熊 勇,趙春艷,朱 娜,李 清,巖溫罕,楊天為
(1.云南民族大學(xué) 民族醫(yī)藥學(xué)院,云南 昆明 650500; 2.中央民族大學(xué) 生命與環(huán)境科學(xué)學(xué)院,北京 100081;3.中華全國供銷合作總社 昆明食用菌研究所,云南 昆明 650221)
腸產(chǎn)毒性大腸埃希菌(Enterotoxigenicescheri-chiacoli,ETEC)是大腸埃希氏菌(Escherichiacoli,簡稱大腸桿菌)的一類,主要寄居于人和動(dòng)物的腸道內(nèi),同時(shí)容易感染兒童、旅游者及家畜等[1].研究表明ETEC的致病性來源于毒力因子是粘附素(菌毛為常見的粘附素)和腸毒素,ETEC通過菌毛介導(dǎo)并寄居于腸道粘膜上,ETEC菌毛致病具有特異性,如ETEC中K99表達(dá)對(duì)豬、牛、羊致病,K88表達(dá)可引起仔豬腹瀉性致病,含菌毛CFA的ETEC菌株可使人致病[2].由ETEC導(dǎo)致的仔豬斷奶后腹瀉是危害仔豬健康生長的重要原因之一,給現(xiàn)代規(guī)模化養(yǎng)豬產(chǎn)業(yè)帶來了重大經(jīng)濟(jì)損失[3].此外,ETEC是各國“旅行者腹瀉”的主要病原菌,也是“成人霍亂綜合征”與“小兒腹瀉”等重要病原菌[3-6].在1998—2017年間,國內(nèi)外對(duì)ETEC相關(guān)研究主要為ETEC菌種[7]和ETEC致人類及動(dòng)物分泌性腹瀉方面[8],諸如仔豬斷奶后腹瀉、小兒腹瀉、旅行者腹瀉等疾病的研究與ETEC產(chǎn)生腸毒素的研究為主要研究熱點(diǎn)[9].通過發(fā)文量與發(fā)表文獻(xiàn)在當(dāng)前數(shù)據(jù)集中的被引用數(shù)量之和作為評(píng)價(jià)指標(biāo)[10],對(duì)研究領(lǐng)域內(nèi)的不同的時(shí)間、國家/地區(qū)、期刊、研究機(jī)構(gòu)、作者等開展文獻(xiàn)計(jì)量分析,以便對(duì)該領(lǐng)域科研水平進(jìn)行評(píng)估.發(fā)文量可快速定位“ETEC”研究領(lǐng)域內(nèi)的高產(chǎn)作者、期刊、機(jī)構(gòu)等,而發(fā)表文獻(xiàn)在當(dāng)前數(shù)據(jù)集中的被引用數(shù)量之和是學(xué)術(shù)影響力重要指標(biāo),可測量某個(gè)時(shí)間,國家/地區(qū),研究機(jī)構(gòu),期刊,作者的學(xué)術(shù)影響力,可快速定位“ETEC”研究領(lǐng)域內(nèi)的核心作者,重要機(jī)構(gòu)與重要期刊等信息[11].文獻(xiàn)評(píng)價(jià)指標(biāo)分別采用HistCite與CiteSpace軟件分析[12-13],通過ETEC研究領(lǐng)域內(nèi)文獻(xiàn)可視化分析,可系統(tǒng)分析ETEC研究領(lǐng)域的整體情況,把握ETEC熱點(diǎn)趨勢,促進(jìn)我國ETEC在人與動(dòng)物致病預(yù)防等科研工作發(fā)展.
數(shù)據(jù)全部來自Webof Science核心合集數(shù)據(jù)庫,以“ETEC”(產(chǎn)腸毒素大腸桿菌)作為檢索詞,檢索范圍是主題,檢索年限為1998—2017年,共檢索出 1 696篇文獻(xiàn).
本研究主要采用引文可視化軟件HistCite與應(yīng)用知識(shí)圖譜工具CiteSpace為分析工具對(duì)1998—2017年間以“ETEC”為文獻(xiàn)主題的 1 696篇文章進(jìn)行分析.
HistCite與CiteSpace是兩款可用于計(jì)量和分析科學(xué)文獻(xiàn)數(shù)據(jù)的信息統(tǒng)計(jì)與信息可視化軟件,可通過數(shù)據(jù)分析得到可視化圖譜,從而分析研究領(lǐng)域內(nèi)發(fā)展脈絡(luò)及趨勢,并獲得該領(lǐng)域信息全景,識(shí)別出某一研究領(lǐng)域內(nèi)重要文獻(xiàn)、作者、研究機(jī)構(gòu)及期刊等.
在1998—2017年間與ETEC相關(guān)論文發(fā)表時(shí)間可在一定程度上反映出這時(shí)段內(nèi)該領(lǐng)域發(fā)展速度、狀況以及熱點(diǎn)時(shí)期,此20年內(nèi)文獻(xiàn)發(fā)表時(shí)間分布表見圖1,發(fā)表文獻(xiàn)在當(dāng)前數(shù)據(jù)集的被引用量之和分布表見圖2[14].
國家/地區(qū)ETEC相關(guān)文獻(xiàn)發(fā)表數(shù)量與被引用量可以反映出該國家或地區(qū)在ETEC研究領(lǐng)域內(nèi)影響力與科研能力,在對(duì) 1 696篇文獻(xiàn)統(tǒng)計(jì)分析表明全球ETEC研究存在著很大的地區(qū)不平衡,文獻(xiàn)作者來自98個(gè)不同國家與地區(qū),其中ETEC相關(guān)文獻(xiàn)發(fā)文量以及在當(dāng)前數(shù)據(jù)集中的被引量排名前十的國家見表1,表2.表1數(shù)據(jù)表明 98個(gè)不同的國家與地區(qū)中,以美國ETEC相關(guān)文獻(xiàn)發(fā)文量最多,共495篇,占數(shù)據(jù)集的29.2%,其次中國共179篇相關(guān)文獻(xiàn),占總發(fā)文量10.6%,美國發(fā)文量為中國的2.75倍,由此表明美國在ETEC研究領(lǐng)域內(nèi)研究水平最高,中國其次.從表2數(shù)據(jù)中,可得出各國家/地區(qū)文獻(xiàn)被引頻次之和,美國仍居第一,總被引量高達(dá) 3 980次,篇平均被引量為8篇,與之比較,中國發(fā)文量雖為世界第2,但在文獻(xiàn)總被引量僅299篇,篇平均被引量僅為1.67篇,遠(yuǎn)低于瑞典、加拿大、比利時(shí)、孟加拉、埃及、挪威等國家,由此可以看出中國ETEC相關(guān)文獻(xiàn)整體質(zhì)量與世界先進(jìn)水平之間仍有較大差距.在 1 696篇ETEC相關(guān)文獻(xiàn)中,不同語言發(fā)表為:英語 1 648篇,法語13篇,西班牙語8篇,波蘭語7篇,德語6篇,漢語5篇,匈牙利語與葡萄牙語各3篇,意大利語與土耳其語各2篇,此數(shù)據(jù)表明,在所有ETEC相關(guān)文獻(xiàn)所用語種中,英語占據(jù)絕對(duì)優(yōu)勢,占總文獻(xiàn)量的97.2%,這再次表明美國在相關(guān)領(lǐng)域內(nèi)研究水平最為先進(jìn),其收錄期刊主要為英文期刊,且多數(shù)科研人員使用工作語言也是世界性的語言英語,這些因素也提高了英文文獻(xiàn)比例.
表1 不同國家/地區(qū)的ETEC相關(guān)文獻(xiàn)發(fā)文量分布表
表2 不同國家/地區(qū)的ETEC相關(guān)文獻(xiàn)在當(dāng)前數(shù)據(jù)集的被引用量分布表
以1998—42017年ETEC相關(guān)文獻(xiàn)發(fā)表機(jī)構(gòu)為統(tǒng)計(jì)源,在當(dāng)前數(shù)據(jù)集中的被引量進(jìn)行排序,名列前20的機(jī)構(gòu)見表3、4.在發(fā)文量上,名列第1為瑞典的哥德堡大學(xué)為93篇,占總發(fā)文量的5.5%,約為排名第2美國馬里蘭大學(xué)的1.4倍.總體上,在發(fā)文量排名前20機(jī)構(gòu)中,有15個(gè)機(jī)構(gòu)來自美國,1個(gè)機(jī)構(gòu)來自瑞典,1個(gè)來自比利時(shí).從文獻(xiàn)在當(dāng)前數(shù)據(jù)集中被引量上來看,仍舊是以瑞典的哥德堡大學(xué)為第1,其被引量達(dá)到 1 282次,約是被引量排名第2機(jī)構(gòu)USN的1.9倍,在被引量排名前10的機(jī)構(gòu)中,有7所來自美國,有2所來自瑞典,有1所來自挪威.
表3 不同機(jī)構(gòu)的ETEC相關(guān)文獻(xiàn)發(fā)文量分布表
表4 不同機(jī)構(gòu)ETEC相關(guān)文獻(xiàn)在當(dāng)前數(shù)據(jù)集中的被引用量分布表
從表3、4中可以看出,美國在ETEC相關(guān)領(lǐng)域研究中所具備強(qiáng)大實(shí)力及科研影響力.此外,雖然瑞典ETEC相關(guān)文獻(xiàn)發(fā)文量、被引用量不及美國,但是瑞典的哥德堡大學(xué)在世界全部ETEC研究機(jī)構(gòu)中的發(fā)文量與文獻(xiàn)被引用量都居世界第1,由此可以看出,該研究機(jī)構(gòu)為世界范圍內(nèi)在ETEC研究領(lǐng)域內(nèi)最為權(quán)威,科研實(shí)力與影響力最強(qiáng)的研究機(jī)構(gòu),而中國雖然文獻(xiàn)發(fā)文量排名世界第2,但在ETEC相關(guān)文獻(xiàn)發(fā)表機(jī)構(gòu)中國未在前10名中,可見中國在ETEC相關(guān)研究領(lǐng)域內(nèi)科研實(shí)力及影響力相對(duì)低,應(yīng)該更加注意發(fā)表文獻(xiàn)質(zhì)量,同時(shí)加強(qiáng)與瑞典、美國等優(yōu)秀科研機(jī)構(gòu)的交流與合作,努力提高自身研究水平與論文質(zhì)量.
通過統(tǒng)計(jì)ETEC相關(guān)文獻(xiàn)在不同期刊中的分布可以快速確定該領(lǐng)域的核心期刊,從而為讀者的重點(diǎn)閱讀提供指導(dǎo),同時(shí)也能為文獻(xiàn)的收集和管理提供依據(jù).在1998—2017年間檢索到的 1 696篇ETEC相關(guān)文獻(xiàn)共分布于493個(gè)不同的期刊中,根據(jù)各個(gè)期刊中收錄文獻(xiàn)的多少以及各個(gè)期刊所收錄的文獻(xiàn)在當(dāng)前數(shù)據(jù)集中的被引量之和進(jìn)行排序,列出其中排名前10的期刊見表5、6.從表5看出,期刊中收錄文獻(xiàn)較為分散,期刊發(fā)文量最高為《INFECTION AND IMMUNITY》(感染與免疫),僅為89篇,只占總發(fā)文量的5.2%,剩余94.8%文獻(xiàn)則分布于其余的492個(gè)同期刊中;從表6看出,期刊所收錄的文獻(xiàn)在當(dāng)前數(shù)據(jù)集中的總被引量之和來看,《INFECTION AND IMMUNITY》(感染與免疫)仍占第1,其收錄的 ETEC相關(guān)文獻(xiàn)在當(dāng)前數(shù)據(jù)集的被引量之和為 1 305次,為排名第2的期刊《VACCINE》(疫苗)1.7倍.由此可見,期刊《INFECTION AND IMMUNITY》(感染與免疫)在ETEC研究領(lǐng)域內(nèi)擁有較高的知名度與影響力.另外,排名前10期刊中有7個(gè)期刊出版地是美國,2個(gè)期刊出版地是新西蘭,1個(gè)期刊的出版地是荷蘭,在所收錄的ETEC相關(guān)文獻(xiàn)在當(dāng)前數(shù)據(jù)集中的總被引量之和排名前10的期刊中,有6個(gè)期刊來自美國,有2個(gè)期刊來自英國,2個(gè)期刊來自新西蘭.
表5 不同期刊的ETEC相關(guān)文獻(xiàn)發(fā)文量分布表
續(xù)表5
期刊名稱發(fā)文量JOURNAL OF CLINICAL MICROBIOLOGY(臨床微生物學(xué)雜志)47JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE(動(dòng)物科學(xué)雜志)33VETERINARY IMMUNOLOGY AND IMMU-NOPATHOLOGY(獸醫(yī)免疫與免疫病理)31AMERICAN JOURNAL OF TROPICAL MEDI-CINE AND HYGIENE(美國熱帶醫(yī)學(xué)與衛(wèi)生雜志)28APPLIED AND ENVIRONMENTAL MICROBI-OLOGY(應(yīng)用與環(huán)境微生物學(xué))24CLINICAL AND VACCINE IMMUNOLOGY(臨床與疫苗免疫學(xué))23
表6 不同期刊的ETEC相關(guān)文獻(xiàn)在當(dāng)前數(shù)據(jù)集中的被引用量分布表
ETEC相關(guān)文獻(xiàn)中的核心作者對(duì)于推動(dòng)該領(lǐng)域的研究和發(fā)展開拓研究領(lǐng)域的深度與廣度都起著重要的作用,通過對(duì)ETEC相關(guān)文獻(xiàn)的作者進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析可以快速確定該領(lǐng)域內(nèi)的核心作者,并了解該作者的發(fā)文情況,實(shí)現(xiàn)對(duì)該領(lǐng)域的跟蹤研究.在檢索到 1 696篇文獻(xiàn)中,共有 6 020個(gè)作者,每個(gè)作者發(fā)文量以及作者發(fā)表全部文獻(xiàn)在當(dāng)前數(shù)據(jù)集的被引量之和排序前十作者,見表7、8.從表7中得出,發(fā)文量最高作者為Svennerholm A M,他在1978 — 2017年間共發(fā)表了81篇文獻(xiàn),占總發(fā)文量4.8%,是發(fā)文量排名第2的作者Qadri F的2倍以上,是近20年間,該領(lǐng)域內(nèi)最為高產(chǎn)的作者.從在表8中看出,作者發(fā)表全部文獻(xiàn)在當(dāng)前數(shù)據(jù)集被引量之和Svennerholm A M仍然是文獻(xiàn)被引用量最多,是被引用量最高的文章(Enterotoxigenic Escherichia coli in developing countries: Epidemiology, microbiology, clinical features, treatment, and prevention)作者之一,另外,該文章作者之一的Qadri F發(fā)文量居位列第二,因此,可以將Svennerholm A M、Qadri F等可看作該領(lǐng)域內(nèi)最為核心作者.發(fā)表文獻(xiàn)在當(dāng)前數(shù)據(jù)集中被引用量之和排名前10的作者中,Svennerholm A M、Qadri F、Faruque A S G、Sack R B和Sack D A均來自瑞典的哥德堡大學(xué),F(xiàn)leckenstein J M與Sack R B 來自美國的馬里蘭大學(xué),Zhang W P與Francis D H 來自美國猶他州立大學(xué),Savarino S J來自美國醫(yī)學(xué)研究中心.
表7 不同作者的ETEC相關(guān)文獻(xiàn)發(fā)文量分布表
表8 不同作者的ETEC相關(guān)文獻(xiàn)在當(dāng)前數(shù)據(jù)集中的被引用量分布表
將1 696篇文獻(xiàn)導(dǎo)入軟件Histcite生成了被引用頻次的可視化分析圖(見圖3),從圖中可以看到近20年間被引頻次最高的30篇文獻(xiàn)之間的關(guān)系,每個(gè)圓圈代表1篇文獻(xiàn),圓圈里的數(shù)字代表該文獻(xiàn)在當(dāng)前數(shù)據(jù)集中的編號(hào),圓圈越大表示代表該圓圈的文獻(xiàn)被引頻次越高,帶箭頭的線表示的是2篇文獻(xiàn)之間的關(guān)系,箭頭指向的文獻(xiàn)是被引用的文獻(xiàn)[15].在圖中可以看到被引用頻次最高的文章為第380篇,是Qadri F, Svennerholm A M, Faruque A S G和Sack R B所寫的“Enterotoxigenic Escherichia coli in developing countries: Epidemiology, microbiology, clinical features, treatment, and prevention”,而獨(dú)立分支的108號(hào)文章是Kotloff KL、Nataro JP、Blackwelder WC等所著“Burden and aetiology of diarrhoeal disease in infants and young children in developing countries (the Global Enteric Multicenter Study, GEMS): a prospective, case-control study”是30篇文獻(xiàn)中唯一研究關(guān)于ETEC引起的發(fā)展中國家嬰幼兒腹瀉疾病文獻(xiàn),從圖3中還可以看出,2005—2007年3年間是高被引頻次文獻(xiàn)分布最多3年,與圖2的結(jié)果是一致的.
從表9列出了Web of science中收錄的近20年間發(fā)表以ETEC為主題的文獻(xiàn)中在當(dāng)前數(shù)據(jù)集中被引用量排名前10的文章.排名第1的文獻(xiàn)為Enterotoxigenic Escherichia coli in developing countries: Epidemiology, microbiology, clinical features, treatment, and prevention[16],該文中Svennerholm A M與Qadri F為ETEC相關(guān)研究領(lǐng)域內(nèi)高產(chǎn)及核心作者,該文章在當(dāng)前數(shù)據(jù)集中的被引用量多達(dá)257次,在Web of science中總被引數(shù)高達(dá)428次.另外,9篇文獻(xiàn)中有8篇文獻(xiàn)是關(guān)于ETEC導(dǎo)致人類及其它動(dòng)物的疾病與防治的研究,有1篇是關(guān)于產(chǎn)腸毒素大腸桿菌感染的分子機(jī)制的研究.
表9 以ETEC為主題的文獻(xiàn)中在當(dāng)前數(shù)據(jù)集中被引用量分布表
ETEC相關(guān)文獻(xiàn)中的關(guān)鍵詞是文獻(xiàn)研究內(nèi)容高度濃縮,關(guān)鍵詞在不同時(shí)間出現(xiàn)頻次能反映出ETEC相關(guān)研究的研究走向.出現(xiàn)頻次較高的關(guān)鍵詞能反映出ETEC研究領(lǐng)域內(nèi)的關(guān)注焦點(diǎn)或者是某個(gè)時(shí)間段內(nèi)先進(jìn)的研究方法或迫切需要解決的熱點(diǎn)問題,研究者感興趣的學(xué)術(shù)話題.將 1 696篇文獻(xiàn)作為數(shù)據(jù)源導(dǎo)入軟件Citespace中,經(jīng)分析可得到由關(guān)鍵詞與名詞短語形成的混合網(wǎng)絡(luò)圖譜,見圖4,ETEC相關(guān)領(lǐng)域高頻熱點(diǎn)詞排名前10的見表10.從圖4與表10中可看出,20年間ETEC主要研究熱點(diǎn)是產(chǎn)腸毒素大腸桿菌菌種研究[17]、產(chǎn)腸毒素大腸桿菌對(duì)豬的影響[18]及對(duì)產(chǎn)腸毒素大腸桿菌導(dǎo)致腹瀉的研究[19],因?yàn)槌薊TEC本身是檢索詞導(dǎo)致Enterotoxiqenicescherichia coli一詞出現(xiàn)頻率最高之外,以Pig(豬),train(菌種),Diarrhea(腹瀉)3個(gè)詞出現(xiàn)頻率最高,因此,近20年間,ETEC相關(guān)研究領(lǐng)域內(nèi)主要以ETEC對(duì)豬影響、ETEC導(dǎo)致腹瀉疾病等為研究熱點(diǎn)[20].其次,根據(jù)其它出現(xiàn)關(guān)鍵詞可知, ETEC對(duì)兒童和仔豬的影響、對(duì)發(fā)展中國家影響、對(duì)旅行者腹瀉的影響,還有對(duì)ETEC產(chǎn)生的腸毒素研究也是近20年來的研究重點(diǎn)[21].
表10 以ETEC為主題的文獻(xiàn)中在當(dāng)前數(shù)據(jù)集中被引用量分布表
本文利用HistCite與CiteSpace軟件對(duì)Web of Science數(shù)據(jù)庫中1998—2017年間的所有ETEC相關(guān)文獻(xiàn)進(jìn)行了分析研究得到以下結(jié)論. ① 在核心作者方面,Svennerholm A M發(fā)表文獻(xiàn)無論是數(shù)量和被引用數(shù)量都遙遙領(lǐng)先于第2名的QadriF,是當(dāng)前ETEC研究領(lǐng)域內(nèi)最為重要的研究者,發(fā)表文獻(xiàn)在當(dāng)前數(shù)據(jù)集中被引用數(shù)量排名前10的作者包括Svennerholm AM在內(nèi)有5位作者均來自瑞典哥德堡大學(xué); ② 在國家/地區(qū)方面,美國與瑞典發(fā)表文獻(xiàn)被引用數(shù)量之和遠(yuǎn)遠(yuǎn)領(lǐng)先其它國家,中國發(fā)文量排名世界第3,但被引用數(shù)量之和較低; ③ 期刊分布上,INFECTION AND IMMUNITY期刊發(fā)文量與被引用數(shù)量之和都遠(yuǎn)超排名第2的VACCINE; ④ 在研究機(jī)構(gòu)方面,瑞典的哥德堡大學(xué)發(fā)表文獻(xiàn)被引用數(shù)量之和約為第2名的美國醫(yī)學(xué)研究中心的2倍,且發(fā)表文獻(xiàn)被引用數(shù)量排名前10作者中,有5位作者來自哥德堡大學(xué),故該研究機(jī)構(gòu)為ETEC研究領(lǐng)域內(nèi)最為權(quán)威科研機(jī)構(gòu); ⑤ 應(yīng)用Hitcite軟件繪制ETEC相關(guān)文獻(xiàn)被引用頻次的可視化分析圖時(shí),選取了被引頻次最高30篇文獻(xiàn),有些新文獻(xiàn)因發(fā)表時(shí)間比較接近導(dǎo)致其被引用數(shù)量較低,因此未出現(xiàn)圖中節(jié)點(diǎn)處,這是本研究受限之一; ⑥ Web of Science數(shù)據(jù)庫收錄的文獻(xiàn)側(cè)重于收集母語為英語國家或地區(qū)發(fā)表文獻(xiàn),此種文獻(xiàn)來源地區(qū)分布不平衡性對(duì)本文分析結(jié)果有一定影響.通過本文分析,對(duì)于ETEC研究領(lǐng)域內(nèi)高產(chǎn)及核心作者、期刊、研究機(jī)構(gòu)和研究熱點(diǎn)等信息進(jìn)行了綜合性了解,可為該領(lǐng)域跟蹤學(xué)習(xí)和研究提供了一定作用與方向指導(dǎo).