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        基于物種敏感度分布的概率生態(tài)風(fēng)險評價的Matlab實現(xiàn)

        2020-12-10 07:22:06馮永亮
        唐山學(xué)院學(xué)報 2020年6期
        關(guān)鍵詞:生態(tài)評價

        馮永亮

        (唐山學(xué)院 基礎(chǔ)教學(xué)部,河北 唐山 063000)

        0 引言

        物種敏感度分布(Species Sensitivity Distribution,SSD)是一種用于描述不同物種對某個脅迫因素敏感度差異的統(tǒng)計分布模型。SSD的概念最早于1978年由美國環(huán)保局(U.S.EPA)在推導(dǎo)全國環(huán)境水質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)時提出,隨后于1985年確定了以SSD的5%分位數(shù)所對應(yīng)的濃度(HC5)推導(dǎo)環(huán)境基準(zhǔn)值,并以此代替之前的專家判斷法,沿用至今[1]。我國在2017年頒布的《淡水水生生物水質(zhì)基準(zhǔn)制定技術(shù)指南》中也推薦使用SSD模型進(jìn)行淡水水生生物水質(zhì)基準(zhǔn)推導(dǎo)。此外,隨著SSD理論的發(fā)展,許多學(xué)者開始采用SSD與環(huán)境監(jiān)測數(shù)據(jù)相結(jié)合的概率方法評價污染物的生態(tài)風(fēng)險[2-5]。Chen[3]分別采用急性和慢性毒性數(shù)據(jù),構(gòu)建了9種污染物的SSDs曲線,并結(jié)合環(huán)境監(jiān)測濃度構(gòu)建聯(lián)合概率曲線(JPCs)評價了中國臺灣北部基隆河中污染物的生態(tài)風(fēng)險,發(fā)現(xiàn)Zn和Cu的風(fēng)險最高,有機(jī)物的風(fēng)險可忽略。目前SSD模型在許多國家和地區(qū)得到了很好的應(yīng)用[6-7],已經(jīng)成為污染物環(huán)境質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)制定和生態(tài)風(fēng)險評價的核心方法。

        隨著SSD理論的發(fā)展和廣泛應(yīng)用,一些學(xué)者或機(jī)構(gòu)為SSD模型的構(gòu)建和生態(tài)風(fēng)險評價開發(fā)了相應(yīng)的軟件。這些軟件大體上可分為兩類:一類是基于Excel表格開發(fā)的,如USEPA開發(fā)的一款用于因果評估的在線應(yīng)用程序(CADDIS)中的SSD Generator,荷蘭國家公共衛(wèi)生和環(huán)境研究所(RIVM)開發(fā)的ETX 2.0[8];另一類是基于專業(yè)的統(tǒng)計軟件R開發(fā)的,如澳大利亞聯(lián)邦科學(xué)和工業(yè)研究組織(CSIRO)基于Burr III分布開發(fā)的軟件BurrlizO[9],Kon等開發(fā)的網(wǎng)頁版工具M(jìn)OSAIC_SSD[10]。這些軟件主要集中于SSD的構(gòu)建和環(huán)境標(biāo)準(zhǔn)(HC5)的推導(dǎo),存在著可選統(tǒng)計模型較少、未能與環(huán)境數(shù)據(jù)相結(jié)合等缺點。本研究結(jié)合環(huán)境監(jiān)測數(shù)據(jù),首次給出了基于SSD的概率生態(tài)風(fēng)險評價的Matlab函數(shù)“PERA”,為污染物的生態(tài)風(fēng)險評價提供技術(shù)支持。

        1 SSD的原理和假設(shè)

        不同生物生活史、生理、形態(tài)、行為和地域分布的差異構(gòu)成了生態(tài)系統(tǒng)的生物多樣性。對于生態(tài)毒理學(xué),這些生物多樣性意味著不同生物對特定污染物具有不同的敏感性。物種間的這種敏感性差異可以利用特定的概率分布曲線即SSD曲線來描述。

        物種敏感度分布的基本假設(shè)是不同物種對特定污染物的敏感性能夠用一些統(tǒng)計分布模型(如Log-normal和Log-logistic分布等)來描述。生態(tài)毒理學(xué)的數(shù)據(jù)可以看成是來自于這些分布模型的樣本,并用于SSD參數(shù)的估計。SSD模型的基本形式見圖1。

        圖1 物種敏感度分布曲線示意圖

        圖1中的圓圈為原始毒性數(shù)據(jù)點,可以是急性(如半數(shù)致死濃度,LC50)或慢性(如無觀測效應(yīng)濃度,NOECs)效應(yīng)濃度。擬合的曲線為毒性數(shù)據(jù)的累積概率曲線(即SSD)。圖中的箭頭表示SSD具有正向和反向兩個方面的應(yīng)用。其中反向(箭頭Y→X)可應(yīng)用于污染物的環(huán)境質(zhì)量標(biāo)準(zhǔn)(EQC)的獲得,主要是通過曲線計算特定物種損害比例所對應(yīng)的污染物濃度,通常取HC5作為EQC,從而保護(hù)生態(tài)系統(tǒng)中95%的生物不受污染物的影響;正向(箭頭X→Y)可以用于生態(tài)風(fēng)險評價,主要由SSD曲線計算污染物在特定濃度下(一般為環(huán)境監(jiān)測濃度)導(dǎo)致有害生物效應(yīng)的累積概率,即受影響物種的比例(PAF),進(jìn)而定量表征污染物的生態(tài)風(fēng)險。

        2 基于SSD的概率生態(tài)風(fēng)險評價

        化學(xué)物質(zhì)的生態(tài)風(fēng)險主要是通過環(huán)境監(jiān)測數(shù)據(jù)與毒性數(shù)據(jù)進(jìn)行表征的,表征的方法包括簡單的風(fēng)險商HQs法和相對復(fù)雜的概率生態(tài)風(fēng)險評價法。風(fēng)險商HQs法(即環(huán)境監(jiān)測濃度除以毒性閾值)是簡單的單點估計法,具有簡單、透明和對數(shù)據(jù)要求低等優(yōu)點,但其只適用于污染物篩選的初級階段[11-12]。為了更加精確詳細(xì)地表征生態(tài)風(fēng)險,很多學(xué)者推薦采用更為復(fù)雜的概率方法,即聯(lián)合概率曲線(JPC)法。JPC方法通過比較環(huán)境監(jiān)測數(shù)據(jù)和毒性數(shù)據(jù)的分布特征可以定性和定量地表征生態(tài)風(fēng)險,常被用作細(xì)化各種污染物生態(tài)風(fēng)險的高水平方法[13]。下面給出JPC的構(gòu)建過程和其生態(tài)學(xué)意義。

        設(shè)EC為污染物的環(huán)境監(jiān)測濃度,SS為污染物的毒性效應(yīng)濃度,隨機(jī)變量X1和X2分別來自于EC和SS的概率分布。

        Pr(logEC>logSS)=Pr(X1>X2)。

        (1)

        式(1)為污染物的環(huán)境監(jiān)測濃度大于其毒性效應(yīng)濃度的概率,有兩種等價的積分形式表達(dá)式:

        (2)

        (3)

        其中PDFXi,CDFXi(i=1,2)分別表示隨機(jī)變量Xi的概率密度函數(shù)和累積分布函數(shù);式(3)中1-CDFX1(x)表示隨機(jī)變量X1超過給定數(shù)值x的概率,即傳統(tǒng)概率論中的生存函數(shù),在環(huán)境毒理學(xué)中通常將其定義為超越函數(shù)EXFX1(x)=1-CDFX1(x)。此時式(3)可等價轉(zhuǎn)化為下式

        (4)

        由式(2)和式(4)右邊的積分表達(dá)式可知,Pr(X1>X2)即為污染物環(huán)境風(fēng)險在統(tǒng)計學(xué)上的期望值,其在數(shù)值上等于Van Straalen[14]給出的生態(tài)風(fēng)險δ和Cardwell[15]給出的期望總風(fēng)險(ETR)。

        基于式(4),以毒性數(shù)據(jù)的累積概率(即dCDFX2(x))為自變量,環(huán)境監(jiān)測數(shù)據(jù)的超越概率(即EXFX1(x))為因變量,構(gòu)造的曲線即為聯(lián)合概率曲線(具體構(gòu)建過程見圖2)。該曲線上的點表示導(dǎo)致不同物種損害水平的概率[2],曲線與兩坐標(biāo)軸圍成的面積即為污染物環(huán)境風(fēng)險的期望值Pr(X1>X2),也有學(xué)者稱該值為發(fā)生有害生物效應(yīng)的總體風(fēng)險概率(ORP)[16-17]。

        類似地,JPC也可以根據(jù)式(2)進(jìn)行構(gòu)建,即暴露數(shù)據(jù)的累積概率(dCDFX1(x))為自變量,毒性數(shù)據(jù)的累積概率(CDFX2(x))為因變量,曲線與兩坐標(biāo)軸圍成的面積為Pr(X1>X2)。

        3 概率生態(tài)風(fēng)險評價的Matlab程序

        基于上述分析過程,構(gòu)建用于污染物概率生態(tài)風(fēng)險評價的Matlab函數(shù)“PERA”,其程序代碼如下所示。

        function [HCq,ORP]=PERA(Tdata,q,option,ECdata)

        % Tdata為污染物的毒性數(shù)據(jù),需為向量形式。

        % q為SSD的q分位數(shù)HCq,0

        % option=1和option=2分別表示基于Log-normal和Log-logistic分布構(gòu)造SSD曲線。

        % ECdata為污染物的環(huán)境監(jiān)測數(shù)據(jù),需為向量形式。

        % [HCq]=PERA(Tdata,q,option),返回SSD曲線和HCq值。

        % [HCq,ORP]=PERA(Tdata,q,option,ECdata),除返回SSD曲線和HCq值外,還返回JPC曲線和ORP值。

        if nargin<3

        error('輸入?yún)?shù)必須為3個或4個');

        end

        data=sort(Tdata);

        [n,m]=size(data);

        n=max(n,m);

        p=zeros(n,1);

        for i=1:n

        p(i)=i/(n+1);

        end

        data1=log10(data);

        if option==1

        dis='normal';

        else if option==2

        dis='logistic';

        end

        end

        [log,logci]=mle(data1,'distribution',dis);

        p2=icdf(dis,q,log(1),log(2));

        HCq=10^p2;

        N=10000;

        mm=0.2;

        mi=min(data1);

        mi=min(mi)-mm;

        mx=max(data1);

        mx=max(mx)+mm;

        x1=linspace(mi-0.1,mx+0.1,N);

        p11=cdf(dis,x1,log(1),log(2));

        p=p*100;

        p11=p11*100;

        MS=6;

        figure

        plot(data1,p,'ro','MarkerSize',MS,'MarkerFaceColor','r')

        hold on

        LW=1.5; % 圖像中線的寬度。

        plot(x1,p11,'k-','LineWidth',LW)

        axis([mi-0.1,mx+0.1,0,101]);

        FS=12;% 圖像中字號的大小。

        xlabel('log_{10}(concentration)')

        ylabel('Potentially Affected Percentage (%)')

        set(gca,'FontSize',F(xiàn)S,'Fontname','times new Roman')

        set(get(gca,'XLabel'),'FontSize',F(xiàn)S,'Fontname','times new Roman')

        set(get(gca,'YLabel'),'FontSize',F(xiàn)S,'Fontname','times new Roman')

        %%以下程序用于構(gòu)造聯(lián)合概率曲線JPC。

        if nargin==4

        data2=log10(ECdata);

        [phat,pci]=mle(data2,'distribution','normal'); %擬合環(huán)境數(shù)據(jù)的參數(shù)。

        y=0:0.00001:1;

        p22=icdf(dis,y,log(1),log(2)); %求SSD的反累積對數(shù)濃度數(shù)值。

        p33=cdf('normal',p22,phat(1),phat(2)); %求相對于SSD反累積對數(shù)濃度數(shù)值對應(yīng)的環(huán)境監(jiān)測數(shù)據(jù)的累積函數(shù)值。

        p44=1-p33; %求相對于SSD反累積數(shù)值對應(yīng)的環(huán)境監(jiān)測數(shù)據(jù)的超越概率。

        ORP=trapz(y,p44); %計算JPC曲線與兩坐標(biāo)軸所圍區(qū)域的面積。

        p44=p44*100;

        y=y*100;

        figure

        plot(y,p44,'r','LineWidth',LW)

        title('JPC','Fontname','times new Roman','FontSize',F(xiàn)S)

        xlabel('Percent of species affected (%)');

        ylabel('Probability exceedance (%)');

        set(gca,'FontSize',F(xiàn)S,'Fontname','times new Roman')

        set(get(gca,'XLabel'),'FontSize',F(xiàn)S,'Fontname','times new Roman')

        set(get(gca,'YLabel'),'FontSize',F(xiàn)S,'Fontname','times new Roman')

        end

        4 Matlab程序的應(yīng)用實例

        采用Li[5]對萊州灣西部表層海水重金屬Zn的環(huán)境監(jiān)測數(shù)據(jù)(2016年9月監(jiān)測)和Zn對海洋生物的慢性毒性數(shù)據(jù)對本文Matlab程序進(jìn)行實際運行。

        給定Zn的毒性數(shù)據(jù)Tdata=[20,1000,1144.962,97,1000,2154.395,10000,142.5,313,100,10,5000,400,380,4500,1000,970,200,139,480,230,600,520,124.0718,200,178,2500,630,88.5,15000,170.2,605,55,160,64,10,500,616.4414,80,170.9976,100,270,674,2000,2768.212,960,421.7163,1000,250,160,5900,1944.402];

        Zn的環(huán)境監(jiān)測數(shù)據(jù)ECdata=[39,40.6,39.1,38.6,43.6,40.4,41.2,41.9,41.1,37.8,38.4,36.8,38.4,38.7,39.1,38.5,41.2,40.7,42.4,39.5];

        在Matlab 2017b下運行:

        >> [HC5,ORP]=PERA(Tdata,0.05,2,ECdata)

        HC5=29.0852

        ORP=0.0698

        所得SSD曲線和JPC曲線分別見圖3和圖4。該結(jié)果與Li[5]的研究成果一致。

        圖4 萊州灣西部表層海水中Zn的聯(lián)合概率曲線(JPC)

        5 討論

        專業(yè)的統(tǒng)計軟件R是學(xué)者們在做關(guān)于污染物生態(tài)風(fēng)險評價時使用最多的一個軟件平臺[7,18-19]。R軟件強(qiáng)大的統(tǒng)計軟件包(如fitdistrplus)能夠為SSD的建立、HC5的估計等提供更多自由全面的選擇,但該軟件的熟練運用需要使用者具有一定的概率統(tǒng)計學(xué)功底。本文給出的Matlab函數(shù)“PERA”只需要使用者具有污染物的毒性數(shù)據(jù)就能夠方便地得到SSD曲線和其重要參數(shù)HC5,為概率統(tǒng)計學(xué)功底較弱的環(huán)境工作者提供了技術(shù)支持。

        目前關(guān)于生態(tài)風(fēng)險評價的軟件主要集中在SSD的構(gòu)建和環(huán)境標(biāo)準(zhǔn)(HC5)的推導(dǎo),如CSIRO開發(fā)的BurrlizO[9],U.S.EPA開發(fā)的SSD Generator和Kon等開發(fā)的MOSAIC_SSD[10]等。這些軟件雖然可以讓使用者方便地得到SSD和HC5,但并沒有與污染物的環(huán)境監(jiān)測數(shù)據(jù)相結(jié)合,無法進(jìn)行污染物的概率生態(tài)風(fēng)險評價。本文給出的Matlab函數(shù)“PERA”只需要使用者具有污染物的毒性數(shù)據(jù)和環(huán)境監(jiān)測數(shù)據(jù),就可以方便地得到聯(lián)合概率曲線JPC和污染物的總體風(fēng)險概率ORP。雖然RIVM開發(fā)的軟件ETX 2.0也可以給出JPC和ORP,但該軟件中的SSD模型只能選Log-normal[8],而本文所給函數(shù)中的SSD模型有Log-normal和Log-logistic兩種選擇。另外,本文所給Matlab函數(shù)的開源代碼,使用者可以對其作適當(dāng)增加或修改(如增加或修改SSD模型的概率分布類型等),較ETX2.0更具靈活性。目前關(guān)于SSD的軟件主要是基于Excel表格和專業(yè)統(tǒng)計軟件R開發(fā)的,尚未有基于Matlab的程序或函數(shù),本文首次給出了基于SSD的概率生態(tài)風(fēng)險評價的Matlab函數(shù)“PERA”,為污染物的生態(tài)風(fēng)險評價提供進(jìn)一步的技術(shù)支持。

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