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        金絲猴毛首線蟲線粒體cox1 基因序列分析

        2020-11-03 13:04:20李向勇李春輝粟玉剛隆雪明
        中國動物檢疫 2020年11期

        李向勇,李春輝,粟玉剛,范 鐵,隆雪明

        (1.長沙生態(tài)動物園,湖南長沙 410118;2.長沙市農業(yè)綜合行政執(zhí)法局,湖南長沙 410013;3.湖南省獸藥飼料監(jiān)察所,湖南長沙 410006)

        毛首線蟲(或毛尾線蟲)也稱為鞭蟲(whipworm),屬于毛尾目(Trichurata)、毛尾科(Trichuridae)、毛尾屬(Trichuris),成蟲寄生于人與動物的盲腸[1-2]。毛首線蟲?。╰richuriasis)是人與動物常見的寄生蟲病,呈世界性分布,多分布于熱帶地區(qū)(包括中國),是一種容易被忽視的熱帶寄生蟲病[3]。據報道[4-5],全球毛首線蟲感染人數為(6.04~7.95)億。金絲猴(Rhinopithecus roxellana)是我國特有的動物,被我國政府和《瀕危野生動植物種國際貿易公約》(CITES)列為一級保護物種[6],被列入國際自然保護聯盟(IUCN)瀕危物種紅色名錄中的瀕危物種。現如今,金絲猴種群繁衍除了面臨棲息地被侵犯外,還有來自病毒和毛首線蟲的感染困擾[7]。因此,正確鑒定毛首線蟲種類,不僅具有重要學術價值,而且對預防和控制毛首線蟲病也具有重要的社會和經濟意義。

        毛首線蟲的種內鑒定一直是國際性難題。毛首線蟲具有特殊的外形,雖然很容易鑒定到屬,但是種內鑒定只能靠蟲體大小、交合刺長度、交合刺鞘以及蟲卵等形態(tài)學特征進行鑒定[8]。當遇到形態(tài)相似性較高的蟲體和蟲卵時,傳統(tǒng)的形態(tài)學鑒定具有很大的局限性。如今,選用合適的基因分子標記,是寄生蟲分子分類學的首要任務。線粒體DNA(mtDNA)具有進化速度快、基因突變率高、母性遺傳等特點,是研究寄生蟲系統(tǒng)發(fā)生學、群體遺傳學和分子分類的理想分子標記[9-11]。而線粒體細胞色素c 氧化酶Ⅰ亞基(cox1)基因作為編碼基因,進化速度快,以母系遺傳為主,且不受基因重組、易位等激變影響,被國際DNA 條形碼聯盟推薦為首選基因[12]。本研究以采自長沙生態(tài)動物園金絲猴體內的毛首線蟲作為研究對象,通過PCR 擴增其部分cox1基因(pcox1)序列并進行分析,從而明確金絲猴毛首線蟲線粒體cox1基因部分序列能否成為理想的種間遺傳標記,旨在為今后金絲猴毛首線蟲的分類、鑒別及本病的防治等奠定基礎。

        1 材料與方法

        1.1 蟲體樣品

        本試驗研究的6 條金絲猴毛首線蟲樣品于2017 年采自長沙生態(tài)動物園(金絲猴2016 年從上海野生動物園引進),樣品代碼標記為B-1、B-2、B-3、B-4、B-5、B-6。

        1.2 主要試劑

        蛋白酶K,購自Merck 公司;WizardTMDNA Clean-up System 試劑盒,購 自Promega 公 司;EmeraldAmp Max HS PCR Master Mix、DL 2 000 DNA Marker,均購自TaKaRa 公司。

        1.3 樣品DNA 制備

        先利用解剖顯微鏡觀察蟲體樣品的形態(tài)學結構,并用高清照相機拍下蟲體圖片進行初步形態(tài)學鑒定。樣品保存于裝有70%酒精的玻璃瓶中,置于-20 ℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

        從70%的酒精保存液中取出單個蟲體,用雙蒸水反復吹打沖洗3 次后,置于新的1.5 mL Eppendorf 管中;用滅菌的微型剪刀將蟲體組織剪碎,并反復研磨,然后根據WizardTMDNA Cleanup System 試劑盒說明書添加消化體系與20 μL 蛋白酶K;混勻后,放于55 ℃恒溫水浴箱中消化15~18 h;將消化好的混懸液再根據說明書提取蟲體DNA,DNA 樣品分裝后置于-20 ℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.4 PCR 擴增pcox1 基因

        根據Bowles等[13]報道的引物JB3 和JB4.5(JB3:5'-TTTTTTGGGCATCCTGAGGTTTAT-3',24 bp;JB4.5:5'-TAAAGAAAGAACATAATGAAAATG-3',24 bp)來擴增線粒體pcox1,隨后將引物交予生工生物工程(上海)股份有限公司合成。擴增體系為25μL:上下游引物各0.5 μL,模板DNA 1 μL,雙蒸水10.5 μL,EmeraldAmp Max HS PCR Master Mix 12.5 μL。PCR 過程:94 ℃預變性5 min;94 ℃變性30 s,55 ℃退火30 s,72 ℃延伸1 min,共36 個循環(huán);最后72 ℃延伸5 min。取5 μL PCR 產物進行1%TAE 瓊脂糖凝膠電泳,用Good View Nucleic Acid Stain 染色,紫外投射儀下觀察結果,凝膠成像系統(tǒng)攝像。

        1.5 pcox1 基因序列測定及系統(tǒng)發(fā)育樹構建

        將PCR 產物送至生工生物工程(上海)股份有限公司測序,測序結果用DNAstar 5.0 軟件分析,從GenBank 檢索現有毛尾科毛首線蟲屬毛首線蟲的cox1基因序列(表1),然后與之進行相似性比對并構建毛首線蟲系統(tǒng)發(fā)育樹,以旋毛蟲(Trichinella spiralis,KU321696.1)作為外群,利用ClustalX 1.81 及Mega 5.0 軟件對獲得的序列和GenBank 的毛首線蟲pcox1部分序列進行比對及遺傳距離計算,同時利用Mega5.0 程序中的鄰位相連法(Neighbor-Joining,NJ)反復運算1 000 次,選取最佳模型,繪制種系發(fā)育樹。

        表1 代表性的毛首線蟲cox1 序列信息

        2 結果與分析

        2.1 形態(tài)學檢查

        顯微鏡下觀察到雄蟲交合刺(圖1)和蟲卵(圖2),經反復對照文獻和寄生蟲圖譜結合蟲體照片(圖3~4),初步確定為金絲猴毛首線蟲(Trichuris rhinopiptheroxella)。

        圖1 雄蟲交合刺

        圖2 蟲卵

        2.2 PCR 擴增

        經PCR 擴增,6 個樣品均成功擴增出長度為411 bp 的基因片段,與預期pcox1基因目的片段長度相符,且無非特異性條帶,空白對照為陰性(圖5)。

        圖3 雌蟲局部

        圖4 蟲體

        圖5 毛首線蟲線粒體pcox1 基因PCR 擴增結果

        2.3 測序及分析

        擴增所獲得的pcox1序列減除引物后長度一致,均為411 bp。將所測得的6 個樣本個體的pcox1序列進行種內比較,結果發(fā)現這些樣本的pcox1序列完全一致,無種內變異。序列中A、G、T、C 含量分別為26.52%、18.73%、36.74%、18.00%。其中A+T 含量(63.26%)明顯高于C+G含量(36.74%)。pcox1基因序列種間分析結果顯示,種間差異較大,差異率為24.0%~34.1%。

        2.4 cox1 基因序列系統(tǒng)發(fā)生樹

        采用NJ 法構建系統(tǒng)發(fā)生樹(圖6)。由圖6 可知,6 個樣本與GenBank 檢索到的Trichuris rhinopiptheroxella處于同一分支,同源性為100%,所在分支與其他毛首線蟲所在分支距離較遠。

        3 討論

        圖6 基于cox1 基因序列以NJ 法所構建的金絲猴毛首線蟲系統(tǒng)進化樹

        寄生蟲的準確分類鑒定對寄生蟲病防治具有重要意義。但單靠傳統(tǒng)的形態(tài)學方法已經不能準確高效地進行寄生蟲分類鑒定。形態(tài)學分類方法存在一定局限性,尤其對于相似種或者近緣種,很難從形態(tài)上進行區(qū)分,而分子生物學的發(fā)展很好地解決了這一問題。線粒體cox1作為線粒體編碼基因,具有母系遺傳、進化速度快、受基因突變影響小等特點,被很多專家學者認為是種內遺傳學、分子分類學、分子進化學等學科理想的遺傳標記[14-17]。

        本研究以長沙生態(tài)動物園金絲猴體內采集的毛首線蟲為樣本進行序列比對。發(fā)現分離的6 條金絲猴毛首線蟲種內相似性很高(100%),同時與GenBank 上檢索的Trichuris rhinopiptheroxella相似性也為100%,而與其他毛首線蟲種間差異較大,為24.0%~34.1%。系統(tǒng)發(fā)育分析結果顯示,毛首線蟲分離株與GenBank 上檢索的Trichuris rhinopiptheroxella處于同一分支,而與其他毛首線蟲分枝相隔較遠。依此判定,此次在長沙生態(tài)動物園金絲猴體內采集的毛首線蟲均為Trichuris rhinopiptheroxella。此次研究結果充分說明毛首線蟲的cox1基因序列種內保守而種間差異大,可以作為毛首線蟲分類學理想的遺傳標記,還為進一步研究毛首線蟲的群體遺傳結構奠定了基礎。

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