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        2016—2019 年我國I 類新城疫病原學監(jiān)測與遺傳進化分析

        2020-11-03 13:04:10
        中國動物檢疫 2020年11期

        (中國動物衛(wèi)生與流行病學中心,山東青島 266032)

        新城疫病毒(Newcastle disease virus,NDV)屬于副黏病毒科(Paramyxoviridae)正禽腮腺炎病毒屬(Orthoavulavirus),為單股負鏈RNA 病毒,可感染240 多種禽類。NDV 只有1 個血清型,但可分為多種基因型。根據(jù)病毒F基因序列差異,毒株可分為I 類(class I)和II 類(class II)兩大類。II 類NDV 流行時間較長,至少包括21 種基因型。歷史上引起5 次ND 大流行的毒株和常用疫苗株均屬于II 類NDV[1]。I 類NDV 只有1 個基因型,但可細分為3 個基因亞型[1]。2003 年I 類NDV 在法國野生麻鴨中被首次分離到,此后又出現(xiàn)于野生水禽和野鳥中,近年來又傳播至家禽[2-4]。2008 年通過病毒分離,我國首次證實I 類NDV 的存在,隨后研究發(fā)現(xiàn)病毒已在我國廣泛流行[5-6]?;仡櫺哉{(diào)查發(fā)現(xiàn),2002 年在浙江、福建等地活禽市場檢出的病毒與其同類,說明I 類NDV 早已存在[7]。雖然I 類NDV 絕大多數(shù)為無毒株或弱毒株,但已有學者證實NDV 弱毒株可通過雞或雞胚連續(xù)傳代增強毒力[8-11]。我國養(yǎng)禽業(yè)發(fā)達,I 類NDV 污染面廣[12]且存在基因變異和毒力增強的風險。因此,對國內(nèi)家禽中攜帶的I 類NDV 進行長期系統(tǒng)監(jiān)測,掌握病毒分布和流行規(guī)律,對新城疫防控具有重要意義。本研究于2016—2019 年,按照《國家動物疫病監(jiān)測與流行病學調(diào)查計劃》,在我國23 個?。ㄗ灾螀^(qū)、直轄市)998 個采樣點,隨機采集家禽口咽/泄殖腔雙拭子樣本、野鳥糞便樣本和環(huán)境樣本,通過病毒分離和常規(guī)RT-PCR 技術(shù)檢測I 類NDV,并對分離株進行遺傳進化分析,以期為科學防控新城疫提供參考數(shù)據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 樣本與雞胚

        從國內(nèi)23 個?。ㄗ灾螀^(qū)、直轄市)的批發(fā)市場、農(nóng)貿(mào)市場、養(yǎng)殖場和屠宰場,隨機采集不同種類家禽的口咽/泄殖腔雙拭子樣品和環(huán)境樣品,并在野鳥棲息地采集野鳥糞便樣品。SPF 雞胚,購自濟南斯帕法斯家禽有限公司。

        1.2 病毒分離鑒定

        按照國標《新城疫診斷技術(shù)》(GB16550—2008)規(guī)定方法,將采集的樣品接種9~11 日齡SPF 雞胚。每個樣品接種2 枚雞胚,37 ℃孵育,棄掉24 h 內(nèi)死胚;96 h 后,收獲雞胚尿囊液,進行血凝(HA)、血凝抑制(HI)試驗;分裝鑒定為NDV 陽性的尿囊液,-80 ℃保存。

        1.3 RNA 提取

        采用High Pure Viral RNA Kit(Roche)提取病毒RNA,將提取的RNA 立即用于RT-PCR 擴增或者于-20 ℃保存。

        1.4 RT-PCR 鑒定

        采用本實驗室建立的RT-PCR 方法[13],利用Hiscript High Fidelity One Step RT-PCR Kit(Vazyme)擴增病毒F基因。引物序列見表1。RT-PCR 反應條件為:50 ℃ 30 min;94 ℃ 3 min;94 ℃ 30 s,52 ℃30 s,72 ℃ 30 s,進行35 個循環(huán);72 ℃ 6 min。擴增產(chǎn)物用1%瓊脂糖凝膠電泳鑒定,陽性樣品送青島睿博興科生物技術(shù)有限公司測序。

        表1 I 類NDV 鑒定引物

        1.5 遺傳進化分析

        利用MEGA 6 軟件,對毒株F基因序列進行系統(tǒng)進化分析;采用鄰位相連法(neighbor-joining)構(gòu)建系統(tǒng)進化樹。

        2 結(jié)果

        2.1 I 類NDV 監(jiān)測

        2016—2019 年,按照《國家動物疫病監(jiān)測與流行病學調(diào)查計劃》,在安徽、江蘇、上海等23個?。ㄗ灾螀^(qū)、直轄市)開展了新城疫病原學主動監(jiān)測,在998 個采樣點共采集家禽口咽/泄殖腔拭子、野鳥糞便樣本和環(huán)境樣本45 458 份,經(jīng)病毒分離、RT-PCR 鑒定和序列測定,共分離到I類NDV 558 株,病毒陽性率為1.23%(95%CI,1.13%~1.33%)。其中,2018年I類NDV陽性率最高,為1.88%(表2)。558 株病毒主要來源于雞(403株)和鴨(126 株),少量來自鵝、鴿和環(huán)境樣本(表3)。野鳥糞便樣本中未檢測到病毒。

        2016—2019 年分離的558 株I 類NDV 來源于安徽、福建、廣東、廣西、貴州、湖北、江蘇、江西、寧夏、上海、四川、云南、西藏、青海、新疆和浙江等16 個省(自治區(qū)、直轄市)的127 個采樣點,主要分布于我國華東、西南和西北地區(qū),其中,廣東、廣西、江蘇、江西、寧夏、上海、云南等地連續(xù)4 年分離到I 類NDV。監(jiān)測到I 類NDV 的127 個采樣點包括,31 個活禽批發(fā)市場、91 個農(nóng)貿(mào)市場、3 個養(yǎng)殖場和2 個屠宰場?;钋菖l(fā)市場和農(nóng)貿(mào)市場年均病毒陽性率分別為28.70%和24.33%(圖1),明顯高于養(yǎng)殖場和屠宰場(P<0.05)。

        表2 2016—2019 年I 類NDV 主動監(jiān)測病原學檢測結(jié)果

        2.2 I 類NDV 遺傳進化分析

        遺傳進化分析結(jié)果(圖2)顯示:2016—2019年分離的558 株I 類NDV 分屬于2 種基因亞型:1.1.2 亞型551 株、1.2 亞型7 株。其中,1.1.2 亞型為目前我國家禽中流行的優(yōu)勢基因亞型,在我國16 個省(自治區(qū)、直轄市)家禽中均分離到;1.2基因亞型均為鴨源分離株,分別于2016 年和2018年分離自寧夏、江蘇和廣西等地。

        3 討論

        圖1 不同采樣點I 類NDV 陽性率分布

        表3 2016—2019 年I 類NDV 宿主分布

        圖2 2016—2019 年I 類NDV F 基因進化樹

        1926 年3 月,印度尼西亞在爪哇島首次發(fā)現(xiàn)新城疫,隨后英格蘭、朝鮮、印度、斯里蘭卡、菲律賓、日本和澳大利亞等國也相繼報道發(fā)生新城疫。迄今為止,該病已蔓延至世界各地,給養(yǎng)禽業(yè)造成嚴重危害。毒株遺傳進化分析結(jié)果顯示,NDV 可分為I 類、II 類兩大類[14]。I 類NDV 出現(xiàn)較晚,2003 年首次在法國野生麻鴨中分離到,早期主要存在于野生水禽和野鳥中,隨后在活禽市場家禽中被陸續(xù)分離到[2-4]。早期基因分型方法將I 類NDV分為至少10 個基因型[2],國內(nèi)流行毒株主要為基因2 型 和3 型[7,12]。2012 年,Diel 等[14]將I 類NDV 合并為1 個基因型,但細分為3 個基因亞型(1a、1b 和1c)。我國流行毒株主要為基因1b 亞型。2019 年,全球9 家OIE 新城疫參考實驗室聯(lián)合20 家國際著名實驗室更新了NDV 分類方法,將I 類NDV 劃分為1 個基因型3 個基因亞型(1.1.1、1.1.2 和1.2)[1]。我國早期分離株屬于1.1.1 和1.2基因亞型[5-6]。2016—2019 年我國分離的I 類NDV主要為1.1.2 基因亞型,只有7 株病毒屬于1.2 基因亞型。序列分析結(jié)果顯示,2016 年我國寧夏和江蘇分離的6 株1.2 基因亞型毒株與北美野生水鳥分離株高度同源。此類病毒于2015 年首次出現(xiàn)于我國廣西鴨群,但由于缺乏周邊國家新城疫監(jiān)測數(shù)據(jù),至今仍不清楚該毒株的確切來源[15]。

        我國I 類NDV 污染面廣。2016—2019 年我國16 個?。ㄗ灾螀^(qū)、直轄市)127 個采樣點均分離到I 類NDV。2011—2015 年監(jiān)測數(shù)據(jù)表明,I類NDV 主要分布于我國華東、華中、華南和西南等東部和南部地區(qū)[12]。本研究結(jié)果顯示,近年來I類NDV 主要分離自我國華東、西南和西北地區(qū),暗示病毒正逐漸從我國東部和南部向西部蔓延?;钋菖l(fā)市場和農(nóng)貿(mào)市場是I類NDV的高污染場點。本研究在活禽市場的雞、鴨、鵝、鴿等家禽和環(huán)境樣本中均分離到I 類NDV。部分活禽市場中,家禽免疫情況不明,多種禽類混養(yǎng),市場衛(wèi)生條件較差,這些因素極易導致病毒傳播。因此,應加強活禽市場的生物安全管理,積極采取消毒、休市等措施。2017—2018 年,本研究在少數(shù)養(yǎng)殖場中也分離到I 類NDV。I 類NDV 雖為弱毒株,使感染雞不表現(xiàn)明顯臨床癥狀,但在雞體內(nèi)連續(xù)傳代后,可能通過基因變異增強毒力。因此,在家禽飼養(yǎng)過程中,應制定科學的免疫程序,做好疫苗免疫和抗體監(jiān)測,同時加強飼養(yǎng)管理,改善養(yǎng)殖環(huán)境,提高家禽抵抗力,降低病毒感染、變異和傳播的風險。

        4 結(jié)論

        本研究發(fā)現(xiàn),我國I 類NDV 污染面廣,宿主范圍廣泛,且存在2 種基因亞型。建議加強飼養(yǎng)家禽I 類NDV 的免疫、監(jiān)測,同時加強飼養(yǎng)管理,提高家禽抵抗力,降低病毒基因變異使毒力增強的風險。

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