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        單重PCR 鑒別犬4 種布魯氏菌檢測方法的建立

        2020-11-03 13:04:18徐懷英黃迪海郝文娟盛曉丹秦卓明
        中國動物檢疫 2020年11期
        關鍵詞:檢測

        徐懷英,黃迪海,仉 偉,郝文娟,盛曉丹,秦卓明,2

        (1.山東省農業(yè)科學院家禽研究所,山東濟南 250100;2.山東省健牧生物藥業(yè)有限公司,山東濟南 250100;3.濟南市動物生物藥品工程技術研究中心,山東濟南 250100;4.濟南市動物園服務中心,山東濟南 250031)

        布魯氏菌?。╞rucellosis)是一種人獸共患病,由布魯氏菌屬細菌侵入宿主機體引起,其臨床發(fā)病特點為被感染人和動物長期發(fā)熱、多汗、關節(jié)痛以及肝脾腫大等,且可引起生殖系統(tǒng)疾病,公共衛(wèi)生意義巨大。

        布魯氏菌屬的4 個種均可以感染犬,包括:羊種布魯氏菌(B.melitensis)、牛種布魯氏菌(B.abortus)、豬種布魯氏菌(B.suis)和犬種布魯氏菌(B.canis)[1]。犬種布魯氏菌生長菌落為天然粗糙型,而牛種、羊種、豬種布魯氏菌生長菌落一般是光滑型。由犬種布魯氏菌引起的犬布魯氏菌病稱為最適寄生型,由其他3 種布魯氏菌引起的犬布魯氏菌病稱為轉移型。在牧區(qū),由于犬多為散養(yǎng),生食病死畜禽現象普遍存在,犬布魯氏菌感染率較高,抗體陽性率介于8.16%~42.65%[2-3]。2016—2017 年的濟南市寵物犬布魯氏菌病血清學調查結果顯示,光滑型布魯氏菌抗體陽性率為8.76%,粗糙型布魯氏菌為1.99%[4],表明在寵物犬中存在不同程度的布魯氏菌感染,潛在傳播風險較大。

        聚合酶鏈式反應(PCR)是一種快速、特異、敏感的分子檢測方法。我國已經建立了Bruce-Ladder PCR 檢測布魯氏菌的國家診斷技術標準(GB/T 18646—2018),但該方法需要首先對病原菌進行分離和純培養(yǎng),不適宜在基層推廣應用。本研究根據粗糙型布魯氏菌wbkD及wbkF基因序列缺失351 bp 的特點[5],通過設計1 對引物并優(yōu)化反應條件建立了PCR 檢測方法。該方法可同時鑒別診斷4 種布魯氏菌(犬種、牛種、羊種和豬種),既適用于病原菌的純培養(yǎng)物,又適合于感染犬的血液、流產或排泄物樣品的檢測,且能一次性區(qū)分光滑型(牛種、羊種和豬種)和粗糙型(犬種)布魯氏菌,適合于基層推廣和應用。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 菌株B.abortus、B.melitensis、B.suis和B.canis滅活菌液,由中國獸醫(yī)藥品監(jiān)察所丁家波研究員惠贈;大腸桿菌及沙門氏菌,由山東省農業(yè)科學院家禽研究所保存。

        1.1.2 犬布魯氏菌陽性血液樣品。經布魯氏菌虎紅平板凝集試驗抗原檢測為陽性的20 份犬布魯氏菌血液樣品。

        1.1.3 主要試劑及儀器 10×PCR Buffer、TaqDNA 聚合酶、dNTP,均購自湖南艾科瑞生物工程有限公司;DL 2 000 bp DNA Marker、DL 1 000 bp DNA Marker,均購自寶生物(北京)有限公司;細菌基因組DNA 提取試劑盒,購自天根生化科技(北京)有限公司;瓊脂糖,購自Biowest公司;NanoDropTMOne/OneC 超微量紫外分光光度計、PCR 儀,均購自Thermo Fisher 公司;Tanon 1600 凝膠圖像分析系統(tǒng),購自上海天能科技有限公司。

        1.2 方法

        1.2.1 細菌基因組DNA 的提取 按照細菌基因組DNA 提取試劑盒說明書,提取上述細菌的基因組DNA,-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.2.2 引物設計 下載GenBank 中登錄的B.abortus、B.melitensis、B.suis和B.canis基因組序列并進行比對,根據B.canis基因組中wbkD、wbkF基因序列差異,應 用Primer Premier 5.0 軟件設計1 對引物(BF:5'-TCTA TTATTACGGACGGCTGGCTGAG-3';BR:5'-GTGGTGGCCCATGTGGCGCTT-3')。引物送北京六合華大基因科技股份有限公司合成。其中,牛種、羊種、豬種布魯氏菌目的片段長度預計均為717 bp;犬種布魯氏菌缺失351 bp,目的片段長度預計為366 bp。

        1.2.3 反應體系建立及條件優(yōu)化 PCR反應體系為:10×PCR Buffer 0.25 μL,dNTP(10 mmol/L)1 μL,待檢DNA 模板2 μL,引物BF 和BR(10 mmol/L)各1 μL,TaqDNA 聚合酶(5 U/μL)0.25 μL,最后用RNA-free 補足反應體系至25 μL。PCR 反應條件為:95 ℃預變性3 min;98 ℃變性10 s,分別設置6 個退火溫度(52、54、56、58、60 和62 ℃)退火30 s,72 ℃延伸40 s,共進行35 個循環(huán);最后72 ℃延伸10 min。擴增產物于4 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.2.4 特異性試驗 按照優(yōu)化的PCR 反應體系及反應條件,分別對4種布魯氏菌、大腸桿菌和沙門氏菌基因組DNA 進行序列擴增,然后將PCR 反應產物進行1.5%瓊脂糖凝膠電泳,驗證反應的特異性。

        1.2.5 敏感性試驗 將4種基因組DNA(犬種、羊種、牛種和豬種)樣品分別用NanoDrop ? One/OneC 超微量紫外分光光度計進行含量和純度測定,然后對各樣品10 倍倍比稀釋6 個梯度,各取2 μL不同含量的模板,使用引物BF 和BR 進行PCR 擴增,驗證該檢測方法的靈敏性。

        1.2.6 臨床應用 選擇20 只發(fā)生過流產的布魯氏菌血清學陽性雌犬,每只犬后肢靜脈采集抗凝血1份。參照文獻[6]中布魯氏菌抗凝血樣DNA 提取方法提取基因組DNA,利用設計的特異性引物進行PCR 檢測,檢測該方法在臨床上的應用效果。

        2 結果與分析

        2.1 PCR 反應條件優(yōu)化

        在52、54 ℃退火溫度下,PCR 反應條帶較亮;56、58 ℃退火溫度下,PCR 反應條帶逐漸變暗;60、62 ℃退火溫度下,未觀察到PCR 條帶(圖1)。通過優(yōu)化試驗,確定該引物退火溫度為54 ℃。最佳反應條件為:95 ℃預變性3 min;98 ℃變性10 s,54 ℃退火30 s,72 ℃延伸40 s,共進行35 個循環(huán);然后72 ℃延伸10 min。

        圖1 不同退火溫度對牛種、羊種、豬種和犬種布魯氏菌PCR 反應的影響

        2.2 特異性試驗

        利用建立的PCR 反應體系,對牛種、羊種和豬種布魯氏菌均能擴增出預期的717 bp目的條帶,對犬種布魯氏菌能擴增出366 bp 目的條帶,而對大腸桿菌、沙門氏菌,均未擴增出相應條帶,表明建立的PCR 方法特異性較好(圖2)。

        圖2 PCR 方法的特異性試驗結果

        2.3 敏感性試驗

        經NanoDrop ? One/OneC 超微量紫外分光光度計測定,犬種、羊種、豬種和牛種布魯氏菌基因組DNA 濃度分別為50.7、62.0、78.0 及55.0 ng/μL,分別10 倍倍比稀釋6 個梯度,然后進行PCR 并將反應產物進行瓊脂糖凝膠電泳(圖3)。

        圖3 4種布魯氏菌PCR 反應的敏感性試驗結果

        從圖3 可以看出,當犬種布魯氏菌基因組DNA 濃度為5.07×(10-2~101)ng/μL 時,利用建立的PCR 方法擴增后均有明顯特異性條帶,擴增片段大小為366 bp;當濃度等于或小于5.07×10-3ng/μL時,均無擴增條帶。當羊種布魯氏菌基因組DNA濃度為6.20×(10-2~101)ng/μL 時,PCR 擴增后均有明顯特異性條帶,擴增片段大小為717 bp;當濃度等于或小于6.20×10-3ng/μL 時,均無擴增條帶。當豬種布魯氏菌基因組DNA 濃度為7.80×(10-3~101)ng/μL 時,PCR 擴增后均有明顯特異性條帶,擴增片段大小為717 bp;當濃度等于或小于7.80×10-4ng/μL 時,均無擴增條帶。當牛種布魯氏菌基因組DNA 濃度為5.50×(10-2~101)ng/μL 時,PCR 擴增后均有明顯特異性條帶,擴增片段大小為717 bp;當濃度等于或小于5.50×10-3ng/μL 時,均無擴增條帶。

        由此可見,該方法能檢測到犬種、羊種、豬種和牛種布魯氏菌基因組DNA 最低濃度分別為5.07×10-2、6.20×10-2、7.80×10-3和5.50×10-2ng/μL,表明本方法的檢測靈敏度較高。

        2.4 寵物犬布魯氏菌臨床檢測

        對20 份寵物犬布魯氏菌血清學檢測為陽性的血液樣品進行PCR 檢測,發(fā)現5、11 和15 號樣品在366 bp 處擴增出特異性條帶(圖4),表明上述3 份樣品犬種布魯氏菌病原陽性。將這3 份抗凝血樣品送中國獸藥監(jiān)察所進行細菌分離鑒定,共分離到2 株犬種布魯氏菌。

        圖4 臨床血液樣品布魯氏菌PCR 檢測結果

        3 討論

        感染犬的4 種布魯氏菌均可感染人,其中以羊種布魯氏菌毒力和傳播性最強,牛種和豬種其次,犬種最弱[7]。伴隨著人民生活水平的提高,城鎮(zhèn)家庭飼養(yǎng)寵物犬數量龐大,截至2018 年12 月,我國寵物犬數量已高達7 400 萬只,已有多例人通過密切接觸犬而感染布魯氏菌的報道[8-10]。因此,高度關注犬布魯氏菌感染,對于保障人類和寵物健康意義重大。

        細菌的分離培養(yǎng)和血清學診斷是布魯氏菌病檢測的主要手段,從血液、流產胎兒、陰道分泌物等材料中分離到布魯氏菌是最具診斷性的“金標準”。但由于該病菌對人具有感染性,因此,必須在有資質的P3 實驗室進行病原分離。同時該菌分離受采樣時機等因素影響較大,分離率較低,不利于布魯氏菌病的早期診斷。血清學診斷便捷簡單,但虎紅平板凝集試驗(RBT)和試管凝集試驗(SAT)易出現假陽性,常用于布魯氏菌病流行病學調查時的初篩,而ELISA 抗體檢測易出現假陰性[11]。本研究建立的單重PCR 可一次性鑒別粗糙型(犬種)與光滑型(羊種、牛種和豬種)布魯氏菌,且在檢測時可以直接采取病料組織,十分便捷,方便在基層推廣應用。

        利用本試驗建立的單重PCR 方法對20 份布魯氏菌血清學陽性犬血清進行檢測,共檢出3 份犬種布魯氏菌陽性樣品。將該批血液樣品送中國獸醫(yī)藥品監(jiān)察所布魯氏菌檢測實驗室進行GB/T 18646—2018 引物的PCR 檢測,結果一致。推測可能是由于犬種布魯氏菌為粗糙型,而其種他為光滑型,不同生物型布魯氏菌與機體作用機制不同。

        布魯氏菌不同種菌株間基因組同源性非常高[12-13],如布魯氏菌16S rDNA 核苷酸序列相似性達99.6%~100%。已建立的聚合酶鏈反應-限制性片段長度多態(tài)性(PCR-RELP)需在單菌落純化后進行[14],其他多重PCR 方法需要至少添加4 對以上的引物進行擴增[15]。本研究利用犬種布魯氏菌在wbkD與wbkF基因序列缺失351 bp 的特點,通過犬種與其他3 種布魯氏菌擴增長度的差異,確定是犬種還是其他布魯氏菌種。該方法為犬布魯氏菌病流行病學調查提供了便捷、特異性好、敏感性高的診斷技術,適于寵物門診及基層研究單位對犬布魯氏菌病盡早鑒別診斷,以盡快采取治療或撲殺措施。

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