趙位 喻東 程建國
關(guān)鍵詞:林麝;肺炎克雷伯氏菌;kp05372基因;原核表達
林麝(Moschus berezoviskii)為《瀕危野生動植物種國際貿(mào)易公約》附錄Ⅱ和國家一級保護動物,其雄性分泌的麝香為名貴的中藥材和高級動物香料,具有重要的社會價值和經(jīng)濟價值。人工養(yǎng)殖是林麝資源保護的主要對策之一,我國從1958年開始人工養(yǎng)殖林麝,歷經(jīng)半個多世紀,發(fā)展仍較緩慢。影響林麝人工養(yǎng)殖的一個重要原因是林麝化膿性肺炎疾病的發(fā)病率和死亡率高[1]。林麝患化膿性肺炎后前期一般不易發(fā)現(xiàn),發(fā)現(xiàn)時已經(jīng)處于較嚴重階段,基本上無救治希望[2]。引起圈養(yǎng)林麝化膿性肺炎的病原菌種類繁多,包括大腸桿菌、沙門氏菌、肺炎鏈球菌、巴氏桿菌、綠膿桿菌、金黃色葡萄球菌和肺炎克雷伯氏菌等多種病原[3-4]。
肺炎克雷伯氏菌(Klebsiella pneumoniae)屬于腸桿菌科克雷伯菌屬。自Friediander(1882年)首次從病人的肺組織中分離得到該菌后,在大熊貓、疣猴、金絲猴和林麝等多種珍稀動物體內(nèi)均分離得到該菌[5-8]。該菌為條件性致病菌,在機體免疫力下降或長期使用抗生素導致菌群失調(diào)時,可引起人或動物感染肺炎、腦膜炎、肝膿腫、腸炎、腹膜炎等多種疾病[9]。在肺炎克雷伯氏菌基因組中分布著大量轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子,其中LysR家族轉(zhuǎn)錄因子是最大的調(diào)節(jié)蛋白家族[10],其調(diào)控的目的基因參與了細菌的毒力、新陳代謝、運動性、抗氧化、黏附和分泌等[11]。前期研究中,課題組在患化膿性肺炎和腹瀉林麝的腸道中分離出1株肺炎克雷伯氏菌,該菌株對小鼠具有強致病性,全基因組測序分析發(fā)現(xiàn),該菌株基因組序列中有1段序列大小為909 bp的編碼序列(登錄號:KX026659),命名kp05372,通過生物信息學方法分析發(fā)現(xiàn),該基因為1個新的LysR家族轉(zhuǎn)錄因子,可能具有LysR家族轉(zhuǎn)錄因子相似的功能[12]。因此,本研究擬通過對該基因進行原核表達,以期為該基因的功能研究奠定基礎。
1 材料與方法
1.1 試驗菌株與質(zhì)粒
林麝源肺炎克雷伯氏菌菌株由筆者所在實驗室保存;感受態(tài)大腸桿菌DH5α和BL2(DE3),購自天根生化科技有限公司;克隆載體pMD19-T sample載體,購自大連TaKaRa公司;表達載體 pET-32a(+) 為筆者所在實驗室保存。
1.2 主要試劑
細菌基因組DNA提取試劑盒及DNA Marker(DL2000)、DNA純化回收試劑盒、質(zhì)粒抽提試劑盒、SDS-PAGE凝膠試劑盒、Western Blot試劑盒;限制性內(nèi)切酶KpnⅠ、EcoRⅠ、D2000 plus DNA ladder、Trans 2K plus ⅡDNA Marker、蛋白質(zhì)Marker、DNA T4連接酶、PVDF膜、考馬斯亮藍R250、IPTG和2×SDS凝膠上樣緩沖液、抗His標簽單克隆抗體、二抗(兔抗鼠)等。
1.3 pMD19-T/kp05372重組克隆載體構(gòu)建與鑒定
運用Primer 5.0和Oligo 6.0設計擴增kp05372基因的特異性引物(P1:5′-GGTACCATGAACGGGATCAGTTTCAACC-3′,下劃線堿基為KpnⅠ酶切位點;P2:5′-GAATTCTTAGCTGCGACGCTCCTG-3′,下劃線堿基為EcoRⅠ酶切位點)。以GPKP菌株DNA為模板,進行kp05372基因的PCR擴增。PCR反應體系為:2×Taq PCR Master Mix 12.5 μL,10 mmol/L P1引物1.0μL,10 mmol/L P2引物 1.0 μL,DNA模板 10 μL,ddH2O 9.5 μL。PCR 反應程序為:94 ℃預變性5 min;94 ℃變性30 s,63 ℃退火1 min,72 ℃延伸1 min,30個循環(huán);72 ℃延伸10 min,4 ℃保存。將擴增產(chǎn)物進行電泳、膠回收和測序,測序結(jié)果與目標序列進行比對、驗證,然后利用T4連接酶將其與pMD19-T載體16 ℃連接過夜,將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化至E.coli DH5α感受態(tài)細胞中,然后取100 μL涂于含0.1 mg/mL氨芐青霉素(Amp)的LB培養(yǎng)基上,37 ℃恒溫培養(yǎng)16 h后,挑取單菌落分別接種于LB液體培養(yǎng)基中,37 ℃恒溫振蕩16 h。隨后分別提取質(zhì)粒,以P1、P2為引物,進行PCR和用KpnⅠ、EcoRⅠ單、雙酶切驗證。
1.4 pET-32a(+)/kp05372重組表達質(zhì)粒構(gòu)建與鑒定
利用KpnⅠ和EcoRⅠ酶對重組克隆質(zhì)粒pMD19-T/kp05372和表達質(zhì)粒pET-32a(+)雙酶切。pMD19-T/kp05372質(zhì)粒37 ℃酶切2 h,pET-32a(+) 質(zhì)粒37 ℃酶切12 h,電泳分離酶切產(chǎn)物,然后膠回收目的片段,16 ℃連接過夜。連接反應體系如下:目的片段5.0 μL;pET-32a(+)片段1.0 μL;T4 Ligase 0.5 μL;T4 Ligase Buffer 1.0 μL;H2O 2.5 μL。最后將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)入感受態(tài)細胞E.coli DH5α,涂布于含0.1 mg/mL Amp的LB固體培養(yǎng)基,于37 ℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)12 h,分別挑取陽性克隆菌株,提取質(zhì)粒進行PCR和KpnⅠ、EcoRⅠ單、雙酶切驗證,對鑒定正確的重組表達質(zhì)粒送公司進行測序。
1.5 重組蛋白的誘導表達及條件優(yōu)化
將pET-32a(+)/kp05372重組質(zhì)粒陽性E.coli BL21(DE3)接種于含0.1 mg/mL Amp的LB液體培養(yǎng)基中,37 ℃溫度振蕩培養(yǎng)至D600 nm約為0.6,分別加入IPTG至終濃度為0.0、0.2、0.4、0.6、0.8、1.0、1.2、1.4 mmol/L,誘導培養(yǎng)4 h,各取菌液 1 mL。同時,取部分IPTG濃度為0.6 mmol/L菌液離心,收集上清,用Tris-HCl(pH值=8.0)洗滌沉淀,超聲波裂解菌體,離心,收集沉淀。同時,在IPTG濃度0.6 mmol/L組設置28、30、37 ℃溫度梯度及1、2、3、4、5、6、7、8、9 h的誘導時間梯度。最后,分別在0.6 mmol/L菌液上清、裂解上清、裂解沉淀、不同IPTG濃度菌液、不同誘導時間菌液、不同溫度梯度菌液沉淀樣品中,加入25 μL PBS和 25 μL 2×SDS凝膠上樣緩沖液,混勻后沸水煮 5 min,10 000 r/min 離心1 min,取10 μL上層液體SDS-PAGE電泳,經(jīng)考馬斯亮藍R250染色后脫色,利用凝膠成像系統(tǒng)分析目的蛋白的表達情況。同時,設置誘導的空載體pET-32a(+) BL21(DE3)轉(zhuǎn)化菌作為對照。