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        基于投影尋蹤分類法的甘蔗種質(zhì)綜合評價

        2020-05-18 08:16:08武晉宇應(yīng)雄美朱建榮趙俊劉家勇吳才文IbrahimSolimanHelalELGAMAL趙勇
        關(guān)鍵詞:評價

        武晉宇,應(yīng)雄美,朱建榮,趙俊,劉家勇,吳才文,Ibrahim Soliman Helal ELGAMAL,趙勇

        (1.云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院甘蔗研究所,云南 開遠(yuǎn) 661699;2.云南省甘蔗遺傳改良重點實驗室 云南 開遠(yuǎn) 661699)

        目前,世界上甘蔗雜交育種罕有突破,甘蔗蔗糖分和產(chǎn)量改良效果不顯著[1–3],主要是因為種質(zhì)資源受限,親本遺傳基礎(chǔ)狹窄,育種群體遺傳變異不足[4–5]。經(jīng)過數(shù)代品種改良后,中國仍處于新臺糖22當(dāng)家的局面,蔗糖分提升不顯著,嚴(yán)重制約了蔗糖產(chǎn)業(yè)的發(fā)展。為改變這一狀況,云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院甘蔗研究所加強了對美國[6]、澳大利亞[7]、泰國[8]、法國[9]、菲律賓[9]等國外種質(zhì)資源的引進(jìn)與利用,以拓寬親本遺傳基礎(chǔ)。目前的研究主要集中在抗逆性評價[10–11]、宿根性評價[12–13]、遺傳多樣性評價[14–15]及工農(nóng)藝性狀評價分析[16–17]等方面。

        常見評價甘蔗種質(zhì)的方法主要有主成分分析法[18–19]、模糊綜合評判分析法[20–21]、灰色關(guān)聯(lián)度分析法[22–23]和投影尋蹤分類(projection pursuit clustering, PPC)法[24]。本試驗主要參考趙勇等[7]的研究,利用投影尋蹤分類法對從法國和菲律賓引進(jìn)的甘蔗種質(zhì)資源進(jìn)行工農(nóng)藝性狀評價,挖掘優(yōu)異種質(zhì),以期為中國甘蔗種質(zhì)創(chuàng)新提供參考,同時也為甘蔗種質(zhì)資源評價探索新的方法。

        1 材料與方法

        1.1 材料

        供試甘蔗種質(zhì)資源共 40份,其中菲律賓種質(zhì)22份(PHIL型6份、VMC–型16份),法國種質(zhì)18份(FR–型)。

        1.2 試驗設(shè)計

        試驗在云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院甘蔗研究所育種基地進(jìn)行?;睾0胃叨? 051.8 m,屬亞熱帶高原季風(fēng)氣候,光照資源充足,年日照時數(shù)2 382 h,年均氣溫20 ℃,年均降水量771.1 mm。2016年12月29日進(jìn)行田間試驗(新植)。隨機區(qū)組設(shè)計。3次重復(fù)。2行區(qū),行長4.0 m,行距1.1 m。每行下種芽14個,四周設(shè)保護(hù)行。試驗地為水田。試驗地管理同大田生產(chǎn)。

        1.3 工農(nóng)藝性狀指標(biāo)調(diào)查

        農(nóng)藝性狀調(diào)查:2017年11月中旬,對40份種質(zhì)開展農(nóng)藝性狀指標(biāo)調(diào)查。采用標(biāo)尺測量株高,采用游標(biāo)卡尺測量莖徑,每個種質(zhì)測量5株。根據(jù)每米實際成莖數(shù)統(tǒng)計有效莖。各個種質(zhì)隨機檢測6條蔗莖,測量單莖質(zhì)量,每個重復(fù)2條。

        品質(zhì)性狀檢測:2017年11月至2018年3月,參考LIU等[25]的方法檢測40份種質(zhì)的甘蔗錘度、甘蔗蔗糖分、蔗汁蔗糖分、甘蔗簡純度和甘蔗纖維分。每個種質(zhì)每次隨機檢測6條蔗莖,每個重復(fù)2條。每月每個重復(fù)檢測1次,共檢測5個月。

        1.4 數(shù)據(jù)分析

        運用Excel 2013對數(shù)據(jù)進(jìn)行整理,其中,工藝性狀指標(biāo)因數(shù)據(jù)全部為百分?jǐn)?shù),采用ASIN函數(shù)對數(shù)據(jù)進(jìn)行反正弦轉(zhuǎn)化后再進(jìn)行統(tǒng)計分析;采用DPS統(tǒng)計分析軟件對各種質(zhì)工農(nóng)藝性狀指標(biāo)進(jìn)行方差分析和基本參數(shù)估計;運用投影尋蹤分類法[7]對40份種質(zhì)資源進(jìn)行投影方向和投影值大小分析;基于投影值的聚類分析對各種質(zhì)進(jìn)行分類評價,以篩選優(yōu)異種質(zhì)。

        2 結(jié)果與分析

        2.1 各種質(zhì)主要工農(nóng)藝性狀差異分析

        對40份種質(zhì)9個主要工農(nóng)藝性狀指標(biāo)進(jìn)行方差分析。結(jié)果(表1)表明,除株高和有效莖外,其他性狀指標(biāo)均存在極顯著差異(P<0.01),變異系數(shù)介于 5.68%~51.55%,說明各種質(zhì)間差異較大,故需要進(jìn)一步對各種質(zhì)進(jìn)行評價和篩選。

        表1 40份甘蔗種質(zhì)的主要工農(nóng)藝性狀Table 1 The main agronomic characters of 40 sugarcane germplasms

        2.2 投影尋蹤分類法評價分析

        2.2.1 投影方向分析

        利用DPS統(tǒng)計分析軟件對40份供試種質(zhì)的主要工農(nóng)藝性狀(均值)進(jìn)行投影尋蹤分類法分析,得到各性狀的投影方向(圖1)?;赑PC法原理,各指標(biāo)投影方向的大小實際上反映了該指標(biāo)對種質(zhì)綜合評價的影響程度。從圖1可見,甘蔗蔗糖分、錘度、蔗汁蔗糖分和簡純度等工藝性狀指標(biāo)投影方向較高,對種質(zhì)綜合評價的影響較大;其后依次為單莖質(zhì)量、莖徑、纖維分;株高和有效莖投影方向較低。

        圖1 甘蔗主要工農(nóng)藝性狀的投影方向Fig.1 Projection direction of main agronomic characters of sugarcane

        2.2.2 投影值計算

        確定投影方向后,基于主要工農(nóng)藝性狀的投影尋蹤分析,得到各甘蔗種質(zhì)資源的投影值(圖2)。投影值越大,種質(zhì)綜合性狀表現(xiàn)越好。從圖2可以看出,40份甘蔗種質(zhì)投影值介于 0.0~2.5,各種質(zhì)投影值大小差異顯著。

        圖2 40份甘蔗種質(zhì)的投影值Fig.2 The projection values on 40 sugarcane germplasm

        2.2.3 基于聚類分析對40份種質(zhì)進(jìn)行分類

        基于供試種質(zhì)投影值的大小,采用歐氏距離–可變類平法對40份種質(zhì)進(jìn)行聚類分析。結(jié)果(圖3)表明,在1.15~2.31的距離上可把40份種質(zhì)分為5類,第Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ類群分別有種質(zhì)7、8、13、5、7份。

        圖3 基于投影值的40份甘蔗種質(zhì)聚類分析結(jié)果Fig.3 The cluster analysis result of 40 sugarcane germplasm based on projection value

        進(jìn)一步對各類群投影值進(jìn)行分析,結(jié)果(表2)表明,第Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ、Ⅴ類群投影均值分別為1.56、1.26、1.75、2.00、0.60,且類群間存在極顯著差異(P<0.01)。其中第Ⅳ類群投影均值最高,最大為2.13,最小為1.93。5個類群投影值變異系數(shù)為1.66%~37.55%。

        表2 類群投影值均值及變異系數(shù)Table 2 The projection mean value and variation coefficient of various groups

        2.3 優(yōu)良種質(zhì)的篩選

        根據(jù)投影尋蹤原理,投影值越大,其綜合性狀越好。從供試種質(zhì)的綜合投影值的聚類結(jié)果來看,第Ⅳ類群(5份種質(zhì))投影均值最高。從表3可以看出,5份種質(zhì)的甘蔗蔗糖分介于14.90%~16.43%;簡純度介于86.00%~88.50%;莖徑介于2.42~ 2.77;有效莖介于4.88~9.00。

        表3 第Ⅳ類群種質(zhì)的工農(nóng)藝性狀Table 3 The main agronomic characters of fine germplasms

        3 結(jié)論與討論

        近年來,云南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院甘蔗研究所加強了對國外甘蔗種質(zhì)的引進(jìn)與評價利用。趙勇等[19]采用農(nóng)藝性狀分級的方法,評價了317份甘蔗種質(zhì)資源,其中包含了從多個國家引進(jìn)的甘蔗種質(zhì)。就外引種質(zhì)的栽培利用現(xiàn)狀來看,引進(jìn)種質(zhì)的性狀、品質(zhì)差異顯著,大多數(shù)種質(zhì)因其表現(xiàn)差未被利用于甘蔗雜交。本研究中,40份從法國和菲律賓引進(jìn)的種質(zhì),各種質(zhì)綜合性狀差異顯著,9個性狀的均值的變異系數(shù)介于5.68%~51.55%,除株高和有效莖外,其他 7個主要工農(nóng)藝性狀的均值均存在極顯著差異(P<0.01)。蘇火生等[26]對引進(jìn)的18個國外甘蔗種質(zhì)進(jìn)行品比,發(fā)現(xiàn)各品質(zhì)資源的表現(xiàn)也各異。另外,劉家勇等[27]對 68份引進(jìn)甘蔗種質(zhì)的遺傳多樣性進(jìn)行AFPL分析,發(fā)現(xiàn)大部分種質(zhì)之間親緣關(guān)系相近,遺傳基礎(chǔ)相似,遺傳多樣性并不豐富;因此,加強外國種質(zhì)引進(jìn),客觀評價外引種質(zhì),篩選優(yōu)異種質(zhì)并提供雜交利用,對甘蔗育種具有重要意義。

        對 40份外引甘蔗種質(zhì)進(jìn)行投影尋蹤分類法分析表明,投影方向以甘蔗蔗糖分最高,其后依次為甘蔗錘度、蔗汁蔗糖分、甘蔗簡純度、單莖質(zhì)量和莖徑等,株高和有效莖的較低。甘蔗蔗糖分是甘蔗品種改良最主要的參考指標(biāo);因此,確定甘蔗蔗糖分等工藝性狀為最優(yōu)投影方向是合理的。另外,株高和有效莖的投影方向較低,說明了投影尋蹤分類法可較好地體現(xiàn)各性狀指標(biāo)的權(quán)重分配。本試驗中,基于投影尋蹤分類法得到了各種質(zhì)的投影值,通過聚類分析篩選了 5份優(yōu)良種質(zhì)(第Ⅳ類群),其中,法國種質(zhì)2份(FR97–127和FR97–53),菲律賓種質(zhì) 3 份(VMC95–29、VMC96–169 和 VMC97–30);且5份種質(zhì)平均甘蔗蔗糖分介于14.90%~16.43%,甘蔗蔗糖分較高,可以作為高糖種質(zhì)進(jìn)行雜交育種利用。

        綜合來看,投影尋蹤分類法對 40份引進(jìn)甘蔗種質(zhì)的評價客觀、實用,可以作為大量甘蔗種質(zhì)資源評價的另一途徑。

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