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        組蛋白甲基化修飾在多發(fā)性骨髓瘤發(fā)生發(fā)展中的作用研究進展*

        2020-08-11 12:49:10
        中國腫瘤臨床 2020年13期
        關(guān)鍵詞:甲基化酶精氨酸漿細胞

        多發(fā)性骨髓瘤(multiple myeloma,MM)是以終末分化的漿細胞克隆性增生為特征的血液系統(tǒng)惡性腫瘤,可引起全身多臟器功能損害,主要表現(xiàn)為骨質(zhì)破壞、腎損害、貧血、高鈣血癥及感染等。雖然MM的治療取得較大進展,患者生存期獲得延長,但易復發(fā)且不可治愈。本文旨在探討MM的發(fā)病機制、尋找更為有效的治療靶點。

        MM的生物學特性錯綜復雜,是一種異質(zhì)性很強的血液系統(tǒng)腫瘤,多種因素共同參與MM 的發(fā)生發(fā)展,主要包括遺傳學異常[1]、骨髓微環(huán)境的改變[2-3]和表觀遺傳學異常[4]。近年研究顯示,表觀遺傳學異常在MM 發(fā)生和疾病演變過程中扮演重要角色,包括DNA 甲基化、組蛋白修飾和非編碼RNA。組蛋白修飾包括組蛋白乙?;?、甲基化、磷酸化、泛素化、類泛素化及瓜氨酸化。MM患者全基因測序結(jié)果顯示,多種組蛋白甲基化酶發(fā)生突變,包括去甲基化酶UTX、甲基化酶MLL 和MMSET[5-6]。上述發(fā)現(xiàn)為MM 的聯(lián)合化療提供新的治療靶點。組蛋白甲基化較為復雜,通??砂l(fā)生在組蛋白N末端的賴氨酸(K)或精氨酸(R)殘基上,其功能與位點(K 或R)和甲基化程度(單、二或三甲基化)相關(guān),如H3K4me3、H3K36me3、H3K79me3、H4R3me1 和H4K20me1 可激活相關(guān)基因轉(zhuǎn)錄,而H3K9me3 和H3K27me3 則抑制基因轉(zhuǎn)錄[7-8]。組蛋白甲基化過程由組蛋白甲基化轉(zhuǎn)移酶(histone methyltransferases,HMTs)和組蛋白去甲基化酶(histone demethylases,HDMs)共同調(diào)節(jié),從而調(diào)控下游基因表達。現(xiàn)將組蛋白甲基化調(diào)節(jié)酶及其在MM中的作用綜述如下。

        1 HMTs

        目前,已知的賴氨酸甲基化轉(zhuǎn)移酶(lysine meth?yltransferases,KMTs)超過30 余種,分屬KMT1~8 個家族(表1)。根據(jù)其結(jié)構(gòu)特點分為兩類,一類為含有SET結(jié)構(gòu)域,另一類包含DOT1L結(jié)構(gòu)域。精氨酸甲基化則主要由PRMTs(protein arginine methyltransfer?ase)家族成員催化完成,PRMTs 催化甲基基團從S-腺苷甲硫氨酸(SAM)轉(zhuǎn)移到蛋白質(zhì)精氨酸胍基的氮原子上。主要有3 個亞型:非對稱精氨酸二甲基化(ω-NG,NG-asymmetric dimethylarginine,ADMA),對稱精氨酸二甲基化(ω-NG,NG-symmetric dimethylar?ginine,SDAM)和精氨酸單甲基化(ω-NG-monomethy?larginine,MMA)。目前,已知有9 種PRTMs,分別為PRTM 1~9(表1)。

        2 HDMs

        組蛋白賴氨酸殘基的去甲基化酶(histone lylsine demethylases,KDMs)分為兩大類,一類為KDM1 家族成員,主要依靠FAD 為輔助因子完成去甲基化,如LSD1(lysinespecific histonedemethylase 1),以甲醛和非甲基化的賴氨酸殘基為產(chǎn)物的去甲基化酶,可與co-REST、BHC80、HDAC1/2 等蛋白形成復合物發(fā)揮作用,作用于H3K4me1/2;另一類家族成員則包含1個JMJC(Jumonji C)結(jié)構(gòu)域,依賴于Fe(Ⅱ)和α-酮戊二酸為輔因子,可對H3K4、H3K9和H3K36等多個位點進行去甲基化作用。包括多個亞型(KDM2~7)(表2)。目前,對精氨酸殘基的去甲基化酶報道很少,有研究顯示KDM 家族的部分成員,如KDM3A 和KDM6B,也可以在精氨酸殘基去甲基化[9]。JMJD6(Jumonji domain-containing protein 6)為包含JMJC 結(jié)構(gòu)域的鐵及2-酮戊二酸依賴的加雙氧酶,可對H3R2、H4R3 進行去甲基化。此外,組蛋白甲基化酶也會針對非組蛋白作用,從而影響重要的細胞信號通路,包括NF-κB、RAS 通路、PI3K/Akt、Wnt/βcatenin、P53和ERα通路[10]。

        表1 HMTs及其作用位點

        表2 KDMs及其作用位點

        表2 KDMs及其作用位點(續(xù)表2)

        3 組蛋白甲基化在MM發(fā)生發(fā)展中的作用

        3.1 甲基化轉(zhuǎn)移酶

        MMSET 亦稱為WHSC1/NSD2,是目前在MM 中研究最多的HMTs。約15%~20%MM 患者發(fā)生t(4;14)易位,導致IgH上MMSET和成纖維細胞生長因子受體3(FGFR3)過表達。t(4;14)易位患者無進展生存期(progression-free survival,PFS)和總生存率(overall survival,OS)顯著縮短,但硼替佐米可克服這種不良預后[11]。MMSET主要催化H3K36雙甲基化和H4K20 的雙、三甲基化。MM 中MMSET 過表達導致H3K36me2 水平增高,引起癌基因轉(zhuǎn)錄激活,促進癌細胞增殖[12],受影響的基因還包括細胞周期(如cy?clin E2)、凋亡和P53通路(如BAX和Bcl2)、DNA修復(如ATM和GADD45A)和整合素介導的信號通路(如CDC42)[13]。既往研究報道MMSET還可以甲基化Au?rora激酶A(AURKA)導致P53蛋白酶體降解,從而引起腫瘤細胞增殖[14]。MMSET亦可與表觀遺傳學的抑制物相互作用,如sin3a、HDAC1-2和H3K4去甲基化酶LSD1/KDM1A,形成轉(zhuǎn)錄抑制復合物。MMSET、KAP1 和HDACs 形成的復合物可通過抑制miR-126導致c-myc 水平增高,刺激MM 細胞增殖[15]。沉默MMSET后可導致MM細胞周期停滯,誘導凋亡[16]。

        MMSET 亦與耐藥密切相關(guān),使其成為一個潛在的治療靶點。MMSET 可調(diào)節(jié)干擾素調(diào)節(jié)因子4(in?terferon regulatory factor 4,IRF4)的表達,抑制該基因可增強硼替佐米療效。MMSET 高表達還使得DNA損傷修復增加,導致部分患者對DNA 損傷類藥物不敏感。臨床上也觀察到表達t(4;14)患者在應用DNA損傷類藥物后(如馬法蘭)很快復發(fā)[17]。MMSET在高效的同源重組和非同源末端連接兩種DNA修復過程中是必需的,體外使其沉默后可增加對化療藥物的敏感性[18]。最近通過高通量篩選,5 種潛在的MMSET 抑制物被鑒定篩選,但仍需進一步工作確定其在MM中的作用[19]。

        EZH2 為多疏抑制復合物2(polycomb repressive complex 2,PRC2)的催化亞基。其可催化H3K27me3,從而抑制靶基因轉(zhuǎn)錄,并參與調(diào)控細胞周期、細胞衰老、細胞分化等生理或病理過程[20]。近年EZH2成為MM中的研究熱點,其在MM進展過程中上調(diào),并與高危表型和不良預后相關(guān)[21]。EZH2過表達還與IL-6A、c-myc激活或miR26a下調(diào)相關(guān)。有研究通過全基因組測序詳細闡釋了MM中H3K27me3相關(guān)標志,發(fā)現(xiàn)了常見的激活(H3K4me3富集)和沉默(H3K27me3富集)的特殊靶基因,與疾病進展及不良預后相關(guān)[22]。應用EZH2特異性抑制劑UNC199和GSK343可重新激活參與分化、細胞周期和凋亡的相關(guān)基因起到抗MM作用。雖然有研究表明在MMSET高表達的MM細胞中EZH2抑制劑敏感性增強,但有研究[23]并未發(fā)現(xiàn)兩者間存在關(guān)聯(lián),該結(jié)果尚需進一步研究。研究表明,UNC199還可通過影響miRNAs表達導致下游癌基因或活化因子下調(diào)[24]。EZH2也參與骨髓瘤骨病的發(fā)生發(fā)展。成骨前體細胞中轉(zhuǎn)錄抑制因子(growth factor independence 1,GFI1)介導的RUNX2沉默依賴于HDAC1、LSD1(KDM1A)和EZH2的募集[25]。這些研究成果提示其可能成為潛在的治療靶點。多種EZH2抑制劑目前在實體腫瘤和淋巴瘤中已進入臨床試驗階段,有單藥應用亦有聯(lián)合化療方案。其中最具潛力的是tazemetostat/EPZ-6438,在淋巴瘤患者中觀察到良好療效,且不良反應較小[26]。而GSK2816126單藥臨床試驗的結(jié)果欠佳,Ⅰ期臨床試驗入組復發(fā)的非霍奇金淋巴瘤、MM和實體腫瘤患者,起始劑量從50 mg開始,逐漸升至最大劑量3 000 mg。結(jié)果顯示22例可評估的患者中,僅1例部分緩解和7例疾病穩(wěn)定[27]。目前,已被中止試驗。但相關(guān)生物標志物的鑒定可能會增加此類藥物的臨床療效。Laurie等[28]發(fā)明一項基于基因表達的EZ評分體系,能夠預測EZH抑制物在HMCL和初診MM中的敏感性。

        G9a和GLP屬于Su(var)3-9家族,主要負責常染色質(zhì)組蛋白H3K9位點的單、雙及三甲基化進而抑制相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄。G9a 與胚胎發(fā)育、腫瘤細胞生長、認知及適應性行為和脂肪形成等多種生物過程密切相關(guān)[29]。近期研究顯示,GLP在冒煙型骨髓瘤患者中高表達[30]。在急性淋巴細胞白血病、急性髓細胞白血病、淋巴瘤和MM 細胞系中,應用siRNA 技術(shù)或小分子抑制劑降低G9a表達可顯著抑制瘤細胞生長,上述研究結(jié)果提示G9a/GLP 可成為MM 治療潛在的新靶點。

        KMT1/SUV39H1負責H3K9的三甲基化,在正常骨髓漿細胞和MM患者漿細胞中存在差異表達。H3K9甲基化是異染色質(zhì)蛋白(heterochromatin protein1,HP1)染色區(qū)的停泊位點,在異染色質(zhì)形成及基因轉(zhuǎn)錄調(diào)控中具有重要作用[31]。SUV39H1被發(fā)現(xiàn)可結(jié)合RUNX1的抑制區(qū)域。在MM中,高表達的SUV39H1與不良預后相關(guān),敲除后導致增殖減低、凋亡增加、ROS過度產(chǎn)生和DNA損傷。SUV39H1抑制物chaetocin在人MM細胞系和原代細胞中具有抗瘤細胞作用[32]。

        KTM2/MLL 可催化H3K4 甲基化,促進轉(zhuǎn)錄激活。MLL(mixed lineage leukemia)家族成員MLL1-5在7%MM 患者中發(fā)生突變,但對患者的PFS 和OS 均無顯著性影響[33]。

        PRMT5可催化組蛋白和非組蛋白精氨酸殘基的甲基化[34]。PRMT5參與分化、增殖、同源重組和細胞遷移,在多種血液系統(tǒng)腫瘤和實體腫瘤中被發(fā)現(xiàn)過表達[35]。PRMT5被發(fā)現(xiàn)在MM中上調(diào),并與不良預后相關(guān)。應用siRNA 敲低或抑制劑EPZ015666 可在HMCL 和原代細胞中抑制細胞周期,誘導凋亡。此外,口服的EPZ015666可在小鼠模型中有效降低瘤負荷。EPZ015666在淋巴瘤中可介導P53甲基化,但在MM中其甲基化并不依賴于P53[36]。相反,TRIM21被證實為PRMT5 在MM 中的結(jié)合物,導致經(jīng)典NF-κB信號通路受抑,從而使IKK介導的自噬增強[37]。

        PRMT4 作為精氨酸甲基轉(zhuǎn)移酶1(coactivitor-as?sociated arginine methyltransferase1,CARM1)的輔助刺激因子,介導H3R2me2a、H3R17me2a、H3R26me2a和非組蛋白甲基化,從而促進轉(zhuǎn)錄。Drew 等[38]首次驗證EZM2302,一種選擇性PRMT4抑制劑,體外具有抗MM 作用。Nakayama 等[39]也于體外證明另一個PRMT4特異性抑制劑TP-064在MM中的抗增殖作用。

        3.2 去甲基化酶

        KDM1A也稱為LSD1,介導H3K4me1/2去甲基化,抑制轉(zhuǎn)錄。但在特定條件下,KDM1A也可去除H3K9單雙甲基,導致轉(zhuǎn)錄激活。KDM1A還可與其他表觀遺傳學調(diào)控復合物,如NuRD、SIRT1、CoREST/HDAC、MMSET和SIN3A/HDAC聯(lián)合作用[40]。此外,KDM1A還可抑制P53功能[41]。KDM1A在多種血液系統(tǒng)腫瘤和實體腫瘤中表達增高[42],但KDM1A/LSD1在MM中的作用尚存爭議。有研究發(fā)現(xiàn)癥狀型MM和漿細胞白血病(plasma cell leukemia,PCL)患者中LSD1的水平顯著高于無進展MM患者,且E-鈣黏附蛋白和波形纖維蛋白的水平降低;還可抑制破骨形成,增加MM細胞對HDAC抑制劑的敏感性;與MMSET形成抑制復合物,支持其在MM中的成瘤功能[43]。相反,Wei等[44]研究發(fā)現(xiàn),KDM1A的種系突變會促進MM發(fā)展。此外,KDM1A在MM進展過程中下調(diào),在MGUS 和MM 中KDM1A 也低于正常漿細胞;KDM1A突變的細胞中富含myc基因。KDM1A的抑制劑GSK-LSD1在小鼠模型中可促進MGUS發(fā)展;抑制KDM1A還可促進U266和原代細胞增殖。KDM1A/LSD1在MM中的作用如何仍需進一步研究。

        KDM3/JMJD1C 賴氨酸去甲基化酶家族包括KDM3A、KDM3B 和JMJD1C。正常情況下,KDM3A和KDM3B 介導H3K9me1/2 去甲基化,在精子發(fā)育、干細胞自我更新和脂肪生成中發(fā)揮作用[45]。Ohguchi等[46]研究發(fā)現(xiàn),KDM3A-KLF2-IRF4軸在MM 細胞存活中發(fā)揮重要作用。KDM3A 水平在MGUS 和MM 患者中較正常對照增高,敲除KDM3A 可起到抗MM 效應,并發(fā)現(xiàn)KLF2(Krüppel-like factor 2)和IRF4 下調(diào)。KLF2在支持正常的B細胞和漿細胞功能方面發(fā)揮作用。IRF4 為漿細胞特異性轉(zhuǎn)錄因子,可促進漿細胞成熟,且為MM 成瘤所必需[47]。有研究證實,KDM3A 在慢性缺氧條件下培養(yǎng)的MM 細胞中上調(diào),敲除后可誘導細胞凋亡,進一步證實HIF1α 介導的KDM3A 上調(diào)可誘導長鏈非編碼RNA MALAT1表達,進而上調(diào)糖酵解基因和抗凋亡途徑,提示在MM進展過程中,MALAT 表達亦上調(diào)[48]。結(jié)果表明,HIF1α-KDM3A-MALAT1在缺氧的MM細胞中為潛在的治療靶點。上述研究結(jié)束均表明,KDM3A 在MM 中有促成瘤的作用,因此需尋找特異性抑制劑[49]。

        KDM5(JARID1)家族(KDM5A-D)介導H3K4me1-3去甲基,其中對H3K4me3親和力最高,可直接抑制轉(zhuǎn)錄,或與其他抑制因子協(xié)同作用。3個獨立的初診MM患者隊列的生存分析顯示,KDM5B是預后不良的危險因素。全KDM5 抑制劑KDOAM-25 處理MM 細胞系MM1s,發(fā)現(xiàn)G1期停滯,細胞存活減少,ChIP-sequencing分析顯示H3K4三甲基化水平增高[50]。另一種KDM5抑制劑compound33已被鑒定,但尚未應用在MM中[51]。

        KDM6A(UTX)和KDM6B(JMJD3)介導H3K27me2/3去甲基化。UTX通常與其他表觀遺傳調(diào)控因子共同作用,如HMTs MLL2/3和HATs P300/CBP,激活轉(zhuǎn)錄[52]。已在10%MM患者中發(fā)現(xiàn)UTX表達的突變?nèi)笔В?3]。在髓外MM和PCL,UTX的突變率達到30%~40%。Ohguchi等[54]研究發(fā)現(xiàn),沉默UTX可促進瘤細胞增殖、黏附性和致瘤性,還可以增強MM細胞對EZH2抑制劑的敏感性,主要與Bcl-6重激活、繼發(fā)IRF4和c-myc抑制有關(guān)。表明EZH2抑制劑治療存在UTX突變的患者具有臨床意義。而KDM6B/JMJD3則相反,其在MM中高表達,缺失后則可誘導細胞凋亡。NF-κB信號通路可激活KDM6A,依次上調(diào)MAPK通路相關(guān)基因,包括ELK和FOS,從而促進瘤細胞存活。KDM6B介導的MAPK通路活化是非去甲基化依賴的。KDM6B被鑒定為一種抑癌基因,在17p13缺失的高危患者中與TP53協(xié)同作用[55]。上述研究結(jié)果均證實KDM6A 可作為EZH2 抑制的標志,而KDM6B則可能成為潛在的MM治療靶點。GSK-J4為首個KDM6家族的小分子抑制劑,但其抑制效果與KDM5類似[56]。因此,有必要開發(fā)特異性的KDM6抑制劑。

        4 結(jié)語

        組蛋白甲基化過程在MM中發(fā)揮重要作用,與表位突變、基因組不穩(wěn)定、MM進展、耐藥性出現(xiàn)和短暫的PFS 有關(guān)。深入研究組蛋白甲基化異常對MM 發(fā)病機制的影響,有助于尋找新的治療干預靶點。針對HMTs 或HDMs 的藥物已被證明可改變表觀遺傳格局,誘導抑癌基因重新表達。但臨床應用的一項重要限制為不良反應。此外,表觀遺傳靶向藥物對正常細胞群的長期影響亟需進一步研究。該類藥物未來將進入個體化治療,新的生物標志物識別、新藥開發(fā)及多藥聯(lián)合等均可提供臨床指導。

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