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        無創(chuàng)產前基因檢測在性染色體非整倍體產前篩查中的應用

        2020-04-25 08:51:02黃婷婷盧婉劉艷秋
        實驗與檢驗醫(yī)學 2020年2期
        關鍵詞:分析

        黃婷婷,盧婉,劉艷秋

        (江西省婦幼保健院產前診斷中心,江西 南昌 330006)

        臨床常見性染色體非整倍體(sex chromosomal aneuploidies,SCA)主要包括 45,X(Turner綜合征)、47,XXY(克氏綜合征)、47,XXX(超雌綜合征)及 47,XYY(超雄綜合征)等[1]。SCA患者臨床表型多樣,有些患者可終生沒有異常表型,而有些可表現為身高發(fā)育異常、器官結構異常、智力低下或精神及神經功能障礙、第二性征發(fā)育不良致不孕不育等。傳統(tǒng)的血清學篩查方法不能篩查SCA,而產前診斷技術(羊膜腔穿刺、絨毛活檢以及臍靜脈穿刺)具有一定的創(chuàng)傷性,有感染、出血、流產、胎兒損傷等風險。隨著高通量測序技術的發(fā)展,通過無創(chuàng)產前檢測(non-invasive prenatal testing,NIPT)對胎兒 SCA 的產前篩查得到廣泛應用。本研究通過對2016年1月至2018年1月在本中心行NIPT的20334例孕婦中篩查的SCA陽性病例進行回顧性分析,計算陽性預測值 (positive predictive value,PPV),探討NIPT技術對檢測胎兒SCA的臨床應用價值。

        1 資料與方法

        1.1 研究對象 選擇2016年1月1日至2018年1月31日在江西省婦幼保健院產前診斷中心行NIPT的20334例孕婦,排除標準參照國家衛(wèi)生和計劃生育委員會《孕婦外周血游離胎兒DNA產前篩查與診斷技術規(guī)范》。NIPT篩查SCA陽性的76例孕婦檢測結果提示為性染色體數目增多或減少。分析NIPT篩查SCA陽性孕婦檢測指征并進行詳細的遺傳咨詢,在知情同意下行介入性產前診斷(抽取羊水或臍血),行G顯帶核型分析及熒光原位雜交,對診斷結果進行分析,本研究經本院倫理委員會批準。

        1.2 研究方法

        1.2.1 NIPT⑴標本采集 采集孕婦外周血5ml,于4℃條件下,1600g,離心10min,吸取上清置入離心管,再16000g,離心10min,二次分離以清除血漿內的殘余細胞。⑵)胎兒游離DNA提取:嚴格按照核酸提取試劑盒的說明書(磁珠法)提取游離DNA,再經過末端修復、接頭連接、PCR構建DNA文庫,并用Qubit對文庫進行定量。⑶DNA測序:選用胎兒染色體非整倍體試劑盒(T21,T18,T13)以高通量測序儀BGISEQ-500檢測孕婦外周血游離DNA。將每條DNA片段測序所得的序列與人類基因組進行比對,通過生物信息學分析,計算胎兒患性染色體非整倍體疾病的風險值。

        1.2.2 羊膜腔或臍血穿刺 對NIPT篩查SCA陽性孕婦進行詳細的遺傳咨詢,在充分知情同意下行介入性產前診斷。對孕16~24周孕婦行羊膜腔穿刺抽取羊水20ml,孕24周以上孕婦行臍靜脈穿刺抽取臍血2.5ml,備用。電話隨訪未行介入性產前診斷的孕婦,隨訪內容包括妊娠結局,及胎兒出生時情況。

        1.2.3 G顯帶核型分析 將獲取的羊水或臍血按照常規(guī)方法進行細胞接種、培養(yǎng)、收獲、制片和G顯帶,利用Leica全自動染色體分析系統(tǒng)進行中期細胞的掃描和圖像采集,由2位有資質的人員閱片,分析5個核型,計數20個核型,遇到嵌合型染色體時增加計數至50個或以上,最后出具診斷報告。

        1.2.4 熒光原位雜交 將獲取的羊水或臍血按照常規(guī)方法進行細胞處理、玻片處理、雜交、洗片、復染,雜交玻片置于熒光顯微鏡下觀察分析,出具報告。

        1.3 統(tǒng)計學方法 用Excel表格收集數據。正態(tài)分布計量資料用±s)表示;計數資料用頻數、率或構成比表示。

        2 結果

        2.1 篩查SCA陽性病例的NIPT指征 共20344例孕婦行NIPT,篩查SCA陽性孕婦76例,其中孕婦的最大年齡是47歲,最小年齡是17歲,平均年齡(32.5±5.0)歲。主要指征唐篩21三體高風險31例(40.8%),唐篩 18三體高風險 3例(3.9%),孕中期AFP 值偏低 1例(1.3%),高齡 29例 (38.2%),無明顯指征12例(15.8%)。見表1。

        表1 20344例孕婦行NIPT的指征

        2.2 NIPT篩查SCA陽性與核型分析及熒光原位雜交結果比較 篩查SCA陽性孕婦76例,其中NI PT提示性染色體減少39例,28例孕婦行介入性產前診斷,8例核型分析異常;性染色體數目增多37例,24例孕婦行介入性產前診斷,17例核型分析異常。見表2。

        表2 NIPT篩查SCA的陽性預測值

        2.2.1 NIPT提示性染色體數目減少結果分析NIPT提示性染色體減少39例,經遺傳咨詢,27例孕婦行羊膜腔穿刺,1例孕婦因孕周較大行臍靜脈穿刺。20例核型分析及熒光原位雜交結果正常,3例為 XO,1例 47,XXX[32]/45,X[17],1例 45,X[19]/46,X,i(X)(q10)[35],1 例 45,X[7]/46,X,Yqh-[43],1例45,X[22]/46,XY[28],1例熒光原位雜交結果正常,但核型分析結果為46,X,del(X)(p21),t(9;17)(q12;q21)pat,電話隨訪均引產。另1例孕婦未行介入性產前診斷直接引產,7例孕婦拒絕進一步診斷,3例孕婦失聯(lián)。見表3。

        表3 NIPT提示性染色體數目減少結果分析

        表4 NIPT提示性染色體數目增多結果分析

        2.2.2 NIPT提示性染色體數目增多結果分析NIPT提示性染色體數目增多37例,經詳細的遺傳咨詢,22例孕婦行羊膜腔穿刺,2例孕婦因孕周較大行臍靜脈穿刺。7例核型分析及熒光原位雜交結果正常,另7例47,XXY,7例47XXX,2例47,XYY,1例47,XXX[8]/46,XX[41]。結果正常及2例羊水提示胎兒47,XXX及47XYY孕婦選擇繼續(xù)妊娠,電話隨訪胎兒出生時正常,余孕婦選擇終止妊娠。見表4。

        3 討論

        出生缺陷是影響兒童健康的主要公共衛(wèi)生問題,且影響新生兒的生活質量。染色體異常是最嚴重的出生缺陷之一,由于缺乏有效治療,染色體異常往往引起嚴重胎兒損傷。SCA患兒臨床表現差異較大,可能會造成胎兒生殖器官發(fā)育異常、智力發(fā)育障礙、生長發(fā)育異常、心腎障礙等情況[2],早期干預如物理治療、對癥治療和個性化教育等可明顯改善SCA患兒的預后。但性染色體異常致死致殘率較低,通過B超檢查基本難以發(fā)現,有創(chuàng)產前診斷是臨床應用的有效方法,不過孕婦的接受度不高,故胎兒SCA的早期篩查顯得尤其重要。

        近年來,NIPT技術已廣泛應用于常染色體非整倍體的產前篩查[3,4]。大量文獻[5,6]肯定NIPT在孕婦產前篩查中的作用,但在篩查13、18、21號染色體以外的其他染色體非整倍體性改變時,該技術的靈敏度及準確性還有待進一步的提升[7]。如NIPT對胎兒SCA的產前篩查時,檢出率有較大差異[8]。Bin Yu等[9]通過大規(guī)模平行基因組測序篩查胎兒SCA的總PPV為54.54%。Zhang等[10]研究中,10275例孕婦行NIPT,SCA篩查陽性率為0.55%,總PPV為54.54%,其中45,X的PPV僅為29.41%,47,XXY的PPV為77.78%,47,XXX及47,XYY的PPV均為100%。本研究使用高通量大規(guī)模平行基因組測序技術篩查胎兒SCA的總PPV為48.1%,其中性染色體減少的PPV為28.6%,性染色體增多的PPV為70.8%,與賈頤舫等報道一致[11]。不同研究中NI PT篩查SCA的PPV不同,主要是由于納入研究的樣本量及測序深度不同等所致。

        細胞游離DNA來源于母體及胎盤組織,因此母體嵌合現象、未確診的母體SCA、母體拷貝數失衡、胎兒染色體嵌合體等可影響NIPT篩查胎兒SCA的準確性[12,13]。胎兒游離DNA主要來源于胎盤滋養(yǎng)層細胞,其核型常為嵌合,嵌合的程度及母親體重均會影響NIPT檢測的性能。本研究中NIPT篩查性染色體數目減少的陽性預測值偏低的主要原因是:⑴X染色體上有1098個基因,Y染色體上有78個基因,其中58個基因是這兩條染色體上的同源基因,這些同源基因中的29個基因位于X染色體和Y染色體的末端。⑵目前的測序長度只有36個底座,故容易導致X染色體和Y染色體測序定位錯位。⑶胎盤組織中來源于父親的X染色體更易發(fā)生隨機失活導致NIPT篩查性染色體數目減少的陽性預測值偏低[14]。

        在本研究中,有24例NIPT篩查的高危SCA患者拒絕接受進一步的核型分析。臨床上,遺傳醫(yī)師應客觀地向孕婦及家屬解釋NIPT篩查SCA的準確率及局限性,不應盲目夸大NIPT的作用,且對胎兒可能出現的性染色體異常的預后進行遺傳學咨詢。另25例已確診的胎兒SCA孕婦中23例選擇引產。SCA不屬于嚴重的致死、致殘或致愚疾病,其妊娠選擇往往受到醫(yī)生遺傳咨詢方法、家庭的社會經濟水平、受教育程度、文化背景、孕婦對疾病的認識和接受程度等多種因素的影響[15]。當產前篩查或診斷為胎兒SCA時,不僅對臨床醫(yī)生遺傳咨詢提出了挑戰(zhàn),更使孕婦妊娠選擇處于兩難境地。

        綜上所述,NIPT可用于性染色體非整倍體產前篩查,但陽性預測值不高,需要進一步完善檢測技術和分析方法,以提高檢測準確率。

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