張正衛(wèi),楊一君
(南京醫(yī)科大學(xué)附屬淮安第一醫(yī)院 1.病理科,2.婦產(chǎn)科,江蘇 淮安 223001)
結(jié)直腸癌是目前世界上常見的惡性腫瘤之一,每年約有120 萬新發(fā)病例,同時約有60 萬患者死于該病[1]。及時診斷和治療雖然降低了結(jié)直腸癌患者的病死率,但是患者的5年生存率仍然停留在60%~70%[2],一大部分結(jié)直腸癌患者被確診時已經(jīng)處于進展期,局部侵襲和遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移是結(jié)直腸癌患者死亡的重要原因,因此預(yù)防和緩解結(jié)直腸癌的進展和轉(zhuǎn)移對改善患者的預(yù)后意義重大。
長鏈非編碼RNA(long non-coding RNAs, lncRNA)屬于長度>200 個核苷酸的非編碼RNA,越來越多的研究報道lncRNAs 與細(xì)胞凋亡、增殖、遷移、侵襲等密切相關(guān),在腫瘤發(fā)生、發(fā)展中的作用也愈發(fā)受到關(guān)注[3-5],LncRNA 在多種類型腫瘤中異常表達,通過多種途徑影響腫瘤進展和轉(zhuǎn)移[6-8]。lncRNA HSALNT0000015 是一個編碼289 個核苷酸的lncRNA,本研究通過檢測lncRNA HSALNT0000015 在結(jié)直腸癌組織和人結(jié)直腸癌細(xì)胞中的表達,分析其對結(jié)直腸癌細(xì)胞增殖、遷移和侵襲的影響,探討lncRNA HSALNT0000015 與結(jié)直腸癌進展、轉(zhuǎn)移及預(yù)后的關(guān)系。
DMEM 培養(yǎng)基和胎牛血清(FBS)購自美國Gibco公司,人結(jié)直腸癌細(xì)胞Lovo、SW480、HT-29、HCT 116 和正常人腸黏膜上皮細(xì)胞HIEC 購自上海中國科學(xué)院細(xì)胞庫,敲減lncRNA HSALNT0000015 的質(zhì)粒和空載質(zhì)粒購自上海吉凱生物有限公司,Lipofectamine 2000脂質(zhì)體、MTT 試劑盒和實時熒光定量聚合酶鏈反應(yīng)(quantitative real-time PCR, qRT-PCR)試劑盒和引物購自上海生工生物工程股份有限公司,Transwell 小室和Matrige 基質(zhì)購自美國Corning 公司,抗轉(zhuǎn)錄因子Slug、上皮鈣黏素(E-cadherin)、波形蛋白(Vimentin)及GAPDH 抗體購自美國CST 公司,生存期結(jié)腸癌cDNAHColA095Su02 芯片購自上海芯超生物有限公司,手術(shù)標(biāo)本取自南京醫(yī)科大學(xué)附屬淮安第一醫(yī)院結(jié)直腸癌患者,包括癌組織80 例,癌旁組織15 例。手術(shù)時間2006年2月—2010年2月,隨訪時間截至2015年9月。
1.2.1 細(xì)胞培養(yǎng)和轉(zhuǎn)染人結(jié)直腸癌細(xì)胞Lovo、SW480、HT-29、HCT116 和正常人腸黏膜上皮細(xì)胞HIEC 培養(yǎng)于含5% FBS 的DMEM 培養(yǎng)基,置于5%二氧化碳、37℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng),由于結(jié)直腸癌細(xì)胞系HCT116 中l(wèi)ncRNA HSALNT0000015 表達最高,選取對數(shù)生長期的HCT116 細(xì)胞進行轉(zhuǎn)染,參照轉(zhuǎn)染說明書進行操作,將HCT116 細(xì)胞以2×105個/孔接種于6 孔板,當(dāng)融合度達50%~60%時,分別將空白對照、陰性對照質(zhì)粒、siRNA 轉(zhuǎn)染HCT116 細(xì)胞設(shè)為空白組、對照組及實驗組,繼續(xù)培養(yǎng)12 h 后更換培養(yǎng)基。
1.2.2 qRT-PCR 檢測lncRNA HSALNT0000015 水平使用Trizol 試劑提取細(xì)胞RNA,將RNA 逆轉(zhuǎn)錄為cDNA 后進行檢測,以GAPDH 為內(nèi)參,檢測lncRNA HSALNT0000015 相對表達水平,lncRNA HSALNT00 00015 表達量取中位數(shù),高于中位數(shù)定義為lncRNA HSALNT0000015 高表達,低于中位數(shù)定義為lncRNA HSALNT0000015 低表達。qRT-PCR反應(yīng)體系為: cDNA 模板2 μl,正、反向引物各1 μl,10×混合試劑2 μl,雙蒸水15 μl,反應(yīng)條件為94℃預(yù)變性3 min,94℃變性30 s、55℃退火30 s、72℃ 延伸30 s,共30 個循環(huán)。見表1。
1.2.3 MTT 法檢測細(xì)胞增殖能力取轉(zhuǎn)染后狀態(tài)良好的空白組、對照組及實驗組HCT116 細(xì)胞,消化收集細(xì)胞后將密度調(diào)整為0.5×104個/ml,以3×103個/孔接種于96 孔板。使用MTT 試劑盒檢測細(xì)胞的增殖能力,每孔加入MTT 溶液10 μl,繼續(xù)培養(yǎng)4 h,酶標(biāo)儀檢測490 nm 波長處的光密度(OD)值,檢測第0、12、24、36 及72 小時的細(xì)胞增殖能力。實驗重復(fù)5 次。
1.2.4 Transwell 遷移/侵襲實驗檢測細(xì)胞遷移/侵襲能力取轉(zhuǎn)染后狀態(tài)良好的空白組、對照組及實驗組HCT116 細(xì)胞,消化收集細(xì)胞,使用無血清培養(yǎng)基調(diào)整細(xì)胞密度為2×104個/ml,以0.4×103個/孔加入Transwell 小室,在下室中加入10% FBS 的500 μl 培養(yǎng)基,繼續(xù)培養(yǎng)12 h 后,使用甲醇固定,0.2%結(jié)晶紫染色,倒置顯微鏡下觀察,取4 個視野(100 倍)計數(shù),實驗重復(fù)4 次。侵襲實驗: 在遷移實驗的基礎(chǔ)上在上室鋪Matrige 基質(zhì),其余操作同遷移實驗。
表1 qRT-PCR 引物及siRNA 寡核苷酸序列
1.2.5 免疫印跡法檢測細(xì)胞遷移相關(guān)蛋白表達水平取轉(zhuǎn)染后狀態(tài)良好的空白組、對照組及實驗組HCT116細(xì)胞,提取蛋白后進行聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDSPAGE),一抗孵育過夜,二抗孵育1 h 后顯影。GAPDH為內(nèi)參,檢測E-cadherin、Slug 和Vimentin 蛋白。實驗重復(fù)4 次。
數(shù)據(jù)分析采用SPSS 22.0 統(tǒng)計軟件,計量資料以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(±s)表示。比較采用成組t檢驗、單因素方差分析或重復(fù)測量設(shè)計的方差分析,進一步兩兩比較采用LSD-t檢驗;計數(shù)資料以例表示,比較用χ2檢驗;生存分析采用Kaplan-Meier 生存曲線,組間比較采用Log-rank χ2檢驗;多因素分析采用Cox 回歸模型,P<0.05 為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
lncRNA HSALNT0000015 在結(jié)直腸癌組織中相對表達量(6.890±0.180)與癌旁組織(2.127±0.242)比較,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(t=11.062,P=0.000);結(jié)直腸癌組織中l(wèi)ncRNA HSALNT0000015 高、低表達的淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移和臨床分期比較,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05),表達越高,腫瘤越趨于淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移,臨床分期越高;而年齡、性別及T 分期比較,差異無統(tǒng)計學(xué)意義(均P>0.05)。見表2。
結(jié)直腸癌患者術(shù)后隨訪5 ~9年,死亡43 例,生存分析結(jié)果顯示,在Ⅰ、Ⅱ期(42 例)、Ⅲ、Ⅳ期(38 例)和Ⅰ~Ⅳ期(80 例)的結(jié)直腸癌患者中,lncRNA HSALNT0000015 高表達患者的總體生存率均低于lncRNA HSALNT0000015 低表達患者(χ2=60.241、14.820 和65.232,均P=0.000)。多因素Cox回歸分析結(jié)果表明,結(jié)直腸癌組織中l(wèi)ncRNA HSALNT 0000015 高表達是結(jié)直腸癌患者預(yù)后不良的危險因素[=16.289(95% CI: 6.950,38.179),P=0.000]。見圖1和表3、4。
結(jié)直腸癌細(xì)胞Lovo、SW480、HT-29、HCT116中l(wèi)ncRNA HSALNT0000015 表達高于正常人腸黏膜上皮細(xì)胞HIEC(F=153.942,P=0.000),選擇HCT116細(xì)胞作為實驗細(xì)胞敲減lncRNA HSALNT0000015 的表達(見圖2A)。由于si-1 敲減效率最高(F=40.760,P=0.000),因此選擇si-1 作為實驗組細(xì)胞(見圖2B)。第0、12、24、48 和72 小時,空白組HCT116細(xì)胞的OD 值分別為(0.221±0.011)、(0.423±0.032)、(0.615±0.041)、(1.021±0.092)和(1.434±0.124),對照組HCT116 細(xì)胞的OD 值分別為(0.223±0.022)、(0.434±0.042)、(0.652±0.033)、(0.963±0.122)、(1.432±0.114),實驗組HCT116 細(xì)胞的OD 值分別為(0.201±0.032)、(0.184±0.022)、(0.291±0.062)、(0.383±0.032)、(0.501±0.042)。3 組不同時間點OD 值比較,采用重復(fù)測量設(shè)計的方差分析,結(jié)果: ①不同時間點OD 值有差異(F=589.198,P=0.001);②組間OD 值比較有差異(F=790.000,P=0.001),實驗組低于空白組和對照組;③3 組OD 值變化趨勢有差異(F=168.913,P=0.000)。見圖2C。
表2 結(jié)直腸癌組織中l(wèi)ncRNA HSALNT0000015 表達與臨床病理特征的關(guān)系 例
圖1 lncRNA HSALNT0000015 不同表達水平結(jié)直腸癌患者的Kaplan-Meier 生存曲線
表3 結(jié)直腸癌患者預(yù)后因素的單因素分析參數(shù)
表4 結(jié)直腸癌患者預(yù)后因素的多因素分析參數(shù)
圖2 敲減HSALNT0000015 后抑制HCT116 細(xì)胞的增殖能力
遷移實驗中,HCT116 細(xì)胞穿膜細(xì)胞數(shù),實驗組為(40.442±7.481)個/視野、空白組為(133.812±7.473)個/ 視野、對照組為(132.442±8.623)個/ 視野,3 組比較,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(F=737.991,P=0.000)。侵襲實驗中,HCT116 細(xì)胞穿膜細(xì)胞數(shù),實驗組為(18.562±2.941)個/視野、空白組為(55.942±7.683)個/視野和對照組為(54.313±7.684)個/視野,3 組比較,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(F=191.223,P=0.000)。見圖3。
3 組E-cadherin、Slug 和Vimentin 蛋白相對表達量比較,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P<0.05)。實驗組HCT116 細(xì)胞E-cadherin 蛋白相對表達量高于空白組和對照組(P<0.05),而Slug 和Vimentin 蛋白相對表達量低于空白組和對照組(P<0.05)。見表5和圖4。
圖3 敲減HSALNT0000015 后抑制HCT116 細(xì)胞遷移和侵襲能力 (×100)
表5 3 組Slug、E-cadherin 和Vimentin 蛋白相對表達量的比較 (±s)
表5 3 組Slug、E-cadherin 和Vimentin 蛋白相對表達量的比較 (±s)
組別 Slug E-cadherin Vimentin空白組 0.693±0.035 0.550±0.030 0.997±0.180對照組 0.600±0.062 0.427±0.031 0.897±0.045實驗組 0.267±0.055 1.377±0.172 0.260±0.046 F 值 55.445 76.812 39.514 P 值 0.000 0.000 0.000
圖4 在HCT116 細(xì)胞中敲減lncRNA HSALNT0000015后對相關(guān)蛋白的影響
lncRNA 可以作為miRNA 海綿結(jié)合并調(diào)控miRNA的功能,除此之外,lncRNA 也可以與蛋白質(zhì)相互作用增強或削弱其功能[4],lncRNA 在腫瘤早期診斷和治療方面的潛力越來越受到關(guān)注[9-11],lncRNA 可能在腫瘤的發(fā)生、發(fā)展過程中起到重要作用。許多l(xiāng)ncRNA 如LINC01354、CPS1-IT1、RP11 在結(jié)直腸癌組織中異常高表達或低表達,發(fā)揮促癌作用或抑癌作用[6,12-13]。HSALNT0000015 是一種新發(fā)現(xiàn)的尚不清楚功能的lncRNA。
本研究結(jié)果表明,lncRNA HSALNT0000015 在結(jié)直腸癌組織和結(jié)直腸癌細(xì)胞中的表達水平高于癌旁組織和正常人腸上皮細(xì)胞,且隨著TNM 分期越高相對表達更高;此外,lncRNA HSALNT0000015 在有淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移結(jié)直腸癌組織中較無淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移結(jié)直腸癌組織中相對表達更高。敲減結(jié)直腸癌HCT116 細(xì)胞中l(wèi)ncRNA HSALNT0000015 的表達水平后,細(xì)胞增殖、遷移和侵襲能力均被抑制,以上結(jié)果提示lncRNA HSALNT0000015 可能參與調(diào)控結(jié)直腸癌的進展和轉(zhuǎn)移。
上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化過程將上皮細(xì)胞重新編程使其具有間充質(zhì)表型,是增強腫瘤細(xì)胞侵襲和轉(zhuǎn)移的關(guān)鍵步驟[14]。已有許多研究報道lncRNA 通過上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化過程促進結(jié)直腸癌遷移和侵襲[15-17],上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化過程由一系列轉(zhuǎn)錄因子介導(dǎo),如Slug、Snail、Twist和Zed1/2 等,轉(zhuǎn)錄因子可以抑制E-cadherin 并誘導(dǎo)間充質(zhì)標(biāo)志物如N 型鈣黏蛋白、Vimentin 和纖連蛋白的表達[18-20]。本研究敲減結(jié)直腸癌細(xì)胞HCT116 細(xì)胞中l(wèi)ncRNA HSALNT0000015 的表達后,轉(zhuǎn)化因子Slug 和Vimentin 表達下調(diào),E-cadherin 表達上升,表明lncRNA HSALNT0000015 可能是通過上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化過程促進結(jié)直腸癌細(xì)胞的遷移和侵襲。
生存分析發(fā)現(xiàn),lncRNA HSALNT0000015 與結(jié)直腸癌患者的不良預(yù)后呈正相關(guān),Cox 回歸分析結(jié)果顯示,腫瘤組織中l(wèi)ncRNA HSALNT0000015 的異常高表達是結(jié)直腸癌患者總體生存時間的危險因素,以上結(jié)果表明lncRNA HSALNT0000015 可以作為判斷結(jié)直腸癌患者的不良預(yù)后標(biāo)志物。
綜上所述,HSALNT0000015 在結(jié)直腸癌組織和細(xì)胞中異常高表達,且其高表達可能與腫瘤增殖、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、TNM 分期相關(guān),敲減lncRNA HSALNT0000015 的表達可以抑制結(jié)直腸癌細(xì)胞系HCT116 的增殖、遷移和侵襲能力,其作用機制可能為lncRNA HSALNT0000015 通過上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化過程促進結(jié)直腸癌細(xì)胞的遷移和侵襲,lncRNA HSALNT0000015 可能會為結(jié)直腸癌患者預(yù)后判斷和治療提供新的方向。