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        珠蛋白生成障礙性貧血異常-α3.7 缺失條帶的基因型研究

        2020-10-13 02:57:44顧燕英吳蓓穎顧鳴敏
        關(guān)鍵詞:珠蛋白障礙性家系

        顧燕英,吳蓓穎,林 琳,蔡 剛#,顧鳴敏

        1. 上海交通大學醫(yī)學院附屬瑞金醫(yī)院檢驗科,上海 200025;2. 上海交通大學基礎醫(yī)學院基礎醫(yī)學實驗教學中心,上海 200025

        珠蛋白生成障礙性貧血是由于珠蛋白基因發(fā)生突變或缺失導致珠蛋白生成障礙而引起的遺傳性溶血性貧血,臨床上以α 和β 珠蛋白生成障礙性貧血最為常見。其中,α 珠蛋白生成障礙性貧血主要分為缺失型和非缺失型 2 類,以東南亞缺失(--sea)、右向缺失(-α3.7)和左向缺失(-α4.2)為主,且該3 種缺失類型約占廣東省α 珠蛋白生成障礙性貧血的96%[1-2]。目前,多數(shù)臨床采用常用的商品化診斷試劑盒即跨越斷裂點聚合酶鏈反應(gap-polymerase chain reaction,Gap-PCR)法檢測上述3 種常見的基因缺失,而該方法對于罕見的α 珠蛋白基因缺失則易產(chǎn)生漏檢或誤檢。本研究就4 238 例患者先行常規(guī)珠蛋白生成障礙性貧血基因檢測、再行Gap-PCR 和Sanger 測序法,對異常-α3.7條帶的樣本做進一步檢測并行家系分析,以期為臨床提供更準確的基因診斷結(jié)果及遺傳咨詢。

        1 對象與方法

        1.1 研究對象

        收集2016 年6 月—2019 年9 月于上海交通大學醫(yī)學院附屬瑞金醫(yī)院兒科、血液科和婦產(chǎn)科就診的行常規(guī)珠蛋白生成障礙性貧血基因檢測的患者4 238 例,其中男性1 491 例、女性2 747 例,年齡1 d ~95 歲。

        本研究經(jīng)上海交通大學醫(yī)學院附屬瑞金醫(yī)院倫理委員會批準[審批號:(2019)臨倫審第(54)號],所有研究對象或監(jiān)護人均簽署了知情同意書。

        1.2 研究方法

        1.2.1 血常規(guī)檢查 抽取患者靜脈血3 mL,以乙二胺四乙酸二鉀(dipotassium ethylenediaminetetraacetic acid,EDTA-K2)抗凝。隨后,采用XS-800i 全自動血液分析儀(Sysmex,日本)對患者各項紅細胞參數(shù)進行檢測,包括紅細胞平均體積(mean corpuscular volume,MCV)、 紅細胞平均血紅蛋白量(mean corpuscular hemoglobin,MCH)、血紅蛋白(hemoglobin,Hb)等。上述參數(shù)的參考區(qū)間參照《全國臨床檢驗操作規(guī)程(第3 版)》,即MCV 正常參考區(qū)間為男(83.9 ~99.1)fL、 女(82.6 ~99.1)fL,MCH 正常參考區(qū)間為男(27.8 ~ 33.8)pg、女(26.9 ~33.3)pg,Hb 正常參考區(qū)間為男(131 ~172)g/L、女(113 ~151)g/L。

        1.2.2 基因組DNA 提取 采用基因組DNA 提取試劑盒[天根生化科技(北京)有限公司]對EDTA-K2 抗凝血行DNA 提取,方法依據(jù)說明書步驟進行。

        1.2.3 常規(guī)珠蛋白生成障礙性貧血基因檢測 采用Gap-PCR 法檢測α 珠蛋白基因3 種常見的缺失(--sea、-α3.7和-α4.2)。采用反向斑點雜交法(reverse dot blot,RDB)檢測3 種常見的非缺失α 珠蛋白基因點突變[分別為αWestmeadα(αWS)、αQuongSzeα(αQS)和αConstantSpringα(αCS)] 和17種β 珠蛋白基因突變[分別為CD41-42(-TTCT),IVS-Ⅱ-654(C →T),-28(A →G),CD17(AAG →TAG),CD71-72(+A),βE(GAG →AAG),-29(A →G),CD43(GAG →TAG),CD27/28(+C),CD14-15(+G),CD31(-C),-32(C →A),-30(T →C),IVS-Ⅰ-1(G →T),IVS- Ⅰ-5(G →C),5'UTR; +43-40(-AAAC),initiation condon(ATG →AGG)]?;蛟\斷試劑由亞能生物技術(shù)(深圳)有限公司提供,并按照試劑說明書進行操作及結(jié)果判讀。

        1.2.4 罕見型珠蛋白生成障礙性貧血基因檢測 選擇異常-α3.7缺失條帶的樣本,即常規(guī)Gap-PCR 法檢測缺失型α 珠蛋白生成障礙性貧血時擴增出-α3.7條帶(弱條帶)及αα 條帶,或同時擴增出-α3.7條帶、αα 條帶及--sea條帶,送至亞能生物技術(shù)(深圳)有限公司進行罕見型珠蛋白生成障礙性貧血檢測。該檢測方法采用Gap-PCR 法通過特異引物進一步檢測X1/X2 融合片段及αααanti4.2片段,判斷是否為香港型α 珠蛋白生成障礙性貧血基因(Hong Kong αα,HKαα);若檢測結(jié)果為陰性,則采用Sanger 測序法行α1、α2 基因測序,并在HbVar 數(shù)據(jù)庫(http://globin.bx.psu.edu/hbvar)中查找測序結(jié)果的突變位點。

        1.2.5 家系分析 珠蛋白生成障礙性貧血是一種常染色體隱性遺傳的單基因遺傳病,遺傳方式符合孟德爾定律。本研究根據(jù)孟德爾分離定律和自由組合定律(子代的2 個等位基因分別來自父親與母親,即只有父親或母親攜帶HKαα 與-α3.7基因,子代才可能出現(xiàn)HKαα/-α3.7基因型),對2 個家系的基因型進行分析。

        1.3 統(tǒng)計學方法

        采用Excel 2016 及SAS 8.2 軟件對研究數(shù)據(jù)進行統(tǒng)計分析。符合正態(tài)分布的定量資料以x—±s 表示,符合非正態(tài)分布的定量資料以M(Q1,Q3)表示。定性資料以百分率表示。在不同基因類型的血常規(guī)參數(shù)中,以Hb 取自然對數(shù)后(為正態(tài)分布)行單因素方差分析,基因型間比較采用獨立樣本t 檢驗;MCV 和MCH(為非正態(tài)分布)采用多獨立樣本的秩和檢驗?;蛐烷g比較采用兩獨立樣本的秩和檢驗。P<0.05 表示差異具有統(tǒng)計學意義。

        2 結(jié)果

        2.1 常規(guī)珠蛋白生成障礙性貧血基因檢測結(jié)果

        采用Gap-PCR 和RDB 法對常見珠蛋白生成障礙性貧血基因突變和缺失進行檢測,結(jié)果(表1、圖1)顯示,在4 238 例患者中共檢出-α3.7缺失條帶者109 例,其基因型被初步判斷為88 例-α3.7/αα、19 例-α3.7/αα 復合β 珠蛋白生成障礙性貧血、1 例-α3.7/αQS,及1 例-α3.7、αα、--sea3 條帶(未確定);同時在檢出的109 例中,有14 例-α3.7條帶較αα 條帶細弱,有1 例同時出現(xiàn)-α3.7、αα、--sea3 個條帶,因此將該15 例用于罕見型α 珠蛋白生成障礙性貧血基因的檢測。

        表1 109 例-α3.7 缺失條帶患者中珠蛋白生成障礙性貧血患者的基因診斷結(jié)果及檢出率Tab 1 Genetic diagnosis results and detection rate of common mutations of thalassemia in 109 cases with -α3.7 deletion bands

        圖1 Gap-PCR 法檢測結(jié)果的電泳圖 Fig 1 Electrophoretogram of Gap-PCR results

        2.2 罕見型α 珠蛋白生成障礙性貧血基因檢測結(jié)果

        將上述14 例出現(xiàn)-α3.7弱條帶和1 例同時出現(xiàn)-α3.7、αα、--sea3 個條帶的樣本(共計15 例)送至亞能生物技術(shù)(深圳)有限公司進行罕見型α 珠蛋白生成障礙性貧血檢測,即采用Gap-PCR 檢測HKαα 基因及Sanger 測序法進行α1、α2 基因測序。結(jié)果(表2)顯示,有13例為HKαα/αα 或HKαα/-α3.7,1 例為HKαα/--sea,1 例為NG_000006.1:g.34569_38382 del 3 812 bp 罕見缺失;且經(jīng)與HbVar 數(shù)據(jù)庫比對發(fā)現(xiàn),該罕見缺失尚未記錄。通過進一步的Gap-PCR 和Sanger 測序法檢測,罕見型α 珠蛋白生成障礙性貧血基因的總誤檢率為0.35%(15/4 238),在-α3.7缺失中誤檢率為13.76%(15/109);HKαα 基因的總檢出率為0.33%(14/4 238),在-α3.7缺失中誤檢率為12.84%(14/109)。

        表2 15 例罕見型α 珠蛋白生成障礙性貧血患者的基因檢測結(jié)果Tab 2 Gene detection results of 15 patients with rare α-thalassemia

        2.3 HKαα 的家系分析

        由于采用Gap-PCR 法檢測HKαα 基因未能區(qū)分HKαα/αα 或HKαα/-α3.7等基因型,且本研究中存在2 個HKαα 的家系(家系1 來自上海、家系2 來自甘肅),因此可通過家系分析進一步區(qū)分其基因型。結(jié)果(表3)發(fā)現(xiàn),家系2 中母親和孩子的基因型確定為HKαα/αα,但家系1 中父親和家系2 中外婆的基因型仍不能區(qū)分。

        表3 2 個HKαα 家系的基因型分析Tab 3 Genotype analysis of two HKαα families

        2.4 不同α 珠蛋白生成障礙性貧血基因類型的血常規(guī)參數(shù)比較

        通過對不同類型的α 珠蛋白生成障礙性貧血患者進行血常規(guī)檢查與統(tǒng)計分析,結(jié)果(表4)顯示,HKαα/αα 或HKαα/-α3.7基因型的MCV 和MCH 水平高于-α3.7/αα 基因型(P=0.031,P=0.007),而Hb 水平間差異則無統(tǒng)計學意義;NG_000006.1:g.34569_38382 del 3 812bp 基因型的MCV、MCH 和Hb 水平分別為76.7 fL、24.6 pg 和139.0 g/L, 其中Hb 水平在正常參考區(qū)間內(nèi),而MCV、MCH 水平較HKαα/αα or HKαα/-α3.7基因型有所下降。

        表4 不同類型的α 珠蛋白生成障礙性貧血患者的血常規(guī)參數(shù)比較Tab 4 Comparison of blood routine parameters from the patients with different types of α-thalassemia

        3 討論

        α 珠蛋白生成障礙性貧血是由于α 珠蛋白基因缺陷導致α 珠蛋白肽鏈合成受到部分或完全抑制所致。α 珠蛋白基因簇位于16 號染色體16p13.3 位點,其基因在基因簇上的排列順序為5'-ζ-Ψζ-Ψα2-Ψα1-α2-α1-θ-3'。該基因簇包括2 個高度同源的基因,即α 1和α 2,在減數(shù)分裂時同源染色體發(fā)生錯配和不等交換則會產(chǎn)生-α3.7缺失型和對側(cè)重復αααanti3.7三聯(lián)體,或-α4.2缺失型和對側(cè)重復αααanti4.2三聯(lián)體等[3-4]。目前,臨床上常用的Gap-PCR 法可同時檢測α 珠蛋白的3 種常見缺失(即--sea、-α3.7和-α4.2),但對于罕見的缺失型易漏檢或誤檢。

        本研究通過對4 238 例患者行常規(guī)珠蛋白生成障礙性貧血基因檢測發(fā)現(xiàn),15 例樣本出現(xiàn)了異常-α3.7缺失條帶,通過進一步行Gap-PCR 法檢測發(fā)現(xiàn)14 例為HKαα 基因。HKαα 是一種罕見的α 珠蛋白生成障礙性貧血基因,是由α 珠蛋白基因簇的重組和不等交換形成的含有-α3.7和αααanti4.2片段的重組基因,包含一個正常的α2 基因、一個由α1 與α2 形成的融合基因(-α3.7缺失基因片段)和一個由X1 與X2 形成的融合基因[5],因此HKαα 基因用Gap-PCR 法能夠擴增出正常的αα 條帶和-α3.7缺失條帶。本研究發(fā)現(xiàn)HKαα 基因型能夠擴增出-α3.7缺失條帶,但是相比αα 條帶較為細弱,而-α3.7/αα 基因型的正常αα 條帶和-α3.7缺失條帶的亮度、粗細基本一致;繼而猜測,可能是由于HKαα 基因包含正常的α2 基因與-α3.7基因片段,而-α3.7缺失基因只含有-α3.7基因片段,兩者的-α3.7缺失基因和正常αα 基因的拷貝數(shù)不同,導致擴增產(chǎn)物的量亦不同,因此電泳結(jié)果中-α3.7與αα 條帶的亮度及粗細均存在差異。因此,經(jīng)Gap-PCR 法獲得的-α3.7/αα 電泳條帶,其可能是-α3.7/αα、HKαα/αα 或者HKαα/-α3.7,應在臨床工作中加以重視。另外,針對同時出現(xiàn)-α3.7、αα、--sea3 個條帶的異常結(jié)果,臨床上也應考慮其是否為HKαα 基因型,以避免誤檢或漏檢。

        本研究發(fā)現(xiàn),11 例HKαα/αα 或HKαα/-α3.7基因型患者的MCV 和MCH 均高于-α3.7/αα 基因型,與文獻[6-9]報道結(jié)果一致,但2 種基因型的Hb 水平間差異無統(tǒng)計學意義;本研究還發(fā)現(xiàn),MCV 與MCH 參數(shù)對于不同類型的α 珠蛋白生成障礙性貧血的區(qū)分相較于Hb 更敏感,可能與貧血時紅細胞代償性增多而使Hb 水平增加有關(guān);同時,在本研究中1 例HKαα/--sea患兒為6 周,其Hb 為100 g/L, MCV 和MCH 介于--sea/αα 基因型與-α3.7/--sea基因型,但由于HKαα/--sea基因型只有1 例且年齡較小,其血常規(guī)參數(shù)難以與--sea/αα 與-α3.7/--sea進行比較。有文獻[9-10]報道HKαα/--sea臨床癥狀明顯輕于-α3.7/--sea,若夫妻雙方分別攜帶HKαα 和--sea,該家庭則可選擇保住胎兒,以減輕家庭的經(jīng)濟與心理負擔。因此,避免將HKαα/--sea誤診為-α3.7/--sea, 將有助于提供正確的產(chǎn)前診斷和遺傳咨詢。

        目前有關(guān)于HKαα 的報道主要集中在兩廣地區(qū),廣西地區(qū)人群中HKαα 的攜帶率為0.07%[6],廣東地區(qū)的-α3.7攜帶者中HKαα 的檢出率為2.27%,且其在人群中的攜帶率為0.07%[11]。同時,也有文獻[8]對福建省進行研究顯示HKαα 在福建籍人群中的檢出率為0.36%,在-α3.7攜帶者中的檢出率為7.27%。陳文璟等[9]對-α3.7/αα 樣本進行檢測發(fā)現(xiàn),HKαα 漏診率為16%。本研究共檢出HKαα 基因14 例,總檢出率為0.33%,在-α3.7攜帶者中檢出率為12.84%;且2 個家系分別來自甘肅和上海,均為珠蛋白生成障礙性貧血的非高發(fā)地區(qū)。本實驗檢出的HKαα 基因比例較高,有助于增加臨床對HKαα 基因的認識,從而進行更準確的遺傳咨詢。

        目前,檢測HKαα 基因的方法有巢式PCR 技術(shù)、Southern 印跡雜交、測序技術(shù)等,其中以兩輪巢式PCR方法最為多見[7-10],可以對HKαα 基因型進行診斷。本實驗采用Gap-PCR 法通過特異性引物分別檢測X1/X2 融合片段(HKαα 和αααanti4.2都包含此片段)及αααanti4.2片段(αααanti4.2特異性存在),但結(jié)果并未能區(qū)分HKαα/αα 或HKαα/-α3.7,因此還需通過家系分析來進行確定。

        在由Gap-PCR 檢測的15 例異常-α3.7條帶中,1 例為HKαα 基因型陰性,經(jīng)進一步測序發(fā)現(xiàn)其α 珠蛋白基因序列為NG_000006.1:g.34569_38382 del 3 812 bp,該缺失在HbVar 數(shù)據(jù)庫上尚未見記錄。其中-α3.7細弱條帶的產(chǎn)生,可能是由于該缺失與-α3.7(NG_000006.1:g.34164_37967 del 3 804 bp)的缺失片段近,且在引物設計時-α3.7缺失的上下游引物間的缺失片段不同,導致擴增效率降低所致;同時,該條帶比HKαα 基因型的相應條帶更為細弱,因此在臨床工作中可能會被誤診為-α3.7/αα 或αα/αα,需引起重視。另外,本研究還發(fā)現(xiàn)該病例的Hb 水平在正常參考區(qū)間內(nèi),MCV、MCH 水平低于HKαα/αα or HKαα/-α3.7基因型,或可通過MCV 和MCH 進行簡單的區(qū)分。綜上,我們發(fā)現(xiàn)并非出現(xiàn)細弱-α3.7條帶的基因型都是HKαα 基因型;因此在臨床檢測中,當出現(xiàn)異常-α3.7條帶時建議醫(yī)師先進行HKαα 基因檢測,如果為陰性可再行α 珠蛋白基因測序,以減少錯檢與漏檢。

        目前,臨床所用的檢測技術(shù)涵蓋了絕大部分的珠蛋白生成障礙性貧血類型,除血常規(guī)與常規(guī)基因檢測外,血紅蛋白毛細管電泳分析技術(shù)也是當前該貧血篩查的技術(shù)之一,且方法簡單易行,對于罕見類型具有良好的提示作用[12]。因此,在臨床工作中醫(yī)師可通過聯(lián)合檢測以及經(jīng)驗的積累來減少對罕見型珠蛋白生成障礙性貧血的誤檢和漏檢。本研究總結(jié)了臨床常規(guī)檢測中發(fā)現(xiàn)的異常-α3.7缺失條帶的罕見類型和特征,但由于珠蛋白基因的復雜性和方法的局限性使得某些結(jié)果的解釋存在不足。隨著今后基因檢測水平的增加和臨床檢測經(jīng)驗的累積,如何在常規(guī)檢測工作中減少漏檢與誤檢將有待更進一步的深入研究。

        參·考·文·獻

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