易華山,趙 瑤,馬鮮平,2,王芝英,2,張德志,2,李前勇,3,左福元,3
(1.西南大學 動物科學學院,重慶 402460;2.重慶市獸醫(yī)科學工程研究中心,重慶 402460;3.重慶市肉牛工程技術研究中心,重慶 402460)
藍舌病(Blue tongue, BT)是由藍舌病病毒(Bluetongue virus, BTV)引起的、以昆蟲(庫蠓)為傳播媒介的反芻動物的一種非接觸性傳染病,其易感動物為綿羊、山羊、牛和鹿及野生反芻動物,是OIE劃定為A類、我國列為一類的重要動物疫病[1]。藍舌病毒(Bluetongue virus,BTV)屬于呼腸孤病毒科(Reoviridae))環(huán)狀病毒屬(Orbivirus)的雙股RNA (dsRNA)病毒,BTV粒子呈圓形、二十面體對稱,無囊膜,10條分節(jié)段的dsRNA包含19 219個核苷酸,編碼7種結構蛋白(VP2、VP5、VP7、VP3、VP1、VP4和VP6)和5種非結構蛋白(NS1、NS2、NS3、NS3a和NS4)[1-2]。BTV完整病毒粒子(~550S)外層衣殼由VP2和VP5組成,VP7與VP3構成內層衣殼,包裹著病毒的10條分節(jié)段的dsRNA和三種具有酶催化活性的VP1、VP4和VP6蛋白組成病毒核心顆粒(470S)[3]。亞核心顆粒是缺失外層衣殼和VP7蛋白層的中間結構,VP3是亞核心顆粒唯一主要結構蛋白,是顆粒裝配的支架;裝配好的亞核心結構必須包被VP7三聚體才能形成成熟的核心顆粒,然后核心顆粒進一步被外層蛋白外衣殼層修飾形成成熟的病毒粒子[1,3]。BTV(~550S)感染首先是吸附易感宿主細胞后較大的VP2蛋白(110 kDa)與某種細胞表面糖蛋白結合并促進網格蛋白介導的病毒內吞作用,而具有膜融合作用的VP5蛋白(60 kDa)將470S核心顆粒從細胞內吞體內釋放,隨著外層VP2和VP5蛋白的解體,啟動BTV基因組RNA轉錄、蛋白的合成與病毒的組裝[1,3]。
利用低溫電子顯微鏡(Cryo-EM)和圖像分析表明,BTV外殼有60個類三角蛋白復合體(triskelion-like)的VP2纖突(spikes),圍繞120個膜穿透蛋白VP5的球形三聚體(圖1A)[3-4]。Zhang Xing等[5]以(3.5 ?)近原子分辨率定義了VP2和VP5蛋白的詳細結構(圖1B,圖2),以揭示每種蛋白在BTV進入細胞過程中的作用。BTV病毒結合宿主細胞表面唾液酸受體的VP2單體分為四個不同的區(qū)域,即中心蛋白質(hub),發(fā)夾(hairpin),金字塔形體(body)和高度柔性的外部頂點(tip),VP2也是宿主中和抗體結合位點[5]。Hub結構域有一個10股血凝素樣β折疊桶,驅動單體相互作用的三聚體以及具有唾液酸受體結合的口袋(pocket)[5]。在hub和body結構域的交界面,發(fā)現了典型的鋅指基序CCCH的四面體,負責早期內吞體(endosome)中pH觸發(fā)的VP2蛋白構象的變化[3,5]。Hassan、Forzan等研究表明,膜穿透/融合蛋白VP5三聚體具有高度致密的球狀折疊結構,以α螺旋和位于中心的卷曲螺旋結構促進VP5三聚體的形成,類似于人類免疫缺陷病毒(HIV)gp41膜病毒融合蛋白。每個VP5單體都有三個不同的結構域組成,一個位于核心表面下方裂隙中的柔性匕首結構域(a hidden dagger domains)、一個富含螺旋的伸展結構域(unfurling domains)和一個帶有膜相互作用元件的錨定結構域(anchoring domains)(圖2)[3]。VP5蛋白在病毒粒子中以三聚體形式存在(圖2B),其中匕首結構域中兩個螺旋結構 (α1 and α2)與相鄰的內層衣殼VP7蛋白的三聚體發(fā)生相互作用(圖2C)[3]。當BTV暴露于早期內吞體(Early endosome,pH 6.0~6.5)低pH環(huán)境下,VP5 N端匕首結構域發(fā)生構象變化而使其M1-S41基序及WHXL脂質作用、W411-L414基序與內吞體膜發(fā)生膜融合作用。隨著VP2蛋白的完全拆卸、降解, VP5蛋白的匕首(dagger domain)蛋白和伸展結構域(unfurling domains)可實現顯著重折疊[1,5-6]。VP5蛋白錨定結構域中的β-折疊片(β-meander motif)基序含有組氨酸簇,可感知晚期內吞體pH(Late endosome,pH 5.5)以釋放四個假定的膜相互作用蛋白而從晚期內吞體內釋放,實現具有轉錄活性的病毒顆粒進入細胞質內[3]。研究表明,VP5可利用一種晚期的內吞體特異性脂質來實現膜的滲透,這一過程類似于某些囊膜病毒,如流感病毒的HA2蛋白,通過晚期內吞體而進入細胞,并利用組氨酸殘基作為pH傳感器,隨后在感應晚期內吞pH后發(fā)生顯著構象變化[7-9]。
圖1 低溫電鏡技術重建BTV病毒
圖2 BTV病毒VP5結構域示意圖
1.2.1 BTV VP7與VP3蛋白結構 不同于病毒完整粒子(550S),對純化的BTV病毒通過蛋白水解可產生非常穩(wěn)定的由VP7、VP3、VP1、VP4、VP6及病毒基因組組成的核心粒子(470S)[3]。研究表明,BTV二十面體核心顆粒的三維(3D)結構顯示三角剖分數為13(T=13),由260個VP7(38 kDa)三聚體形成,似六元環(huán)排列在132個通道上,五個環(huán)結構排列在頂點;五個準等價三聚體形成明顯的原體單元,每個三聚體由兩個不同的結構域組成,“上段”(反向β-sandwich)和“下段”(主要是α-螺旋)[3,10]。一種單體的頂部區(qū)域靠近相鄰單體的下部區(qū)域,可使單體之間具有廣泛的相互作用。VP7下部結構域連接到由VP3蛋白(103 kDa)60個二聚體形成的病毒內層衣殼,VP3結構層具有T=2對稱性; 每個二聚體由“A”和“B”型構象組成,每個構象具有三個結構域,剛性“殼”,“頂端”和“二聚化”結構域[3]。 病毒內層衣殼的VP3層由12個十聚體通過“二聚化”結構域的互連形成,每個十聚體由五重的“A”型分子與周圍5個頂點的五重“B”型VP3分子組成[10-13]。在三重軸的VP3層中也有一些孔隙,但在完整的核心粒子中,這些孔隙被VP7三聚體完全填塞;在存在Mg2+和NTP的情況下,VP3和VP7在五重軸周圍向外移動,這可能是由于聚合酶復合物的激活,從而允許VP3層中存在的孔打開而使病毒mRNAs進入細胞質內進行病毒蛋白的合成及病毒基因組的復制[14]。迄今為止,包括酵母病毒L-A在內,大多數分節(jié)段dsRNA基因組的病毒都含有120個VP3亞基T = 2基本亞單位,這種結構可能是為了基本的生物學功能而保留的,比如在不同的病毒中保持轉錄復合物和基因組的正確結構[2-3,15]。
1.2.2 病毒三蛋白轉錄復合物(TC)結構 在BTV病毒顆粒內層核衣殼內部由VP1、VP4和VP6蛋白構成病毒三蛋白轉錄復合物(Viral tri-protein transcriptase complex,TC)結構[3]。 VP1 蛋白(150 kDa)由 L1 基因編碼,類似于λ3結構模型, VP1蛋白是BTV病毒依賴的RNA聚合酶(Viral RNA-dependent RNA polymerases,RdRp)具有中心聚合酶、N端和C端結構域[16-17],具有 RNA 依賴的 RNA 聚合酶活性,以病毒ssRNA為模板合成病毒dsRNA[18]。VP4(78 kDa)蛋白具有mRNA加帽酶活性,在RNA三磷酸酶,鳥苷酸轉移酶和兩種甲基化酶的協同作用下,催化在核心顆粒內的RNA轉錄物的5'末端形成cap1(m7GPPPNm)結構[19-20]。重組VP4的晶體結構顯示該蛋白呈細長的沙漏形態(tài),具有不同的結構域,每個功能結構域依次排列以促進酶催化活性[21]。VP6 (36 kDa)是RNA包裝中必不可少的ATP依賴性RNA解旋酶,可促進VP1的轉錄活性,其高分辨率結構尚不清楚;然而,核磁共振分析揭示了具有兩個大的環(huán)狀結構域,其顯示出非常容易與各種大小RNA的分子作用[1,3]。同時,VP6蛋白具有 ATP 結合活性,依賴 RNA ATP 酶活性和解旋功能,能使 BTV 的雙鏈RNA解螺旋并輔助 mRNA的合成等[1,3]。
病毒包涵體(Virus inclusion body,VIBs)或病毒蛋白聚集體是BTV和呼腸孤病毒科家族成員的標志,是基因組復制和亞病毒裝配的功能位點[3]。新合成的病毒蛋白與病毒RNA分子相互作用優(yōu)先于病毒衣殼組裝和dsRNA合成[3]。在BTV感染細胞中, NS1蛋白優(yōu)先促進BTV ssRNA的翻譯,促進病毒蛋白質合成;而NS2形成纖維網絡狀的VIBs,募集基因組組裝、復制和核心組裝所需的病毒ssRNA和蛋白質組分[1,22-23]。新產生的亞核蛋白(VP1、VP4、VP6和VP3)和10個節(jié)段的RNA轉錄物由NS2直接募集到VIBs中,并在VIBs中與VP3組裝成亞核心顆粒,然后再獲得VP7蛋白生成穩(wěn)定的病毒核心粒子。盡管還沒有確定VP3與VP7組裝的確切機制,但目前的研究表明,NS2與這些組分中的每一種蛋白直接或間接發(fā)生相互作用,特別是與BTV ssRNA的相互作用,具有高度特異性[1,3]。因此,一系列基于RG的研究證明,在BTV復制的早期階段,NS2促進了三種酶蛋白和VP3形成起初的復制酶復合物,VP7不直接參與復制酶復合物,僅用于穩(wěn)定復制酶復合物[24-25]。重組結構蛋白的共表達能使缺乏RNA基因組的CLPs組裝成為可能,表明這些蛋白具有內在的自組裝途徑,該系統使得VP3和VP7組裝過程的更精細階段得以解析[26-27]。例如,一個缺失VP3二聚化結構域的缺失突變體可以破壞亞核的形成,但卻可以生成VP3的十聚體和二聚體,這說明VP3二聚體形成了一個二聚體中間體的裝配途徑,并且通過二聚化結構域使十聚體與十聚體相互作用而參與整個VP3亞核的裝配[28]。
Sung等[29]應用體外轉錄/翻譯,無細胞裝配(CFA)系統進一步支持了重組蛋白裝配機制,首先在體外翻譯BTV聚合酶復合蛋白,然后與10個ssRNA轉錄物一起孵育,然后再依次與VP3和VP7一起孵育,所生成的產物具有完整的10個節(jié)段的ssRNA的BTV核心顆粒;并且添加NTPs和二價陽離子優(yōu)于VP7蛋白產生的BTV核心顆粒,包裝的ssRNA可以充當BTV dsRNA合成的模板,而且這種組裝的顆粒在易感細胞中具有感染性[3]。Sung等[29]研究還表明,VP6對于ssRNA包裝是必需的, VP7為亞核提供穩(wěn)定性,保護包裝的ssRNA免受RNA酶活性的影響[3,29]。顯然,在沒有非結構蛋白的情況下, BTV結構蛋白和RNA區(qū)段可以組裝形成感染性顆粒[3]。 隨著組裝過程,新合成的核心顆粒從VIBs中釋放,并利用細胞內囊泡分選和胞外途徑來繼續(xù)完成病毒組裝及出芽過程并傳播具有感染性的成熟病毒顆粒[3,30-31]。
BTV 10個RNA節(jié)段(3.95 kb~0.8 kb)可分為大、中、小三大類,每個節(jié)段的序列不同,在不同RNA截短可變區(qū)都具有互補的短5`和3`端UTRs及兩端高度保守的六核苷酸,正是通過這些UTRs,BTV和其他相關病毒開始分類募集各自基因組ssRNA 節(jié)段[32-34]。病毒基因組裝配開始于VP1聚合酶和VP4加帽酶的相互作用,同時VP6六聚體與10個ssRNA復合物相互作用,它們一起形成聚合酶復合物,并在五重軸上與VP3十聚體相互作用,隨著12個十聚體形成的亞核心粒子內層衣殼的形成及160個VP7三聚體依次沉積而形成BTV二十面體核心顆粒,在核心顆粒的表面再沉積120個VP5蛋白三聚體和60個VP2蛋白的三聚體形成完整的病毒粒子(圖3)[3]。研究表明,復雜RNA網絡節(jié)段間相互作用是病毒ssRNA分選、募集、包裝正確基因組區(qū)段的驅動力,并且從最小ssRNA節(jié)段S10開始按特定節(jié)段的順序募集,引發(fā)RNA-RNA與其他節(jié)段的相互作用以形成起始復合體;隨后,招募中等至較大的ssRNA,直到將完整的基因組包裝到衣殼中(圖3)[3]。在整個組裝的過程中,每一節(jié)段的組裝信號具有高度的特異性,不僅在UTRs中,在基因編碼區(qū)域中也有高度特異性的序列分布。而且,UTRs,特別是S10 UTRs,負責觸發(fā)裝配所需的正確的二級結構;寡核糖核苷酸、ORNs與BTV RNA的3'UTR互補的寡核糖核苷酸等,如果這些RNA網絡被擾亂,可阻止BTV體外衣殼化并能抑制體內病毒的復制[1,3]。
圖3 BTV粒子各組分時序組裝示意圖[3]
BTV新組裝的核心顆粒必須離開VIBs以獲得兩個外衣殼蛋白(VP2和VP5)并形成成熟的病毒顆粒,因此,核心顆粒及時從VIBs中釋放是病毒粒子成熟過程中必須調控的一個重要步驟[3]。NS2蛋白通過細胞磷酸化激酶而磷酸化,通過蛋白構象改變,成為核心顆粒從VIBs釋放而進入細胞質的關鍵調控因子[7]。研究表明,BTV VP2和VP5蛋白均可見于VIBs外周區(qū)域而有利于釋放核心顆粒獲得外層衣殼。通過桿狀病毒表達系統或體外轉錄 - 翻譯系統研究證實,在病毒組裝反應中VP2和VP5蛋白與核心顆粒表面蛋白VP7相互作用;并且VP2與VP5可分別與核心顆粒表面獨立地結合而直接連接到核心顆粒上[11,35-36]。一旦BTV核心顆粒獲得外層的VP2和VP5蛋白,核心顆粒就不再具有轉錄活性,因為在VP7蛋白三角形頂部作為VP2和VP5蛋白沉積的平臺而使VP7頂點處的孔被封閉[4-5]。每個VP2三聚體通過中心蛋白體和發(fā)夾結構域的基部(具有兩個組氨酸羧基末端)與四個VP7三聚體接觸, VP2發(fā)夾結構域的環(huán)也可以與VP7三聚體的膠凍卷頂部結構域相互作用[3,5]。VP5與VP7之間的相互作用更為廣泛,涉及到VP5的三個結構域[3]。重組表達研究的結果進一步證實了, VP2與VP5三聚體的N末端螺旋和VP2發(fā)夾環(huán)錨定結構域與VP5三聚體之間的相互作用較弱,這與BTV侵入細胞期間VP2在內吞體低pH環(huán)境下的脫離相一致,也就是VP2解離以VP5的匕首蛋白和伸展結構域構象變化而實現[3]。
BTV作為一種重要的dsRNA媒介病毒和病毒研究的模型系統已被廣泛研究,對BTV組裝路徑及其復制周期深入研究(圖3)[3],為開發(fā)新的診斷試劑,蛋白質和衣殼疫苗以及符合DIVA標準的新型減毒病毒BTV疫苗提供了基礎。雖然BTV基因組前體RNA在衣殼內的確切位置及其詳細的裝配機制仍不清楚,包裝的RNA的精確位置和TC復合物在二十面體衣殼中的作用機制?病毒基因組各節(jié)段的精確篩選募集與精確組裝機制等? 但是在不久的將來,單粒子低溫電子顯微鏡、低溫層析成像技術及單分子熒光光譜等將可能解決這些問題,為研究病毒與宿主適應性之間的共同機制,探索新的抗病毒策略,研究新型的具有廣泛活性的抗病毒制劑。