擔(dān)子菌門(mén)(BasidiomycotaR.T.Moore 1980)真菌是以食藥用菌為代表的大型真菌最主要的種類(lèi)構(gòu)成,也包括植物病原菌銹菌和黑粉菌,還有酵母菌等,其物種數(shù)占真菌界的1/3,有4萬(wàn)余種。該類(lèi)群所涉及的食用菌產(chǎn)業(yè)自2014年就已成為農(nóng)業(yè)第5大種植業(yè),藥用菌的活性產(chǎn)物開(kāi)發(fā)前景廣闊。然而由于種類(lèi)繁多、分類(lèi)歷史悠久、大量新類(lèi)群的發(fā)現(xiàn)引發(fā)分類(lèi)系統(tǒng)巨大變革,阻礙了相關(guān)資源的認(rèn)識(shí)進(jìn)程。為此,中國(guó)科學(xué)院微生物所趙瑞琳?qǐng)F(tuán)隊(duì)集結(jié)近10年來(lái)?yè)?dān)子菌門(mén)分類(lèi)研究的新進(jìn)展,首先在多基因及基因組層面對(duì)整個(gè)門(mén)的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系開(kāi)展研究,并估算了目前擔(dān)子菌門(mén)內(nèi)亞門(mén)、綱、目、科的演化時(shí)間,具體包括:6個(gè)基因(LSU、SSU、5.8s、rpb1、rpb2、ef1)的多基因系統(tǒng)發(fā)育圖譜、116個(gè)代表種的396個(gè)直系同源基因的系統(tǒng)發(fā)育基因組圖譜研究及771個(gè)代表種分子鐘分析推算了科和科以上的分類(lèi)階元的演化時(shí)間。為建立擔(dān)子菌門(mén)標(biāo)準(zhǔn)化分類(lèi)系統(tǒng)中的各分類(lèi)等級(jí)的演化時(shí)間標(biāo)準(zhǔn)提供了依據(jù)。
此外,在理清擔(dān)子菌門(mén)內(nèi)主要進(jìn)化支序的系統(tǒng)發(fā)育關(guān)系基礎(chǔ)上,趙瑞琳?qǐng)F(tuán)隊(duì)聯(lián)合27國(guó)專(zhuān)家對(duì)擔(dān)子菌門(mén)中已知的3 198個(gè)屬名進(jìn)行梳理;同時(shí)還整理提供了每個(gè)合法屬的各類(lèi)信息,包括分類(lèi)地位、物種數(shù)、模式種、生活類(lèi)型、生境、分布地、DNA數(shù)據(jù)以及系統(tǒng)發(fā)育等,進(jìn)一步完善分類(lèi)系統(tǒng)的各類(lèi)信息。獲得目前最完整的擔(dān)子菌門(mén)分類(lèi)系統(tǒng):包括4亞門(mén)、18綱、68目、241科、1 928屬,共41 270個(gè)種(分別增加1亞門(mén)、2綱、14目、64科、337屬和9 755種)。研究成果于2019年11月發(fā)表于《Fungal Diversity》上。
以該研究成果為基礎(chǔ)的網(wǎng)站https://www.basidio.org正在建設(shè)中。該網(wǎng)站將持續(xù)對(duì)擔(dān)子菌門(mén)分類(lèi)系統(tǒng)進(jìn)行維護(hù)和更新,實(shí)現(xiàn)大型真菌(蘑菇)為主的這一大類(lèi)真菌的分類(lèi)系統(tǒng)的整體性呈現(xiàn),不僅為分類(lèi)學(xué)家,而且為資源的利用者、生態(tài)學(xué)家等提供巨大的便利。