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        基于ISSR標(biāo)記的卡特蘭種質(zhì)資源遺傳多樣性分析

        2020-08-28 08:57:56崔學(xué)強(qiáng)黃昌艷鄧杰玲李秀玲張自斌盧家仕
        關(guān)鍵詞:資源

        崔學(xué)強(qiáng),唐 璇,黃昌艷,鄧杰玲,李秀玲,張自斌,盧家仕

        (廣西農(nóng)業(yè)科學(xué)院花卉研究所,廣西 南寧 530007)

        【研究意義】卡特蘭又名卡特利亞蘭或嘉德利亞蘭,是蘭科(Orchidaceae)卡特蘭屬(Cattleya)及其近緣屬物種的統(tǒng)稱(chēng),主要產(chǎn)于中南美洲一帶,為巴西、哥倫比亞及哥斯達(dá)黎加等國(guó)的國(guó)花??ㄌ靥m假鱗莖呈紡錘形或圓柱形,葉革質(zhì),單葉或雙葉頂生,氣生根系,著花1至數(shù)朵,多花種類(lèi)著花數(shù)可達(dá)數(shù)十朵,花期因種而異,花色豐富而艷麗,花朵盛開(kāi)時(shí)有特殊芳香,被譽(yù)為洋蘭之王[1],可作高級(jí)盆花和名貴切花,還可作為高雅美麗的胸飾花,觀賞價(jià)值極高,深受世界各地人民的喜愛(ài)。卡特蘭在我國(guó)未發(fā)現(xiàn)原生種分布,需從其他國(guó)家引種栽培,而引種栽培的卡特蘭存在許多同種異名和同名異種現(xiàn)象,對(duì)我國(guó)卡特蘭雜交育種的親本選擇造成了不利影響。已有研究表明,利用ISSR分子標(biāo)記技術(shù)可對(duì)部分蘭科植物進(jìn)行遺傳多樣性分析及親緣關(guān)系和品種鑒定[2-4],但迄今關(guān)于卡特蘭遺傳多樣性分子標(biāo)記方面的研究報(bào)道較少。因此,應(yīng)用ISSR分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)引種的卡特蘭進(jìn)行親緣關(guān)系分析,對(duì)卡特蘭原生種的分類(lèi)、鑒定及雜交育種親本選擇具有重要意義?!厩叭搜芯窟M(jìn)展】目前對(duì)卡特蘭的研究主要集中于栽培技術(shù)[5]、組培快繁[6-8]、花期調(diào)控[9]和基因挖掘[10]等方面。Ziekienlcz等[11]、王少銘等[12]、楊和川等[13]研究認(rèn)為,ISSR分子標(biāo)記技術(shù)具有引物設(shè)計(jì)容易、操作簡(jiǎn)單、多態(tài)性好、可重復(fù)性高等優(yōu)點(diǎn)。關(guān)于ISSR分子標(biāo)記技術(shù)在其他蘭類(lèi)植物上的應(yīng)用,何荊洲等[2]采用ISSR分子標(biāo)記研究了36個(gè)蝴蝶蘭品種的遺傳關(guān)系;陳業(yè)等[3]采用ISSR分子標(biāo)記對(duì)23種兜蘭屬植物親緣關(guān)系進(jìn)行分析;盧家仕等[4]采用ISSR分子標(biāo)記研究了20份蘭科植物的遺傳多樣性;黃曉慧等[14]利用ISSR分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)中國(guó)蘭進(jìn)行了PCR反應(yīng)體系優(yōu)化及引物篩選。李永清等[15]利用ISSR分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)36份鐵皮石斛種質(zhì)資源進(jìn)行親緣關(guān)系分析,發(fā)現(xiàn)在遺傳相似系數(shù)0.700處可將鐵皮石斛種質(zhì)資源劃分為6個(gè)類(lèi)群。李宗艷等[16]利用ISSR分子標(biāo)記技術(shù)分析7個(gè)硬葉兜蘭(Paphiopedilummicranthum)居群的遺傳多樣性,發(fā)現(xiàn)7個(gè)居群聚為兩類(lèi),居群間遺傳分化與地理距離無(wú)顯著相關(guān)性。李麗輝等[17]利用RAPD和ISSR分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)7種蘭屬(CymbidiumSw.)21個(gè)品種資源進(jìn)行遺傳多樣性和親緣關(guān)系分析,發(fā)現(xiàn)21個(gè)蘭屬品種資源間遺傳距離為1.910~6.600,聚類(lèi)結(jié)果與傳統(tǒng)形態(tài)學(xué)分類(lèi)結(jié)果基本一致?!颈狙芯壳腥朦c(diǎn)】目前,鮮見(jiàn)利用ISSR分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)卡特蘭進(jìn)行多樣性親緣關(guān)系分析的研究報(bào)道。【擬解決的關(guān)鍵問(wèn)題】對(duì)18份卡特蘭種質(zhì)資源進(jìn)行ISSR-PCR擴(kuò)增及遺傳關(guān)系和聚類(lèi)分析,探究其親緣關(guān)系和遺傳特征,為卡特蘭品種鑒定及雜交育種親本選擇提供參考依據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 植物材料

        18份卡特蘭種質(zhì)資源均從國(guó)內(nèi)外收集獲得,種植于廣西農(nóng)業(yè)科學(xué)院花卉研究所種質(zhì)圃,其基本信息見(jiàn)表1。

        表1 用于ISSR分析的卡特蘭信息

        1.2 試驗(yàn)方法

        1.2.1 基因組DNA提取及檢測(cè) 采用改良CTAB法分別提取18份卡特蘭的基因組DNA[18]。用1.0 %瓊脂糖凝膠電泳和紫外分光光度計(jì)檢測(cè)其濃度和純度,用TE緩沖液將提取的基因組DNA稀釋至20 ng/μl,置于-20 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

        1.2.2 引物篩選及ISSR-PCR擴(kuò)增 供試引物為加拿大哥倫比亞大學(xué)公布的第9套ISSR引物,由生工生物工程(上海)股份有限公司合成,從中篩選出擴(kuò)增條帶清晰、穩(wěn)定、多態(tài)性高的引物對(duì)樣品進(jìn)行PCR擴(kuò)增。PCR反應(yīng)體系20 μl:無(wú)菌水8 μl、2×TaqPCR Master Mix 10 μl、引物1 μl、模板DNA 1 μl。擴(kuò)增程序:94 ℃預(yù)變性4 min;94 ℃變性1 min,54 ℃ 45 s,72 ℃ 1 min,進(jìn)行35個(gè)循環(huán);72 ℃ 延伸7 min,產(chǎn)物4 ℃保存。取10 μl PCR擴(kuò)增產(chǎn)物用于1.0 %瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè),最后用凝膠成像系統(tǒng)觀察并拍照。

        1.3 統(tǒng)計(jì)分析

        根據(jù)擴(kuò)增產(chǎn)物的電泳結(jié)果,凝膠上在相同遷移率位置上有條帶的記為“1”,無(wú)條帶的記“0”。將不同引物記錄的條帶構(gòu)建[0,1]矩陣。試驗(yàn)數(shù)據(jù)采用NTSYS 2.10進(jìn)行統(tǒng)計(jì),采用非加權(quán)算術(shù)平均聚類(lèi)(UPGMA)法進(jìn)行聚類(lèi)分析。用GenAlEx 6.51計(jì)算等位基因數(shù)(Na)、有效等位基因數(shù)(Ne)、Shannon信息多樣性指數(shù)(I)和Nei’s遺傳多樣性指數(shù)(He)。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 引物的多態(tài)性分析結(jié)果

        從100條ISSR引物中篩選出6條擴(kuò)增條帶清晰、多態(tài)性高、重復(fù)性好的ISSR引物對(duì)18份卡特蘭種質(zhì)資源進(jìn)行ISSR分析,結(jié)果(表2)表明,每條引物擴(kuò)增產(chǎn)生的條帶數(shù)在20~30條,平均為25.5條,6條引物擴(kuò)增共獲得條帶153條,其中多態(tài)性條帶為153條,引物平均多態(tài)性比率達(dá)100 %,說(shuō)明18份卡特蘭種質(zhì)資源遺傳多樣性較豐富。圖1為部分引物對(duì)供試樣品的擴(kuò)增結(jié)果。

        表2 6條ISSR引物對(duì)卡特蘭基因組DNA進(jìn)行PCR擴(kuò)增的結(jié)果

        M:DL2000 Marker;1~18與表1編號(hào)相同M:DL2000 Marker;1-18 was the same as in table 1

        2.2 卡特蘭種質(zhì)資源間遺傳相似性分析結(jié)果

        利用6條ISSR引物產(chǎn)生的標(biāo)記信息,經(jīng)NTSYS 2.10計(jì)算18份卡特蘭種質(zhì)資源的遺傳相似系數(shù),結(jié)果(表3)表明18份卡特蘭種質(zhì)資源的遺傳相似系數(shù)為0.6514~0.8991。其中,遺傳相似系數(shù)最小的是C3(Cattleyaguatemalensis)與C13(Cattleyaforbesii),說(shuō)明二者的親緣關(guān)系最遠(yuǎn),遺傳差異相對(duì)較大;遺傳相似系數(shù)最大的為C6(CattleyaBrazilian Jewel)與C8(Cattleyanobilior),說(shuō)明二者的親緣關(guān)系最近,遺傳差異相對(duì)較小。對(duì)遺傳多樣性參數(shù)的統(tǒng)計(jì)結(jié)果(表4)表明,Na為2.000個(gè),Ne為1.207個(gè),He為0.157,I為0.281,說(shuō)明18份卡特蘭種質(zhì)資源間具有較豐富的遺傳多樣性。

        表3 18份卡特蘭種質(zhì)資源的遺傳相似系數(shù)

        表4 18份卡特蘭種質(zhì)資源遺傳多樣性參數(shù)

        2.3 18份卡特蘭種質(zhì)資源的聚類(lèi)分析結(jié)果

        為了確定各供試材料間的遺傳關(guān)系,采用NTSYS 2.10對(duì)遺傳矩陣進(jìn)行UPGMA聚類(lèi)分析,構(gòu)建樹(shù)狀聚類(lèi)圖。從圖2可看出,在遺傳相似系數(shù)為0.749處,18份卡特蘭種質(zhì)資源可分為6大類(lèi),其中,第一大類(lèi)包括C1、C12和C18,均為卡特亞屬(Cattleya),該屬為單葉種,花朵較大;第二大類(lèi)包括C2、C3、C10和C14,其中C2屬于波浪邊亞屬(Crispae),為卡特蘭迷你原生種,植株矮小,單花,花大,C3、C10和C14屬于圈聚花蘭屬(Guarianthe),為雙葉種,多花,花?。坏谌箢?lèi)只有C5,屬于類(lèi)匈伯加亞屬(Schomburgkoidea),雙葉種,花中等大小,花朵無(wú)斑點(diǎn);第四大類(lèi)包括C7、C9和C11,屬于鐮刀形花亞屬(Falcata),雙葉種,花大且有斑點(diǎn);第五大類(lèi)包括C4、C13、C15和C16,屬于因特美地亞屬(Intermedia),雙葉種,一梗多花;第六大類(lèi)包括C6、C8和C17,屬于藕莖花亞屬(Rhizantha),該屬植株矮小,花大,其中C6為C8與C17的雜交種,保留親本C8的遺傳物質(zhì)較多。

        圖2 18份卡特蘭種質(zhì)資源UPGMA聚類(lèi)分析結(jié)果Fig.2 UPGMA clustering analysis results of 18 Cattleya germplasm resources

        3 討 論

        卡特蘭原產(chǎn)于南美洲國(guó)家,其中文譯名沒(méi)有統(tǒng)一標(biāo)準(zhǔn),不同學(xué)者針對(duì)同種卡特蘭的中文譯名存在較大差異,本研究的中文譯名參照王雁等[19]的《卡特蘭》一書(shū)。從分類(lèi)角度分卡特蘭有狹義和廣義卡特蘭,狹義卡特蘭單指卡特亞屬(Cattleya),包括屬內(nèi)的原生種和屬內(nèi)種間的雜交品系,廣義卡特蘭泛指卡特亞屬(Cattleya)及其他相關(guān)近緣屬的所有原生種及雜交種。本研究的供試材料Guarianthebowringiana、Guariantheguatemalensis和Guarianthepatinii原為雙葉種卡特亞屬(Cattleya)的圈聚花蘭亞屬(Subgenuscircumvola),2007年已變更屬名為圈聚花蘭屬(Guarianthe),成為獨(dú)立屬[1],其余材料均為卡特亞屬(Cattleya)。

        由于卡特蘭原生種資源缺乏的限制,目前國(guó)內(nèi)開(kāi)展分子標(biāo)記研究仍屬空白,但國(guó)外已有相關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道。Jin等[20]利用RAPD技術(shù)對(duì)25個(gè)卡特蘭品種進(jìn)行親緣關(guān)系研究,通過(guò)分子聚類(lèi)結(jié)果證實(shí)Cattleyawalkeriana與Cattleyanobilior分屬于不同的種,而此前Cattleyawalkeriana曾被認(rèn)為是Cattleyanobilior的一個(gè)種或Cattleyaloddigesii的雜種。本研究結(jié)果也表明,Cattleyawalkeriana與Cattleyanobilior為不同種,且其親緣關(guān)系較近。目前形態(tài)學(xué)分類(lèi)將Cattleyawalkeriana和Cattleyanobilior歸為藕莖花亞屬(Rhizantha),分子標(biāo)記結(jié)果與其形態(tài)學(xué)分類(lèi)結(jié)果一致。Fajardo等[21]利用ISSR分子標(biāo)記技術(shù)對(duì)巴西一種瀕臨絕種蘭花Cattleyagranulosa及其他4種巴西本土種Brassavolatuberculata、Cattleyabicolor、Cattleyalabiata和Cattleyaschofieldiana的遺傳多樣性進(jìn)行分析,結(jié)果表明ISSR遺傳標(biāo)記可有效檢測(cè)卡特蘭種間的遺傳分化。而本研究聚類(lèi)分析結(jié)果與形態(tài)學(xué)分類(lèi)結(jié)果完全一致,與Fajardo等[21]的研究結(jié)果相符。Pinheirode等[22]利用RAPD和ISSR分子標(biāo)記技術(shù)研究130個(gè)卡特蘭樣品,聚類(lèi)分析結(jié)果表明所有樣品可劃分為5個(gè)類(lèi)群,Cattleyalabiata與其他種間親緣關(guān)系較遠(yuǎn)。本研究18份卡特蘭種質(zhì)資源在相似系數(shù)為0.749處被分為6大類(lèi),通過(guò)遺傳相似性分析發(fā)現(xiàn)Cattleyaguatemalensis和Cattleyaforbesii親緣關(guān)系最遠(yuǎn),雖然二者均為雙葉種,多花,但其親緣關(guān)系較遠(yuǎn),也為其隸屬于不同的屬提供了證據(jù)。CattleyaBrazilian Jewel是Cattleyanobilior與Cattleyawalkeriana的雜交種,與Cattleyanobilior的親緣關(guān)系最近是因?yàn)槠湟话氲倪z傳物質(zhì)來(lái)源于Cattleyanobilior。

        4 結(jié) 論

        卡特蘭種質(zhì)資源間具有豐富的遺傳多樣性;UPGMA聚類(lèi)分析結(jié)果與傳統(tǒng)的形態(tài)學(xué)分類(lèi)結(jié)果基本一致,18份卡特蘭種質(zhì)資源分別隸屬于卡特亞屬、波浪邊亞屬、類(lèi)匈伯加亞屬、鐮刀形花亞屬、因特美地亞屬、藕莖花亞屬和圈聚花蘭屬7個(gè)屬。

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