彭湃
蝙蝠是“百毒不侵”的天然病毒蓄水池,它們?yōu)槭裁磾y帶大量病毒卻免受其害?人類是否可以從這里尋求一條對付多種病毒的普適性思路?
北京時(shí)間3月31日,清華大學(xué)結(jié)構(gòu)生物學(xué)高精尖創(chuàng)新中心、杜克-新加坡國立大學(xué)醫(yī)學(xué)院、中國疾控中心、中科院動物研究所、美國杜克大學(xué)的研究團(tuán)隊(duì)聯(lián)合在論文預(yù)印本網(wǎng)站BioRxiv在線發(fā)表了一項(xiàng)最新研究(該研究尚未經(jīng)同行評議),通過對蝙蝠細(xì)胞的兩萬多個(gè)基因進(jìn)行系統(tǒng)全面的篩查,確定了數(shù)十個(gè)病毒復(fù)制所依賴的關(guān)鍵蝙蝠基因,并發(fā)現(xiàn)了一個(gè)共同的新的宿主基因MTHFD1,該基因的抑制劑carolacton可有效抑制新冠病毒復(fù)制。
人類需要廣譜抗病毒藥物
從SARS、埃博拉到2019年的新冠肺炎(COVID-19),病毒引起的傳染性疾病一直是嚴(yán)重危害全球健康的主要病種之一。這些疫情發(fā)展史更讓我們深刻體會到,當(dāng)務(wù)之急是對于廣譜的抗病毒藥物的研發(fā)。
廣譜抗病毒藥物對于新發(fā)突發(fā)病毒感染的應(yīng)急性治療可以救重癥病人于危難,對于降低死亡率和緩解疫情有不可估量的作用。
然而,傳統(tǒng)的抗病毒藥物以病毒蛋白作為靶點(diǎn),它們在應(yīng)對不斷出現(xiàn)的多種不同類別的病毒時(shí)很難發(fā)揮作用,而且病毒也很容易通過突變自身基因而產(chǎn)生耐藥性。
相比之下,由于多種病毒在細(xì)胞內(nèi)復(fù)制需要很多共同的宿主蛋白才能完成復(fù)制周期,所以針對病毒復(fù)制依賴的宿主蛋白的新型抗病毒藥物,可能具有廣譜性和不易產(chǎn)生耐藥性的優(yōu)點(diǎn)。
蝙蝠為何“百毒不侵”?
蝙蝠屬于哺乳動物門翼手目,是唯一能真正飛行的哺乳動物。近年來諸多大規(guī)模致死疫情都和蝙蝠發(fā)生著千絲萬縷的聯(lián)系。
2003年的SARS、2014年的埃博拉以及2019年末開始暴發(fā)的的新冠肺炎均給世界各地帶來了巨大的經(jīng)濟(jì)損失和心理恐慌。諸多證據(jù)支持蝙蝠是這些致病病毒的共同的天然宿主,病毒從蝙蝠到某個(gè)中間宿主傳播最終導(dǎo)致了疫情的大規(guī)模暴發(fā)。
然而,令人不解的是,雖然蝙蝠可以攜帶多種致病病毒,但是這些病毒卻不會對蝙蝠造成明顯的癥狀。蝙蝠對病毒的高度耐受性可能也是其能攜帶并傳播多種病毒的重要原因。
有專家表示,從免疫學(xué)角度來說,蝙蝠的免疫系統(tǒng)還是很獨(dú)特的,它是唯一一個(gè)會持續(xù)飛行的哺乳動物,飛行這種能力就造成它很多基因和人或者其他哺乳動物的基因不一樣,這些不一樣的基因很多就是和抗病毒、免疫系統(tǒng)相關(guān)的。
此前也有證實(shí),蝙蝠體內(nèi)總是保持了一定量的干擾素表達(dá)。干擾素是一個(gè)很關(guān)鍵的抗病毒蛋白,如果它在身體中總是保持“低量”,就相當(dāng)于動物本身具有“全天候保護(hù)”的防御機(jī)制。也就是說,蝙蝠的免疫通路會保持一定量的防御狀態(tài),但不會免疫過激。像人感染SARS等病毒最后會死于過度的炎癥反應(yīng),但是蝙蝠的炎癥反應(yīng)和先天免疫不會過激,所以它也不會受到損傷。
蝙蝠與人類的病毒感染機(jī)制有何不同?
基于以上背景,研究團(tuán)隊(duì)建立了第一個(gè)蝙蝠(黑妖狐蝠,Pteropus alecto)的全基因組CRISPR敲除文庫并完成了黑妖狐蝠腎上皮細(xì)胞(PaKi細(xì)胞)的流感病毒感染的全基因組CRISPR篩選,從中找到了20多個(gè)病毒復(fù)制所依賴的宿主因子。
與此同時(shí),杜克-新加坡國立大學(xué)醫(yī)學(xué)院的課題組,用RNA干擾(RNAi)的方法進(jìn)行了蝙蝠細(xì)胞針對腮腺炎病毒感染的篩選,找到了數(shù)十個(gè)病毒依賴的宿主因子。
通過對兩組篩選結(jié)果進(jìn)行比較,研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)其中都包括細(xì)胞內(nèi)吞作用和蛋白分泌通路的重要基因,這些跟人類細(xì)胞的病毒感染是類似的,說明蝙蝠細(xì)胞和人類細(xì)胞的病毒感染對這些通路的依賴是保守的。
除此之外,兩組篩選都發(fā)現(xiàn)了一個(gè)共同的新的宿主基因MTHFD1。MTHFD1編碼亞甲基四氫葉酸脫氫酶,是DNA和RNA的組成成分嘌呤堿基從頭合成的重要代謝酶。
非常有意思的是,以前的工作在人體細(xì)胞的全基因組篩選病毒宿主因子都沒有發(fā)現(xiàn)MTHFD1。進(jìn)一步的研究發(fā)現(xiàn)蝙蝠細(xì)胞的MTHFD1表達(dá)水平比人類相應(yīng)組織的細(xì)胞要低很多,這可能和蝙蝠適應(yīng)飛行生活的生理變化有關(guān)。
總體來說,研究團(tuán)隊(duì)通過對蝙蝠細(xì)胞的兩萬多個(gè)基因進(jìn)行系統(tǒng)全面的篩查,確定了數(shù)十個(gè)病毒復(fù)制所依賴的關(guān)鍵蝙蝠基因。這些基因在蝙蝠和人類中功能是保守的,但是基因表達(dá)水平的物種差異可能決定了病毒感染的不同的病理結(jié)果。
發(fā)現(xiàn)抑制劑carolacton
研究團(tuán)隊(duì)進(jìn)一步發(fā)現(xiàn),RNA病毒包括腮腺炎病毒、馬六甲病毒、寨卡病毒等都對MTHFD1的缺失非常敏感,而MTHFD1的抑制劑carolacton對于上述病毒的復(fù)制有非常強(qiáng)的抑制作用。這個(gè)現(xiàn)象在蝙蝠和人類細(xì)胞都很顯著。
Carolacton是一種天然產(chǎn)物,被作為抗生素候選分子用于抑制細(xì)菌的菌膜生成。
令人欣喜的是,通過與中國疾控中心合作,研究團(tuán)隊(duì)發(fā)現(xiàn)carolacton也能有效的抑制新冠病毒在人體細(xì)胞中的復(fù)制,而且抗病毒有效濃度遠(yuǎn)遠(yuǎn)低于細(xì)胞毒性濃度,展示出了良好的成藥性。
蝙蝠的基因篩查導(dǎo)致了MTHFD1這個(gè)全新的抗病毒藥物靶點(diǎn)及carolacton這個(gè)抗病毒小分子的發(fā)現(xiàn)。這個(gè)結(jié)果也提示我們可以從研究蝙蝠的病毒感染機(jī)制中學(xué)習(xí)到如何應(yīng)對病毒感染。
蝙蝠細(xì)胞的全基因組CRISPR篩選找到一個(gè)RNA病毒復(fù)制的關(guān)鍵宿主因子MTHFD1,其抑制劑carolacton能有效抑制新冠病毒在靈長類動物細(xì)胞系中的復(fù)制。
據(jù)悉,研究團(tuán)隊(duì)后續(xù)將在動物感染模型上進(jìn)一步對car? olacton及其衍生物的抗病毒功能進(jìn)行臨床前測試,希望能將其作為一種廣譜抗病毒藥物早日推向臨床。MTHFD1相關(guān)的基因?qū)Σ《镜挠绊懠捌渌幬锇邢虻难芯恳灿型峁└嗟暮蜻x藥物分子。
另外,研究團(tuán)隊(duì)前期建立的全基因組篩選系統(tǒng)也將在針對蝙蝠的其它組織細(xì)胞,特別是免疫細(xì)胞的研究中發(fā)揮巨大作用,幫助研究者繼續(xù)探尋蝙蝠的更多的奧秘。
(源自“澎拜新聞”)
責(zé)編:馬京京