胃癌是世界上最常見的惡性腫瘤之一,Bray等[1]對全球185個國家36種癌癥進行統(tǒng)計分析顯示:胃癌每年新發(fā)病例約100多萬,約占癌癥新發(fā)病例6%,居惡性腫瘤中第六位。中國是胃癌高發(fā)國家,每年新發(fā)病例數(shù)約40萬,占全世界40%左右[2]。目前胃癌在全球范圍內(nèi)呈高發(fā)趨勢,主要集中于中國、日本、韓國等東亞國家,已經(jīng)嚴重威脅到了人類的健康[3],探究促進胃癌發(fā)生發(fā)展的新機制,探索胃癌治療的新方法意義重大。
長鏈非編碼RNA(long-chain non-coding RNA,lncRNA)是長度在200~100 000 nt之間的RNA分子,近年來越來越多的研究發(fā)現(xiàn)其在染色體沉默、染色質(zhì)表觀遺傳學(xué)修飾、基因轉(zhuǎn)錄、蛋白翻譯及定位等各方面發(fā)揮了重要的作用[4]。據(jù)文獻報道:lncRNA FOXD2-AS1在結(jié)直腸癌[5]、食管癌[6]、肺癌[7]、肝癌[8]等多種癌癥中高表達,并參與腫瘤的發(fā)生、增殖、遷移、侵襲及化療抵抗等生物學(xué)過程。本研究通過臨床組織標本驗證lncRNA FOXD2-AS1的表達情況與患者臨床病理資料的關(guān)系,并在體外實驗中研究其在促進胃癌發(fā)展的作用及可能的機制。
人正常胃癌上皮細胞系GES-1、人胃癌細胞系BGC-823、AGS、MGC-803、MKN45、MKN-74由湖南省中醫(yī)藥大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院實驗室饋贈,E-Cadherin(Cat:10204-MM08)及N-cadherin(Cat:11039-R020)抗體購自義翹神州有限公司、Vimentin抗體購自美國CST公司(#5741)、β-catenin(ab32572)及Cyclin-D1(ab16663)抗體購自美國Abcam公司,GAPDH(Cat:10494-1-AP)一抗購自美國Proteintech公司,鼠二抗及兔二抗均購自上海優(yōu)寧維生物公司,RPMI1640及胎牛血清(FBS)均購自于以色列BI公司,RNA提取試劑盒、反轉(zhuǎn)錄試劑盒及qRT-PCR試劑盒均購自北京全式金生物技術(shù)有限公司,RNA保護液及轉(zhuǎn)染試劑Lipofectamine3000 Transfection Reagent購自美國賽默飛公司,lncRNA FOXD2-AS1小干擾RNA序列及對照序列均由蘇州吉瑪基因股份有限公司合成,GAPDH及l(fā)ncRNA FOXD2-AS1引物由湖南擎科生物技術(shù)有限公司合成。
1.2.1 大數(shù)據(jù)應(yīng)用 在GEPIA在線數(shù)據(jù)庫中(http://gepia.cancer-pku.cn)分析LncRNA FOXD2-AS1在胃癌中的表達情況;從TCGA數(shù)據(jù)庫中下載胃癌患者資料,分析lncRNA FOXD2-AS1的表達情況、在K-M在線分析數(shù)據(jù)庫(http://kmplot.com)分析lncRNA FOXD2-AS1的表達情況及與患者腫瘤分期關(guān)系。
1.2.2 胃癌組織RNA提取 選取2018年9月—2019年3月30例在湖南中醫(yī)藥大學(xué)第一附屬醫(yī)院行胃癌根治術(shù)患者新鮮標本,患者均知情同意,并獲得醫(yī)學(xué)倫理委員會批準。在標本離體30 min內(nèi)將標本收取并剪成1 mm3小塊置于RNA保護液中,放入液氮保存,提取RNA前將組織從液氮中取出,放入液氮預(yù)冷的研缽中研碎,參照RNA提取試劑盒說明書提取組織RNA,并測定濃度,選取OD260/OD280值在1.9~2.1之間的RNA進行后續(xù)實驗,保證RNA的完整性,參照反轉(zhuǎn)錄試劑盒將RNA合成cDNA,細胞樣本RNA提取方法同上。
1.2.3 細胞培養(yǎng)及分組 人胃癌細胞系BGC-823培養(yǎng)于含10%的胎牛血清、1% 100 μg/ml青霉素及100 μg/ml鏈霉素的RPMI 1640完全培養(yǎng)基中,置于37℃、5%CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng)。將人胃癌細胞系BGC-823分別轉(zhuǎn)染siRNA-A、siRNA-B以及siRNANC,分為siRNA-A組、siRNA-B組及siRNA-NC組。lncRNA FOXD2-AS1 siRNA-A序列正義鏈:5'-GCGAAGAGUACGUUGCUAUTT-3';反義鏈:5'-AUAGCAACGUACUCUUCGCTT-3';lncRNA FOXD2-AS1 siRNA-B序列正義鏈:5'-GUUCGAG AGUGAAUUUACATT-3';反義鏈:5'-UGUAAA UUCACUCCUCGAACTT-3';陰性對照序列正義鏈:5'-UUCUCCGAACGUGUCACGUTT-3';反義鏈:5'-ACGUGACACGUUCGGAGAATT-3'。轉(zhuǎn)染方法參照Lipofectamine3000 Transfection Reagent說明書及干擾序列說明書進行。
1.2.4 qRT-PCR實驗 提取組織及細胞樣本RNA,將RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA,參照qRT-PCR試劑盒說明書采用qPCR三步法進行實驗,實驗條件:在94℃預(yù)變性30 s,94℃ 5 s,60℃ 15 s,72℃ 10 s,進行40個循環(huán)擴增,利用GAPDH作為內(nèi)參,定量采用2-ΔΔCt法,計算胃癌各細胞系、癌組織與癌旁組織以及siRNA-A組、siRNA-B組及陰性對照組中l(wèi)ncRNA FOXD2-AS1相對表達量。GAPDH引物序列:上游引物:5'-GAGTCAACGGATTTGGTCGT-3';下游引物:5'-GACAAGCTTCCCGTTCTCAG-3';lncRNA FOXD2-AS1引物序列:上游引物:5'-CCG CGTAAGCCTCATAGAAG-3';下游引物:5'-GGG AGTAGGGTGAGGAAAGG-3'。
1.2.5 細胞增殖能力檢測 采用CCK8比色法測定lncRNA FOXD2-AS1 siRNA-A組、siRNA-B組及陰性對照組細胞增殖能力。將三組細胞以3 000個/孔種植于96孔板中,分別于培養(yǎng)0、24、48、72和96 h后,吸盡培養(yǎng)基,每孔加入含10%CCK8試劑的RPMI 1640溶液100 μl,2 h后在450 nm波長下,利用酶標儀測定吸光度,實驗重復(fù)三次,取平均值并繪制增殖曲線。采用平板克隆形成實驗檢測細胞增殖及克隆形成能力。胰酶消化,充分打勻并計數(shù),6孔板中加入2 ml完全培養(yǎng)基,每孔加入400個細胞,當培養(yǎng)皿中出現(xiàn)肉眼可見的克隆時終止培養(yǎng),甲醇固定15 min,0.1%結(jié)晶紫溶液染色30 min后肉眼計數(shù)克隆數(shù),克隆形成率=克隆數(shù)/接種細胞數(shù)×100%,實驗重復(fù)三次,取平均值。
1.2.6 細胞遷移能力測定 預(yù)先用記號筆在6孔板背后每隔0.5 cm劃一道線。培養(yǎng)人胃癌BGC-823細胞株至對數(shù)期,并按5×105個/孔接種于6孔板,37℃細胞培養(yǎng)箱內(nèi)培養(yǎng)過夜,第二天待細胞長滿,用200 μl槍頭垂直于畫線進行劃痕,并用PBS洗兩次,分別加入含無血清培養(yǎng)基,并于顯微鏡下拍照,記錄0 h劃痕位置及寬度,培養(yǎng)箱內(nèi)繼續(xù)培養(yǎng)24 h后與0 h同一位置進行拍照,并計算劃痕愈合率,愈合率=(0 h劃痕寬度-24 h劃痕寬度)/(0 h劃痕寬度),實驗重復(fù)3次,取平均值。
1.2.7 細胞侵襲能力測定 采用Transwell實驗檢測細胞侵襲能力,將三組細胞消化吹打勻,并用不含血清的RPMI 1640培養(yǎng)基重懸,將細胞密度調(diào)整到1.5×104個/毫升,取200 μl細胞懸液接種于Transwell小室上室,下室加入含10%FBS的完全培養(yǎng)基,培養(yǎng)24 h后,PBS輕洗兩遍,用甲醇固定細胞,用棉簽擦拭掉上室細胞,將下室細胞采用0.1%結(jié)晶紫溶液染色,染色30 min后顯微鏡200倍視野下,分別取左上、左下、右上、右下以及中間五個視野,計算穿膜細胞數(shù),實驗重復(fù)三次,取平均值。
1.2.8 蛋白印跡(Western blot)實驗 提取lncRNA FOXD2-AS1 siRNA-A組、siRNA-B組及陰性對照組細胞總蛋白,裂解并變性,電泳條件:濃縮膠80 V至蛋白Marker分離后,加大電壓至溴酚藍跑至膠底;轉(zhuǎn)膜條件:300 mA轉(zhuǎn)80 min,脫脂奶粉室溫封閉1 h,加入相應(yīng)一抗,4℃過夜,二抗室溫孵育1 h,ECL液顯影,并計算灰度值,實驗重復(fù)三次。
數(shù)據(jù)用SPSS21.0統(tǒng)計分析軟件處理,計量資料用均數(shù)±標準差()表示,組間兩兩比較經(jīng)單因素方差分析,若符合方差齊性正態(tài)性分布采用t檢驗,若不符合則用秩和檢驗,組間重復(fù)測量數(shù)據(jù)分析采用重復(fù)測量設(shè)計的方差分析,率的比較或構(gòu)成比比較采用四格表卡方檢驗,P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。
GEPIA 數(shù)據(jù)庫在線分析顯示lncRNA FOXD2-AS1在胃癌組織中較癌旁組織中高表達(P=0.000),見圖1A;K-M(Kaplan-Meier Plotter(http://kmplot.com))數(shù)據(jù)庫在線分析顯示:lncRNA FOXD2-AS1的表達與患者的不良預(yù)后密切相關(guān)(P=0.000),見圖1B;取30例胃癌根治術(shù)患者標本提取RNA行qRT-PCR結(jié)果顯示:lncRNA FOXD2-AS1在癌組織中表達較癌旁組織顯著增高,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.000),見圖1C。
我們以l ncRNA FOXD2-AS1中位表達量(2.883)為界,將患者分為lncRNA FOXD2-AS1高表達組及低表達組(每組各15例),并與患者臨床一般資料及病理資料比較,結(jié)果顯示lncRNA FOXD2-AS1的表達與腫瘤分期相關(guān)(P=0.025),與患者年齡、性別、腫瘤大小及浸潤深度無關(guān)(均P>0.05),見表1。
圖1 lncRNA FOXD2-AS1在胃癌組織中的表達及與患者預(yù)后的關(guān)系Figure 1 lncRNA FOXD2-AS1 expression in gastric cancer tissues and its relation with patients’ prognosis
表1 lncRNA FOXD2-AS1表達與胃癌患者臨床病理分期相關(guān)性Table 1 Correlation between lncRNA FOXD2-AS1 expression and clinicopathological stage of gastric cancer patients
qRT-PCR檢測lncRNA FOXD2-AS1在各細胞系中表達情況,將GES-1細胞系相對表達量設(shè)為1,計算各胃癌細胞系較GES-1細胞系lncRNA FOXD2-AS1相對表達量,實驗重復(fù)3次。qRT-PCR結(jié)果顯示:胃癌細胞系A(chǔ)GS、BGC-823、MGC-803、MKN-45、MKN-74細胞系相對表達量分別為2.43±0.14(P=0.000)、4.38±0.18(P=0.000)、1.73±0.08(P=0.001)、1.87±0.11(P=0.0002)、2.07±0.14(P=0.0002),各胃癌細胞系中l(wèi)ncRNA FOXD2-AS1相對表達量均明顯高于胃正常上皮細胞系GES-1(均P<0.05),其中BGC-823細胞系lncRNA FOXD2-AS1相對表達量最高,見圖2。
圖2 lncRNA FOXD2-AS1在不同胃癌細胞系中的表達Figure 2 lncRNA FOXD2-AS1 expression in different gastric cancer cell lines
2.3.1 沉默效率驗證 BGC-823細胞轉(zhuǎn)染lncRNA FOXD2-AS1的小干擾RNA(siRNA-A、siRNA-B)及陰性對照序列(siRNA-NC)后,qRT-PCR驗證lncRNA FOXD2-AS1表達情況,結(jié)果顯示:將陰性對照組lncRNA FOXD2-AS1相對表達量設(shè)為1,與陰性對照組相比,F(xiàn)OXD2-AS1 siRNA-A組與FOXD2-AS1 siRNA-B組lncRNA FOXD2-AS1相對表達量為0.37±0.05(P=0.000)、0.30±0.02(P=0.000),說明兩組lncRNA FOXD2-AS1的沉默效率均大于60%,與陰性對照組相比顯著下降(均P<0.05),兩組siRNA均可為后續(xù)實驗所用,見圖3A。
2.3.2 CCK8結(jié)果 單因素方差分析顯示,轉(zhuǎn)染24 h內(nèi)各組OD值差異無統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.379),轉(zhuǎn)染48、72和96 h后,各組細胞OD值差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(均P=0.000),且siRNA-NC組增殖速度較FOXD2-AS1 siRNA-A組與FOXD2-AS1 siRNA-B組明顯增快,見圖3B。
圖3 lncRNA FOXD2-AS1沉默效率驗證(A)、CCK8增殖實驗(B)及細胞平板克隆形成實驗(C)結(jié)果Figure 3 Results of lncRNA FOXD2-AS1 silencing efficiency verification(A),CCK8 proliferation experiment (B) and cell plate clone formation experiment(C)
2.3.3 平板克隆形成實驗結(jié)果 siRNA-NC組、FOXD2-AS1 siRNA-A組與FOXD2-AS1 siRNA-B組克隆形成數(shù)目分別為313.3±12.01、149.6±14.7、126.3±8.7個,克隆形成率分別約78.2%、37.5%和31.5%,經(jīng)單因素方差分析,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.000),且siRNA-NC組克隆形成率明顯高于FOXD2-AS1 siRNA-A組與FOXD2-AS1 siRNA-B組,見圖3C。
2.4.1 劃痕實驗結(jié)果 siRNA-NC組、FOXD2-AS1 siRNA-A組與FOXD2-AS1 siRNA-B組24 h劃痕愈合率分別為(74.7±1.7)%、(49.7±2.2)%、(39.6±1.4)%,經(jīng)單因素方差分析,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.000)。且FOXD2-AS1 siRNA-A組與FOXD2-AS1 siRNA-B組劃痕愈合率明顯低于陰性對照組,見圖4A。
2.4.2 Transwell小室侵襲實驗結(jié)果 siRNA-NC組、FOXD2-AS1 siRNA-A組與FOXD2-AS1 siRNA-B組穿透基質(zhì)膠到達下室的細胞數(shù)分別為423.0±19.5、279.7±15.6、229.0±10.8,經(jīng)單因素方差分析,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.000),F(xiàn)OXD2-AS1 siRNA-A組與FOXD2-AS1 siRNA-B組侵襲細胞數(shù)明顯少于陰性對照組,見圖4B。
圖4 劃痕實驗(A)和Transwell小室侵襲實驗(B)結(jié)果Figure 4 Results of wound healing assay(A) and Transwell test(B)
qRT-PCR及Western blot實驗結(jié)果顯示:FOXD2-AS1 siRNA-A組與FOXD2-AS1 siRNA-B組中E-cadherin的表達較陰性對照siRNA-NC組顯著增高,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.000),而N-cadherin、Vimentin、β-catenin與Cyclin D1的表達量較陰性對照siRNA-NC組均顯著降低,差異具有統(tǒng)計學(xué)意義(均P=0.000),見圖5 。
研究報道多種lncRNA與胃癌的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)。Xu等[9]報道lncRNAPVT1與FOXM1的正反饋調(diào)節(jié)調(diào)控胃癌的增殖及侵襲轉(zhuǎn)移。Yan等[10]發(fā)現(xiàn)lncRNA SNHG6通過沉默P27蛋白的表達以及吸附miR-101-3p來調(diào)節(jié)ZEB1表達從而促進胃癌細胞的增殖及EMT,影響胃癌患者的臨床預(yù)后。Zhang等[11]發(fā)現(xiàn)HNRNPKP2通過調(diào)控CXCR4的表達從而促進胃癌的肝轉(zhuǎn)移;影響胃癌發(fā)生發(fā)展的lncRNA還包括lncRNA ZFPM2-AS1[12]、lncRNA ELIT-1[13]、lncRNA LINC00346[14]等,lncRNA在胃癌增殖、細胞周期調(diào)控、侵襲、轉(zhuǎn)移及血管生成等方面都發(fā)揮了重要的調(diào)控作用。
圖5 沉默lncRNA FOXD2-AS1對Wnt/β-catenin通路相關(guān)蛋白及EMT相關(guān)蛋白qRT-PCR實驗(A)和Western blot實驗(B)驗證結(jié)果Figure 5 Effect of lncRNA FOXD2-AS1 silencing on expression of Wnt/β-catenin pathway related proteins and EMT-related proteins detected by qRT-PCR(A) and Western blot(B)
lncRNA FOXD2-AS1在多種腫瘤中高表達,并與患者的病理分期及臨床預(yù)后密切相關(guān)。在肝癌中,lncRNA FOXD2-AS1可以通過招募EZH2到p27基因的啟動子上,調(diào)控p27基因表達,從而促進肝癌發(fā)展[15]。在神經(jīng)膠質(zhì)瘤中,lncRNA FOXD2-AS1可以吸附miRNA-185-5p,并通過PI3K/AKT通路促進腫瘤的增殖及侵襲轉(zhuǎn)移[16]。lncRNA FOXD2-AS1作為一個重要的癌基因,在不同的癌癥中其作用也不盡相同。本研究發(fā)現(xiàn)lncRNA FOXD2-AS1在胃癌組織中較癌旁組織中明顯升高,數(shù)據(jù)挖掘結(jié)果顯示其高表達與胃癌的預(yù)后相關(guān),同樣在我們的樣本中發(fā)現(xiàn)其表達與胃癌的病理分期相關(guān),這表明lncRNA FOXD2-AS1可能促進了胃癌的進展。進一步體外實驗研究發(fā)現(xiàn):在胃癌BGC-823細胞系中抑制lncRNA FOXD2-AS1的表達可顯著抑制BGC-823細胞的增殖、克隆形成、遷移及侵襲能力。在進一步機制探索中我們發(fā)現(xiàn),抑制lncRNA FOXD2-AS1的表達可以抑制N-cadherin與Vimentin的表達,促進E-cadherin的表達,同時抑制Wnt/β-catenin通路關(guān)鍵蛋白β-catenin以及下游蛋白Cyclin D1的表達,結(jié)果提示抑制lncRNA FOXD2-AS1可能通過抑制Wnt/β-catenin通路的激活,從而抑制胃癌細胞EMT的發(fā)生降低胃癌細胞的侵襲和轉(zhuǎn)移能力,研究結(jié)果與Huang等研究發(fā)現(xiàn)EphA2通過Wnt/β-catenin通路促進胃癌侵襲轉(zhuǎn)移相符[17]。
本實驗尚存在一些不足之處:(1)在驗證胃癌組織及癌旁組織表達情況與患者病理分期時只收集了30例患者的標本及信息,樣本量較小,這也可能是導(dǎo)致lncRNA FOXD2-AS1的表達僅與臨床分期相關(guān),而與腫瘤大小及浸潤深度無明顯差異的原因之一,后續(xù)實驗需進一步擴大樣本量;(2)lncRNA FOXD2-AS1調(diào)控Wnt/β-catenin通路的確切機制仍不清楚,還需進一步機制研究。
綜上所述,lncRNA FOXD2-AS1在胃癌組織及胃癌細胞系中高表達,與患者腫瘤臨床分期和預(yù)后相關(guān),抑制其表達可通過抑制Wnt/β-catenin通路的激活,抑制胃癌細胞EMT的發(fā)生,降低胃癌細胞的增殖及遷移侵襲能力,lncRNA FOXD2-AS1可作為胃癌潛在的治療靶點及臨床預(yù)后標志物。