′通過共價鍵連接形成穩(wěn)定的環(huán)狀結(jié)構(gòu),此環(huán)狀共價環(huán)有效保障了CircRNA對RNA 核酸外切酶高度耐受性特性,因此相比線性RNA 更具有穩(wěn)定性。

        1.2 CircRNA的來源

        CircRNA主要來自于蛋白質(zhì)編碼基因,目前已經(jīng)在于人類基因轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物、病毒及細菌中[6]。CircRNA 是tRNA和lncRNA 之間的基因間隔子或反轉(zhuǎn)錄本,其不含有線性RNA的5′和3′ 的poly(A)結(jié)構(gòu)。根據(jù)其RNA 序列的來源不同將其分為外顯子CircRNA(ecRNA)、內(nèi)含子CircRNA(ciRNA)和外顯子-內(nèi)含子CircRNA 3種,其中外顯子CircRNA 占比最高。除外顯子CircRNA 存在于細胞質(zhì)中外,其余兩種均存在于細胞核中,3種CircRNA在細胞中的結(jié)合位點均為2′-5′磷酸二酯鍵[7]。外顯子CircRNA 除具有miRNA 海綿作用外,還起到RNA 連接蛋白RBP 作用,以調(diào)控RNA的選擇性拼接、運輸及翻譯,從而調(diào)控細胞增殖、分化及凋亡等生理過程,內(nèi)含子CircRNA和外顯子-內(nèi)含子CircRNA 主要參與調(diào)整基因轉(zhuǎn)錄過程[8]。

        1.3 CircRNA的特征及生物學功能

        CircRNA 是近年來新發(fā)現(xiàn)的非編碼RNA,研究者對其生物學特征的研究主要通過與線性RNA 對比而獲得,目前對CircRNA的分子學特征總結(jié)主要包括:①CircRNA 主要產(chǎn)生于外顯子,且主要在細胞質(zhì)中表達,少量參與細胞核中表達的主要為內(nèi)含子CircRNA 或其片段;②外顯子CircRNA 可參與內(nèi)生非編碼RNA的表達調(diào)控,其對RNA 轉(zhuǎn)錄前后的變化起到重要調(diào)節(jié)作用;③CircRNA 可以與miRNA 相互作用從而調(diào)節(jié)目標蛋白表達;④CircRNA 具有對RNA 核酸外切酶高度耐受的共價閉環(huán),從而保障了其結(jié)構(gòu)功能的穩(wěn)定性,這種性質(zhì)對物種進化過程中起到重要保護作用,這種保護作用間接決定了組織特異性;⑤CircRNA 通常被發(fā)現(xiàn)存在于細胞外液(唾液、血液及尿液等)中,且其表達水平是線性RNA的十倍以上[9-11]。CircRNA的上述特征保障了其具有穩(wěn)定的生物學特征,因此有研究發(fā)現(xiàn)多數(shù)物種中的CircRNA的半衰期比線性RNA 長近10 h 左右。

        基于CircRNA的分子特征,研究者發(fā)現(xiàn)了CircRNA 許多潛在的生物學功能,主要包括:①CircRNA 起到miRNA 海綿分子功能。Hansen等[12-13]研究發(fā)現(xiàn)CircRNA 含有多個可以與miRNA-138 連接的位點,同時有研究也進一步證實了小腦變異蛋白(CDR1)的反義鏈CircRNA(CDR1as/CiRS-7)存在人和鼠的腦組織中,CiRS-7(circular RNA sponge for miR-7)含有73個miR-7 結(jié)合位點,當其與miR-7 結(jié)合后可以抑制miR-7 的生物學功能,從而激活miR-7 的下游基因。Thomas B H等[14]研究發(fā)現(xiàn)SRY-CircRNA(SRY-9)可以作為miR-138 的分子海綿,而SRY-9 是小鼠Y 染色體上決定性別的基因,因此生物體中CircRNA 作為miRNA的分子海綿可能性較為普遍。同時研究者們[15]還發(fā)現(xiàn)絕大多數(shù)CircRNA 均可作為miRNAs的分子海綿,就如miRNA 作為mRNA 一樣。②CircRNA 起到RBP 功能,RBP 主要通過對RNA轉(zhuǎn)錄后調(diào)控影響細胞代謝過程(細胞增殖、分化、凋亡及衰老等),如RNA 連接蛋白circ-Foxo3 可通過與細胞蛋白依賴性蛋白激酶2(cyclin-dependent kinases,CKD2)相互作用以抑制細胞周期維持在G1/S 階段[16]。由CircRNA 海綿分子通過與精氨酸蛋白(AGOP)、RNA-QKI MBL 蛋白、RNA 聚合酶Ⅱ(polⅡ)及真核啟動子4A-Ⅲ組成的RNA 蛋白復合體(RNA- protein complexes,RPCs)起到了RBP 作用,并可以與線性RNAs 結(jié)合發(fā)揮轉(zhuǎn)錄后調(diào)控功能[17]。但是,目前對CircRNA 連接蛋白調(diào)控RNA 轉(zhuǎn)錄機理尚不清楚,但是可以初步確認cricRNA 調(diào)控基因轉(zhuǎn)錄過程主要發(fā)生于細胞核中,而其起到RNA 海綿分子作用主要發(fā)生在細胞質(zhì)中。③CircRNA 可參與蛋白編碼過程。CircRNA 屬于非編碼RNA的一條鏈,當其被插入到細胞內(nèi)核糖體結(jié)合位點(IRES)時,就會產(chǎn)生與線性RNA 不同的蛋白編碼轉(zhuǎn)錄,之后真核細胞核糖體中40s 亞基與含有IRES 的CircRNA 發(fā)生病翻譯[18]。截止目前僅發(fā)現(xiàn)病毒CircRNA 具備這種可編碼翻譯蛋白的功能,如HBV 的衛(wèi)星病毒HDV,同時這種病毒CircRNA在真核細胞中的翻譯機理尚不清楚[19]。④CircRNA 協(xié)同miRNA 參與機體不同器官細胞的生理功能調(diào)節(jié)。Chen 等[20]研究中發(fā)現(xiàn)進行體外受精治療期間,CircRNA水平(circ103827,circ104816)與女性高質(zhì)量胚胎數(shù)呈現(xiàn)負相關(guān),Dong 等[21]研究發(fā)現(xiàn)CircRNA水平與精子的運動及受精也具有相關(guān)性。除上述生物學功能外,CircRNA水平也與相關(guān)疾病有一定相關(guān)性,Zhang 等[22]發(fā)現(xiàn)CircRNA101222 表達水平在子癲前期(PE)女性與正常女性之間存在顯著差異。同時,Qian等[23]發(fā)現(xiàn)PE女性和早產(chǎn)女性胎盤組織中有3種CircRNA 表達水平存在顯著差異。

        1.4 CircRNA在腫瘤發(fā)生中的作用機理

        隨著CircRNA的深入研究,研究者發(fā)現(xiàn)CircRNA的水平變化不僅對機體相關(guān)生理功能調(diào)節(jié)作用,同樣對腫瘤的發(fā)生及起到重要影響。大量的研究證實了CircRNA可參與腫瘤細胞的增殖、侵襲、轉(zhuǎn)移及凋亡。Ma 等[24]研究發(fā)現(xiàn)CircRNA-000284 可以與miR-506 作用調(diào)節(jié)宮頸癌細胞的增殖及侵襲,Xing 等[25]發(fā)現(xiàn)CircRNA 可通過調(diào)節(jié)AKT/mTOR 信號路徑影響腫瘤細胞增殖及轉(zhuǎn)移。Liu 等[26]發(fā)現(xiàn)Circ-ZFR 可以通過調(diào)節(jié)PTEN和mir-130a/mir-107 促進腫瘤細胞凋亡及抑制腫瘤細胞擴增,Wang 等[27]發(fā)現(xiàn)has-Circ-0014717 可以通過調(diào)節(jié)p16 的表達影響腫瘤細胞周期。綜合近年來研究可知,CircRNA 主要通過調(diào)節(jié)腫瘤細胞生長過程中相關(guān)信號通路途徑調(diào)節(jié)促進和抑制腫瘤的變化,但是其如何作用信號通路中特定蛋白的機理目前仍需要深入研究。

        1.5 CircRNA的臨床檢測

        隨著近年來深入研究,研究者發(fā)現(xiàn)CircRNA 是一種普遍存在nRNA,其參與細胞中各種不同基因的表達調(diào)控,但是目前對其的研究較少且其潛在的一些功能仍未被揭露。傳統(tǒng)的CircRNA 檢測主要通過CircSeq 技術(shù),這種方法對于低豐度CircRNA的檢測有效率較低,同時對區(qū)別反向剪接產(chǎn)生的CircRNA和細胞中本身存在的CircRNA 功能較差,隨著生物學信息技術(shù)的不斷改進高通量測序技術(shù)有效的改善了RNA-seq 上述缺陷?;诟咄繙y序方法,目前CircRNA的測序工具也相應(yīng)增多如Mapsplice、CIRI 及CIRCexporer 等。除此之外,為便于有效探知CircRNA的功能,目前全球已建立了關(guān)于CircRNA的基因組和序列數(shù)據(jù)庫(如www.circbase.org)中包含了150 000個CircRNA的信息[28]。

        2 CircRNA在婦科腫瘤疾病的相關(guān)性研究進展

        婦科腫瘤是目前婦科疾病中對女性健康危害性最大的一類疾病。婦科腫瘤種類較多,包括宮頸癌、卵巢癌、乳腺癌、子宮內(nèi)膜癌等,據(jù)報道,宮頸癌和卵巢癌的致死率及發(fā)病率最高。

        2.1 CircRNA與宮頸癌

        Abdelmohsen 等[3]通過使用宮頸癌HeLa細胞研究證明CircPABPN1 可以競爭性的連接到HuR上,這樣就可以抑制HuR′s 的連接位點連接到PABPN1 mRNA 上進行翻譯,從而抑制腫瘤細胞擴增。Bachmayr-Heyda 等[29]發(fā)現(xiàn)在13種人類組織中CircRNA的整體峰度與腫瘤細胞增值率呈現(xiàn)負相關(guān)。除此之外,有研究發(fā)現(xiàn),CDRIas 在宮頸癌組織中的表達水平遠高于癌旁組織,而miR-7與其相反[30]。Lee 等[31]通過對宮頸癌的Hela和C33A細胞研究發(fā)現(xiàn),CDRIas 的超表達可以通過抑制miR-7 的活力而增加FAK(粘著斑激酶,miR-7 的靶標)的表達,F(xiàn)AK 的超表達可促進宮頸癌細胞的擴增、侵襲及遷移,此結(jié)果進一步證實CDRIas與miR-7 在宮頸癌的調(diào)節(jié)中具有相關(guān)性。因此建立基于CDR1as 的檢測方法對宮頸癌的早期診斷具有重要作用,除此之外以CDR1as 進行分子靶標進行靶向治療潛力巨大。

        2.2 CircRNA與卵巢癌

        卵巢癌,目前婦科腫瘤中致死率最高的疾病,其不僅影響卵巢部位卵母細胞的正常發(fā)育,同時對卵巢激素分泌也造成很大影響。Zhou 等[32]研究發(fā)現(xiàn),當mRNA 上調(diào)或CircRNA 下調(diào)時,與其相關(guān)的NFkB、PI3k/AKT和TGF(這兩個含有多種miR-24/let-7 結(jié)合位點)就會在轉(zhuǎn)移癌中被上調(diào)。此結(jié)果說明CircRNA與mRNA在卵巢癌的發(fā)生中具有相關(guān)性,并且可以通過與卵巢細胞上miR-24/let-7結(jié)合位點結(jié)合競爭性抑制miRNA的線性剪切和海綿功能,調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)移-誘發(fā)基因的表達,從而有利于卵巢癌的轉(zhuǎn)移。因此以NFkB、PI3k/AKT和TGF作為靶點既可以對卵巢癌的發(fā)生及進展的監(jiān)測具有重要的指導作用。

        2.3 CircRNA與乳腺癌

        乳腺癌同樣是困擾女性健康的重要疾病。有研究發(fā)現(xiàn)CDR1as可以起到的miR-7的海綿分子作用,從而可以反向調(diào)節(jié)miR-7 活性并降低其對ECF,IRS-1,IRS-2,ak1,Raf1,ACK1和PIK3CD 的抑制作用,從而反過來促進包括乳腺癌在內(nèi)的腫瘤的發(fā)展,當miR-671 連接到CDR1as 上,由AGO介導的分裂就會被啟動從而降低CDR1as 的表達水平,從而減弱CDR1as 的表達,間接調(diào)整miR-7的活性水平[33]。miR-7 的表達水平主要被其上游基因HOXD10 正向調(diào)節(jié),其低表達水平可以提升癌癥的侵襲性能,當PAK1 水平上升、miR-7 或HOXD10 水平下降時,乳腺癌細胞的侵襲力就會增強[34]。發(fā)現(xiàn)miR-7 還可靶向REGγ 抑制乳腺癌小的擴增,同時可促進乳腺癌細胞凋亡[35]。因此,miR-7 的表達水平與癌癥的上皮分化密切關(guān)聯(lián):表達水平越低,轉(zhuǎn)移潛能越弱。

        Karla 等[36]發(fā)現(xiàn)miR-7 可以抑制p21 激酶的表達(PAK1),這種酶在多種腫瘤中水平均呈現(xiàn)上調(diào),同時有研究發(fā)現(xiàn)miR-7 在哺乳動物乳腺癌組織中低水平表達,且其表達水平與癌細胞的轉(zhuǎn)移能力能負相關(guān)性。Tang 等[37]發(fā)現(xiàn)作為miR-7的海綿分子,CDR1as 可以反向調(diào)節(jié)其活性并降低其對ECF,IRS-1,IRS-2,ak1,Raf1,ACK1和PIK3CD 的抑制作用,從而反過來促進乳腺癌的惡化。

        2.4 CircRNA與子宮內(nèi)膜癌

        在其他婦科腫瘤研究中,Yang 等[38]發(fā)現(xiàn)Circ-ITCH可以競爭性的連接到miR-17和miR-224,從而影響p21和PTEN的不同表達,PTEN的突變或缺失可使其酶活性失活,然后PTEN失去抑制細胞增殖的能力,PTEN位于10 號染色體上,其可以參與磷酸酶和肌張力蛋白的表達,磷酸酶和肌張力蛋白同源物是一種具有磷酸酶活性的癌癥抑制物,因為它可以抑制分裂、增殖、侵襲、遷移及并加速癌細胞的凋亡。因此,當PTEN的突變或缺失可使其酶活性失活,細胞傾向于惡性腫瘤,可能會引起子宮內(nèi)膜癌。同時Chen 等[39]研究發(fā)現(xiàn),正常人子宮內(nèi)膜癌組織中CircRNAs 表達水平較低,因此CircRNAs 水平的變化對子宮內(nèi)膜癌的發(fā)生具有一定的診斷價值。

        3 CircRNA在婦科腫瘤疾病的診療中面臨的挑戰(zhàn)

        綜合上述研究分析可知,CircRNA已經(jīng)越來越備受科學界所關(guān)注,其參與機體細胞分子生物學調(diào)控的機理也不斷被揭露,然而這些研究都是處于初步研究階段。CircRNA在生物體內(nèi)廣泛存在,但是各種潛在CircRNA分子信息庫的構(gòu)建目前還待完成,同時這些CircRNA在不同疾病的信號通路調(diào)控路徑還需要進一步研究。通過對婦科腫瘤疾病相關(guān)CircRNA分子調(diào)控的近些年研究總結(jié)可知,CircRNA在婦科腫瘤疾病的診斷、病程發(fā)展判斷和靶向分子治療藥物的研究具有重要指導意義。但是,在不同類型婦科腫瘤發(fā)生相關(guān)CircRNA 之間的關(guān)聯(lián)性研究方面較少,仍需要進一步深入挖掘。同時,不同CircRNA在調(diào)節(jié)腫瘤的發(fā)生及抑制過程中角色研究目前還不清楚。特別是在癌癥不同階段,CircRNA分子之間、CircRNA分子與miRNA分子之間復雜協(xié)作機理的研究均是未來科學認知的挑戰(zhàn)。

        4 展望

        婦科惡性腫瘤是婦科疾病中對患者傷害最大的疾病,目前對惡性腫瘤的治療無特效的藥物,主要通過早期診斷及早期治療方式改善預后。為了有效提升早期診斷準確性,分子生物學診斷技術(shù)在婦科腫瘤疾病的診療中越來越收到關(guān)注。CircRNA 是非編碼RNA家族后起之秀,越來越多的研究證實其在生物體中種類豐富多樣,結(jié)構(gòu)較為穩(wěn)定,在細胞或組織中特定表達。因此,基于不同CircRNA分子建立調(diào)控網(wǎng)絡(luò),為后期婦科腫瘤在疾病預防及治療藥物的研發(fā)提供了重要的指導思路。除此之外,CircRNA分子在臨床疾病診斷中新型快速檢測技術(shù)的研發(fā)同樣是未來發(fā)展的一種趨勢。

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