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        空間效應(yīng)模型在青貯玉米新品系評比試驗中的應(yīng)用

        2020-05-30 10:25:22焦金龍向海游楊子和張艷茹吳元奇
        關(guān)鍵詞:效應(yīng)差異分析

        焦金龍,向海游,楊子和,趙 麗,張艷茹,王 偉,吳元奇*

        (1.四川農(nóng)業(yè)大學(xué)玉米研究所,成都 611130;2.四川農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院,成都 611130)

        農(nóng)作物新品種培育需要進(jìn)行品種比較試驗,田間試驗常受兩類變異因素的影響,即空間差異和隨機(jī)誤差[1]。田間試驗存在空間上的差異性,是由試驗田地理位置、土壤結(jié)構(gòu)、施肥情況[2]、營養(yǎng)成分[3]及一些病蟲害等因素引起[4],這會對田間試驗造成極大的影響。隨機(jī)誤差由處理和區(qū)組的交互作用引起,而與小區(qū)地理位置無關(guān)[5]。新品種評比試驗中,育種家通常采用間比法隨機(jī)區(qū)組設(shè)計進(jìn)行田間試驗[6-7],采用傳統(tǒng)方差分析進(jìn)行結(jié)果分析。而在實(shí)際試驗中要保證區(qū)組內(nèi)試驗條件的均勻性很難完成,這是一種很普遍的現(xiàn)象。而傳統(tǒng)方差分析方法難以有效控制田間試驗中的空間變異,導(dǎo)致試驗結(jié)果產(chǎn)生較大偏差。

        近年來,隨著數(shù)據(jù)分析軟件的不斷完善和推廣,國內(nèi)外學(xué)者提出了用空間效應(yīng)模型對田間數(shù)據(jù)進(jìn)行分析,該方法基于地理統(tǒng)計學(xué)處理空間變異的原理,是利用小區(qū)所處的空間位置,結(jié)合空間效應(yīng)模型,通過空間協(xié)方差反映試驗小區(qū)空間變異的特性,將變異特性與混合線性模型相結(jié)合應(yīng)用于試驗誤差的矯正達(dá)到對空間變異的控制[8]??臻g效應(yīng)模型相比于傳統(tǒng)的方差分析,僅需對試驗小區(qū)的地理位置編號,即可進(jìn)行數(shù)據(jù)分析,復(fù)雜的運(yùn)算可以通過相關(guān)的程序分析軟件進(jìn)行,操作簡單方便,在試驗地土壤肥力存在差異時其分析結(jié)果可靠性高[9]。目前,國內(nèi)很少有人將空間模型應(yīng)用在青貯玉米評比試驗分析中。

        本試驗基于統(tǒng)計分析SAS軟件,利用混合效應(yīng)模型(proc mixed)過程對青貯玉米品種評比試驗數(shù)據(jù)進(jìn)行空間模型分析和傳統(tǒng)方差分析[10],比較數(shù)據(jù)的擬合效果、效應(yīng)誤差估計、效應(yīng)估計和效應(yīng)顯著性差異,從而確定空間模型和傳統(tǒng)方差分析的差異,以及空間模型在田間數(shù)據(jù)分析中的準(zhǔn)確性及對田間空間差異的控制。綜上所述,本試驗的目的:在試驗設(shè)計條件為非標(biāo)準(zhǔn)隨機(jī)區(qū)組設(shè)計時,研究空間模型分析是否適用于青貯品系比較,為模型的合理應(yīng)用提供理論依據(jù)。

        1 材料和方法

        1.1 試驗材料

        四川農(nóng)業(yè)大學(xué)玉米研究所提供的22個待評比的青貯玉米品系,對照為雅玉青貯8號,品系及田間編號見表1。

        表1 親本組合或品系名稱對應(yīng)編號Table 1 Parent combination or Lines name corresponding number

        1.2 試驗設(shè)計

        于2018年3—8月在四川農(nóng)業(yè)大學(xué)崇州實(shí)驗基地進(jìn)行試驗。根據(jù)崇州試驗地和供試品系的數(shù)量,采取遵循重復(fù)、隨機(jī)區(qū)組排列、局部控制的原則下,進(jìn)行隨機(jī)區(qū)組設(shè)計劃分為8個區(qū)組,每個區(qū)組小區(qū)數(shù)量不一,共種植23個青貯玉米品系,設(shè)置兩次重復(fù)。于2018年3月23日播種,各品系分別種植15行,行距為0.75 m,每行12穴,每穴3粒種子,種植密度為62 900株/hm2,設(shè)保護(hù)行。根據(jù)所建立直角坐標(biāo)系設(shè)定坐標(biāo)原點(diǎn)為(0,0),計算出每個小區(qū)中心位置坐標(biāo)(X,Y),坐標(biāo)具體數(shù)值見附表2。

        1.2 測定指標(biāo)和方法

        生物產(chǎn)量的計算:全株含水量60%~70%時,即在籽粒乳線中期至蠟熟期之前(即籽粒1/4乳線和3/4乳線之間)收獲,記錄各小區(qū)總株數(shù)和總鮮重。平均單株鮮重為測量小區(qū)總鮮重除以測量小區(qū)總株數(shù)。

        1.3 數(shù)據(jù)分析

        采用方差分析模型[11-12]和空間效應(yīng)模型[13]分別分析。

        方差分析模型表示為:

        表2 試驗小區(qū)坐標(biāo)Table 2 Coordinates of test plot

        空間效應(yīng)模型表示為:

        模型(1)中,μ 為總體均值,gi為品種效應(yīng),blj為區(qū)組效應(yīng),eij為剩余誤差,模型(2)中與模型(1)各部分基本相同,剩余誤差的分布在 eij~N[o,C(h)],C(h)表示距離為h的兩小區(qū)之間剩余誤差間的方差-協(xié)方差。若以es和es+h分別表示二小區(qū)距離為h的小區(qū)剩余誤差,則 C(h)定義為[14]:

        其中σ02和σ2表示隨機(jī)性和結(jié)構(gòu)性誤差方差組分,兩者之和組成剩余誤差的方差;σ2[f(h)]表示剩余誤差的協(xié)方差,表明兩個剩余誤差之間的協(xié)方差是其所在小區(qū)間距離的函數(shù)。不同的空間變異表現(xiàn)在[f(h)]的形式(空間效應(yīng)模型)及其參數(shù)不同。田間試驗中常會遇到且在SAS軟件中可供選擇使用的[f(h)]形式,有指數(shù)模型(Exponential model)、球狀模型(Spherical model)、高斯模型(Gaussian Model)和線性模型(Linear Model)等。

        通過崇州試驗得到的數(shù)據(jù),以variety表示品系處理,以output表示不同品系的各項數(shù)據(jù),block表示區(qū)組變量,小區(qū)坐標(biāo)變量為X和Y,利用這些變量及其對應(yīng)的數(shù)據(jù)建立SAS數(shù)據(jù)集,空間效應(yīng)模型分析的SAS程序[14]為:

        Proc語句中method=REML定義方差—協(xié)方差參數(shù)估計方法為限制性極大似然法,Class語句指明試驗處理因素變量為variety(品種),語句Model中編碼ddfm=Satterthwaite指出自由度估計方法為Satterthwaite,Repeated語句中編碼subject=intercept表示不同觀測值間存在空間變異。type=sp(sph)表示空間有效應(yīng)模型為球狀模型。(X,Y)表示數(shù)據(jù)空間位置坐標(biāo)。type后括號內(nèi)的編碼為空間變異模型名稱的縮寫,可靈活改變??刹捎玫目臻g效應(yīng)模型還有指數(shù)模型(exp)、高斯模型(gau)和線性模型(1in)。常規(guī)方差分析的SAS程序可查詢相關(guān)文獻(xiàn)[13]。比較模型擬合效果時常用的擬合指標(biāo)有AIC(Akaike Information Criterion)、AICC(Corrected AIC)和 BIC(Bayesian Information Criterion)等。AIC、AICC和BIC的值越小,則表明相應(yīng)的模型對數(shù)據(jù)處理擬合效果越好。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 對供試青貯玉米品系平均單株鮮重產(chǎn)量的分析數(shù)據(jù)擬合效果

        由表3可知,不同供試品種的測量總株數(shù)、總鮮重和平均單株鮮重均存在很大的差異,平均單株鮮重為0.68~1.44 kg,川青8號平均單株鮮重可達(dá)1.44 kg,正大選系99/建系單株鮮重最小為0.66 kg。同一品種在不同小區(qū)間仍存在較大的差異。由表4可知,球狀模型的3個信息量指標(biāo)均小于方差分析模型中的信息量指標(biāo),表明試驗數(shù)據(jù)之間存在一定的空間變異,采取空間模型數(shù)據(jù)分析是十分有必要的。線性模型和指數(shù)模型參數(shù)未達(dá)到收斂,因而信息指標(biāo)不存在結(jié)果,這表明線性和指數(shù)模型不能描述本次試驗數(shù)據(jù)空間變異。根據(jù)信息量指標(biāo)越小模型擬合度越高的原則可知,空間效應(yīng)球狀模型對數(shù)據(jù)有更好的擬合效果。高斯模型的信息量指標(biāo)大于方差分析模型,說明前者的擬合效果劣于后者。綜上所述,下面用空間效應(yīng)球狀模型和方差分析模型進(jìn)行統(tǒng)計分析結(jié)果的比較。

        2.2 F檢驗和t檢驗

        由表5可知,F(xiàn)檢驗在方差分析中和空間效應(yīng)模型分析中均達(dá)到極顯著水平(P<0.05)。但概率值P=0.000 1在空間模型中小于方差分析的P=0.028 4,兩種方法的第二自由度也不同。結(jié)果說明在0.05顯著水平時玉米品系平均單株產(chǎn)量的差異在兩種方法中都能檢驗出來。雖然兩種分析方法對玉米各品系平均單株產(chǎn)量效應(yīng)差異F檢驗在0.05概率水平的結(jié)論相同,但其測驗效率并不相同,因為試驗處理效應(yīng)差異很大,即使兩模型分析法F測驗效率不同也都能將該差異在0.05的顯著水平鑒別出來??臻g效應(yīng)模型的F值(F=6.17)大于方差分析模型的F值(F=2.46),說明空間效應(yīng)模型分析的誤差均方更小,比方差分析更靈敏,更可能發(fā)現(xiàn)些較小的真實(shí)差異。將所有品系與對照品種進(jìn)行t檢驗,由表4可知,在品系間差異性檢驗方面,方差分析和空間效應(yīng)模型分析存在著明顯的差異。第一,方差分析模型標(biāo)準(zhǔn)誤均相同,這是對所有品系的平均單株產(chǎn)量總體方差相同的假定,即主觀假定區(qū)組內(nèi)所有小區(qū)土壤的肥力是均勻的,但實(shí)際情況往往是區(qū)組內(nèi)存在空間變異。第二,空間效應(yīng)模型分析中所有兩兩比較的標(biāo)準(zhǔn)誤均小于方差分析模型,說明空間效應(yīng)模型的分析效率比方差分析模型要高,空間分析法可在一定程度上控制由于空間變異存在對試驗分析結(jié)果的影響。第三,空間效應(yīng)模型中所有品系比較的標(biāo)準(zhǔn)誤各不相同,標(biāo)準(zhǔn)誤隨著所比較品種空間位置的不同而變化,反映了試驗地空間變異的特征。

        表3 不同供試品種收獲時總株數(shù)、總鮮重產(chǎn)量和平均單株鮮重Table 3 Total plant number,total fresh weight yield and average fresh weight per plant were harvested for different test varieties

        表4 不同模型擬合玉米品系比較試驗平均單株產(chǎn)量數(shù)據(jù)的信息量指標(biāo)值Table 4 Information index values of average yield data of single plant in the comparison test of maize fitted by different models

        表5 方差分析和空間效應(yīng)模型分析對玉米平均單株產(chǎn)量F檢驗的結(jié)果Table 5 Results of F test on average yield per plant of maize analyzed by variance analysis and spatial effect model

        2.3 平均單株產(chǎn)量的估計值及排序

        表6為方差分析和空間模型分析對20個品系平均單株產(chǎn)量的估計值及其大小排序結(jié)果。兩種分析方法在平均單株產(chǎn)量估計值和大小排序中都存在著明顯的差異。這些差異是由于兩種方法對試驗誤差控制效果不同所造成的。按照單株平均產(chǎn)量的高低對品系進(jìn)行篩選,從20個品系中選擇出20%的優(yōu)良品系,即選擇4個品系。用方差分析法所選出的4個品系為8,9,17,和18,而空間效應(yīng)模型選擇的4個品系為1,9,10和17??臻g效應(yīng)模型分析中平均單株產(chǎn)量高的4個品系中有2個品系(1,10)被方差分析所剔除。品系1和10在方差分析中位居第5位和第9位,而在空間效應(yīng)模型分析中位居第4位和第3位。這些差異說明,不同的分析方法會導(dǎo)致不同的品系評價。為了保障試驗分析的精確度和提高品種選擇的可靠性,應(yīng)選用適宜的方法進(jìn)行試驗數(shù)據(jù)分析。

        3 討論與結(jié)論

        3.1 討論

        本次試驗中采用了方差分析和空間效應(yīng)模型分析對青貯玉米平均單株產(chǎn)量進(jìn)行分析??臻g模型分析通過利用試驗小區(qū)的空間地理位置,結(jié)合空間變異模型,有效地控制了土壤肥力差異對試驗結(jié)果的影響,因此,在平均單株產(chǎn)量的分析中,空間模型分析具有更好的數(shù)據(jù)擬合效果和較高的分析效率,這與文獻(xiàn)中胡希遠(yuǎn)[13,15]研究結(jié)果是一致的。研究表明[13,16]隨著空間變異的增加,方差分析模型處理田間數(shù)據(jù)的誤差逐漸偏大,準(zhǔn)確性逐漸降低,相反空間模型始終保持誤差較低,準(zhǔn)確率較高。從本試驗看,分析單株產(chǎn)量宜采用空間效應(yīng)模型。不同的分析方法都存在一定的局限性,沒有任一種方法對于所有指標(biāo)的分析效果都是最好的,這也印證了W.W.Stroup[4]的研究。

        表6 方差分析和空間效應(yīng)模型分析對玉米品系平均單株產(chǎn)量估計值和大小排序Table 6 Estimation and ranking of average yield per plant of maize by variance analysis and spatial effect model analysis

        采用空間效應(yīng)模型分析,不用測定田間土壤的理化性質(zhì),以保證區(qū)組內(nèi)試驗條件相同或盡量相同,這樣可以簡化試驗設(shè)計,但并不能說不需要區(qū)組試驗設(shè)計,在無區(qū)組試驗設(shè)計中空間模型分析效率會降低,因為空間模型在一定程度上會降低空間變異對效應(yīng)值的影響,而不能完全消除,所以區(qū)組實(shí)際還是有必要的。具體過程利用SAS統(tǒng)計軟件完成,不需進(jìn)行復(fù)雜的計算。對本試驗所遇到的非標(biāo)準(zhǔn)隨機(jī)區(qū)組設(shè)計,空間效應(yīng)模型分析同樣具有適用性,所以在作物品種評比試驗中,如馬鈴薯、小麥、油菜品種比較試驗中涉及此類非標(biāo)準(zhǔn)區(qū)組設(shè)計時,建議采用空間效應(yīng)模型分析,以提高分析結(jié)果的準(zhǔn)確性。

        3.2 結(jié)論

        ①空間效應(yīng)模型分析與方差分析相比,空間效應(yīng)模型分析對試驗數(shù)據(jù)的擬合效果更好。

        ②所有品系與對照品種的兩兩比較t檢驗結(jié)果表明,空間效應(yīng)模型分析的分析效率更高,對空間變異的控制能力更強(qiáng)。

        ③由于對空間變異的控制能力不同,空間效應(yīng)模型分析與方差分析在F檢驗、t檢驗,品系效應(yīng)估計值和大小排序結(jié)果方面都存在顯著不同。

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