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        基于CT影像組學(xué)特征的腎腫瘤組織學(xué)亞型分類

        2020-10-09 10:07:26朱元良
        科技風(fēng) 2020年24期
        關(guān)鍵詞:分類

        朱元良

        摘 要:目的:分析基于CT影像組學(xué)特征的腎腫瘤組織學(xué)亞型分類的方法及作用,以期為腎透明細(xì)胞癌(ccRCC)、乏脂肪血管平滑肌脂肪瘤(fp-AML)臨床鑒別診斷工作提供參考。方法:以我院38例ccRCC患者與40例fp-AML患者為研究對象,均施以CT影像學(xué)檢測,提取其CT影像學(xué)組織學(xué)特征,以皮爾森相關(guān)陣矩去除冗雜特征,通過Welchs實(shí)驗(yàn),確定存在明顯差異的特征,借助序列浮動(dòng)前向選擇算法篩選有鑒別能力的CT影像組學(xué)特征,應(yīng)用AdaBoost、支持向量機(jī)(SVM)、隨機(jī)森林(RF)、k最近鄰(kNN)分類器實(shí)施分類。結(jié)果:在AdaBoost、SVM、RF、kNN4種分類器中,SVM的準(zhǔn)確度、敏感度、特異度、陰性預(yù)測率、陽性預(yù)測率均較高,ROC曲線下面積較大,分別為91.82%、89.75%、92.36%、95.01%、86.42%、0.942。結(jié)論:基于CT影像組學(xué)特征的腎腫瘤組織學(xué)亞型分類模型的構(gòu)建,可提高ccRCC、fp-AML臨床鑒別準(zhǔn)確度,促進(jìn)臨床診療工作的順利開展。

        關(guān)鍵詞:CT影像組學(xué)特征;腎透明細(xì)胞癌;乏脂肪血管平滑肌脂肪瘤;分類

        腎腫瘤為泌尿系統(tǒng)最常見的腫瘤之一,多為惡性[1]。臨床上常見的腎腫瘤包括腎母細(xì)胞瘤、腎細(xì)胞癌與發(fā)生于腎盞腎盂的移行細(xì)胞乳頭狀腫瘤。在腎部惡性腫瘤中,90%以上均為腎細(xì)胞癌,其中滲透膜細(xì)胞癌(ccRCC)約占70%,為目前臨床上常見的致死率較高的腎細(xì)胞癌亞型[2]。腎血管平滑肌脂肪瘤則為常見的腎部良性腫瘤,可通過CT檢測確診。而乏脂肪血管平滑肌脂肪瘤(fp-AML)由于缺乏或不含分散性脂肪組織,致使其與ccRCC影像學(xué)特征較為類似,故而,易被臨床誤診[3]。因此,需找尋一種有效鑒別ccRCC、fp-AML的方法,以保證臨床診斷的有效性與準(zhǔn)確性。影像學(xué)組技術(shù)為近年來興起的一種新型影像學(xué)分析方法,其主要是通過提取醫(yī)學(xué)影像內(nèi)具有特殊性的特征,來明確腫瘤特征,從而提升臨床診斷的正確率?,F(xiàn)有研究表示,影像學(xué)技術(shù)結(jié)合機(jī)器學(xué)習(xí)而建立的影像學(xué)模型能有效提升無創(chuàng)檢查方式的客觀性與準(zhǔn)確性,為臨床診療提供可靠依據(jù)。但現(xiàn)階段臨床上對基于CT影像組學(xué)特征的腎腫瘤組織學(xué)亞型分類模型構(gòu)建的相關(guān)研究較少。鑒于此,為驗(yàn)證在ccRCC、fp-AML鑒別中基于CT影像組學(xué)特征的腎腫瘤組織學(xué)亞型分類模型構(gòu)建的方法及意義,現(xiàn)對本院本院38例ccRCC患者與40例fp-AML患者的CT影像學(xué)組特征實(shí)施模型構(gòu)建及分類,具體如下:

        1 資料與方法

        1.1 臨床資料

        選擇我院2019年2月至2020年2月收治的38例ccRCC患者與40例fp-AML患者。所有患者均了解且支持本次研究,并經(jīng)醫(yī)學(xué)理論委員會(huì)批準(zhǔn)。

        1.2 方法

        所有患者均施以CT檢測:選用我院多層螺旋CT機(jī),管帶碾壓設(shè)為120kV,重建切片厚度控制為1mm,截面厚度為5mm,施以常規(guī)掃描。CT圖像攝取時(shí)間和病理檢查時(shí)間間隔不可超過4周。

        提取CT影像學(xué)特征前,首先由1名工作經(jīng)驗(yàn)超過10年的影像學(xué)診斷醫(yī)師勾畫腫瘤感興趣區(qū)域(ROI)。該醫(yī)生于選擇腫瘤最大切面之后,依照腫瘤大小,根據(jù)以下準(zhǔn)則提取ROI:(1)于腫瘤區(qū)域中提取;(2)避開鈣化、出血、囊腫、壞死區(qū)域;(3)選擇均勻、明顯區(qū)域。本研究把矩形框最大尺寸設(shè)定為23×23像素,以減少算法計(jì)算量。

        本研究通過影像學(xué)組技術(shù),從每個(gè)ROI中選取540個(gè)特征,包括:417個(gè)小波特征,92個(gè)紋理特征,31個(gè)灰度特征,以上特征計(jì)算方式皆和圖像生物標(biāo)志物標(biāo)準(zhǔn)化倡議(IBIS)內(nèi)的計(jì)算方法相一致。紋理特征借助分析圖像內(nèi)像素灰度值關(guān)系與分布狀況,客觀評估腫瘤異質(zhì)性,本研究中分別提取灰度依賴矩陣特征22個(gè)、灰度區(qū)域大小矩陣特征20個(gè)、灰度游程矩特征18個(gè)、灰度共生矩陣特征24個(gè)?;叶忍卣鳠o需考慮空間關(guān)系便可描述圖像灰度分布狀況,本研究獲取的灰度值特征主要有峰度、偏度、能量等。對一階離散小波變換(DWT)可把ROI圖像分成HH、HL、LH、LL4個(gè)子圖像,從每個(gè)子圖像中選取紋理、灰度特征,總獲取417個(gè)小波特征。

        選擇CT影像學(xué)特征前,先對特征實(shí)施預(yù)處理,把特征全部歸一化,以防止大數(shù)值中的特征對小數(shù)值中特征進(jìn)行過度的支配。首先,借助皮爾森相關(guān)矩陣(PCM),將冗余特征剔除,然后,通過Welchs查看是否存在統(tǒng)計(jì)學(xué)差異特征;以序列浮動(dòng)前向選擇(SFFS)算法,取具有較好識(shí)別能力的子集,以提高分類的準(zhǔn)確性。

        本研究利用AdaBoost分類器、支持向量機(jī)(SVM)、隨機(jī)森林(RF)、k最近鄰(kNN)分類ccRCC、fp-AML。以留1法評估分類器性能,性能評估內(nèi)容包括陰性預(yù)測值、陽性預(yù)測值、特異度、敏感度、準(zhǔn)確度及ROC曲線下面積。

        2 結(jié)果

        于Spyder3.2.8環(huán)境下實(shí)現(xiàn)編程,因留1法較差檢驗(yàn)的應(yīng)用,對每1折內(nèi)訓(xùn)練集數(shù)據(jù)分別實(shí)施特征選擇。本研究實(shí)驗(yàn)開展82次特征選擇。通過PCM篩選后,剩下401~432個(gè)特征。之后,借助Welchs實(shí)施特征選擇,保留113~125個(gè)特征。最后,以SFFS算法于每1折剩下的特征中選取大小分別為60、50、40、30、20、10的特征子集。對剩余的子集分別應(yīng)用AdaBoost、SVM、kNN、RF分類器實(shí)施分類。4種分類器的性能如下:AdaBoost分類器的準(zhǔn)確度、敏感度、特異度、陰性預(yù)測率、陽性預(yù)測率、ROC曲線下面積分別為88.27%、83.34%、9041%、92.38%、78.24%、0.868;SVM準(zhǔn)確度、敏感度、特異度、陰性預(yù)測率、陽性預(yù)測率、ROC曲線下面積分別為9182%、89.75%、92.36%、95.01%、86.42%、0.942,RF準(zhǔn)確度、敏感度、特異度、陰性預(yù)測率、陽性預(yù)測率、ROC曲線下面積分別為86.74%、83.25%、88.13%、91.42%、75.03%、0.876;kNN準(zhǔn)確度、敏感度、特異度、陰性預(yù)測率、陽性預(yù)測率、ROC曲線下面積分別為88.29%、88.75%、88.13%、93.15%、76.14%、0.921。

        3 討論

        既往臨床關(guān)于ccRCC、fp-AML分類研究中多是通過紋理分析技術(shù)選取少量紋理特征實(shí)施分析。本研究中則選用影像學(xué)技術(shù),獲取CT影像學(xué)圖像的特殊征象,以全面地對腫瘤特征實(shí)施描述。相較于其他研究中通過單一算法實(shí)施特征選擇,本研究則有效融合Wrapper算法與Filter算法對影像學(xué)組特征實(shí)施選擇。同時(shí),本研究選用4種應(yīng)用較為廣泛的分類器對其性能實(shí)施對比,以獲取性能最佳的分類器,從而保證后期臨床診斷正確性。

        目前,在臨床醫(yī)學(xué)影像分析中越來越多的學(xué)者開始關(guān)注于影像學(xué)組技術(shù)的應(yīng)用及發(fā)展。于非侵入性診斷方面,通過影像學(xué)組模型的構(gòu)建,可有效幫助臨床醫(yī)師了解腫瘤特征,為臨床診療工作提供科學(xué)依據(jù)。在基于CT影像學(xué)特征的腎腫瘤組織學(xué)亞型分類模型的構(gòu)建中,通過對冗雜特征、弱相關(guān)特征、無關(guān)特征的剔除,從而可有效明確有效鑒別ccRCC、fp-AML特異性特征,為后期以上兩種疾病診斷中提供參考,促進(jìn)臨床診斷質(zhì)量的提升,避免誤診現(xiàn)象的出現(xiàn)。本研究中借助影像學(xué)技術(shù)于每個(gè)CT圖像ROI區(qū)域內(nèi)中提取417個(gè)小波特征、92個(gè)紋理特征及31個(gè)灰度特征,然后通過PCM與Welchs檢驗(yàn)及SFFS計(jì)算選擇有效的特征,最后,利用4種不同分類器組建模型實(shí)施分類。通過對4種模型性能的對比,得出SVM分類器性能最佳。

        綜上所述,基于CT影像學(xué)特征的腎腫瘤組織學(xué)亞型分類模型的構(gòu)建,可提升腎病疾病診斷準(zhǔn)確性,促進(jìn)患者早期治療工作的開展,具有較好實(shí)踐價(jià)值。

        參考文獻(xiàn):

        [1]王禹,董瀟,孔垂?jié)?,?不同病理類型腎腫瘤的影像學(xué)特點(diǎn)和病理學(xué)特點(diǎn)分析[J].中華泌尿外科雜志,2019,40(5):374-379.

        [2]王平,裴旭,殷小平,等.基于增強(qiáng)CT影像組學(xué)模型鑒別腎透明細(xì)胞癌與非透明細(xì)胞癌[J].中國醫(yī)學(xué)影像技術(shù),2019,35(11):1689-1692.

        [3]丁冠融,李涵默,莊君龍.多排螺旋CT檢查對乏脂肪腎血管平滑肌脂肪瘤的診斷價(jià)值[J].實(shí)用癌癥雜志,2019,31(7):1201-1203.

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