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        脊髓損傷后基因表達(dá)和分子調(diào)控的系統(tǒng)研究

        2020-09-05 01:44:48蘇國(guó)輝
        工程 2020年4期
        關(guān)鍵詞:星形膠質(zhì)生物學(xué)

        蘇國(guó)輝

        脊髓損傷使脊髓功能臨時(shí)或永久性地發(fā)生變化,對(duì)患者造成嚴(yán)重的生理、社會(huì)和職業(yè)后果。對(duì)脊髓損傷后發(fā)生的一系列生理病理過(guò)程的深入了解將有利于脊髓損傷的治療。該研究通過(guò)全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序來(lái)分析大鼠脊髓半切損傷后多個(gè)時(shí)間點(diǎn)(0 h, 0.5 h, 3 h, 6 h, 12 h, 1 d,3 d, 7 d, 14 d, 21 d, 28 d)損傷處近端、遠(yuǎn)端脊髓組織,發(fā)現(xiàn)損傷組與假手術(shù)組對(duì)照之間的差異基因。通過(guò)IPA(ingenuity pathway analysis)分析獲得這些差異基因所涉及的脊髓損傷后顯著變化的不同類(lèi)型細(xì)胞(星形膠質(zhì)細(xì)胞、小膠質(zhì)細(xì)胞、少突膠質(zhì)細(xì)胞、免疫細(xì)胞和血管內(nèi)皮細(xì)胞)的生物學(xué)過(guò)程(圖1)。通過(guò)計(jì)算各類(lèi)生物學(xué)過(guò)程中所包含的差異基因的平均表達(dá)值,獲得這些生物學(xué)過(guò)程的動(dòng)態(tài)變化趨勢(shì)。構(gòu)建有關(guān)星形膠質(zhì)細(xì)胞激活,小膠質(zhì)細(xì)胞激活,少突膠質(zhì)細(xì)胞分化,血管缺氧、出芽和重塑等脊髓損傷后的關(guān)鍵生物學(xué)過(guò)程的基因表達(dá)分子調(diào)控網(wǎng)絡(luò),并選取這些過(guò)程中的關(guān)鍵基因進(jìn)行驗(yàn)證(圖2)。

        不同于最近流行的單細(xì)胞測(cè)序技術(shù),該文采用全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序來(lái)研究脊髓組織。脊髓損傷是一個(gè)復(fù)雜的、涉及多方面的病理過(guò)程,伴隨著一系列的生理病理及細(xì)胞變化過(guò)程。因此,脫離損傷后脊髓組織的整體微環(huán)境,僅通過(guò)單一一類(lèi)細(xì)胞的研究來(lái)分析脊髓損傷這一復(fù)雜的過(guò)程是艱難且不合適的。對(duì)損傷組織的全轉(zhuǎn)錄組測(cè)序有利于對(duì)脊髓損傷后的多細(xì)胞、多系統(tǒng)交叉研究,為脊髓損傷后的復(fù)雜變化提供系統(tǒng)研究。

        圖1. 不同類(lèi)型細(xì)胞脊髓損傷前(a)和損傷后(b)生物學(xué)過(guò)程變化的總結(jié)示意圖。

        基于他們的研究,可以做如下幾點(diǎn)總結(jié):①脊髓損傷后星形膠質(zhì)細(xì)胞激活是脊髓損傷后星形膠質(zhì)細(xì)胞的主要活動(dòng)變化,并在損傷后3 d最顯著。涉及星形膠質(zhì)細(xì)胞激活的基因包括MMP9、SERPINE1、IL1B、TLR2和CEBPB,在損傷后表達(dá)上調(diào)。然而SNCA基因在這個(gè)過(guò)程中表達(dá)下調(diào),其表達(dá)可能抑制脊髓損傷后的星形膠質(zhì)細(xì)胞激活。②小膠質(zhì)細(xì)胞在脊髓損傷后3~28 d大量激活,與小膠質(zhì)細(xì)胞激活相關(guān)的基因HMOX1、IL-6、CYBB、ERBB2和TGFB1等表達(dá)上調(diào)。③少突膠質(zhì)細(xì)胞的凋亡存活、分化發(fā)育等過(guò)程在脊髓損傷后1 d急劇下降,其中與少突膠質(zhì)細(xì)胞分化相關(guān)的基因BMP2、HGF、TP53、LINGO1、TNC和VCAN在損傷后表達(dá)發(fā)生變化。④脊髓損傷后各類(lèi)炎癥細(xì)胞(包括中性粒細(xì)胞、單核細(xì)胞、淋巴細(xì)胞等)聚集到損傷處,相關(guān)細(xì)胞因子和趨化因子在損傷后0.5 h上調(diào)。炎癥相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子ATF3、FOS等也表達(dá)上調(diào)。⑤脊髓損傷后血管增生,與血管內(nèi)皮細(xì)胞的遷移、增殖、激活密切相關(guān)。損傷后的血管再生經(jīng)歷了缺氧、血管發(fā)芽、重塑等過(guò)程,涉及LIF、THBS1、FGF9和RUNX2等關(guān)鍵基因。

        圖2. 脊髓損傷后關(guān)鍵基因和生物學(xué)過(guò)程的變化。VEC:血管內(nèi)皮細(xì)胞(vascular endothelia cell)。

        總的來(lái)說(shuō),這項(xiàng)研究擴(kuò)展了目前對(duì)脊髓損傷的分子病理認(rèn)知;揭示了脊髓損傷后遠(yuǎn)近端在損傷后不同時(shí)間點(diǎn)的病理過(guò)程和微環(huán)境的變化;為脊髓損傷修復(fù)提供基于整合多靶點(diǎn)、多藥物、細(xì)胞相互作用及生物工程技術(shù)的新的研究思路。

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