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        五大連池天然露頭泉水源地嗜鐵細(xì)菌的分離鑒定

        2020-09-27 05:17:44王菁華孫義敏李月興郭新明
        國土與自然資源研究 2020年5期
        關(guān)鍵詞:五大連池橘黃色相似性

        劉 威,王菁華,潘 虹,孫義敏,王 松,李月興,郭新明

        (黑龍江省科學(xué)院自然與生態(tài)研究所,哈爾濱150040)

        五大連池隸屬黑龍江省黑河市,位于小興安嶺以及松嫩平原交匯地帶,具有寒溫帶大陸性季風(fēng)氣候特征[1]。此礦泉水區(qū)域內(nèi)富含第四系玄武巖潛水,主要為次生礦水,來源并儲存在嫩江組下伏的石炭系額頭山組片巖、板巖及海西期花崗閃長巖中的原生礦水,沿斷裂并垂直向上含水層排泄為主,在局部地段白堊系含水層中形成次生礦水層,在水頭壓力下向東、東南方向運移,沿南北向張扭性斷裂,以泉的形式排出地表,即南飲泉和北飲泉[2]。五大連池重碳酸礦泉水含有多種微量元素[3],水中鐵離子主要以二價鐵離子的形態(tài)存在,此價態(tài)易于人體吸收,是天然的、理想的鐵離子優(yōu)質(zhì)保健飲品,在醫(yī)療保健方面作用明顯[4-6]。

        微生物在低鐵條件下可合成的一類具有小分子量的、能特異地螯合Fe3+特點的螯合因子,為嗜鐵素,應(yīng)用于醫(yī)藥、生物防治方面越來越受到重視[7]。微生物分泌的嗜鐵素能活化土壤中的難溶性鐵離子,提高鐵元素的溶解性和移動性,進(jìn)而提高土壤中鐵元素的生物利用度[8-10]。大量研究表明,嗜鐵素在植物病害防治和促進(jìn)植物生長方面均起著重要的作用[11-15]。嗜鐵素除了在生物防治方面的應(yīng)用越來越多外,還廣泛應(yīng)用于醫(yī)藥等領(lǐng)域[16]。研究人員將藥物與嗜鐵素通過物理或者化學(xué)方法結(jié)合起來,形成鐵—嗜鐵素—連接體—藥物的復(fù)合物。然后利用微生物特異的鐵—嗜鐵素轉(zhuǎn)運系統(tǒng)將復(fù)合物定向轉(zhuǎn)移到病原菌細(xì)胞內(nèi),從而像單克隆抗體一樣具有靶向作用功能,它可以有效的規(guī)避病原菌微生物的耐藥性問題[17]。

        涌出地面數(shù)小時后的天然礦泉水中二氧化碳大量逸失,溶解氧含量增加,導(dǎo)致二價鐵離子迅速氧化。故本研究嘗試從五大連池天然露頭泉水源地篩選分泌嗜鐵素的細(xì)菌,對菌株形態(tài)特征、培養(yǎng)性狀、生理生化特性及16S rRNA 序列進(jìn)行鑒定,為所篩菌株的開發(fā)利用提供理論依據(jù)與技術(shù)支持。

        1 材料和方法

        1.1 試驗材料

        1.1.1 樣品:選取五大連池天然露頭泉附近共10 個采樣點,采集樣品。

        1.1.2 培養(yǎng)基。CAS 檢測平板[18]。

        1.1.3 主要試劑。生理生化試劑盒(海博);Biospin Bacteria Genomic DNAExtraction Kit 試劑盒購自上海生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司;PCR 擴(kuò)增的全套試劑購自大連寶生物工程有限公司;16S rRNA 序列擴(kuò)增引物由上海生物工程技術(shù)服務(wù)有限公司合成;鉻天青成都艾科達(dá)化學(xué)試劑有限公司。

        1.2 試驗方法

        1.2.1 嗜鐵素分泌細(xì)菌的分離與篩選。稱取各樣本1g,加入 100mL 的 LB 培養(yǎng)液中,在 28℃培養(yǎng)條件下振蕩培養(yǎng)48h,轉(zhuǎn)速200r/min。對培養(yǎng)液進(jìn)行稀釋,最后 3 個稀釋度(10-5~10-7)各取 100μL,各稀釋度做 3個重復(fù)。采用CAS 檢測平板法,28℃恒溫培養(yǎng)5d,觀察培養(yǎng)皿菌落生長情況及橘黃色螯合圈的產(chǎn)生。將各單菌落在CAS 固體培養(yǎng)基上進(jìn)行劃線分離并純化,根據(jù)橘黃色菌圈的大小篩選產(chǎn)嗜鐵素能力較強的菌株。

        1.2.2 菌種鑒定。形態(tài)觀察:將所篩細(xì)菌進(jìn)行菌落及菌體形態(tài)觀察,鑒定依據(jù)《伯杰氏細(xì)菌鑒定手冊》進(jìn)行。生理生化鑒定:參照《伯杰氏細(xì)菌鑒定手冊第九版》。分子鑒定:16S rRNA 基因的序列分析:將待測的菌種轉(zhuǎn)接于TSB 斜面培養(yǎng)基,待菌種生長成熟后轉(zhuǎn)接于TSB液體培養(yǎng)基中,28℃恒溫,250rpm 震蕩培養(yǎng)3~7d。離心收集菌體,用無菌水洗滌3 次后置于4℃保存、備用。提取基因組DNA,利用上述提取的基因組DNA 作為 16S rRNA 基因組PCR 擴(kuò)增的模板,16S 通用引物為27F 和1492R,然后進(jìn)行膠回收PCR 產(chǎn)物,并采用瓊脂糖凝膠電泳進(jìn)行驗證。PCR 回收產(chǎn)物與pMD-18T連接后放入16℃水浴中連接3h 左右,轉(zhuǎn)化DH5a 大腸桿菌感受態(tài)細(xì)胞;分別提取質(zhì)粒然后PCR(方法同上),瓊脂糖凝膠電泳驗證是否為陽性克隆,并送至測序公司測序。將測序結(jié)果在NCBI 上,經(jīng)BLAST 軟件與已知的16S rRNA 序列進(jìn)行相似性分析,選取近源模式種用ClustX 1.81 軟件進(jìn)行多序列比對。在GenBank 數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行相似性搜索,選定其中同源性較高的相關(guān)菌株, 用 MAGE 7.0 軟件以Neighbor-Joining 方法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 菌株的分離與篩選

        從10 個采樣點中利用CAS 檢測平板法初篩獲得19 株產(chǎn)嗜鐵素細(xì)菌。CAS 瓊脂培養(yǎng)基中因含有CAS、十六烷基銨(HDTMA)及Fe3+的三元復(fù)合物而呈藍(lán)色。當(dāng)更強的螯合劑將鐵從該復(fù)合物中移出時,顏色會由藍(lán)色轉(zhuǎn)為橘黃色。挑取初篩平板上產(chǎn)生橘黃色暈圈的菌落(圖1 第一排三個平板)和不產(chǎn)生橘黃色暈圈的菌落(圖1 第2 排三個平板),如圖所示,挑取單菌落接種到CAS 固體平板上培養(yǎng)后,目標(biāo)菌落在CAS 平板上產(chǎn)生明顯的橘黃色暈圈,而沒有產(chǎn)嗜鐵素細(xì)菌的采樣點不產(chǎn)生橘黃色暈圈。

        2.2 菌株產(chǎn)嗜鐵素能力的定性檢測

        對19 株初篩菌株利用點接培養(yǎng)對產(chǎn)嗜鐵素的能力進(jìn)行定性檢測,平板上均出現(xiàn)明顯的橘黃色暈圈,說明所篩菌株均具有較強的產(chǎn)嗜鐵素能力。選取兩株產(chǎn)橘黃色菌圈明顯的菌株2-12、3-4,2-12 號較3-4號菌產(chǎn)橘黃色菌圈直徑大,如圖2 所示,說明2-12 號菌產(chǎn)嗜鐵素能力更強。

        2.3 嗜鐵素分泌細(xì)菌的鑒定結(jié)果

        2.3.1 形態(tài)觀察結(jié)果。篩選出的19 株嗜鐵素分泌菌的染色、形態(tài)和培養(yǎng)特征:均為革蘭氏陰性桿菌,大小在 0.5~0.8μm×1.5~3.0μm 間,1~4 根極生鞭毛,有莢膜,運動,無芽孢。在KMB 平板上,三類菌株菌落圓形隆起,邊緣整齊,濕潤,粘稠,易挑起,菌落初期透明,后期膿狀樣,菌落較大且顯現(xiàn)不同程度的黃色。

        2.3.2 生理生化鑒定結(jié)果。依據(jù)《伯杰氏細(xì)菌鑒定手冊》可確認(rèn)篩選出的19 株嗜鐵素分泌菌均為假單胞菌屬細(xì)菌(Pseudo-monas spp.)。不同菌株生理生化特征如表1 所示,各分離菌株符合假單胞菌的基本特征,在甲基紅試驗和V-P 試驗中均呈陰性,不水解淀粉、乳糖,能還原硝酸鹽,均具有氧化酶、雙水解酶、精氨酸、過氧化氫酶活性,不產(chǎn)生吲哚和H2S,能在4℃低溫生長。這與相關(guān)文獻(xiàn)報道相符[19,20]。

        2.3.3 16S rRNA 基因的序列分析。分離菌株在NCBI上經(jīng)BLAST 分析,結(jié)果表明各菌株均屬于假單胞菌屬,分別與 Pseudomonas qingdaonensis、Pseudomonas donghuensis 和Pseudomonas protegens 具有最高相似性,序列相似性均大于99%。將測定的假單胞菌16S rRNA序列測定的結(jié)果在GenBank 數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行相似性搜索,選定同源性較高的相關(guān)菌株,以Neighbor-Joining 方法用MAGE 7.0 軟件構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,得到相應(yīng)的分類學(xué)上的地位。16S rRNA 基因序列的系統(tǒng)發(fā)育分析結(jié)果如圖3,系統(tǒng)發(fā)育樹共有3 個分枝,代表有3 個類群,其中類群Ⅰ有12 個菌株,類群Ⅱ有2 個菌株,類群Ⅲ有5 個菌株,各類群之間親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。

        圖1 產(chǎn)嗜鐵素細(xì)菌的分離篩選

        圖2 嗜鐵素分泌菌2-12、3-4 嗜鐵能力的定性檢測

        表1 生理生化特性

        圖3 根據(jù)16S rRNA 基因序列構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育進(jìn)化樹

        3 結(jié)論與討論

        本研究共得到19 株具有分泌嗜鐵素功能的細(xì)菌,根據(jù)菌株形態(tài)學(xué)特征、生理生化特性及16S rRNA基因序列分析,各菌株均為假單胞菌屬,分別與Pseudomonas qingdaonensis、Pseudomonas donghuensis 和Pseudomonas protegens 具有最高相似性,序列相似性均大于99%。對19 株初篩菌株利用點接培養(yǎng)對其產(chǎn)嗜鐵素能力進(jìn)行定性檢測,平板上均出現(xiàn)明顯的橘黃色暈圈,具有較強的產(chǎn)嗜鐵素能力,選取兩株產(chǎn)橘黃色菌圈明顯的菌株 2-12、3-4,2-12 號較 3-4 號菌產(chǎn)橘黃色菌圈直徑大,2-12 號菌產(chǎn)嗜鐵素能力更強。

        五大連池南泉礦泉水自然涌出的溫度接近于4℃,水中的Fe 主要以Fe2+形式存在,涌出地面數(shù)小時后的天然礦泉水中溶解的二氧化碳?xì)怏w大量逸失,溶解氧含量增加,二價鐵離子迅速氧化為三價鐵,最終變成氧化鐵沉淀。水源地篩選的嗜鐵素分泌菌為礦泉水開發(fā)中的利用提供了理論依據(jù)與技術(shù)支持。

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