孫 科,耿鳳英,于秋菊,王 鋒
(徐州生物職業(yè)技術(shù)學(xué)院 藥品食品學(xué)院,江蘇 徐州 221006)
牛蒡(Arctium lappcL.)為菊科(Compositae)牛蒡?qū)伲⊿ynurus)植物,是一種典型的藥食同源植物[1],含有蛋白質(zhì)、菊糖、多種維生素和礦物質(zhì),其中胡羅素含量是胡蘿卜的150倍,蛋白質(zhì)和鈣含量是根莖類植物之冠,具有降血壓、降血脂、抗病毒、抗腫瘤等作用[2]。中國牛蒡產(chǎn)量居世界第一[3],而徐州市豐縣年產(chǎn)牛蒡28萬t,年銷售收入20億元,因此,徐州豐縣有“牛蒡之鄉(xiāng)”之稱[4]。
鉀是植物生長需要量最大的三大類必需營養(yǎng)元素之一,地殼中鉀元素含量約占2.47%,但是土壤中92%~98%的鉀是以礦物質(zhì)鉀形式存在的[5],是植物不能直接利用的。我國是一個土壤缺鉀嚴(yán)重的國家,目前約有0.3億hm2土地缺鉀[6],并且我國鉀肥的儲量較小、開發(fā)難度大,每年需要大量進(jìn)口鉀肥。以江蘇為例,江蘇每年大約需要鉀肥10萬t,但江蘇自給的鉀肥僅有0.15萬t,其余需要從俄羅斯等國進(jìn)口[7]。轉(zhuǎn)化土壤中的無效鉀,提高土壤中有效鉀含量,是解決我國土壤缺鉀的一個有效途徑。土壤中存在一些通過自身的代謝作用,能夠把無效鉀轉(zhuǎn)化為植物可以直接吸收利用的有效鉀的微生物,稱其為解鉀菌(postassium bacteria)。60多年前,前蘇聯(lián)科學(xué)家亞歷山大羅夫[8]第一次發(fā)現(xiàn)硅酸鹽細(xì)菌以來,解鉀菌的研究從未間斷過并取得一定的進(jìn)展。盛下放等[9]分離篩選到一株高效的解鉀菌NBT,解鉀率達(dá)到226.0%,大田試驗(yàn)顯示對棉花有一定的增產(chǎn)作用;SUGUMARAN P等[10]篩選得到一株解鉀菌,可使土壤中有效鉀質(zhì)量濃度達(dá)到99.60 mg/kg,植物干質(zhì)量增加125%。
目前,關(guān)于解鉀菌報道較多,但解鉀菌的絕對解鉀量仍然不高,針對牛蒡?qū)S媒忖浘难芯窟€沒有報道。因此,本研究從牛蒡根際土壤中分離篩選解鉀菌,通過形態(tài)觀察、生理生化試驗(yàn)及分子生物學(xué)技術(shù)對其進(jìn)行菌種鑒定,并通過單因素試驗(yàn)和響應(yīng)面試驗(yàn)對其解鉀條件進(jìn)行優(yōu)化,最后,通過牛蒡盆栽試驗(yàn)驗(yàn)證其促生能力,為牛蒡?qū)S糜袡C(jī)肥提供解鉀微生物菌劑。
1.1.1 材料
通過5點(diǎn)取樣法在徐州市豐縣牛蒡標(biāo)準(zhǔn)化種植基地采集牛蒡根際5~15 cm深土壤樣本,采集后混勻裝入無菌牛皮紙袋密封,貼上標(biāo)簽,4 ℃保存。
1.1.2 試劑
FeCl3、CaCO3、MgSO4·7H2O、Na2HPO4(均為分析純):格里斯(天津)醫(yī)藥化學(xué)技術(shù)有限公司;酵母浸膏、蔗糖、瓊脂(均為生化試劑):北京陸橋技術(shù)股份有限責(zé)任公司;鉀長石粉(K2O≥10%):江西佳利生化高科有限公司;Taq聚合酶(2.5 U/μL)、脫氧核糖核酸(deoxyribonucleic acid,DNA)Marker、聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)(polymerase chain reaction,PCR)產(chǎn)物純化試劑盒:上海生工生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司。
1.1.3 培養(yǎng)基
初篩培養(yǎng)基[11]:FeCl30.005 g/L,CaCO30.1 g/L,Na2HPO42.0 g/L,MgSO4·7H2O 0.5 g/L,(NH4)2SO41.0 g/L,蔗糖5.0 g/L,鉀長石粉(去離子水浸泡過夜,反復(fù)沖洗8~10次,陰干,去除可溶性鉀)1.0 g/L,瓊脂18 g/L,蒸餾水1 000 mL,pH值7.0~7.5。121 ℃高壓蒸汽滅菌20 min。
種子液培養(yǎng)基[12]:NaCl 0.1 g/L,(NH4)2SO41.0 g/L,CaCO31.0 g/L,K2HPO42.0 g/L,MgSO4·7H2O 0.5 g/L,蔗糖10 g/L,酵母膏0.5 g/L,蒸餾水1 000 mL,pH 7.4。121 ℃高壓蒸汽滅菌20 min。固體培養(yǎng)基中添加瓊脂粉20 g/L。
發(fā)酵培養(yǎng)基[13]:NaCl 0.1 g/L,CaCO31.0 g/L,(NH4)2SO41.0 g/L,Na2HPO42.0 g/L,MgSO4·7H2O 0.5 g/L,蔗糖10.0 g/L,酵母膏0.5 g/L,鉀長石粉(去離子水浸泡過夜,反復(fù)沖洗8~10次,陰干,去除可溶性鉀)10.0 g/L,蒸餾水1 000 mL,pH 7.4。121 ℃高壓蒸汽滅菌20 min。
改良LB液體培養(yǎng)基[14]:NaCl 10.0 g/L,L-色氨酸0.5 g/L,酵母提取物5.0 g/L,胰蛋白胨10.0 g/L,雙蒸水1 000 mL;pH 6.8~7.2。121 ℃高壓蒸汽滅菌20 min。
HZ-124/85S半微量電子天平:上海諾宣科學(xué)儀器有限公司;HNY-200B恒溫?fù)u床:上海喬躍電子科技有限公司;LH-PYX3M生化培養(yǎng)箱:常州金南儀器制造有限公司;VD-850臺式超凈工作臺:杭州旭清科技有限公司;MG96G型基因擴(kuò)增儀:北京君意東方電泳設(shè)備有限公司;XW-80A漩渦混合器:廣森實(shí)驗(yàn)器材有限公司;TDZ4離心機(jī):青島諾凱達(dá)機(jī)械制造有限公司;UV2800S紫外分光光度計:上海力辰儀器科技有限公司;ICP-5000電感耦合等離子體發(fā)射光譜(inductivelycoupled plasma-optical emission spectrometer,ICP-OES)儀:北京吉天儀器有限公司。
1.3.1 牛蒡根際土壤中解鉀菌的初篩
稱取10 g牛蒡根際土壤,加入90 mL無菌去離子水中充分振蕩,采用10倍梯度稀釋至10-6,制備土壤懸液。取稀釋度為10-4、10-5、10-6的土壤懸液各100 μL均勻涂布于初篩培養(yǎng)基,每個濃度做3個平行,30 ℃倒置培養(yǎng)60 h。挑選菌落直徑大、圓形、表面濕潤的單菌落進(jìn)行劃線純化,直至顯微觀察得到純菌種。
1.3.2 牛蒡根際土壤中解鉀菌的復(fù)篩
(1)有效鉀含量的測定
挑取初篩解鉀菌菌落接種到種子培養(yǎng)基,在37 ℃、200 r/min條件下培養(yǎng)至菌體濃為108CFU/mL作為種子液。按5%(V/V)的接種量將種子液接種于發(fā)酵培養(yǎng)基,30 ℃、200 r/min條件下培養(yǎng)6 d,以等量滅菌的種子液為對照組,每個菌落做3個平行。采用過氧化氫灰化法處理發(fā)酵液,利用電感耦合等離子體發(fā)射光譜(ICP-OES)儀測定處理后發(fā)酵液中鉀離子含量[15],并計算有效鉀的相對增加率,其計算公式如下:
a=(ρ1-ρ0)/×100%[15]
式中:a:有效鉀增加率,%;ρ1:試驗(yàn)組發(fā)酵液中有效鉀含量,mg/L;ρ0:對照組發(fā)酵液中有效鉀含量,mg/L。
(2)解鉀菌分泌吲哚乙酸(indole-3-acetic acid,IAA)能力的測定
挑取初篩解鉀菌菌落接種到改良的LB液體培養(yǎng)基,37℃、200r/min條件下恒溫振蕩培養(yǎng)48h。取發(fā)酵液,10000r/min離心20 min,取上清液50 μL加入等體積Sackowchi's顯色劑,倒在白瓷板上避光觀察,30 min出現(xiàn)粉紅色為陽性,表示該菌株可以分泌吲哚乙酸(IAA)[16]。以接種滅活解鉀菌培養(yǎng)液為對照,取上述陽性菌株混合液,測定波長530 nm處的吸光度值,計算陽性解鉀菌株分泌IAA的量[17]。
1.3.3 解鉀菌株的鑒定
形態(tài)觀察[18]:借助顯微鏡進(jìn)行菌株的形態(tài)特征觀察和菌落特征觀察。
生理生化特性鑒定:參考文獻(xiàn)[18-19]進(jìn)行生理生化試驗(yàn)。
16S rDNA序列分析[20]:利用細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒提取解鉀菌株的DNA,以其為模板,使用通用引物F(5'-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3')和R(5'-GGTTACCTTGTTACGACTT-3')PCR擴(kuò)增16S rDNA基因。PCR擴(kuò)增體系(20 μL):10×PCR緩沖液2 μL,模板DNA 20 μL,脫氧核糖核苷三磷酸(deoxy-ribonucleoside triphosphates,dNTPs)(10 mmo/L)0.45 μL,上、下游引物(20 μg/L)各0.25 μL,TaqDNA聚合酶(5 U/μL)0.4 μL,加雙蒸水(ddH2O)至終體積。PCR擴(kuò)增程序:95 ℃預(yù)變性5 min;95 ℃變性30 s,55.5 ℃退火45 s,72 ℃延伸2 min,共35個循環(huán);72 ℃最后延伸10 min。回收瓊脂糖凝膠PCR克隆片段連接到T載體,送至南京世和基因生物技術(shù)有限公司進(jìn)行基因測序,測序結(jié)果提交至美國國立生物技術(shù)信息中心(national center for biotechnology information,NCBI)的GenBank數(shù)據(jù)庫進(jìn)行BLAST比對搜索,選取同源性較高的模式菌株的16S rDNA,利用Mega 6軟件中的鄰接(neighbor-joining,NJ)法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。
1.3.4 解鉀菌株解鉀條件優(yōu)化
(1)單因素試驗(yàn)
考察初始pH值(2.0、3.0、4.0、5.0、6.0、7.0、8.0、9.0)、發(fā)酵溫度(25 ℃、26 ℃、27 ℃、28 ℃、29 ℃、30 ℃、31 ℃、32 ℃)、接種量(1%、2%、3%、4%、5%、6%、7%、8%(V/V))、培養(yǎng)時間(12 h、16 h、20 h、24 h、28 h、32 h、36 h、40 h)對可溶性鉀含量的影響,每個試驗(yàn)做3個平行。
(2)響應(yīng)面試驗(yàn)
根據(jù)單因素試驗(yàn)結(jié)果,以發(fā)酵溫度(X1)、初始pH值(X2)、接種量(X3)和發(fā)酵時間(X4)為自變量,以可溶性鉀含量(Y)為響應(yīng)值,進(jìn)行中心組合響應(yīng)面試驗(yàn),試驗(yàn)設(shè)計因素與水平見表1。
表1 解鉀條件優(yōu)化響應(yīng)面試驗(yàn)因素與水平Table 1 Factors and levels of response surface tests for potassium-dissolving conditions optimization
1.3.5 盆栽試驗(yàn)
對解鉀能力優(yōu)化后的菌株進(jìn)行盆栽試驗(yàn),選用0~25 cm耕層的土壤,將土壤風(fēng)干粉碎后,裝入花盆中(底直徑25 cm,高29 cm),每盆裝3 kg,共裝20盆。將20盆土壤隨機(jī)分成2組(實(shí)驗(yàn)組和對照組)。實(shí)驗(yàn)組將發(fā)酵原液加入適量無菌水稀釋,把牛蒡種子浸入稀釋液中1~2 h,陰干后播種,剩余的稀釋液播種時一起施入土壤。對照組用等量的無菌水處理。30 d后測量牛蒡的株高、莖的直徑、葉片數(shù)和地上部分鮮質(zhì)量。
1.3.6 數(shù)據(jù)處理
使用軟件Design Expert 8.0.6[21]對試驗(yàn)結(jié)果數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計分析。
通過初篩共獲得36株具有解鉀能力的菌株。挑選直徑較大、圓形、表面濕潤的9個菌落進(jìn)行復(fù)篩,對菌株進(jìn)行編號,分別為PB-1、PB-2、PB-3、PB-4、PB-5、PB-6、PB-7、PB-8和PB-9,測定每株解鉀菌發(fā)酵液中的有效鉀含量,同時測定IAA產(chǎn)量,每株解鉀菌做3個平行,結(jié)果分別見表2和表3。
表2 9株菌株解鉀率的測定結(jié)果Table 2 Determination results of potassium-dissolving rates of 9 strains
表3 9株菌株產(chǎn)泌吲哚乙酸能力的測定結(jié)果Table 3 Determination results of indole-3-acetic acid production capacity of 9 strains
由表2可知,9株解鉀菌解鉀率較高,可溶性鉀的增加率在116%~136%之間,其中菌株P(guān)B-9發(fā)酵液中可溶性鉀的增加率最高,達(dá)到136%。比李新新等[22]篩選的類芽孢桿菌屬解鉀菌G4可溶性鉀增加率(127.6%)、李海龍等[23]分離篩選出的芽孢桿菌QL21的可溶性鉀增加率(25.1%)高。由表3可知,9株解鉀菌在改良LB液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)24 h后,有7株菌株可以產(chǎn)IAA,其中菌株P(guān)B-9產(chǎn)IAA的能力最強(qiáng),IAA產(chǎn)量達(dá)到38.64 mg/L。因此,選取菌株P(guān)B-9為研究對象,進(jìn)行下一步研究。
2.2.1 形態(tài)學(xué)鑒定
菌株P(guān)B-9在種子固體培養(yǎng)基上培養(yǎng)48 h后,菌落及細(xì)胞形態(tài)見圖1。由圖1a可知,菌株P(guān)B-9的菌落呈圓形,不透明,乳白色,表明光滑、隆起,邊緣濕潤。由圖1b可知,菌株P(guān)B-9革蘭氏染色陽性,多呈棒狀,單個或呈短鏈排列,大小約(1.2~1.5)μm×(2.0~4.0)μm,有芽孢、菌毛,有鞭毛,能運(yùn)動。
圖1 菌株P(guān)B-9的菌落(a)及細(xì)胞(b)形態(tài)Fig.1 Colony (a) and cell (b) morphology of strain PB-9
2.2.2 生理生化特征鑒定
表4 菌株P(guān)B-9的生理生化特性Table 4 Biophysical and biochemical characteristics of strain PB-9
由表4可知,菌株P(guān)B-9的生理生化特性與巨大芽孢桿菌的生理生化特性相同,結(jié)合菌落特征和顯微特征,初步鑒定該菌株為巨大芽孢桿菌(Bacillus megateriums)。
2.2.3 分子生物學(xué)鑒定
由圖2可知,菌株P(guān)B-9與巨大芽孢桿菌(Bacillus megaterium)(GenBank:DQ462195)聚于一支,親緣關(guān)系最近。結(jié)合菌株P(guān)B-9的菌落特征、顯微觀察特征和生理生化特性,將菌株P(guān)B-9鑒定為巨大芽孢桿菌(Bacillus megaterium)。對于解鉀菌的系統(tǒng)發(fā)育分類地位,得到國際公認(rèn)的菌種包括:土壤芽孢桿菌(Bacillus edaphicus)[24]、環(huán)狀芽孢桿菌(Bacillus edaphicus)[25]、膠質(zhì)芽孢桿菌(Bacillus mucilagionsus)[26]。但是,隨著國內(nèi)外研究者對解鉀菌的深入研究,目前解鉀菌的種類出現(xiàn)了多樣化趨勢:陳宇豐等[27]從香蕉根際土壤中分離篩選出一株高效解鉀菌,經(jīng)鑒定為陜西鏈霉菌(Streptomyeces shaanxiensis);張朝輝等[28]從烤煙根際分離得到一株解鉀菌K03,通過形態(tài)觀察、生理生化特征及16S rDNA序列分析,鑒定為阿氏腸桿菌(Enterobacter asburiae)。姜霽航等[29]從蘋果根際土壤分離得到5株解鉀能力較強(qiáng)的菌株,經(jīng)鑒定1株為不動桿菌屬(Acinetobactersp.)、3株為假單胞菌屬(Pseudomonassp.)、1株為芽孢桿菌屬(Bacillussp.)。
圖2 基于16S rDNA基因序列菌株P(guān)B-9的系統(tǒng)進(jìn)化樹Fig.2 Phylogenetic tree of strain PB-9 based on 16S rDNA gene sequences
2.3.1 解鉀條件優(yōu)化單因素試驗(yàn)結(jié)果
由圖3可知,可溶性鉀含量隨著發(fā)酵溫度的升高呈先增大后減小的趨勢,當(dāng)發(fā)酵溫度為31 ℃時,可溶性鉀含量(36.28 mg/L)最大,表明31 ℃是菌株P(guān)B-9解鉀的最適溫度。原因可能是溫度會影響菌株P(guān)B-9細(xì)胞內(nèi)酶的活性,溫度31 ℃時菌株P(guān)B-9細(xì)胞內(nèi)酶活性最高,所以菌株解鉀能力最強(qiáng)。可溶性鉀含量隨著初始pH值的升高呈先增大后減小的趨勢,當(dāng)初始pH值為6.0時,可溶性鉀含量(33.16 mg/L)最大,表明初始pH值6.0是菌株P(guān)B-9解鉀的最適初始pH值。原因可能是環(huán)境中的pH值會影響菌株細(xì)胞內(nèi)的pH值,菌株細(xì)胞內(nèi)的pH值也會影響酶的催化活性,從而影響菌株的解鉀能力??扇苄遭浐侩S著接種量的增大呈先增大后減小的趨勢,當(dāng)接種量為7.0%時,可溶性鉀含量(36.19 mg/L)最大,表明菌株P(guān)B-9解鉀的最佳接種量為7.0%。原因可能是當(dāng)接種量過小時,達(dá)到最大解鉀能力需要時間較長,當(dāng)接種量較大時,菌種之間形成競爭過于激烈,同樣不利于解鉀??扇苄遭浐侩S著發(fā)酵時間的延長呈先增大后減小的趨勢,當(dāng)發(fā)酵時間為55 h時,可溶性鉀含量(36.16 mg/L)最大,這與菌種本身的遺傳特性及培養(yǎng)基豐富程度等因素有關(guān)。
圖3 不同培養(yǎng)條件對菌株P(guān)B-9解鉀能力的影響Fig.3 Effect of different culture conditions on potassium-solubilizing ability of strain PB-9
2.3.2 解鉀條件優(yōu)化響應(yīng)面試驗(yàn)結(jié)果
根據(jù)單因素試驗(yàn)結(jié)果,以發(fā)酵溫度(X1)、初始pH值(X2)、接種量(X3)和發(fā)酵時間(X4)為自變量,以可溶性鉀含量(Y)為響應(yīng)值,進(jìn)行中心組合響應(yīng)面試驗(yàn),響應(yīng)面試驗(yàn)結(jié)果與分析見表5,方差分析見表6。
表5 菌株P(guān)B-9解鉀條件優(yōu)化響應(yīng)面試驗(yàn)結(jié)果與分析Table 5 Results and analysis of response surface tests for potassium-dissolving conditions optimization
對表6結(jié)果進(jìn)行多元回歸擬合,得到的回歸方程如下:
表6 響應(yīng)面試驗(yàn)結(jié)果方差分析Table 6 Variance analysis of response surface test results
由表7可知,模型極顯著(P<0.01),失擬項不顯著(P>0.05),說明模型可靠。一次項及二次項均對結(jié)果影響極顯著(P<0.01),交互項對結(jié)果影響不顯著(P>0.05)。對以上回歸方程求解可得出:X1=30.86、X2=6.76、X3=6.58、X4=52.61。也就是當(dāng)發(fā)酵溫度為30.86 ℃、初始pH值為6.76、接種量為6.58%和發(fā)酵時間為52.61 h,可溶性鉀含量最高。結(jié)合實(shí)際情況,最終確定最優(yōu)的發(fā)酵條件為發(fā)酵溫度31 ℃、初始pH值6.8、接種量6.6%和發(fā)酵時間53 h,可溶性鉀含量理論值36.28 mg/L,增長率136.24%。
為了檢驗(yàn)?zāi)P偷臏?zhǔn)確性,在最優(yōu)條件下進(jìn)行驗(yàn)證試驗(yàn),結(jié)果可溶性鉀含量實(shí)際值為38.46 mg/L,與理論值相差較小。由此可以看出預(yù)測模型可以很好預(yù)測菌株P(guān)B-9實(shí)際發(fā)酵情況。
盆內(nèi)種植牛蒡,一組盆內(nèi)接種PB-9菌液,另一組為等量清水(CK)。30 d后測定牛蒡的生長參數(shù),結(jié)果見表7。
表7 菌株P(guān)B-9對牛蒡生長的影響Table 7 Effect of strain PB-9 on the growth of burdock
由表7可知,與對照(CK)組相比,牛蒡生長的各項參數(shù)除了莖直徑差異不顯著(P>0.05)外,其他各項指標(biāo)都有顯著差異(P<0.05)。接菌組牛蒡的株高、葉片數(shù)、地上部分鮮質(zhì)量比CK組分別高25.78%、28.48%、26.54%。所以,菌株P(guān)B-9可以明顯的促進(jìn)牛蒡的生長。原因主要是菌株P(guān)B-9除了具有較強(qiáng)的解鉀作用,還可以分泌IAA,并且能降低土壤pH值抑制有害微生物生長和提高土壤中可溶性鉀的含量。
本研究從徐州豐縣牛蒡種植標(biāo)準(zhǔn)區(qū)牛蒡土壤中初篩出具有較強(qiáng)解鉀能力微生物9株,通過測定發(fā)酵液中可溶性鉀含量及IAA生產(chǎn)能力,復(fù)篩選出1株解鉀能力和產(chǎn)IAA能力都是最強(qiáng)的菌株P(guān)B-9。利用形態(tài)觀察、生理生化特性測定和16S rDNA基因序列分析,鑒定菌株P(guān)B-9為巨大芽孢桿菌(Bacillus megateriums)。通過單因素試驗(yàn)和響應(yīng)面試驗(yàn)確定菌株P(guān)B-9的最優(yōu)解鉀條件為培養(yǎng)溫度31 ℃、初始pH值6.8、接種量6.6%和培養(yǎng)時間為53 h,在此最優(yōu)條件下,可溶性鉀含量為38.46mg/L,增長率為136.24%。最后,通過牛蒡盆栽試驗(yàn)驗(yàn)證菌株P(guān)B-9促生能力,結(jié)果顯示接菌組牛蒡的株高、葉片數(shù)和地上部分鮮質(zhì)量比CK組分別高25.78%、28.48%、26.54%,對牛蒡的生長具有顯著的促進(jìn)作用(P<0.05)。