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        基于多數(shù)據(jù)庫(kù)分析ANK3 在腎透明細(xì)胞癌中的作用

        2020-08-13 07:00:46張大軍葉向東
        醫(yī)藥前沿 2020年12期
        關(guān)鍵詞:數(shù)據(jù)庫(kù)差異分析

        張大軍 葉向東

        (順德和平外科醫(yī)院泌尿外科 廣東 佛山 528300)

        腎透明細(xì)胞癌(Clear cell renal cell carcinoma, ccRCC)是腎癌的最常見(jiàn)類型,起源于腎小管上皮細(xì)胞[1],部分ccRCC 患者早期起病隱匿,錯(cuò)過(guò)手術(shù)時(shí)機(jī),且ccRCC 對(duì)放化療不敏感[2],靶向治療非常重要,因此ccRCC 的早期診斷和治療靶點(diǎn)的研究非常重要。

        錨蛋白重復(fù)序列3(ANK3),又被稱為MRT37。目前ANK3 的研究集中在精神疾病[3]。其與前列腺癌[4]、膀胱癌[5]有關(guān),在腎癌中尚無(wú)報(bào)道。本研究通過(guò)數(shù)據(jù)分析,探索ANK3 在ccRCC 中的表達(dá)及對(duì)臨床、預(yù)后的影響。

        1.資料與方法

        1.1 在Oncomine 數(shù)據(jù)庫(kù)中分析ANK3 在ccRCC 中的表達(dá)差異。從TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)下載ccRCC 患者臨床、預(yù)后及轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),以 ANK3 表達(dá)中位數(shù)分為高低表達(dá)組,比較組間臨床指標(biāo)差異,并進(jìn)行生存分析。

        1.2 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

        使用R 軟件進(jìn)行分析。組間比較采用χ2檢驗(yàn),生存分析采用KM 法。P<0.05 為差異存在統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2.結(jié)果

        2.1 Oncomine 數(shù)據(jù)庫(kù)有9 項(xiàng)關(guān)于ANK3 在ccRCC 中表達(dá)差異的研究(表1)。薈萃分析這9 項(xiàng)研究,提示ANK3 在ccRCC 中表達(dá)量下降(P=2.59×10-7)。

        表1 ANK3 在ccRCC 中的表達(dá)差異研究

        2.2 TCGA 數(shù)據(jù)庫(kù)有537 例ccRCC 樣本,比較臨床指標(biāo)的組間差異(表2)。提示ANK3 表達(dá)量與淋巴侵犯無(wú)關(guān),但低表達(dá)與患者男性、年齡大、分期晚、遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移、低分化及血小板升高有關(guān)。

        表2 ANK3 與ccRCC 臨床信息關(guān)系

        2.3 生存分析結(jié)果提示,ANK3表達(dá)量可影響患者總體生存率,高表達(dá)患者總體生存率更高(n=537, Logrank P=5.7×10-11)。

        3.討論

        ccRCC 是腎實(shí)質(zhì)來(lái)源的惡性腫瘤,缺乏早期診斷標(biāo)志,從基因?qū)用嫜芯坑兄诎l(fā)現(xiàn)早期診斷指標(biāo)、治療靶點(diǎn)。關(guān)于ANK3 的研究集中在精神疾病領(lǐng)域。有研究報(bào)道ANK3 與肺、結(jié)腸、乳腺、膀胱及前列腺腫瘤有關(guān),但在腎癌中尚未見(jiàn)報(bào)道。

        ANK3 在ccRCC 中表達(dá)量更低,這種表達(dá)下調(diào)與患者年齡大、分期晚、低分化、合并遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移以及血小板升高等惡性表現(xiàn)有關(guān),低表達(dá)組患者總體生存期更短??傊?,ANK3 在ccRCC 中表達(dá)下調(diào),這種下調(diào)與多種惡性表型相關(guān),低表達(dá)患者的預(yù)后更差。我們認(rèn)為ANK3 可能是ccRCC 的抑癌基因中的一種,這需要更多研究來(lái)證實(shí)。

        ANK3 對(duì)細(xì)胞生物學(xué)影響及其分子機(jī)制尚不清楚,我們需要更多的研究來(lái)明確ANK3 在腫瘤中扮演的角色,為造福更多的腎癌患者提供依據(jù)。

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