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        24個(gè)STR基因座在長(zhǎng)春市漢族人群的遺傳多態(tài)性

        2020-07-06 09:31:34包赫來(lái)于婷婷宋丹璐金海英秦金風(fēng)
        生物化工 2020年3期
        關(guān)鍵詞:基因座雜合長(zhǎng)春市

        包赫來(lái),于婷婷,宋丹璐,金海英,秦金風(fēng)

        (1.長(zhǎng)春市公安局,吉林長(zhǎng)春 130062;2.寧波海爾施基因科技有限公司,浙江寧波 315040)

        選用SureID?PanGlobal人類DNA身份鑒定試劑盒對(duì)610名長(zhǎng)春市漢族人群無(wú)關(guān)個(gè)體進(jìn)行群體調(diào)查,獲得相關(guān)遺傳學(xué)參數(shù)的基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

        1 材料與方法

        根據(jù)知情同意原則,本實(shí)驗(yàn)所用的610份樣本均采集自吉林長(zhǎng)春地區(qū)漢族人群無(wú)關(guān)個(gè)體,以血卡保存,1 mm孔徑作為直接擴(kuò)增模板。采用PanGlobal試劑盒,參照說(shuō)明書10 μL體系于9700型PCR擴(kuò)增儀進(jìn)行擴(kuò)增。使用ABI 3730基因分析儀進(jìn)行檢測(cè),將檢測(cè)結(jié)果于Genemapper ID-X軟件進(jìn)行分析。

        利用等位基因頻率調(diào)查數(shù)據(jù)分析軟件對(duì)群體數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析,結(jié)果包括各等位基因頻率,觀察值雜合度(Observation heterozygosity,Ho)、期望值雜合度(Expect heterozygosity,He)、多態(tài)性信息總量(Polymorphism information content,PIC)、個(gè)體識(shí)別能力(Discrimination power,DP)和三聯(lián)體非父排 除 概 率(Probability of paternity excluding of trios,PEtrio)[1-2]。根據(jù)軟件分析獲得的數(shù)據(jù)計(jì)算累積DP值(CDP)和累積PEtrio值(CPEtrio)。

        2 結(jié)果與分析

        各等位基因頻率分布見表1,共檢出320個(gè)等位基因,等位基因頻率在0.001~0.534。遺傳學(xué)參數(shù)見表2,Ho為 0.640~0.943,He為 0.636~0.944,除 TPOX 和TH01外,其余22個(gè)基因座Ho值均大于0.7,表現(xiàn)出高雜合度,體現(xiàn)出較高群體遺傳變異水平的鑒別能力;PIC為0.542~0.941,均大于0.5,能提供高度多態(tài)性信息;DP為 0.802~0.993,CDP> 0.999 999,除 TPOX、TH01、D3S1358、CSF1PO 和 D10S1248外,其余19個(gè)基因座的DP值均大于0.9,體現(xiàn)出較高的個(gè)體識(shí)別能力;PEtrio為0.371-0.887,CPEtrio>0.999 999,除 TPOX、TH01和D3S1358外,其余21個(gè)基因座的PEtrio值均大于0.5,體現(xiàn)出較高的親權(quán)鑒定能力。

        表1 長(zhǎng)春地區(qū)漢族人群無(wú)關(guān)個(gè)體24個(gè)STR基因座的等位基因頻率(n=610)

        續(xù)表1

        3 討論

        結(jié)果表明,本研究針對(duì)長(zhǎng)春市漢族人群對(duì)象選擇的24個(gè)常染色體STR基因座,均可提供高度多態(tài)性信息,其中22個(gè)基因座體現(xiàn)出較高群體遺傳變異水平的鑒別能力,19個(gè)基因座體現(xiàn)出較高的個(gè)體識(shí)別能力,21個(gè)基因座體現(xiàn)出較高的親權(quán)鑒定能力。綜上所述,本研究中24個(gè)常染色體STR基因座在長(zhǎng)春市漢族人群中具有優(yōu)良的遺傳多態(tài)性,適用于相關(guān)人群的法醫(yī)學(xué)研究。

        表2 長(zhǎng)春地區(qū)人群24個(gè)STR基因座群體遺傳學(xué)參數(shù)(n=610)

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