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        基于血清藥物化學與網(wǎng)絡藥理學探究麝香通心滴丸治療冠心病的機制

        2020-11-02 13:14:40劉星雨尚云龍姚建標王建方宋永標王如偉
        中成藥 2020年10期
        關鍵詞:通心分子離子滴丸

        王 偉 劉星雨 尚云龍 姚建標 王建方 宋永標 王如偉?

        (1.浙江中醫(yī)藥大學藥學院, 浙江 杭州310052; 2.浙江康恩貝制藥股份有限公司, 浙江 杭州310052;3.浙江省中藥制藥技術重點實驗室, 浙江 杭州310052; 4.內(nèi)蒙古康恩貝藥業(yè)有限公司圣龍分公司,內(nèi)蒙古 鄂爾多斯017400)

        “血清藥物化學” 這一理論最先由德國科學家格哈德·多馬克所提出[1],后來我國科學家王喜軍教授[2]提出符合中醫(yī)藥理論的中藥血清藥物化學。中藥成分較為復雜[3],經(jīng)口服給藥后,普遍認為發(fā)揮藥效的活性成分應該是被吸收入血的成分[4]。通過分析口服給藥后血中成分,可確定中藥在體內(nèi)直接起作用藥效成分。網(wǎng)絡藥理學[4?7]通過生物學網(wǎng)絡中節(jié)點的連接和關系來分析藥物對疾病網(wǎng)絡的干預,從整體效應角度預測藥物靶點,是闡明中藥復方作用機制的重要手段之一。近年來文獻[8?12]報道的網(wǎng)絡藥理學研究大多數(shù)是以各數(shù)據(jù)庫中成分的口服生物利用度為篩選指標。然而多味中藥在組成復方后,其原本的一些成分在其它成分的協(xié)同作用下,會使其原本較低的生物利用度得到改善,并且更改相應的藥物劑型也會提高其生物利用度[13?14]。因此對于多成分的中藥復方制劑,僅靠數(shù)據(jù)庫中的口服生物利用度為篩選指標,會導致靶點預測不夠精確。麝香通心滴丸為內(nèi)蒙古康恩貝藥業(yè)有限公司圣龍分公司已上市產(chǎn)品,收載于2015 年版《中國藥典》 一部,于2017 年1 月13 日被列入國家中藥保護品種,全方包括麝香、蟾酥、人參莖葉總皂苷、丹參、人工牛黃、熊膽粉、冰片,該品種屬于心腦血管領域用藥[15?17]。雖然臨床上治療冠心病療效顯著,但其藥效物質基礎并不明確。本文通過HPLC?Q?TOF/MS 對麝香通心滴丸進行血清藥物化學研究,并基于網(wǎng)絡藥理學對入血成分治療冠心病的作用機制進行研究,為深入闡明麝香通心滴丸作用機制提供一定的依據(jù)。

        1 材料

        1.1 儀器 1260 高效液相色譜儀、6530 Q?TOF/MS 四極桿飛行時間質譜儀(美國安捷倫公司);高速冷凍離心機、渦旋振蕩器(美國賽默飛世爾科技公司);Sartorius BS210S十萬分之一電子天平(德國賽多利斯公司)。

        1.2 試劑與藥物 麝香通心滴丸(內(nèi)蒙古康恩貝有限公司圣龍分公 司,批 號180607)。蟾毒靈(批 號111981?201501,純度99.2%)、熊去氧膽酸(批號110755?201704,純度99.4%)、脂蟾毒配基(批號110718?201809,純度98%)購自中國食品藥品檢定研究院;遠華蟾毒精(批號PS010798,純度98%)、去乙酰華蟾毒精(批號PS010804,純度98%)購自成都普思生物科技股份有限公司;沙蟾毒精(批號5283,純度98%)、甘氨膽酸(批號6723,純度98%)購自上海詩丹德標準技術服務有限公司;?;悄懰幔ㄅ朠ST190801?061,純度98%)購自成都樂美天醫(yī)藥科技有限公司。乙腈(批號SHBK3440,色譜純)、甲醇(批號10958407824,色譜純)購自默克化工技術(上海)有限公司。

        1.3 動物 5 只SPF 級健康雄性SD 大鼠,購自上海西普爾必凱實驗動物有限公司,生產(chǎn)許可證號SCXK(滬)2013?0016,由浙江中醫(yī)藥大學動物實驗中心代為飼養(yǎng),使用許可證號 SYXK(浙)2013?0184,條件為溫度(22±1)℃,相對濕度50%~60%,12 h 光照,通風頻率15~20 次/h。大鼠以標準飼料喂養(yǎng),飲水自由,倫理審查決議編號ZSLL?2017?054。

        2 方法

        2.1 麝香通心滴丸入血成分分析

        2.1.1 麝香通心滴丸混懸液制備 取適量麝香通心滴丸粉研磨成粉末,加入適量0.5%羧甲基纖維素鈉溶液,調(diào)整質量濃度為0.4 g/mL,即得,搖勻備用。

        2.1.2 動物給藥與血清樣品采集 SD 大鼠給藥前禁食12 h,自由飲水,以6.4 g/kg 劑量給藥。給藥前采集空白血樣,在給藥15、30、45、60 min 后眼眶取血各約0.5 mL,收集至EP 管中靜 置30 min,室溫下以3 000 r/min 離心10 min,取上層血清,備用。

        2.1.3 血清樣本處理 分別精密吸取200 μL 空白血清和含藥血清(將“2.1.2” 項下4 個時間點含藥血清各吸取50 μL 混勻)于1.5 mL EP 管內(nèi),加入5 倍量甲醇渦旋5 min,離心(4 ℃、10 000 r/min)10 min,上清液于常溫下氮氣吹干,100 μL 甲醇復溶,渦旋5 min,離心(4 ℃、10 000 r/min)5 min,取上清液供MS 分析。

        2.1.4 色譜條件 Hydro?RP C18色譜柱(250 mm×4.6 mm,4 μm);流動相0.4% 甲酸乙腈(A)?0.2% 甲酸水(B),梯度洗脫(0~5 min,5% A;5~13 min,5~20% A;13~40 min,20~22% A;40~60 min,22~45% A;60~75 min,45~75 A%);柱溫30 ℃;體積流量1.3 mL/min;進樣量10 μL。

        2.1.5 質譜條件 離子源ESI,掃描方式ESI+、ESI?模式;干燥氣體溫度320 ℃,體積流量10 L/min;鞘氣溫度350 ℃,體積流量12 L/min;碎裂能量175 V;毛細管電壓3 kV;正負離子采集范圍m/z50~1 500。

        2.2 網(wǎng)絡藥理學研究

        2.2.1 預測潛在靶點 將分析得到的麝香通心滴丸入血成分通過PubChem 數(shù)據(jù)庫得到其mol2 格式文件,并將其上傳至PharmMapper 服務器(限定靶蛋白為人類,其余為默認選項),采用“藥效團匹配方法” 得到虛擬篩選結果。將篩選出的分子?靶點匹配度(Fit Score)大于等于3 的藥物靶點作為靶蛋白,并通過UniProt 數(shù)據(jù)庫輸入篩選得到的蛋白靶點PDBID,經(jīng)檢索和轉化操作得到的麝香通心滴丸入血成分的潛 在作用靶點。通 過 GeneCards 數(shù)據(jù)庫,以“coronary atherosclerotic heart disease” 為關鍵詞,檢索與冠心病相關的基因,并與上述成分靶點匹配進行分析,篩選與麝香通心滴丸入血成分相關的作用靶點。

        2.2.2 蛋白相互作用網(wǎng)絡構建與分析 String 數(shù)據(jù)庫是一種包含已知和預測蛋白質與蛋白質相互作用的數(shù)據(jù)庫,將上述成分?疾病交集靶點導入String 數(shù)據(jù)庫,限定物種為人類(Homo sapiens),最低相互作用閥值設為高等置信度0.9 “highest confidence”,同時顯示設置隱藏游離點,然后下載PPI 圖形件并保存tsv 文件,最后使用R 語言對得到的PPI 進行核心基因的篩選,其余參數(shù)保持默認設置。

        2.2.3 靶標GO 富集分析和KEGG 通路富集分析 本研究通過David 6.7 數(shù)據(jù)庫,對成分?疾病交集靶點蛋白進行GO富集分析、KEGG 通路富集分析,其中GO 富集分析包括生物過程(biological process)、分子功能(molecularfunction)和細胞組分(cellular component)3 個部分,Select Identifier設置為Official GeneSymbol,List Type 設置為Gene List,限定物種為人,并用FDR 錯誤控制法對P 值作檢驗校正,最終以“P<0.05” 作為條件進行篩選,篩選出具有顯著差異的代謝通路。

        2.2.4 入血成分與核心靶點的分子對接 對上述麝香通心滴丸的入血成分與核心靶基因進行分子對接,首先通過PubChem 數(shù)據(jù)庫得到各分子的化學結構式。在PDB 數(shù)據(jù)庫檢索靶基因蛋白構象,并根據(jù)以下條件篩選:通過X 晶體衍射法獲取的蛋白結構;蛋白的晶體解析度小于3 ?;分型明確的蛋白。然后,使用AutoTools 對蛋白進行加氫去除水分子預處理,AutoGrid 進行能量格點計算,Autodock Vina 進行小分子與蛋白對接,對每個對接進行結合能(af?finity)評分,PyMoL 作活性分子和蛋白的互相作用圖。

        3 結果

        3.1 麝香通心滴丸大鼠入血成分分析 健康大鼠灌胃給予麝香通心滴丸混懸液后,血清樣品的正負離子圖(BPC 模式)見圖1,與對照品離子圖比對后共鑒定出8 種入血成分,見表1。

        表1 麝香通心滴丸入血成分

        化合物1:正離子模式下,一級質譜分析其準分子離子為m/z417.227 1 [M+H]+,保留時間為41.239 min,對其進行二級質譜分析,結果見圖2,其主要的碎片離子有m/z399.215 2 [M?H2O+H]+、363.191 7 [M?3H2O+H]+。將沙蟾毒精的標準品溶液進行HPLC?MS/MS 分析,所得的一級與二級質譜及保留時間與化合物1 相同,由此確認其為沙蟾毒精。

        圖1 樣品血清離子圖

        化合物2:負離子模式下,一級質譜分析其準分子離子為m/z514.283 3 [M?H]-,保留時間為52.446 min,對其進行二級質譜分析,結果見圖3,其主要的碎片離子m/z496.271 6 為準分子離子失去1 分子H2O [M?H2O?H]-。將?;悄懰岬臉藴势啡芤哼M行HPLC?MS/MS 分析,所得的一級與二級質譜及保留時間與化合物2 相同,由此確認其為?;悄懰?。

        圖2 沙蟾毒精質譜圖

        圖3 牛磺膽酸質譜圖

        化合物3:正離子模式下,一級質譜分析其準分子離子為m/z403.247 1 [M+H]+,保留時間為55.824 min,對其進行二級質譜分析,結果見圖4,其主要的碎片離子有m/z367.226 4 [M?2H2O+H]+、349.216 3 [M?3H2O+H]+、253.193 9 [M?C5H9O5+H]+、215.179 0 [M?C8H11O5+H]+。將遠華蟾毒精的標準品溶液進行HPLC?MS/MS 分析,所得的一級與二級質譜及保留時間與化合物3 相同,由此確認其為遠華蟾毒精。

        圖4 遠華蟾毒精質譜圖

        化合物4:負離子模式下,一級質譜分析其準分子離子為m/z464.302 5 [M?H],保留時間為56.952 min,對其進行二級質譜分析,結果見圖5,其主要的碎片離子m/z402.299 6 為準分子離子失去1 分子水和1 分子羧基[M?H2O?COOH?H]-。將甘氨膽酸的標準品溶液進行HPLC?MS/MS 分析,所得的一級與二級質譜及保留時間與化合物4 相同,由此確認其為甘氨膽酸。

        圖5 甘氨膽酸質譜圖

        化合物5:正離子模式下,一級質譜分析其準分子離子為m/z401.231 3 [M+H]+,保留時間為60.756 min,對其進行二級質譜分析,結果見圖6,其主要的碎片離子為準分子離子m/z365.200 9 失去2 分子H2O [M?H2O+H]+。將去乙酰華蟾毒精的標準品溶液進行HPLC?MS/MS 分析,所得的一級與二級質譜及保留時間與化合物5 相同,由此確認其為去乙酰華蟾毒精。

        圖6 去乙酰華蟾毒精質譜圖

        化合物6:正離子模式下,一級質譜分析其準分子離子為m/z387.251 6 [M+H]+,保留時間為62.649 min,對其進行二級質譜分析,結果見圖7,其主要的碎片離子有m/z369.242 1 [M?H2O +H]+、351.231 3 [M?2H2O +H]+、255.209 6 [M?C5H7O4]+。將蟾毒靈的標準品溶液進行HPLC?MS/MS 分析,所得的一級與二級質譜及保留時間與化合物6 相同,由此確認其為蟾毒靈。

        圖7 蟾毒靈質譜圖

        化合物7:負離子模式下,一級質譜分析其準分子離子為m/z437.290 6 [M+COOH]-,保留時間為65.025 min,對其進行二級質譜分析,結果見圖8,其主要的碎片離子m/z391.284 3 為準分子離子失去1 分子甲酸[M?HCOOH]-。將熊去氧膽酸的標準品溶液進行HPLC?MS/MS 分析,所得的一級與二級質譜及保留時間與化合物7 相同,由此確認其為熊去氧膽酸。

        圖8 熊去氧膽酸質譜圖

        化合物8:在正離子模式下,一級質譜分析其準分子離子為m/z385.237 2 [M+H]+,保留時間為68.868 min,對其進行二級質譜分析,結果見圖9,其主要的碎片離子有m/z367.227 2 [M?H2O+H]+、349.214 9 [M?2H2O+H]+、253.194 8 [M?C5H7O4]+。將脂蟾毒配基的標準品溶液進行HPLC?MS/MS 分析,所得的一級與二級質譜及保留時間與化合物8 相同,由此確認其為脂蟾毒配基。

        3.2 麝香通心滴丸入血成分網(wǎng)絡藥理學研究

        3.2.1 作用靶點預測 將麝香通心滴丸8 個入血成分上傳至PharmMapper 數(shù)據(jù)庫后得到的所有靶點,刪除重復并整合得到作用靶點249 個。通過與GeneCards 數(shù)據(jù)庫中的1 778個與冠心病相關基因進行匹配,并通過R 軟件繪制韋恩圖,篩選出134 個成分?疾病交集靶點,見表2、圖10。再通過Cytoscape 3.7.1 軟件將8 個入血成分與134 個成分?疾病交集靶點相連,繪制出麝香通心滴丸的藥物?靶點相互作用的網(wǎng)絡圖,見圖11。

        3.2.2 蛋白相互作用網(wǎng)絡構建與分析 將韋恩圖得到的134 個交集基因輸入String 數(shù)據(jù)庫中進行分析得到PPI 圖,見圖12,其中包括134 個節(jié)點,347 條邊,平均節(jié)點度值為5.18,PPI 富集P 值少于1.0×1016,其中節(jié)點表示蛋白,每條邊則表示蛋白與蛋白之間的相互作用關系,線條越多表示關聯(lián)度越大。將String 中下載的tsv 文件用R 語言進行處理(以各蛋白連接的節(jié)點個數(shù)為指標,列舉節(jié)點數(shù)排名前30 個的蛋白),得到PPI 中的核心基因絲裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)、酪氨酸激酶(SRC)、磷脂酰肌醇3 激酶(PIK3R1)等核心基因,見圖13。

        圖9 脂蟾毒配基質譜圖

        表2 成分?疾病交集靶點

        圖10 藥物?疾病交集靶標韋恩圖

        3.2.3 靶標GO 富集分析及通路富集分析結果 利用David 6.7 平臺對134 個藥物?疾病交集靶點進行GO 富集分析及通路富集分析。GO 富集分析包括分子功能分析、細胞組分分析、生物學過程分析,以?lgP值進行排名并列出排名前15 的途徑,見圖14。在分子功能層面主要涉及類固醇激素受體活性、配體依賴性核受體活性等方面;在細胞組分層面主要涉及細胞外基質、細胞質、細胞質囊泡等方面;生物學過程層面主要涉及有機物質的反應、內(nèi)源性刺激的反應、激素刺激的反應、調(diào)節(jié)細胞增殖等方面。對富集得到的通路結果,以?lgP值及各通路連接的基因數(shù)從大到小進行排名,見圖15。通過查閱文獻,該8 個入血成分可能通過ErbB signaling pathway、VEGF signaling pathway、PPAR signaling pathway 等信號通路治療冠心病。

        圖11 藥物?靶點相互作用網(wǎng)絡圖

        圖12 麝香通心滴丸入血成分與疾病共有靶點PPI 網(wǎng)絡圖

        3.2.4 分子對接 講上述8 個入血成分與上述互作關系排名前10 的核心靶點進行分子對接,結果見表3,結合能(affinity)越小則對接結果越好,affinity<-7 表示具有較好的結合活性,可見該8 個入血成分與大多數(shù)核心靶點對接結果基本較好。其中,去乙酰華蟾毒精與MAPK1 結合活性最高,其分子對接細節(jié)模擬見圖16,可知小分子結合在蛋白的活性口袋,并且有和活性口袋有較好的匹配。

        4 討論

        本文前期按照一定梯度濃度探索麝香通心滴丸最佳給藥劑量[18],分別以0.8、1.6、3.2、6.4、12.8 g/kg 的給藥劑量對SD 大鼠進行灌胃,并對各劑量組下的大鼠分別于給藥15、30、45、60、75、90、105、120 min 后進行眼眶取血并分析血樣。結果,大鼠在6.4、12.8 g/kg 劑量下各時間段含藥血清的離子流圖更豐富,并且基本一致,但12.8 g/kg 較為濃稠,給灌胃帶來不便。最終,以6.4 g/kg為大鼠給藥劑量。

        圖13 節(jié)點數(shù)目前30 的靶點

        本研究參考文獻[19?20],分別采用甲醇和乙腈沉淀血清中的蛋白,發(fā)現(xiàn)甲醇沉淀處理得到的血中移行成分數(shù)目較多,內(nèi)源性雜志干擾較少,因此提取溶劑選用甲醇。前期考察了15、30、45、60、75、90、105、120 min 共8個采血點,對血清樣本質譜數(shù)據(jù)進行分析,發(fā)現(xiàn)不同的入血成分會出現(xiàn)在不同采血時間點樣本中,然而在60 min 后其入血成分的提取離子流響應較低,因此選擇混合前4 個取血點的血樣進行分析。

        大多數(shù)中藥口服給藥后,移行入血的成分才可能發(fā)揮藥效,通過分析口服給藥后血清中的入血成分來確定中藥于體內(nèi)直接作用物質,已成為確定中藥藥效物質基礎的有效途徑。本文基于HPLC?Q?TOF/MS 對麝香通心滴丸進行血清藥物化學研究,通過與對照品比對鑒定出8 個成分,文獻[21?22]報道,沙蟾毒精、遠華蟾毒精、脂蟾毒配基、蟾毒靈等均具有一定強心的作用。

        圖14 入血成分與疾病交集靶點GO 富集

        圖15 KEGG 通路富集

        表3 有效成分與核心靶點的分子對接

        圖16 去乙酰華蟾毒精與MAPK1 的分子對接細節(jié)圖

        Pharm Mapper 是預測化合物生物活性,并建立相應的公共網(wǎng)絡服務器[23]。本研究通過該服務器,采用反向藥效團匹配方法得到虛擬篩選結果,并與GeneCards 數(shù)據(jù)庫中治療冠心病相關的靶點相結合,得到134 個作用靶點,通過David 數(shù)據(jù)庫對其進行KEGG 通路分析,發(fā)現(xiàn)這8 種入血成分有較多基因靶點有富集在與冠心病相關的通路上。通過Autodock Vina[24]對上述入血成分與核心靶基因進行分子對接,結果顯示入血成分與核心靶點結合性較好。

        冠心病是冠狀動脈發(fā)生動脈粥樣硬化,導致血管腔狹窄甚至阻塞,造成心肌缺血、缺氧而導致的心臟病。細胞凋亡是冠心病病理過程的重要因素,抗凋亡基因Bcl?2 和促凋亡基因Bax 共同參與[25],ErbB signaling pathway 通路與細胞凋亡密切相關,其中Bcl?2 家族在內(nèi)源性凋亡過程中起重要調(diào)控作用[26]。研究表明心肌細胞心肌缺血損傷后可通過活化ErbB signaling pathway 通路,誘導內(nèi)源性Nrg?1 下調(diào)促凋亡分子Bax 表達,減輕細胞由于缺氧復氧而造成氧化應激的損傷。Lin 等[27]通過Na2S2O4誘導H9c2 細胞氧化應激后,在細胞培養(yǎng)液中加入一定濃度的麝香通心滴丸后,結果表明麝香通心滴丸顯著提高了Na2S2O4處理誘導的H9c2 心肌細胞的活力并抑制了其異常形態(tài)學變化麝香通心滴丸預處理可減輕Na2S2O4引起的缺氧損傷,下調(diào)H9c2 細胞凋亡前Bax 的表達,并上調(diào)抗凋亡Bcl?2 的表達。

        麝香通心滴丸具有調(diào)節(jié)過PPAR 信號通路的潛在作用。PPAR 信號通路對冠心病的發(fā)展和糖代謝起著重要的調(diào)節(jié)作用。PPAR 主要有PPARα、PPARβ 和PPARγ 三種表型。研究表明,PPARα 和PPARγ 的激活能通過抑制血管內(nèi)皮炎癥反應,抑制細胞增殖和遷移,抑制單核細胞轉化成泡沫細胞,減少血管細胞黏附分子?1、ICAM1 表達等多個方面,發(fā)揮治療冠心病的作用[28]。PPAR?γ 對糖代謝的調(diào)節(jié)主要是增加外周組織對胰島素的敏感性,從而改善胰島素抵抗[29]。本研究發(fā)現(xiàn)PPAR 信號通路上有麝香通心滴丸與冠心病的 共同靶 點PPARA、APOA2、PPARD、RXRB、RXRA、PPARG、FABP3、MMP1、FABP5、NR1H3,因此,推測麝香通心滴丸可能通過調(diào)節(jié)PPAR 信號通路,改善胰島素抵抗來治療冠心病。

        血管內(nèi)皮生長因子(VEGF)是調(diào)節(jié)生理或病理的血管新生及增加血管通透性的一個重要細胞因子,它與內(nèi)皮細胞上的受體結合后會提高微血管的通透性,導致大量的炎性細胞滲入肺間質并產(chǎn)生膠原酶降解內(nèi)皮下基底膜及細胞外基質,進而促進內(nèi)皮細胞增生遷移,從而形成新生血管[30]。VEGFR2 是VEGF 的主要功能受體,其與VEGF 相結合主要介導血管的生成,VEGF/VEGFR2 信號通路是VEGF 信號通路中的主要信號通路,可促進血管內(nèi)皮細胞的增殖、遷移、分化,同時抑制其調(diào)亡。VEGF 是血管生成過程中具有關鍵性的生長因子,可以增加血管密度,促進缺氧區(qū)甚至無血管區(qū)域內(nèi)皮細胞增殖,誘導缺血組織內(nèi)的血管新生,是目前臨床上已知的最強的內(nèi)皮細胞有絲分裂原,可有效促進心肌重塑[31],本研究發(fā)現(xiàn)VEGF signaling pathway 通路上有麝香通心滴丸與冠心病的共同靶點PIK3CG、CDC42、MAPK1、MAP2K1、MAPK14、PLA2G2A、RAF1、SRC、PIK3R1、KDR、AKT2,因此推測麝香通心滴丸可能通過調(diào)節(jié)VEGF signaling pathway 通路來治療冠心病。

        綜上所述,本研究基于血清藥物化學與網(wǎng)絡藥理學,在體內(nèi)化學成分分析辨識的基礎上通過關聯(lián)網(wǎng)絡構建及分析,初步闡釋了麝香通心滴丸治療冠心病作用機制,可為中藥藥效物質基礎分析及其相關作用機制探究提供一定依據(jù)。

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