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        miR-149和miR-196a2在亞洲人群中與腦卒中發(fā)病關(guān)系的Meta分析

        2020-05-21 17:04:54楊錫彤徐弘揚王光明
        大理大學(xué)學(xué)報 2020年4期
        關(guān)鍵詞:葉酸多態(tài)性檢索

        楊錫彤,徐弘揚,馬 蓉,王光明*

        (1.大理大學(xué)第一附屬醫(yī)院基因檢測中心,云南大理 671000;2.大理大學(xué)臨床醫(yī)學(xué)院,云南大理 671000)

        腦卒中(stroke)是一種突發(fā)性的腦血液循環(huán)障礙性疾病,具有發(fā)病率高、致殘率高、死亡率高以及復(fù)發(fā)率高等特點,全球每年大約有1 500萬腦卒中的病人,其中死亡率高達(dá)20%,致殘率達(dá)50%〔1-2〕。腦卒中嚴(yán)重影響人們的生存質(zhì)量與生活水平,因腦卒中引發(fā)的一系列并發(fā)癥不僅給患者帶來痛苦,同時也增加了家庭和社會的負(fù)擔(dān)。腦卒中引起的死亡人數(shù)在我國死亡人數(shù)中占第二位,同時腦卒中也是導(dǎo)致多數(shù)成年人殘疾、生活不能自理的原因之一。腦卒中是一種復(fù)雜的多因素引起的神經(jīng)系統(tǒng)疾病,其中包括不可改變的因素(遺傳因素)以及可改變的因素(環(huán)境因素),但是這些因素都不能解釋腦卒中的發(fā)病機制。而流行病學(xué)的研究認(rèn)為腦卒中的發(fā)生與遺傳因素有較大的關(guān)系〔3〕。

        微小RNA(miRNAs)是一類內(nèi)源性非編碼小分子RNAs,在真核細(xì)胞中主要是由19~25個核苷酸組成,通過結(jié)合到目的基因信使RNA(mRNA)3’非編碼端,在轉(zhuǎn)錄后調(diào)節(jié)基因的表達(dá),從而miRNAs參與了一系列重要的生命進程,包括細(xì)胞增殖、細(xì)胞發(fā)育、細(xì)胞分化、細(xì)胞凋亡和新陳代謝等〔4-5〕。單核苷酸多態(tài)性(SNP)是常見的遺傳變異之一,SNP存在于前體mir-RNA(pre-miRNAs)能影響成熟miRNAs的表達(dá),通過目的基因改變多種生物功能。當(dāng)前的研究表明SNP的位點存在于4種前體mir-RNAs,包括miR-146a C>G(rs2910164),miR-149 T>C(rs2292832),miR-196a2 T>C(rs11614913)和miR-499 A>G(rs3746444),并且能與多種影響人類健康的疾病密切相關(guān),例如腫瘤、高血壓、心血管疾病和糖尿病〔6-7〕。近來的研究發(fā)現(xiàn)miR-149 T>C,miR-196a2 T>C等位基因可能是遺傳的易感因素〔8-9〕。4種microRNAs會引起血管損傷反應(yīng),在循環(huán)系統(tǒng)中與血栓形成或炎癥通路有關(guān)聯(lián)〔10〕。miR-149 T>C,miR-196a2 T>C基因多態(tài)性與腦卒中有相關(guān)性,但不同人群、不同地區(qū)存在差異性和不確定性,因此本研究擬通過對已發(fā)表的miR-149 T>C和miR-196a2 T>C基因多態(tài)性與腦卒中的相關(guān)性研究進行Meta分析,以得出較為客觀的結(jié)論。

        1 資料與方法

        1.1資料來源與檢索策略電子檢索PubMed、Web of Science、CBM及中國知網(wǎng)、萬方、維普數(shù)據(jù)庫,檢索時間從建庫到2018年11月,獲取有關(guān)microRNAs基因多態(tài)性和腦卒中的文章。為提高文獻(xiàn)的查全率和漏查率,分析過程中將進一步對入選研究的參考文獻(xiàn)進行擴大檢索,輔以文獻(xiàn)追溯法查找相關(guān)文獻(xiàn),以提高Meta分析對文獻(xiàn)查全率的要求。英文檢索詞包括microRNAs、miR-149、miR-196a2、polymorphism、SNP、stroke、ischemic、IS、cerebrovascular disease、brain hemorrhage、intracranial hemorrhage、cerebral hemorrhage、cerebral infarction,中文檢索詞包括miR-149、miR-196a2、微小RNA、基因多態(tài)性、腦卒中、腦缺血、腦血管疾病、腦出血、腦梗死、腦梗塞。以PubMed為例,具體檢索策略如下:

        #1 miR-149 ORmiR-196a2

        #2 polymorphism ORSNP

        #3 stroke OR ischemic ORcerebrovascular

        disease ORbrain hemorrhage ORintracranial

        hemorrhage ORcerebral hemorrhage ORcerebral

        infarction

        #4 case-control ORcase control

        #5#1 AND#2 AND#3 AND#4

        1.2文獻(xiàn)納入與排除標(biāo)準(zhǔn)

        1.2.1 納入標(biāo)準(zhǔn) ①研究對象:評估m(xù)iR-149、miR-196a2基因多態(tài)性和腦卒中發(fā)病的相關(guān)性;②研究設(shè)計:文章為病例對照研究;③干預(yù)措施:病例組為腦卒中患者,對照組為健康人群;④足夠充分的數(shù)據(jù)可用于計算OR值;⑤對照組基因型分布符合HWE(Hardy-Weinberg Equilibrium)遺傳平衡定律。

        1.2.2 排除標(biāo)準(zhǔn) ①重復(fù)研究、發(fā)表的文獻(xiàn);②對照組不符合HWE遺傳平衡;③數(shù)據(jù)描述不清或樣本資料交代不清,統(tǒng)計方法不恰當(dāng);④腦卒中診斷不明確或沒有根據(jù)國際公認(rèn)的標(biāo)準(zhǔn);⑤綜述文獻(xiàn);⑥非中、英文文獻(xiàn)。

        1.3質(zhì)量評估對納入文獻(xiàn)的質(zhì)量評價采用Newcastle-Ottawa Scale(NOS)評價,通過入選人群、組間可比性、暴露因素測量3個方面共8個條目對文獻(xiàn)質(zhì)量進行評價,滿分為9分,6分及以上認(rèn)為是高質(zhì)量文獻(xiàn)〔11-12〕,①病例確定是否恰當(dāng)(1分);②病例的代表性(1分);③對照組的選擇(1分);④對照組的確定(1分);⑤實驗設(shè)計和數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析時考慮病例組和對照組的可比性(2分);⑥暴露因素的確定(1分);⑦病例組和對照組暴露因素的確定方法相同(1分);⑧無應(yīng)答率(1分)。

        1.4數(shù)據(jù)提取參考Cochrane協(xié)作網(wǎng)推薦的方法編制資料提取表,由兩名研究者獨立篩選文獻(xiàn)、提取資料并進行交叉核對,如有不一致觀點通過討論進行解決。提取資料的主要內(nèi)容為:①文獻(xiàn)的基本特征(包括文題、年份、研究者姓名等);②所納入文獻(xiàn)研究對象的基本特征、干預(yù)措施和結(jié)局指標(biāo)。研究特征:研究地區(qū)和人群特征、研究組和對照組的例數(shù)和年齡特征;數(shù)據(jù)提?。貉芯拷M和對照組的各基因型的分布情況。

        1.5統(tǒng)計分析采用Stata12.0進行Meta分析,本Meta分析對于計數(shù)資料的效應(yīng)指標(biāo)選取比值比(odds ratio,OR)及其95%可信區(qū)間(confidence interval,CI)表示。異質(zhì)性檢驗的檢驗方法采用Q檢驗和I2統(tǒng)計量,如果異質(zhì)性檢驗結(jié)果P≥0.05、I2<50%,表示各研究間沒有異質(zhì)性,選用固定效應(yīng)模型,計算合并比值并繪制森林圖;如果異質(zhì)性檢驗結(jié)果P<0.05、I2>50%,表示研究間存在異質(zhì)性,選用隨機效應(yīng)模型。計算合并的OR和95%CI,P<0.05為差異有統(tǒng)計學(xué)意義。

        2 結(jié)果

        2.1納入的文獻(xiàn)基本特征初步檢索出文獻(xiàn)65篇,其中PubMed 13篇,Web of Science 8篇,CBM 11篇,中國知網(wǎng)29篇,萬方3篇,維普1篇。按照文獻(xiàn)納入排除標(biāo)準(zhǔn)進行篩選,最終剩余8篇文獻(xiàn)。見圖1。文獻(xiàn)對照組都符合HWE檢驗,共計6 472例研究對象,其中病例3 332例,對照3 140例,納入研究的基本特征及對照組的HWE檢測見表1~2。

        圖1 文獻(xiàn)篩選流程圖

        2.2 Meta分析的結(jié)果

        2.2.1 miR-149 rs2292832 對5種遺傳學(xué)模型(C vs.T,CC vs.TT,CT vs.TT,CC+CT vs.TT,CC vs.CT+TT)進行Meta分析,結(jié)果表明攜帶C或CC基因的人群與腦卒中的發(fā)生風(fēng)險差異有統(tǒng)計學(xué)意義,miR-149 rs2292832基因多態(tài)性與腦卒中有相關(guān)性,人群中攜帶C或CC基因明顯增加了腦卒中的發(fā)生風(fēng)險。結(jié)果見表3,森林圖見圖2。

        2.2.2 miR-196a2 rs11614913 對5種遺傳學(xué)模型(C vs.T,CC vs.TT,CT vs.TT,CC+CT vs.TT,CC vs.CT+TT)進行Meta分析,結(jié)果表明攜帶C或CC基因的人群與腦卒中的發(fā)生風(fēng)險差異無統(tǒng)計學(xué)意義,miR-196a2 rs11614913多態(tài)性與腦卒中的發(fā)生無相關(guān)性。結(jié)果見表4,森林圖見圖3。

        表1 納入研究miR-149 rs2292832和miR-196a2 rs11614913的基本特征

        表2 Meta分析中miR-149 rs2292832和miR-196a2 rs11614913的基因型分布

        表3 miR-149 rs2292832遺傳學(xué)模型森林圖結(jié)果

        圖2 miR-149 rs2292832基因多態(tài)性與腦卒中發(fā)生風(fēng)險森林圖

        表4 miR-196a2 rs11614913遺傳學(xué)模型森林圖結(jié)果

        圖3 miR-196a2 rs11614913基因多態(tài)性與腦卒中發(fā)生風(fēng)險森林圖

        2.3發(fā)表偏倚和敏感性分析分別對納入文獻(xiàn)進行Meta分析繪制漏斗圖,見圖4~5,漏斗圖基本對稱可能會存在發(fā)表偏倚,但發(fā)表偏倚較小不影響最終結(jié)果。對納入文獻(xiàn)逐一剔除進行敏感性分析,并與排除前的合并效應(yīng)量進行分析比較,發(fā)現(xiàn)效應(yīng)量無明顯改變,表明此次研究結(jié)果穩(wěn)定可靠。

        圖4 miR-149 rs2292832 5種遺傳學(xué)模型漏斗圖

        圖5 miR-196a2 rs11614913 5種遺傳學(xué)模型漏斗圖

        3 討論

        近年導(dǎo)致腦卒中的疾病呈現(xiàn)多樣性,其中高血壓、糖尿病是熟知的引起腦卒中的最常見疾病。在探討腦卒中的發(fā)病機制的臨床研究中,遺傳因素與腦卒中的關(guān)聯(lián)性研究是目前的研究熱點。動脈粥樣硬化、血脂異常、高血壓以及高同型半胱氨酸血癥等為腦卒中的傳統(tǒng)危險因素。近年流行病學(xué)的研究表明遺傳因素中的基因突變增加腦卒中發(fā)生風(fēng)險性的比例逐漸加重〔21〕。近年的研究發(fā)現(xiàn)miRNAs作為小分子RNAs,參與了腫瘤、免疫的功能系統(tǒng)、細(xì)胞增殖、心血管疾病和神經(jīng)系統(tǒng)等多種疾病的病理和生理進程,此外miRNAs還能夠調(diào)節(jié)30%的人類基因表達(dá)〔22〕。近年來有關(guān)miR-149和miR-196a2基因多態(tài)性與腦卒中易感性的研究結(jié)果不一致,并且同一種族不同人群、不同地區(qū)存在不確定性。為此,本研究就miR-149和miR-196a2基因多態(tài)性與亞洲人群腦卒中易感性進行Meta分析,旨在揭示兩種miRNAs基因多態(tài)性與腦卒中易感性之間的相關(guān)性,為遺傳學(xué)上對腦卒中危險因素的分子診治具有重要意義。

        當(dāng)前對miRNAs與腦卒中相關(guān)性的研究較多,但研究結(jié)果不盡相同。本研究通過Meta分析表明miR-149、miR-196a2中僅有miR-149 rs2292832基因多態(tài)性與腦卒中的發(fā)生有相關(guān)性,人群中攜帶C和CC基因型患腦卒中的風(fēng)險性明顯增加,而miR-196a2 rs11614913基因多態(tài)性與腦卒中的發(fā)生無相關(guān)性。Xiao等〔23〕的Meta分析中,只納入了兩個研究結(jié)果,該研究表明miR-149 rs2292832基因多態(tài)性能降低腦卒中發(fā)生風(fēng)險。由于不同的研究者納入研究的樣本量的不同而影響了結(jié)果的一致性。本研究共納入了8個研究,通過增加樣本量得到了與Xiao等〔23〕的研究不一致的結(jié)論,miR-149 rs2292832基因多態(tài)性能增加腦卒中的發(fā)生風(fēng)險。本研究比Xiao等〔23〕的研究結(jié)果可信度更高。Xiao等〔23〕的納入研究樣本量過少可能是導(dǎo)致與本研究結(jié)果不一致的主要原因。miR-149和miR-196a2的等位基因與腫瘤壞死因子α(TNF-α)、亞甲基四氫葉酸、C反應(yīng)蛋白(CRP)有密切聯(lián)系,并且miR-149能與亞甲基四氫葉酸轉(zhuǎn)移酶基因的mRNA-3’UTR結(jié)合從而調(diào)控此基因的表達(dá)〔24〕。而亞甲基四氫葉酸轉(zhuǎn)移酶在編碼甲硫酸-葉酸代謝中起到重要作用,其在人體內(nèi)具有活性的5-甲基四氫葉酸(5-MTHFR)的 形 成 過 程 中 起 到 促 進 作 用〔25〕。miR-149 rs2292832位點位于miR-149前體序列非成熟結(jié)合區(qū)內(nèi),miR-149-5p的表達(dá)受rs2292832位點的影響,其中攜帶CC人群體內(nèi)miR-149-5p的表達(dá)量明顯高于攜帶CT和TT人群的表達(dá)量〔26〕。攜帶有miR-149 rs2292832位點基因型CC者體內(nèi)葉酸水平明顯低于基因型TT攜帶者〔22〕。有研究表明人體內(nèi)低表達(dá)亞甲基四氫葉酸轉(zhuǎn)移酶可明顯增加腦卒中的發(fā)病風(fēng)險,并且腦卒中患者體內(nèi)的葉酸水平與健康人群相比明顯降低,而體內(nèi)葉酸水平較低者通過補充葉酸后腦卒中的發(fā)生風(fēng)險明顯降低〔8,10〕。因此可認(rèn)為miR-149 rs2292832位點C等位基因和CC基因型通過影響成熟miR-149,調(diào)控miR-149與亞甲基四氫葉酸轉(zhuǎn)移酶基因結(jié)合,降低亞甲基四氫葉酸轉(zhuǎn)移酶基因表達(dá),抑制甲硫酸-葉酸代謝,降低體內(nèi)5-MTHFR的生成,從而促進腦卒中的發(fā)生。體內(nèi)低5-MTHFR表達(dá)可增加血漿同型半胱氨酸(Hcy)水平,而高Hcy血癥是誘發(fā)心腦血管疾病的中度危險因素,它可以造成血管內(nèi)皮損傷和功能異常,刺激血管平滑肌細(xì)胞增生,破壞機體凝血和纖溶系統(tǒng),影響脂質(zhì)代謝等,使機體處于血栓前狀態(tài),從而增加了心腦血管疾病發(fā)病的危險性〔27〕,通過降低5-MTHFR的生成從而導(dǎo)致血漿Hcy水平增高,促進腦卒中的發(fā)生。

        本研究納入文獻(xiàn)僅限于中英文符合要求的文獻(xiàn),研究人群均為亞洲人群,具有較好的地區(qū)代表性。該研究對揭示亞洲人群miR-149 rs2292832和miR-196a2 rs11614913基因多態(tài)性與腦卒中易感性之間的相關(guān)性較為合理、可靠。本研究存在不足是樣本量較為局限,今后希望能通過大樣本、多中心、同質(zhì)性的病例對照研究,對不同地區(qū)的人群進行研究,進一步闡明基因多態(tài)性與腦卒中的關(guān)聯(lián)性。

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