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        柳州地區(qū)新生兒B族鏈球菌對(duì)抗菌藥物的耐藥性、血清型與分子遺傳背景特征分析Δ

        2020-12-14 06:28:12傅錦堅(jiān)陳繼昌
        關(guān)鍵詞:耐藥新生兒研究

        傅錦堅(jiān),陳繼昌,肖 萍

        (1.柳州市婦幼保健院檢驗(yàn)科,廣西 柳州 545001; 2.柳州市婦幼保健院新生兒科,廣西 柳州 545001; 3.柳州市婦幼保健院藥學(xué)部, 廣西 柳州 545001)

        B族鏈球菌(Group BStreptococcus,GBS)是引起新生兒敗血癥和腦膜炎的主要病原體[1-3]。據(jù)估計(jì),10%~30%的妊娠期婦女直腸陰道定植有GBS,而母體攜帶GBS是新生兒感染的主要來源[4]。在沒有任何干預(yù)的情況下,GBS定植的母親娩出的新生兒中有1%~2%可有嚴(yán)重性的感染,如敗血癥或腦膜炎等[4]。新生兒GBS疾病是分娩期間由母親-新生兒的垂直傳播或由醫(yī)護(hù)人員的水平傳播引起的[5]。在0~6日齡新生兒中發(fā)生的感染被稱為早發(fā)型,在7~90日齡新生兒中發(fā)生的感染被稱為晚發(fā)型;膿毒癥和肺炎常見于早發(fā)型,而腦膜炎和菌血癥在晚發(fā)型中更常見[6]。研究者已開發(fā)多種技術(shù)去更好地理解GBS的種群結(jié)構(gòu),其中多位點(diǎn)序列分型(multilocus sequence typing,MLST)是標(biāo)準(zhǔn)的分型方法[7-8]。循證醫(yī)學(xué)證據(jù)顯示,分離自不同國家不同人群的GBS菌株的MLST結(jié)果表明,只有少數(shù)的克隆復(fù)合體(clonal complex,CC),包括CC1、CC10、CC17、CC19和CC23與GBS的定植或侵襲性感染有關(guān)[9]。在上述CC中,CC17是一種高毒力克隆,主要與新生兒的侵襲性疾病有關(guān);CC19可引起新生兒或成人的侵襲性疾病[10]。最近的研究結(jié)果表明,母體或新生兒定植的菌株中,CC1、CC19和CC23的分離比例非常高[10]。研究結(jié)果表明,CC17是莢膜型別(CT)Ⅲ的同質(zhì)克隆復(fù)合體,不同的CC表達(dá)的莢膜型別不一致[8-10]。多糖莢膜是GBS最重要的毒力因子,基于表面多糖結(jié)構(gòu)的差異,研究者已將其分為10種CT(Ⅰa、Ⅰb、Ⅱ—Ⅸ),被稱為10種血清型[8-10]。由于西部地區(qū)研究新生兒GBS定植的調(diào)查報(bào)道較少,因此,本研究旨在分析柳州地區(qū)新生兒定植的GBS菌株對(duì)抗菌藥物的敏感性、血清分型和分子特征。

        1 資料與方法

        1.1 研究人群和樣本收集

        本研究對(duì)日常監(jiān)測(cè)樣本進(jìn)行采樣。凡是2015年1月至2020年4月在柳州市婦幼保健院出生的新生兒,在母親采集樣本進(jìn)行GBS分析的情況下,對(duì)娩出的新生兒出生后立即用無菌取樣器涂抹耳朵、口腔和臍帶后放置運(yùn)送培養(yǎng)基送檢。上述樣本監(jiān)測(cè)和采集的過程,獲得柳州市婦幼保健院倫理委員會(huì)的批準(zhǔn)(批件號(hào)為20170010)。

        1.2 GBS的分離鑒定

        取出采樣拭子,將其接種于GBS鑒定顯色平板(鄭州安圖生物工程股份有限公司)中,5%CO2、37 ℃下培養(yǎng)18~24 h,挑選粉色、紫色、紅色等可疑陽性菌落進(jìn)行革蘭染色、形態(tài)學(xué)和過氧化氫酶等鑒定,再進(jìn)行CAMP試驗(yàn),觀察溶血模式,確定分離株為GBS。

        1.3 藥物敏感試驗(yàn)和耐藥基因檢測(cè)

        使用K-B紙片擴(kuò)散法進(jìn)行藥物敏感試驗(yàn),折點(diǎn)和抗菌藥物紙片的選擇基于美國臨床與實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)化委員會(huì)提出的標(biāo)準(zhǔn)執(zhí)行。對(duì)以下抗菌藥物進(jìn)行藥物敏感試驗(yàn),包括青霉素、頭孢曲松、左氧氟沙星、克林霉素、紅霉素、氯霉素、利奈唑胺和萬古霉素。多重耐藥的判定標(biāo)準(zhǔn)為菌株對(duì)≥3種不同型別的抗菌藥物產(chǎn)生耐藥。此外,聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)方法用于檢測(cè)四環(huán)素耐藥基因(tetM、tetO、tetL、tetK、tetT和tetS)、大環(huán)內(nèi)酯類耐藥基因(ermA、ermB、ermTR和mefA/E)和林可酰胺類耐藥基因(linB)[11]。

        1.4 GBS的分子特征分析

        采用MLST方法對(duì)GBS的7個(gè)管家基因進(jìn)行測(cè)序后,將測(cè)序結(jié)果通過MLST的數(shù)據(jù)庫(http://eburst.mlst.net)查詢得出序列分型(sequence type,ST)和等位基因。使用網(wǎng)站自帶程序eBURST確定特定ST的CC,單ST指未能聚集成CC的ST。使用PCR方法對(duì)GBS攜帶的10種血清型別進(jìn)行鑒定,并對(duì)GBS的毒力基因,如黏附相關(guān)基因(scpB)、入侵相關(guān)基因(hlyB)和alp表面定位蛋白抗原基因(alphaC、rib、epsilon、alp2/3和alp4)進(jìn)行分型分析,所有的鑒定參照相關(guān)文獻(xiàn)[11]中方法進(jìn)行處理。

        1.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

        2 結(jié)果

        2.1 新生兒GBS定植的臨床特征

        新生兒平均住院時(shí)間為(7.18±11.89)d。共檢出50株GBS,其中,男性新生兒檢出28株(占56.0%);初產(chǎn)分娩新生兒檢出26株(占52.0%);順產(chǎn)新生兒檢出19株(占18.0%);發(fā)生肺炎、窒息的新生兒分別檢出16、4株(分別占32.0%、8.0%),見表1。

        表1 新生兒GBS定植的臨床特征Tab 1 Clinical characteristics of neonatal GBS colonization

        2.2 新生兒GBS菌株的血清型與耐藥、毒力基因之間的關(guān)系

        50例GBS菌株中,80.0%的菌株呈現(xiàn)多重耐藥性;所有GBS菌株均對(duì)青霉素、頭孢曲松、利奈唑胺和萬古霉素敏感,均對(duì)紅霉素和克林霉素耐藥;60.0%的菌株同時(shí)攜帶紅霉素和四環(huán)素的耐藥基因,主要的耐藥基因?yàn)閑rmA和tetM;GBS菌株的血清型主要為Ⅰa型(21株,占42.0%)、Ⅲ型(21株,占42.0%)和Ⅰb型(8株,占16.0%);所有的菌株均攜帶毒力基因scpB和hlyB。不同血清型攜帶的基因不一致,例如,血清型Ⅰa型菌株中,攜帶耐藥基因tetT的菌株數(shù)所占比例最高(8株,占38.1%)(P=0.005);血清型Ⅲ型菌株中,攜帶alp表面定位蛋白抗原基因rib的菌株數(shù)所占比例最高(14株,占66.7%)(P<0.001);血清型Ⅰa型菌株中攜帶alphaC的菌株數(shù)所占比例遠(yuǎn)高于血清型Ⅰb型和Ⅲ型,差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.001)。新生兒GBS菌株的血清型與耐藥、毒力基因之間的關(guān)系見表2。

        2.3 新生兒GBS菌株克隆型、血清型和耐藥基因、毒力基因的特征

        50株GBS菌株中,最常見的基因序列類型為ST12型(15株,占30.0%)、ST19型(10株,占20.0%)、ST17型(9株,占18.0%)和ST23型(5株,占10.0%)。ST17型和ST19型主要與血清型Ⅲ型有關(guān),對(duì)四環(huán)素、紅霉素和克林霉素耐藥,攜帶有耐藥基因tetM和ermA,毒力基因rib;ST12型和ST23型主要與血清型Ⅰa型有關(guān),攜帶有耐藥基因tetM和ermA,毒力基因alphaC和epsilon。新生兒GBS菌株克隆型、血清型和耐藥基因、毒力基因的特征見表3。

        表2 新生兒GBS菌株的血清型與耐藥、毒力基因之間的關(guān)系Tab 2 Correlation between drug resistance, virulence gene and serotypes of neonatal GBS strains

        3 討論

        青霉素是推薦用于預(yù)防和治療GBS疾病的一線藥物。本研究中,所有GBS分離株均對(duì)青霉素敏感,這表明青霉素仍是預(yù)防用藥的首選,與最新的薈萃分析結(jié)果相似[12]。指南推薦,若對(duì)青霉素過敏,建議使用紅霉素和克林霉素作為替代藥物。但本研究結(jié)果顯示,所有的50株GBS菌株均對(duì)紅霉素和克林霉素耐藥,與以往的研究結(jié)果相似[13]。此外,最新的薈萃分析結(jié)果亦表明,亞洲國家分離的GBS菌株對(duì)紅霉素和克林霉素的耐藥率高于非亞洲國家[12]。上述研究結(jié)果表明,使用抗菌藥物對(duì)新生兒進(jìn)行預(yù)防性用藥時(shí),需要在藥物敏感試驗(yàn)結(jié)果的指導(dǎo)下進(jìn)行,尤其是對(duì)于青霉素過敏的新生兒。本研究中,80.0%的GBS菌株呈現(xiàn)多重耐藥性,主要對(duì)紅霉素、克林霉素和四環(huán)素耐藥。與本研究結(jié)果類似的一篇來自中國新生兒侵襲性GBS菌株研究結(jié)果顯示,79.9%的菌株呈現(xiàn)多重耐藥性,主要對(duì)紅霉素、克林霉素和四環(huán)素耐藥[14]。上述結(jié)果凸顯了臨床實(shí)驗(yàn)室持續(xù)監(jiān)測(cè)GBS菌株對(duì)抗菌藥物耐藥性的重要性。

        表3 新生兒GBS菌株克隆型、血清型和耐藥基因、毒力基因的特征Tab 3 Characteristics of clonotype, serotype, drug resistance gene and virulence gene of neonatal GBS isolates

        較少有研究報(bào)道GBS菌株的耐藥機(jī)制。erm基因是主要的大環(huán)內(nèi)酯類耐藥基因,通過甲基化修飾核糖體并抑制紅霉素結(jié)合,達(dá)到對(duì)紅霉素耐藥的目的,而mef基因編碼充當(dāng)藥物外排泵的膜蛋白,將抗菌藥物往外排。本研究中,8株GBS菌株同時(shí)攜帶ermB、ermA和(或)mefA/E,表明GBS對(duì)紅霉素的耐藥性主要通過上述2種機(jī)制介導(dǎo)。鏈球菌中四環(huán)素的耐藥性主要是由tetM、tetO或tetT基因編碼的核糖體保護(hù)蛋白介導(dǎo)的,由tetK或tetL基因編碼介導(dǎo)的外排機(jī)制相對(duì)罕見[15]。本研究結(jié)果與之類似,有70.0%的菌株至少攜帶1種上述耐藥基因。最為重要的是,60.0%的菌株同時(shí)攜帶紅霉素和四環(huán)素耐藥基因,主要的耐藥基因?yàn)閑rmA和tetM。上述耐藥基因的存在可能是耐藥基因水平轉(zhuǎn)移的結(jié)果,未來的研究必須更多地關(guān)注GBS菌株對(duì)抗菌藥物耐藥的遺傳機(jī)制。

        已有研究報(bào)道,可通過研究開發(fā)針對(duì)GBS血清型的疫苗對(duì)GBS疾病進(jìn)行預(yù)防。疫苗的研發(fā)取決于人群監(jiān)測(cè)中GBS血清型分布的準(zhǔn)確數(shù)據(jù)。本項(xiàng)針對(duì)新生兒群體的研究數(shù)據(jù)顯示,42.0%的血清型集中在Ⅰa型,另外42.0%的血清型集中在Ⅲ型,16.0%血清型為Ⅰb型,與廣州市新生兒GBS菌株的分子特征相似[16]。目前正在進(jìn)行的臨床試驗(yàn)為三價(jià)(Ⅰa型、Ⅰb型和Ⅲ型)GBS疫苗[11],在不久的將來,按照現(xiàn)在的監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù),若能在我國投放使用,將能很好地覆蓋新生兒人群。但也有研究結(jié)果顯示,在不同的國家,流行的主要血清型別不一致,如在韓國主要流行的血清型為Ⅲ型和Ⅴ型[17]。上述研究結(jié)果顯示,不同的國家,由于地理位置、種族、人群不一致,GBS的血清型分布亦存在時(shí)間、空間和人群的差異性[18-21]。未來仍需繼續(xù)對(duì)妊娠期、圍產(chǎn)期婦女和新生兒定植和感染的GBS菌株進(jìn)行持續(xù)性監(jiān)測(cè),以方便獲取GBS的遺傳背景和血清學(xué)信息,用于下一步疫苗的研制。

        本研究從50株GBS定植菌株中分離鑒定出11種ST,其中最常見的ST為ST12、ST19、ST17和ST23,占全部菌株的78.0%。本研究共鑒定出6種CC,分別為CC10、CC12、CC17、CC19、CC23和CC103,其也是全球最常見的CC。已有研究結(jié)果認(rèn)為,ST19/Ⅲ與定植有關(guān),而ST17/Ⅲ主要與侵襲性感染有關(guān)[11]。在致病菌株中,最常見的CC是CC17,其對(duì)應(yīng)的血清型為Ⅲ型。據(jù)報(bào)道,由于其高致病性和毒力,CC17最常引起新生兒腦膜炎,尤其是免疫系統(tǒng)尚未成熟的嬰幼兒。在新生兒侵襲性感染的發(fā)生和發(fā)展過程中,CC17菌株通過特殊的毒力機(jī)制增強(qiáng)了GBS的致病性和侵襲性,這是>80%的患兒發(fā)生腦膜炎的主要原因[10]。CC17定植是新生兒GBS感染的主要危險(xiǎn)因素[16]。荷蘭的一項(xiàng)研究結(jié)果發(fā)現(xiàn),1987—2011年,GBS感染發(fā)生率升高的主要原因是CC17的流行率升高[22]。本研究中發(fā)現(xiàn)9株ST17菌株,屬于定植菌株而非感染菌株。CC17和CC19是GBS血清型Ⅲ型最常見的重要基因譜系,因此,Ⅲ型可能是導(dǎo)致嬰兒GBS定植的最常見血清型。此前的研究結(jié)果顯示,盡管進(jìn)行了產(chǎn)前抗菌藥物預(yù)防性用藥,血清型Ⅲ型的ST17和ST19克隆在產(chǎn)后8周仍可檢測(cè)出來[23],可以部分解釋為何產(chǎn)前進(jìn)行了抗菌藥物預(yù)防性用藥,仍有部分菌株可引起新生兒的侵襲性感染。

        此外,本研究結(jié)果顯示,在GBS菌株中存在著特定的血清型-遺傳背景-毒力基因-耐藥基因的組合,如ST17-Ⅲ型-ermA-rib,ST19-Ⅲ型-linB-tetM-rib-epsilon和ST12-Ⅰa型/Ⅰb型-ermA-linB-alphaC等。值得注意的是,本研究中發(fā)現(xiàn),GBS毒力基因rib和alphaC存在于特定的克隆和血清型菌株中,如alphaC僅存在于ST12菌株中,而所有ST12菌株的血清型均為Ⅰ型(Ⅰa型和Ⅰb型)。rib僅存在CC17和CC19中,這2個(gè)克隆均屬于血清型Ⅲ型。上述研究結(jié)果提示,在調(diào)查GBS的分子特征時(shí),需要綜合考慮GBS的特定蛋白,以便發(fā)現(xiàn)新的流行病學(xué)趨勢(shì),并在以后的疫苗研發(fā)中加以考慮和應(yīng)用。

        綜上所述,本研究運(yùn)用多種方法鑒定了新生兒定植性GBS菌株的耐藥表型、耐藥基因型、血清型、毒力基因和遺傳背景分析,并發(fā)現(xiàn)GBS的遺傳背景具有一定的特異性,凸顯了在以后的研究中仍需對(duì)日常監(jiān)測(cè)發(fā)現(xiàn)的GBS菌株加以鑒定分析,以期發(fā)現(xiàn)新的流行病學(xué)趨勢(shì),并在日后研發(fā)多價(jià)GBS疫苗中加以考慮和應(yīng)用。此外,本研究發(fā)現(xiàn),從新生兒群體中分離的GBS菌株呈現(xiàn)多重耐藥性,凸顯了日后持續(xù)監(jiān)測(cè)GBS耐藥性的重要性。

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