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        miR-497-5p靶向調(diào)控CCNE1基因抑制胰腺癌細胞增殖

        2020-09-11 13:43:48姜達偉許瀏王偉林
        腫瘤防治研究 2020年8期
        關(guān)鍵詞:熒光素酶陰性調(diào)控

        姜達偉,許瀏,王偉林

        0 引言

        胰腺癌(Pancreatic cancer,PaCa)是惡性程度極高的實體腫瘤,以早期診斷困難、進展迅速、易轉(zhuǎn)移和化學(xué)耐藥性為主要臨床特征[1]。雖然近年來PaCa的治療取得了較大進步,包括手術(shù)切除、化療和放療,但PaCa患者術(shù)后5年總體生存率仍低于5%[2]。微小RNA(microRNA,miR)是一類長度極短的非編碼RNA分子,通過直接結(jié)合靶基因的3'-非翻譯區(qū)(3'-untranslated region,3’-UTR)而在轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié)靶基因表達,表現(xiàn)為誘導(dǎo)mRNA降解或抑制mRNA翻譯[3]。有研究表明,miR在PaCa的發(fā)生和進展中具有關(guān)鍵調(diào)控作用[4]。研究發(fā)現(xiàn),miR-497-5p在血管肉瘤中表達下調(diào),并且靶向調(diào)控KCa3.1離子通道抑制腫瘤細胞的增殖與侵襲[5]。骨肉瘤組織和細胞中同樣發(fā)現(xiàn)miR-497-5p表達下調(diào),且過表達miR-497-5p靶向調(diào)控ADP-核糖基化因子樣蛋白2(ADP ribosylation factor-like protein 2,ARL2)抑制腫瘤細胞的增殖并誘導(dǎo)凋亡[6]。此外,Chai等[7]發(fā)現(xiàn)miR-497-5p在黑色素瘤組織中表達下調(diào),過表達miR-497-5p抑制A375細胞增殖、遷移和侵襲,并誘導(dǎo)凋亡。目前,miR-497-5p在PaCa中的作用及其分子機制尚未明確。本研究擬對比進行探討,為該腫瘤的治療提供新的見解及思路。

        1 資料與方法

        1.1 臨床樣本收集

        收集2008年3月—2013年3月嘉興學(xué)院附屬醫(yī)院肝膽胰外科通過手術(shù)或穿刺方式獲取的34例PaCa癌組織及其相應(yīng)的癌旁正常組織(癌細胞邊緣≥3 cm),其中男22例,女12例,平均年齡51.72±5.96歲,29例導(dǎo)管腺癌,5例腺鱗癌?;颊咝g(shù)前均無放化療記錄。所有組織均由本院兩位病理學(xué)專家以雙盲方式進行檢查核對,立即放置于液氮中進行快速冷凍并儲存于-80℃?zhèn)溆谩T撗芯恳勋@嘉興學(xué)院附屬第一醫(yī)院倫理委員會批準,所有患者均簽署書面知情同意書。術(shù)后隨訪時間為5年,生存期為手術(shù)至死亡時間或手術(shù)至最后記錄點時間。

        1.2 儀器與試劑

        Prism 7900HT/FAST型熒光定量PCR儀(Applied Biosystems,美國),酶標儀(Thermo Fisher Scientific,美國),F(xiàn)ACSCalibur流式細胞儀(Beckman,美國),E-Gel Imager凝膠成像系統(tǒng)(Invitrogen,美國),LSM710倒置光學(xué)顯微鏡(Zeiss,德國),熒光素酶測試儀(Invitrogen,美國)。反轉(zhuǎn)錄試劑(Qiagen,德國),熒光定量試劑盒(Takara,日本),細胞培養(yǎng)基、血清及l(fā)ipofectamine 2000轉(zhuǎn)染試劑(Thermo Fisher Scientific,美國),Annexin V-FITC/PI凋亡試劑盒(BD,美國),抗CCNE1抗體(Santa Cruz Biotechnology,美國),miR-497-5p模擬物及模擬物陰性對照(RiboBio,中國廣州),雙熒光素酶報告基因試劑盒(Promega,美國),Capan-2和PANC-1細胞(ATCC,美國)。

        1.3 細胞轉(zhuǎn)染

        miR-497-5p模擬物及模擬物陰性對照的序列分別是5’-CAGCAGCACACUGUGGUUUGUAAACCACAGUGUGCUGCUGUU-3’和5’-UUCUCCGAACGUGUCACGUTT-3’。將Capan-2和PANC-1細胞接種至6孔板中,細胞融合度約80%后更換無血清培養(yǎng)基。使用lipofectamine 2000進行轉(zhuǎn)染,分別加入100 pmol miR-497-5p模擬物及模擬物陰性對照,培養(yǎng)6 h后更換含血清培養(yǎng)基,繼續(xù)培養(yǎng)48 h后收集細胞并檢測轉(zhuǎn)染效率。

        1.4 CCK-8實驗檢測細胞增殖

        將轉(zhuǎn)染后的Capan-2和PANC-1細胞接種至96孔板中,37℃、5%CO2的條件下分別培養(yǎng)0、12、24、48及72 h,加入20 μl CCK-8溶液,繼續(xù)培養(yǎng) 2 h。利用酶標儀在450 nm的波長下檢測每孔光密度值。

        1.5 流式細胞術(shù)檢測細胞周期變化

        將轉(zhuǎn)染后的Capan-2和PANC-1細胞接種至6孔板中,37℃、5%CO2的條件下培養(yǎng)48 h后收集細胞,并將細胞密度調(diào)至1×106個/毫升。取1 ml單細胞懸浮液放至75%乙醇中4℃固定過夜。冷PBS洗滌細胞三次,37℃恒溫水浴中用RNase A處理細胞30 min,并在4℃暗室中用碘化丙啶染色20 min。流式細胞儀檢測各期細胞比例。

        1.6 實時熒光定量PCR實驗

        TRIzol試劑抽提細胞和組織的總RNA,并進行反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)。miR-497-5p反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)條件:37℃ 60 min,95℃ 5 min及4℃ 30 min。miR-497-5p實時熒光定量PCR反應(yīng)條件為:95℃ 15 min,94℃ 15 s,55℃ 30 s,72℃ 30 s,共40個循環(huán)。miR-497-5p正義引物:5’-CCTTCAGCAGCACACTGTGG-3’;反義引物:5’-CAGTGCAGGGTCCGAGGTAT-3’;以U6為內(nèi)參,U6正義引物:5’-CTCGCTTCGGCAGCACA-3’;反義引物:5’-AACGCTTCACGAATTTGCGT-3’。CCNE1反轉(zhuǎn)錄反應(yīng)條件:37℃ 15 min,85℃ 5 s及4℃30 min。CCNE1實時熒光定量PCR反應(yīng)條件為:98℃ 20 min,98℃ 10 s,60℃ 30 s,72℃ 30 s,共40個循環(huán)。CCNE1正義引物:5’-GGAAGAGGAAGGCAAACGTG-3’;反義引物:5’-GCAATAATCCGAGGCTTGCA-3’;以GAPDH為內(nèi)參,正義引物:5’-TCGTGGAAGGACTCATGACC-3’;反義引物:5’-ATGATGTTCTGGAGAGCCCC-3’。采用2-ΔΔCt法計算PaCa細胞和組織中miR-497-5p和CCNE1 mRNA的相對表達水平。

        1.7 雙熒光素酶報告基因?qū)嶒?/h3>

        采用MiRcode 11(http://www.mircode.org)分析miR-497-5p與CCNE1 3'-UTR之間的結(jié)合位點。將人CCNE1 mRNA 3’-UTR(包括miR-497-5p的互補結(jié)合位點)克隆至pmirGLO雙熒光素酶報告質(zhì)粒的螢火蟲基因的下游,構(gòu)建CCNE1-野生型(WT)報告質(zhì)粒。同時將突變的結(jié)合位點插入螢火蟲基因的下游產(chǎn)生CCNE1-突變體(MUT)報告質(zhì)粒。將Capan-2和PANC-1細胞接種至6孔板,共轉(zhuǎn)染0.5 μg CCNE1-WT或CCNE1-MUT報告質(zhì)粒和50 pmol miR-497-5p模擬物或模擬物陰性對照。轉(zhuǎn)染48 h后,采用雙熒光素酶報告分析系統(tǒng)檢測螢火蟲和海腎熒光素酶活性,并以海腎熒光素酶活性為參照。

        1.8 蛋白質(zhì)印跡法

        采用RIPA裂解液在4℃下提取總蛋白。通過12%十二烷基硫酸鈉聚丙烯酰胺凝膠電泳膠分離總蛋白,將蛋白質(zhì)印跡轉(zhuǎn)移至PVDF膜,37℃、5%脫脂奶粉封閉2 h,膜與抗CCNE1抗體(1:500稀釋)4℃共孵育過夜。TBST緩沖液洗滌3次后,將膜與辣根過氧化物酶綴合(HRP)的二抗(1:2 000稀釋)37℃共孵育1 h。曝光膠片并檢測陽性條帶。

        1.9 統(tǒng)計學(xué)方法

        采用SPSS19.0軟件進行統(tǒng)計學(xué)分析。計量資料以平均值±標準差形式表示,計數(shù)資料以率的形式表示。采用配對t檢驗分析miR-497-5p與CCNE1 mRNA在癌組織和癌旁組織中的表達差異??ǚ綑z驗分析miR-497-5p的表達與臨床病理特征的關(guān)系。Kaplan-Meier生存分析法分析miR-497-5p的表達與預(yù)后的關(guān)系。CCK-8實驗結(jié)果采用單因素方差分析,其余結(jié)果采用t檢驗。P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1 miR-497-5p在PaCa中的表達水平及臨床意義

        PCR實驗結(jié)果顯示,在癌組織中miR-497-5p表達顯著低于癌旁組織(P<0.001),見圖1A。T3+T4期患者癌組織中miR-497-5p的表達水平顯著低于T1+T2期患者(P<0.001),見圖1B。以miR-497-5p在癌組織表達水平的中位數(shù)(0.21)為臨界值,將34例PaCa患者劃分為低表達miR-497-5p組和高表達miR-497-5p組,每組17例。低表達miR-497-5p與較高的T分期相關(guān)(P=0.003),而與年齡、性別、腫瘤大小、分化程度、臨床分級、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、血管侵犯及CA19-9水平無相關(guān)性,見表1。

        2.2 miR-497-5p的表達與PaCa患者預(yù)后的關(guān)系

        圖1 實時熒光定量PCR實驗分析miR-497-5p在癌與癌旁正常組織(A)及不同T分期癌組織(B)中的表達Figure 1 miR-497-5p expression in cancer tissues,adjacent normal tissues(A) and different T stages cancer tissues(B)detected by real-time quantitative PCR

        表1 miR-497-5p的表達與胰腺癌患者臨床病理特征之間的關(guān)系Table 1 Relation between miR-497-5p expression and clinicopathological characteristics of pancreatic cancer(PaCa) patients

        低表達miR-497-5p組與高表達miR-497-5p組的中位生存時間分別為31月和47月。低表達miR-497-5p組中15例患者死亡,2例患者存活,生存率為11.76%(2/17);高表達miR-497-5p組中12例患者死亡,5例患者存活,生存率為29.41%(5/17)。低表達miR-497-5p組患者5年總體生存率顯著低于高表達miR-497-5p組患者(P=0.036),見圖2。

        圖2 Kaplan-Meier法分析miR-497-5p的表達與PaCa患者預(yù)后的關(guān)系Figure 2 Relation between miR-497-5p expression and prognosis of PaCa patients detected by Kaplan-Meier method

        2.3 過表達miR-497-5p對PaCa細胞增殖的影響

        與模擬物陰性對照相比,轉(zhuǎn)染miR-497-5p模擬物可顯著提高Capan-2和PANC-1細胞中miR-497-5p的表達水平(均P<0.001),見圖3A。與模擬物陰性對照組細胞相比,Capan-2和PANC-1細胞轉(zhuǎn)染miR-497-5p模擬物12、24、48及72 h后細胞的增殖能力顯著降低,見圖3B~C。與模擬物陰性對照相比,Capan-2和PANC-1細胞轉(zhuǎn)染miR-497-5p模擬物后G0/G1期比例增加,S期比例減少,見圖4。

        圖3 miR-497-5p模擬物促進miR-497-5p的表達(A)并抑制Capan-2(B)和PANC-1(C)細胞的增殖Figure 3 miR-497-5p mimics promoted miR-497-5p expression(A) and inhibited proliferation of Capan-2(B) and PANC-1(C) cells

        2.4 miR-497-5p對靶基因CCNE1的直接調(diào)控作用

        生物信息學(xué)分析顯示,CCNE1 mRNA 3'-UTR中5’-UGCUGCU-3’序列與miR-497-5p中3’-ACGACGA-5’序列互補結(jié)合,見圖5A。CCNE1 mRNA在PaCa癌組織的表達水平顯著高于癌旁正常組織(P<0.001),且癌組織中CCNE1 mRNA與miR-497-5p表達呈負相關(guān)(P<0.001),見圖5B~C。與模擬物陰性對照相比,miR-497-5p模擬物顯著抑制CCNE1-WT報告質(zhì)粒轉(zhuǎn)染的Capan-2和PANC-1細胞中的相對熒光素酶活性(P<0.001),見圖6A~B。此外,與模擬物陰性對照相比,轉(zhuǎn)染miR-497-5p模擬物后Capan-2和PANC-1細胞中CCNE1蛋白的表達水平顯著降低(P<0.001),見圖6C。

        圖4 miR-497-5p模擬物對Capan-2(A)和PANC-1(B)細胞周期的影響Figure 4 Effect of miR-497-5p mimics on cell cycle of Capan-2(A) and PANC-1(B) cells

        圖5 生物信息學(xué)分析miR-497-5p對CCNE1的調(diào)控作用Figure 5 Effect of miR-497-5P on CCNE1 bioinformatics analysis

        圖6 miR-497-5p對CCNE1基因的調(diào)控作用分析Figure 6 Analysis of the regulatory effect of miR-497-5p on CCNE1 gene

        3 討論

        研究表明,miR參與細胞多種病理與生理過程,包括增殖、凋亡、分化、轉(zhuǎn)移和內(nèi)分泌穩(wěn)態(tài)等[8]。miR異常表達與人類多種疾病的進展相關(guān),如腫瘤、不育癥、精神性疾病、代謝疾病及高血壓病等[9-10]。目前,研究者已通過高通量芯片在PaCa中篩選出大批差異表達的miR,部分miR作為致癌因子促進PaCa生長與轉(zhuǎn)移,而另一部分miR作為腫瘤抑制因子降低PaCa生長及轉(zhuǎn)移[11-12]。例如,Lv等[13]報道m(xù)iR-661在PaCa中表達上調(diào)并促進腫瘤細胞增殖,miR-661可能是PaCa預(yù)后相關(guān)的一種新的標志物。Ta等[14]證實miR-1290在PaCa中發(fā)揮致癌因子作用,miR-1290可能是一種新的PaCa診斷和治療靶標。Zhu等[15]發(fā)現(xiàn)miR-101在PaCa中表達下降,過表達miR-101可以抑制腫瘤細胞增殖與侵襲,而干擾miR-101可以降低增殖與侵襲。此外,miR-494通過抑制腫瘤細胞上皮-間質(zhì)轉(zhuǎn)化、遷移與侵襲在PaCa中起腫瘤抑制因子的作用[16]。然而,目前仍有很大一部分miR在PaCa中的作用和機制尚不清楚。因此,深入研究這部分miR將進一步闡明PaCa發(fā)生發(fā)展的分子機制,并將為其治療提供新的靶點。

        miR-497-5p定位于人染色體17p13.1區(qū)域,屬于miR-15/16/195/424/497超家族成員之一。據(jù)報道,miR-497-5p在血管肉瘤、結(jié)直腸癌及非小細胞肺癌的發(fā)生和發(fā)展中起重要調(diào)控作用[17]。然而,miR-103在PaCa中的生物學(xué)功能仍不清楚。本研究發(fā)現(xiàn),miR-497-5p在PaCa癌組織的表達水平顯著低于癌旁正常組織,這與miR-497-5p在其他腫瘤中的表達特征一致[17],表明miR-497-5p在PaCa中表達下調(diào)。低表達miR-497-5p患者5年總體生存率顯著低于高表達miR-497-5p患者,提示低表達miR-497-5p與PaCa不良預(yù)后相關(guān)。T3+T4期癌組織中miR-497-5p的表達水平顯著低于T1+T2期癌組織,且低表達miR-497-5p與較高的T分期相關(guān),提示miR-497-5p可能影響PaCa細胞增殖。PaCa進展是腫瘤細胞增殖與轉(zhuǎn)移的過程,也是腫瘤相關(guān)死亡的主要原因。本研究結(jié)果證實,過表達miR-497-5p能顯著抑制PaCa細胞增殖,該效應(yīng)主要通過增加細胞周期中G0/G1期比例,并降低S期比例而實現(xiàn)。該研究結(jié)果與miR-497-5p在其他腫瘤中的作用一致[5-7],表明miR-497-5p具有一定的抗細胞增殖特性。

        本研究發(fā)現(xiàn),CCNE1 mRNA 3'-UTR可與miR-497-5p互補結(jié)合,提示CCNE1可能是miR-497-5p的靶基因。CCNE1屬于細胞周期蛋白基因家族,具有致癌因子作用,高表達CCNE1與卵巢癌、膀胱癌及乳腺癌預(yù)后不良有關(guān)[18]。CCNE1可作為CDK激酶的調(diào)節(jié)劑,與CDK2的調(diào)節(jié)亞基形成復(fù)合物并磷酸化成視網(wǎng)膜細胞瘤基因(RB)轉(zhuǎn)錄共抑制因子而促進細胞增殖并加速G1/S轉(zhuǎn)換。CCNE1蛋白在G1/S轉(zhuǎn)換期積累,隨著細胞進入S期而降解。目前,研究者已在多種腫瘤中觀察到CCNE1基因高表達,且過表達CCNE1導(dǎo)致染色體不穩(wěn)定并促進腫瘤發(fā)生[19]。然而,PaCa中miR-497-5p對CCNE1的調(diào)控作用仍不清楚。本研究還發(fā)現(xiàn),CCNE1 mRNA在PaCa癌組織中的表達水平顯著高于癌旁正常組織,且與miR-497-5p表達呈負相關(guān)。過表達miR-497-5p顯著抑制PaCa細胞中CCNE1的蛋白表達水平。此外,miR-497-5p中3’-ACGACGA-5’序列可直接與CCNE1 mRNA 3'-UTR中5’-UGCUGCU-3’序列互補結(jié)合而抑制CCNE1蛋白表達。該結(jié)果表明,CCNE1是miR-497-5p的靶基因,miR-497-5p通過下調(diào)CCNE1基因表達而抑制PaCa增殖。然而,值得注意的是,有報道發(fā)現(xiàn)miR-497-5p還可以調(diào)控其他靶基因,如信號轉(zhuǎn)導(dǎo)蛋白SMAD3,ARL2和端粒酶亞單位(hTERT)等[9-11]。miR-497-5p是否也通過下調(diào)這些靶基因而抑制PaCa細胞的增殖有待進一步研究。

        綜上所述,miR-497-5p在PaCa中表達下調(diào),低表達miR-497-5p與較高的T分期及不良預(yù)后相關(guān)。過表達miR-497-5p通過改變細胞周期而抑制PaCa細胞增殖。CCNE1是miR-497-5p的靶基因,miR-497-5p靶向調(diào)控CCNE1基因表達抑制胰腺癌細胞的增殖。miR-497-5p可能是一種新的PaCa治療靶標。

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