馬耀光,李維文
唇腭裂是一種常見的先天發(fā)育畸形,世界范圍內(nèi)新生兒的患病率約為0.125%,而這一比率在亞洲人群中可能更高[1]。唇腭裂嚴重影響了患兒的成長,加重了患兒家庭與社會的負擔。非綜合征性唇腭裂(NSCL/P)是指無其他系統(tǒng)畸形的唇裂或唇裂合并腭裂。NSCL/P的病因被認為與環(huán)境、遺傳密切相關(guān)[2]。多組基因已被證實與NSCL/P易感性有關(guān)[3]。近年來腹前同源盒1(ventral anterior homeobox 1,VAX1)基因多態(tài)性與NSCL/P易感性的關(guān)聯(lián)受到學者們的關(guān)注,但其研究結(jié)果并不一致。本研究利用Meta分析的方式,系統(tǒng)檢索相關(guān)文獻,綜合此前的研究結(jié)果,旨在提供更全面的循證醫(yī)學證據(jù)。
1.1.1 納入標準
關(guān)于VAX1基因多態(tài)性與NSCL/P的病例對照研究;有足夠的數(shù)據(jù)計算比值比(OR)和相對應的置信區(qū)間;對照組的基因型分布符合Hardy-Weinberg 遺傳定律。
1.1.2 排除標準
非病例對照試驗,如家系研究;無法準確計算、提取基因型數(shù)據(jù);綜述、會議摘要、Meta分析等。
本Meta分析遵循PRSIMA指南[4]。系統(tǒng)檢索PubMed、EMbase、Web of Science、中國知網(wǎng)數(shù)據(jù)庫(CNKI),不限制語言,檢索時限均為建庫至2020年3月31日。依據(jù)PICO原則將研究主題歸納如下,非綜合征性唇腭裂為P,VAX1 基因多態(tài)性為 I,VAX1 基因為 C,非綜合征性唇腭裂患病風險為O。中文檢索的關(guān)鍵詞包括腹前同源盒1、基因多態(tài)性、唇腭裂、唇裂、腭裂。英文檢索的關(guān)鍵詞包括ventral anterior homeobox 1、VAX1、10q25、polymorphism、single nucleotide polymorphism、orofacial cleft、cleft lip、cleft palate。并追溯合格文獻的參考文獻獲得更全面的研究信息。PubMed檢索過程如下。
#1 VAX1 polymorphisms OR VAX1 single nucleotide polymorphism OR 10q25 polymorphisms OR 10q25 single nucleotide polymorphism OR 10q25 polymorphic regions
#2 nonsyndromic cleft lip with or without cleft palate OR NSCL/P OR nonsyndromic orofacial cleft OR oral cleft OR cleft lip OR cleft palate
#3 #1 AND #2
由兩位研究者獨立提取原始文獻中的數(shù)據(jù),若有不同意見,則通過討論或協(xié)商解決。提取的數(shù)據(jù)包括第一作者、發(fā)表年份、樣本大小、基因檢測方法、基因型分布、研究對象的種族、研究中控制組的來源。
對納入文獻的質(zhì)量評價參照紐卡斯爾-渥太華量表(NOS量表)[5],該量表從試驗組與對照組的選擇、可比性和暴露因素的測量3個方面對所納入的研究進行質(zhì)量評價,滿分共9分。當?shù)梅?6分時可認為所納入的文獻質(zhì)量較高,質(zhì)量等級為A,其余為B。
采用RevMan 5.3進行數(shù)據(jù)統(tǒng)計處理,共應用了5種基因模型(以W為野生型, M為突變型),包括等位基因模型(M vs W)、共顯性模型(WM vs WW)、純合模型(MM vs WW)、隱性模型(MM vs WM+WW)、顯性模型(WM+MM vs WW)。計算各模型下合并效應量的OR與95%置信區(qū)間(95%CI),當研究間異質(zhì)性可以接受時(P≥0.1,I2≤50%)采用固定效應模型;當研究間異質(zhì)性較高時(P<0.1,I2>50%)采用隨機效應模型。以剔除單個研究的方法進行敏感性分析,并采用Egger回歸不對稱檢驗法檢測發(fā)表偏倚,當P>0.05時認為無明顯發(fā)表偏倚。
初步檢索到相關(guān)文獻126篇,經(jīng)去重后剩余58篇,在進行文獻篩選后,納入13篇[6-18]相關(guān)文獻,其中英文文獻10篇[6-10,12-13,16-18],中文文獻3篇[11,14-15]。試驗組3 963例,對照組2 557例(總例數(shù)=6 520)。檢索流程與結(jié)果見圖1。
應用RevMan 5.3與STATA 15.0對所有提取到的數(shù)據(jù)進行分析。共兩個基因位點納入本研究。研究人群來自8個國家或地區(qū)。關(guān)于基因rs7078160位點的有13篇[6-18]文獻,關(guān)于基因rs4752028位點的有4篇[9,15-16,18]文獻。納入研究的對照組基因頻率分布均符合哈迪-溫伯格平衡(HWE)。各個文獻的特征見表1~表3(Y指P值檢驗符合HWE),質(zhì)量評價見表4。
表2 納入研究中rs7078160位點基因多態(tài)性分布 單位:例
表3 納入研究中rs4752028位點基因多態(tài)性分布 單位:例
表4 納入研究的質(zhì)量評價 單位:分
納入13項 rs7078160多態(tài)性與NSCL/P的關(guān)聯(lián)研究[6-18]。在各基因模型下rs7078160基因多態(tài)性與NSCL/P相關(guān)。納入4項rs4752028多態(tài)性與NSCL/P的關(guān)聯(lián)研究。除CT vs TT共顯性外[OR=1.45,95%CI(0.95,2.21),P=0.087],在其他基因模型下該基因多態(tài)性與NSCL/P相關(guān)。詳見表5、表6、圖2、圖3。
表5 rs7078160多態(tài)性在各基因模型下的Meta分析結(jié)果
表6 rs4752028多態(tài)性在各基因模型下的Meta分析結(jié)果
圖2 等位基因模型下rs7078160與NSCL/P易感性關(guān)聯(lián)的森林圖
圖3 等位基因模型下rs4752028與NSCL/P易感性關(guān)聯(lián)的森林圖
對rs7078160多態(tài)性基于人種進行亞組分析, 5個已納入的研究是東亞人群[6,11,14-16],除AG vs GG,AA+AG vs GG[OR=1.09,95%CI(0.90,1.32),P=0.384;OR=1.18,95%CI(0.98,1.41),P=0.081],在其他基因模型下,該基因多態(tài)性與NSCL/P有關(guān)。4個已納入的研究是高加索人群[8-9,13,17],除AA vs TT,AA+AG vs GG[OR=2.19,95%CI(0.78,6.18),P=0.139;OR=2.02,95%CI(0.75,5.41),P=0.163],在其他基因模型下,該基因多態(tài)性與NSCL/P有關(guān)。對 rs4752028多態(tài)性基于人種進行亞組分析, 2個已納入的研究是東亞人群[15-16],除CT vs GG,CC+CT vs TT[OR=1.19,95%CI(0.60,2.35),P=0.615,OR=1.31,95%CI(0.80,2.16),P=0.282],在其他基因模型下,該基因多態(tài)性與NSCL/P有關(guān)。見表5、表6。
應用STATA 15.0軟件進行發(fā)表偏倚評估,在利用Egger′s線性回歸法檢驗后,提示無明顯發(fā)表偏倚,見表7。
表7 Egger 檢驗結(jié)果
利用STATA 15.0檢查單個試驗對結(jié)論的影響,在逐一剔除單個實驗的結(jié)論后,合并結(jié)果無顯著變化。見圖4、圖5。
圖4 rs7078160位點在等位基因模型下的敏感性分析
圖5 rs4752028位點在等位基因模型下的敏感性分析
本研究選取的兩個位點基因位于人染色體的10q25.3區(qū)域VAX1基因下游。其多態(tài)性與唇腭裂的關(guān)聯(lián)被認為與VAX1有關(guān)[19]。VAX1編碼同源異形盒轉(zhuǎn)錄因子作用于音猬因子(Sonic hedgehog,Shh)信號通路下游,而且在發(fā)育過程中對Wnt(Wingless/Int)信號通路起抑制作用[20]。VAX1基因在建立唇連續(xù)性時通過抑制Wnt信號通路活性從而促進細胞周期的退出。其基因突變導致唇裂的機制可能是Shh信號通路與Wnt信號通路被擾亂,最終導致唇上皮異常增生,唇無法正常融合[21]。類似的間接證明還有,在眼發(fā)育中,VAX1可以被骨形態(tài)發(fā)生蛋白4(bone morphogenetic protein 4,BMP4)抑制[22],BMP4已被證實與唇腭裂的發(fā)生有關(guān)[3]。但VAX1的致腭裂作用可能是間接的,Geoghegan等[23]觀察到VAX1基因在發(fā)育中小鼠的腭組織中無明顯表達。
Mangold等[24]在一項GWAS研究中首次報道了VAX1 rs7078160、rs4752028多態(tài)性是NSCL/P易感因素。相同的結(jié)論在不同的人群中也得到了驗證。
此外,也有相關(guān)的病例報道證實了該結(jié)論。在兩例患有染色體10q25端點缺失征的患兒中報道出現(xiàn)了唇裂或腭裂[25]。本研究共納入了13篇文獻,是首個關(guān)于VAX1基因多態(tài)性與NSCL/P患病風險的薈萃分析,首次利用薈萃分析的方法驗證了VAX1 rs4752028多態(tài)性增加了NSCL/P的患病風險,并基于更大的樣本量,更全面的數(shù)據(jù)[26]驗證了rs7078160多態(tài)性與NSCL/P有關(guān)。其中,VAX1 rs7078160 A位點、rs4752028 C位點是NSCL/P的風險因子。在等位基因模型下,VAX1 rs7078160可提高NSCL/P的患病風險至1.33倍(見圖2),VAX1 rs4752028可提高NSCL/P的患病風險至1.60倍(見圖3)。
唇腭裂的發(fā)病病因復雜,基因與基因、基因與環(huán)境的交互都與唇腭裂的發(fā)生有關(guān)[2]。因缺乏原始資料,本研究并未做其他重要臨床資料間的分析。其次,本研究只納入了病例對照研究,人群混雜的因素未予以考量。未來仍需在不同人群中的更大樣本、更高質(zhì)量的研究中證實該結(jié)論。
綜上所述,在VAX1附近的rs7078160位點多態(tài)性與NSCL/P易感性有關(guān)?;谟邢薜臄?shù)據(jù), rs4752028位點多態(tài)性可能與NSCL/P易感性有關(guān)。