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        基于影像組學(xué)的重度抑郁癥及閾下抑郁癥分類研究

        2020-08-04 06:23:06王露瑩趙書俊單保慈圖婭
        關(guān)鍵詞:特征選擇小腦腦區(qū)

        王露瑩,趙書俊,單保慈,圖婭

        1.鄭州大學(xué)物理學(xué)院(微電子學(xué)院),河南鄭州 450052;2.中國科學(xué)院高能物理研究所,北京市射線成像技術(shù)與裝備工程技術(shù)研究中心,北京 100049;3.中國科學(xué)院大學(xué),核科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,北京 100049;4.北京中醫(yī)藥大學(xué),北京 100029;*通訊作者 單保慈 shanbc@ihep.ac.cn

        重度抑郁癥(major depressive disorder,MDD)是一種以反復(fù)的悲傷、思維緩慢和意志活動(dòng)減退為主要臨床特征的精神疾病,對人類健康構(gòu)成嚴(yán)重威脅[1]。閾下抑郁癥(subthreshold depression,StD)是一種精神類病癥,不符合抑郁癥的診斷標(biāo)準(zhǔn),但與正常人相比,患有StD者M(jìn)DD的患病風(fēng)險(xiǎn)更高,目前認(rèn)為閾下抑郁是抑郁癥的前期,其常見癥狀是情緒低落或興趣喪失[2-3]。盡管醫(yī)師可以相對容易地確定這兩種疾病的存在,但是客觀的評價(jià)指標(biāo)將有助于醫(yī)師的診斷和治療。隨著腦影像技術(shù)的發(fā)展,MRI已廣泛應(yīng)用于抑郁癥的診斷和治療等方面[4-5]。既往研究大多提取基于常規(guī)的參數(shù)用于MDD患者的分類,如灰質(zhì)體積、局部一致性、低頻振蕩振幅、部分各向異性[6-7]等。影像組學(xué)是一種醫(yī)學(xué)圖像分析框架,通過一系列算法將醫(yī)學(xué)圖像轉(zhuǎn)換為可挖掘的、更高維度的數(shù)據(jù)集,主要應(yīng)用于臨床腫瘤學(xué)中提取腫瘤的影像組學(xué)特征[8-9]。近年,影像組學(xué)技術(shù)已成功用于神經(jīng)及精神類疾病,如阿爾茨海默病、注意力缺陷多動(dòng)障礙等[10-12]。因此本研究借助影像組學(xué)方法提取結(jié)構(gòu)MRI各腦區(qū)的紋理特征,識(shí)別與MDD和StD診斷相關(guān)的大腦影像組學(xué)特征,并根據(jù)已識(shí)別的特征建立和評估MDD、StD與正常對照組的分類模型,從而幫助臨床醫(yī)師對MDD和StD進(jìn)行輔助診斷。

        1 資料與方法

        1.1 研究對象 納入171例中國漢族受試者,年齡18~68歲,其中未接受過藥物治療的MDD患者40例,男16例,女24例,年齡(34.40±11.57)歲;57例StD患者,男15例,女42例,年齡(32.25±15.62)歲;74名健康對照,男23名,女51名,年齡(29.81±14.63)歲。所有受檢者均簽署知情同意書。由持有執(zhí)業(yè)醫(yī)師證的精神科醫(yī)師采用國際疾病分類第10版[13]的診斷標(biāo)準(zhǔn)對MDD患者進(jìn)行診斷。MDD排除標(biāo)準(zhǔn):①有其他精神疾病或頭部創(chuàng)傷史;②過去4周參加其他臨床試驗(yàn);③正在服用精神科藥物或接受其他系統(tǒng)治療;④患有其他需要治療的嚴(yán)重疾??;⑤有任何自殺計(jì)劃或行為;⑥妊娠或哺乳期。StD納入標(biāo)準(zhǔn):①流行病學(xué)研究中心抑郁量表(center for epidemiologic studies depression scale,CES-D)得分≥16分;②17項(xiàng)漢密爾頓抑郁評定量表得分為7~17分;③未達(dá)到國際疾病分類第10版的MDD診斷標(biāo)準(zhǔn)且既往未被診斷為MDD。排除標(biāo)準(zhǔn)與MDD受試者相同,所有StD患者在接受量表評估3 d后進(jìn)行MRI掃描。74名健康對照的CES-D評分均<16分且既往未被診斷為MDD,并且符合MDD受試者的排除標(biāo)準(zhǔn)。本研究經(jīng)北京中醫(yī)藥大學(xué)第三附屬醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理委員會(huì)批準(zhǔn)[批準(zhǔn)號(hào):(2015)倫審第(29)號(hào)]。

        1.2 儀器與方法 所有受試者均在北京師范大學(xué)認(rèn)知神經(jīng)科學(xué)與學(xué)習(xí)國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的西門子3.0T場強(qiáng)的MRI儀上進(jìn)行腦部T1WI,掃描序列使用梯度回波三維成像序列,掃描參數(shù):TR 2530 ms,TE 3.39 ms,翻轉(zhuǎn)角7°,層厚1.33 mm,視野256 mm×256 mm,采集矩陣256×256,空間分辨率為1 mm×1 mm×1.33 mm。

        1.3 圖像預(yù)處理 結(jié)構(gòu)MRI圖像通過SPM 12(https://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/software/spm12)軟件進(jìn)行預(yù)處理,主要步驟:首先將每一個(gè)體的T1WI DICOM圖像轉(zhuǎn)換為NIFTI格式,然后將轉(zhuǎn)換后的圖像標(biāo)準(zhǔn)化到MNI空間,將標(biāo)準(zhǔn)化后的圖像重采樣為91×109×91的矩陣,分辨率為2 mm×2 mm×2 mm。根據(jù)自動(dòng)解剖標(biāo)記圖譜(automated anatomical labeling,AAL)[14],將每名受試者預(yù)處理后的圖像分割成116個(gè)感興趣區(qū)(ROI)。圖譜將大腦分成90個(gè)區(qū)域,小腦分成26個(gè)區(qū)域。所有ROI的區(qū)域掩模均由軟件WFU-PickAtlas(http://www.ansir.wfubmc.edu)生成[15]。

        1.4 特征提取 使用Python中的包pyradiomics(https://pyradiomics.readthedocs.io/en/latest/)對預(yù)處理后的圖像進(jìn)行影像組學(xué)定量特征計(jì)算,其中包括一階統(tǒng)計(jì)量18個(gè),灰度共生矩陣(gray level cooccurrence matrix,GLCM)23個(gè),灰度運(yùn)行長度矩陣(gray level run length matrix,GLRLM)16個(gè),灰度區(qū)域級(jí)矩陣(gray level size tone matrix,GLSZM)16個(gè),相鄰灰度差矩陣(neighboring gray tone difference matrix,NGTDM)5個(gè),灰度依賴矩陣(gray level dependence matrix,GLDM)14個(gè),共計(jì)92個(gè)影像組學(xué)特征。即每個(gè)ROI區(qū)提取92個(gè)影像組學(xué)特征,共計(jì)提取116×92個(gè)特征用于進(jìn)一步分析。

        1.5 特征選擇 考慮到可能影響預(yù)測模型分類精度的一些冗余和不相關(guān)的特征,通過基于樹的特征選擇進(jìn)行特征選擇。通過計(jì)算標(biāo)準(zhǔn)化后的該特征帶來的信息增益總量計(jì)算特征的重要程度[16],然后將特征重要程度前3%的特征作為最佳特征進(jìn)行建模[17]。使用python中的包sklearn完成上述特征選擇。為了進(jìn)一步評估特征選擇的穩(wěn)定性,本研究采用抽樣Pearson相關(guān)系數(shù)作為評價(jià)指標(biāo)[18-19]。

        1.6 支持向量機(jī)(support vector machine,SVM)分類 SVM在處理高維、非線性、小樣本數(shù)據(jù)時(shí)具有較好的分類效果[20],是神經(jīng)影像學(xué)研究方面的常用分類器[21]。本研究采用網(wǎng)格搜索法自動(dòng)遍歷多種參數(shù)組合,通過受試者工作特征(ROC)曲線下面積(AUC)評價(jià)分類效果,確定SVM的最佳參數(shù)組合用于分類。此外,鑒于10倍交叉驗(yàn)證法具有更穩(wěn)定的性能,本研究采用10倍交叉驗(yàn)證法評估分類器的性能。具體做法:將受檢者的數(shù)據(jù)集隨機(jī)分為10份,逐一將其中的1份作為測試集,其余9份作為訓(xùn)練集,取10次結(jié)果的均值作為對分類器性能的評估。為了得到更精確的結(jié)果,本研究進(jìn)行100次10倍交叉驗(yàn)證并總結(jié)了來自總共1000次訓(xùn)練測試循環(huán)的分類器性能。通過準(zhǔn)確率、敏感度和特異度評估分類模型的性能。

        2 結(jié)果

        2.1 一般資料 3組受檢者性別及年齡比較,差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。

        2.2 特征重要程度 對照組與MDD組分析顯示,重要程度前10位的特征分別位于顳極的顳上回、眶部額中回及眶部額下回。對照組與StD組分析顯示,重 要程度前10位的特征分別位于小腦、楔葉、梭狀回、豆?fàn)詈恕D極的顳中回、豆?fàn)钌n白球、緣上回及杏仁核。MDD與StD組分析顯示,重要程度前10位的特征分別位于海馬旁回、內(nèi)側(cè)額上回、眶部額上回、顳極及杏仁核(圖1,表1~3)。特征選擇穩(wěn)定性的測量結(jié)果見圖2。

        圖1 特征重要程度前10位的腦區(qū)。A為正常對照組與MDD組;B為正常對照組與StD組;C為MDD與StD組。彩色條表示重要程度大小,藍(lán)色為重要程度較小,紅色為重要程度較大

        表1 區(qū)分正常和MDD特征重要程度前10位的特征

        表2 區(qū)分正常和StD特征重要程度前10位的特征

        表3 區(qū)分MDD和StD特征重要程度前10位的特征

        圖2 特征選擇方法在數(shù)據(jù)集上的穩(wěn)定性

        2.3 分類器性能 使用100次10倍交叉驗(yàn)證法求平均后獲得SVM在準(zhǔn)確度、敏感度、特異度獲得的分類器性能結(jié)果(表4)。當(dāng)用于分類MDD和正常對照組時(shí),分類器的準(zhǔn)確度為86.51%。使用相同的特征分類MDD和StD時(shí),分類器的準(zhǔn)確度為88.60%。而分類正常對照組和StD時(shí),準(zhǔn)確度為72.74%。ROC曲線見圖3。

        表4 不同分組間的分類器性能(%)

        圖3 不同組間分類器性能的ROC曲線

        3 討論

        本研究提出在MDD、StD患者和正常對照組中識(shí)別各個(gè)腦區(qū)顯著不同的影像組學(xué)特征,利用SVM對相關(guān)的特征進(jìn)行分類。在分類MDD和正常對照組時(shí)的準(zhǔn)確度為86.51%,AUC為0.91,這一結(jié)果比僅提取基于體素參數(shù)的分類研究[6,22]表現(xiàn)更好。由于影像組學(xué)特征能夠從醫(yī)學(xué)圖像中獲得更多包含空間和紋理的信息,因此本研究確定了影像組學(xué)技術(shù)在診斷分類常見的精神類疾病方面的潛在效用。

        本研究結(jié)果顯示,在對正常對照組和StD進(jìn)行區(qū)分時(shí),重要程度前10位的特征大多位于小腦蚓,小腦蚓位于小腦中線兩側(cè),并稱為邊緣小腦或小腦核,其在調(diào)節(jié)情感、情緒和認(rèn)知過程中具有作用[23],并與StD患者的臨床表現(xiàn)相關(guān),因此對于StD患者,小腦可能是一個(gè)需要關(guān)注的腦區(qū)[24]。既往研究表明,內(nèi)側(cè)眶額皮質(zhì)在監(jiān)測刺激的獎(jiǎng)勵(lì)價(jià)值和預(yù)測即將到來的情緒狀態(tài)或反應(yīng)中具有重要作用,因此,該區(qū)域的結(jié)構(gòu)異??赡芡ㄟ^破壞獎(jiǎng)賞的神經(jīng)處理而導(dǎo)致抑郁癥發(fā)作[2,25]。這一結(jié)果與重要程度前10位的特征位于的腦區(qū)大致相同,因此本研究進(jìn)一步證實(shí)內(nèi)側(cè)眶額皮層是抑郁的靶向區(qū)。Zeng等[26]研究發(fā)現(xiàn)情感網(wǎng)絡(luò)(包括杏仁核、顳極、蒼白球、腦島和顳極)參與情緒調(diào)節(jié)和情感處理,表明上述腦區(qū)的紋理特征改變對抑郁癥可能有一定的影響。

        本研究結(jié)果顯示,分類MDD和StD的準(zhǔn)確度略高于正常對照和MDD,可能是由于樣本數(shù)據(jù)量的差異導(dǎo)致結(jié)果存在一定的偏差,但正常對照和MDD的AUC略高于MDD和StD,其原因?yàn)锳UC對樣本是否均衡并不敏感。因此,MDD患者和StD患者之間的關(guān)系仍需進(jìn)一步研究。

        本研究存在一定的局限性:①鑒于招募者的困難,樣本量小,未來應(yīng)考慮建立跨站點(diǎn)的研究擴(kuò)大樣本量;②并未對MDD和StD患者進(jìn)行隨訪,也未進(jìn)行疾病的機(jī)制研究。未來應(yīng)加強(qiáng)隨訪,進(jìn)一步闡明MDD和StD患者的疾病機(jī)制。

        總之,本研究基于影像組學(xué)的方法,使用影像組學(xué)特征對MDD、StD患者和正常對照進(jìn)行分類,從個(gè)體水平上有效區(qū)分MDD、StD患者和正常人。在分類MDD和正常對照時(shí),重要程度排名前10位的特征中所占比例最高的腦區(qū)位于顳極,表明顳極的紋理特征用于MDD診斷可能敏感度更高。而對于StD和正常對照,所占比例最高的腦區(qū)位于小腦,表明對于StD而言,小腦的紋理改變可能更多。本研究對MDD和StD的臨床診斷有重要的參考價(jià)值。

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