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        基于復雜網(wǎng)絡的中醫(yī)痰癥用藥配伍規(guī)律研究

        2020-04-22 08:14:22馬寧白金牛邢俊鳳郭靜霞
        中醫(yī)藥信息 2020年2期
        關(guān)鍵詞:方劑社團標簽

        馬寧,白金牛,邢俊鳳,郭靜霞

        (內(nèi)蒙古科技大學包頭醫(yī)學院,內(nèi)蒙古 包頭 014040)

        中醫(yī)藥作為中華民族的瑰寶,在數(shù)千年的發(fā)展歷史中,積累了豐富和寶貴的知識財富,特別是一些名家醫(yī)案數(shù)據(jù)對于后人總結(jié)用藥規(guī)律,更好地應用于臨床實踐具有積極地促進作用。研究人員利用頻率分析、關(guān)聯(lián)規(guī)則和聚類分析等方法分析用藥規(guī)律,已成為一種常用的研究方法和手段[1-2]。

        相比于這些傳統(tǒng)的數(shù)據(jù)挖掘方法,近年來出現(xiàn)的復雜網(wǎng)絡分析方法,因其挖掘深度及良好的擴展性,受到了越來越多研究人員的青睞,例如章亞東等針對中醫(yī)治療肺癌處方建立方劑-藥物網(wǎng)絡,在確立核心藥物的基礎(chǔ)上使用基于關(guān)聯(lián)規(guī)則的推薦算法來進行配伍規(guī)律的挖掘[3];呂慶莉基于藥物間關(guān)聯(lián)度建立中藥復雜網(wǎng)絡,然后使用改進COPRA算法對腦血管疾病用藥規(guī)律進行挖掘[4];王嫣然等構(gòu)建失眠的中藥復雜網(wǎng)絡模型,同時引入復雜網(wǎng)絡節(jié)點中心性的概念,挖掘核心節(jié)點,再進行聚類劃分確定藥物配伍關(guān)系[5]。上述這些方法均是在構(gòu)建復雜網(wǎng)絡模型的基礎(chǔ)上,結(jié)合藥物的特性、作用等在算法上做出了一定的改進,從而得到了很多傳統(tǒng)數(shù)據(jù)挖掘無法得到的計算結(jié)果,對于分析藥物配伍規(guī)律提供了新穎的參考依據(jù)。

        本文針對痰癥的中藥方劑用藥,通過數(shù)據(jù)的采集及預處理,首先構(gòu)建基于方劑藥物的痰癥復雜網(wǎng)絡模型,同時依據(jù)藥物特性,確定藥物權(quán)重,在此基礎(chǔ)上使用改進的COPRA算法實現(xiàn)痰癥藥物配伍規(guī)律的挖掘,最后通過與傳統(tǒng)關(guān)聯(lián)規(guī)則算法的對比分析,驗證本方法的有效性和先進性。

        1 研究方法

        1.1 構(gòu)建中藥復雜網(wǎng)絡模型

        在傳統(tǒng)的復雜網(wǎng)絡模型構(gòu)建過程中,通常以藥物為節(jié)點,藥物間連接為邊,建立復雜網(wǎng)絡模型,但這樣建立起來的復雜網(wǎng)絡模型會導致方劑中經(jīng)常出現(xiàn)的佐使藥節(jié)點度過大,而在計算過程中被認為是核心藥,進而影響整個計算結(jié)果的準確性。

        本文首先建立每個方劑的藥物子網(wǎng),即以每個方劑為對象,選擇方劑中的藥物作為網(wǎng)絡節(jié)點,根據(jù)“君臣佐使”的配伍特點,將方劑中藥物分類為君藥、臣藥和佐使藥,其中君藥、臣藥作為網(wǎng)絡節(jié)點分別與其他藥物建立連接邊,佐使藥只與君藥、臣藥建立連接邊,而彼此間不連接,這樣君藥、臣藥的節(jié)點度會更大,以突出核心藥物的地位。例如方劑“苓桂術(shù)甘湯”中:茯苓為主藥,桂枝為臣藥,白術(shù)和甘草為佐使藥,建立的方劑子網(wǎng)如圖1所示。

        圖1 “苓桂術(shù)甘湯”方劑子網(wǎng)

        在此基礎(chǔ)上,根據(jù)方劑中藥物之間是否存在連接邊來確立中藥復雜網(wǎng)絡,如果兩個藥物出現(xiàn)在不同的方劑子網(wǎng)中,并且存在連接邊,則在復雜網(wǎng)絡中建立連接邊,并設置權(quán)重為1,如果該連接邊在n個方劑中出現(xiàn),則在復雜網(wǎng)絡中該連接邊的權(quán)重為n。

        1.2 定義藥物核心度

        在構(gòu)建的復雜網(wǎng)絡模型中,每個藥物的重要程度是不一樣的,這里通過對PageRank算法做出改進,來計算藥物的核心度。

        PageRank算法是一種根據(jù)相鄰節(jié)點重要性來計算節(jié)點權(quán)重的迭代算法[6],該算法在搜索引擎排名、知識推薦等領(lǐng)域中有著廣泛的應用。在該方法中,每個節(jié)點核心度由其PR值來決定。節(jié)點pi的核心度可由如下公式計算:

        (1)

        其中Mpj是所有pj鄰邊的集合,L(pj)是pj連接邊的數(shù)目,N是節(jié)點總數(shù),α為阻力系數(shù),一般取0.85。

        由于每個節(jié)點初始的核心度的是不一樣的,這是由在構(gòu)建中藥復雜網(wǎng)絡模型時,節(jié)點連接邊權(quán)重及節(jié)點的度決定的,因此在迭代開始前初始化節(jié)點核心度公式的如下:

        (2)

        其中d(pi)代表節(jié)點pi的度,Wij代表節(jié)點pi與pj之間連接邊的權(quán)重,如果該邊不存在,則Wij值為0。

        確定藥物核心度的計算過程描述如下:

        步驟1:按照公式(2),初始化藥物核心的PR值。

        步驟2:按照公式(1),進行異步迭代,更新藥物節(jié)點的PR值。

        步驟3:當|PRk+1-PRk|≤m,即在k+1次迭代后,每個藥物節(jié)點的核心度PR值與之前一次迭代的值的差小于給定值m則停止迭代,否則繼續(xù)。

        最后輸出結(jié)果PRk+1。

        1.3 改進COPRA社團發(fā)現(xiàn)算法

        COPRA算法是由Steve Gregory在2010年提出的一種基于標簽傳遞的社團發(fā)現(xiàn)算法[7],該算法可有效發(fā)掘重疊社團,而本文要研究的藥物配伍規(guī)律中,同一藥物會出現(xiàn)在不同的配伍組合中,這一問題即可歸納為復雜網(wǎng)絡中重疊社團的發(fā)現(xiàn),該算法的基本思想為:當前節(jié)點會根據(jù)鄰居社團所歸屬的社團情況,決定本節(jié)點的歸屬,在算法執(zhí)行時會使用隸屬度(Belonging Coefficient)來決定節(jié)點社團的歸屬。

        針對藥物配伍規(guī)律社團發(fā)現(xiàn)的過程應當以核心藥物節(jié)點為中心進行社團的劃分,而由于COPRA算法是一類標簽傳遞算法,為了使節(jié)點得到有效的劃分,應提升核心藥物節(jié)點標簽的傳播度,也即提升節(jié)點對于核心藥物節(jié)點規(guī)劃社區(qū)的隸屬度。具體改進方法如下:

        改進1:在標簽進行傳遞時,假設節(jié)點pi的鄰居節(jié)點包含名為lj的社團標簽,則傳遞后pi中針對標簽lj的權(quán)重wj定義如下:

        ∑KMjPRk

        (3)

        其中Mj代表所有包含標簽lj的pi的鄰居節(jié)點的集合,wj-1代表上次傳遞后節(jié)點針對lj的標簽權(quán)重。

        改進2:給定劃分社團個數(shù)v,對于每一次節(jié)點完成標簽傳遞后,如果社團標簽均小于隸屬度1/v,則優(yōu)先選擇PR值(藥物核心度)最大的標簽進行標記。

        同時,由于COPRA算法在迭代過程中隨機性較強,為有效控制社團內(nèi)節(jié)點的個數(shù),這里采用借鑒文獻[8]中定義的密度函數(shù)對社團演變過程進行控制,抑制規(guī)模過大社團的出現(xiàn)。

        2 實驗結(jié)果

        通過中醫(yī)e百、藥智中藥方劑數(shù)據(jù)庫等獲取治療祛痰方劑共計414首,通過數(shù)據(jù)整理、清洗、規(guī)約構(gòu)建數(shù)據(jù)源。在此基礎(chǔ)上按照前一節(jié)給出的方法構(gòu)建方劑復雜網(wǎng)絡,同時刪除出現(xiàn)頻率過低(頻率≤5)的藥物節(jié)點及其關(guān)聯(lián)邊得到符合要求的稀疏中藥復雜網(wǎng)絡模型,該復雜網(wǎng)絡模型共包含藥物節(jié)點161個,藥物連接邊4 396條,表1所示為網(wǎng)絡中主要核心藥物度值及其權(quán)重值。

        表1 核心藥物度值及權(quán)重值統(tǒng)計

        基于建立的復雜網(wǎng)絡模型,使用改進的COPRA算法發(fā)現(xiàn)重疊社團,這里設置迭代次數(shù)為20(經(jīng)實驗分析,算法在迭代20次時結(jié)果已趨于穩(wěn)定),社團節(jié)點數(shù)目最大值為4,隸屬度刪除閾值v為0.3進行數(shù)據(jù)挖掘。由于COPRA算法具有一定的隨機性,每次運行的結(jié)果均不盡相同。這里重復運行方法200次,統(tǒng)計重復出現(xiàn)藥物組合的出現(xiàn)頻率,其中出現(xiàn)頻次超過50次的藥物組合共計116個,部分出現(xiàn)頻率高的藥物組合統(tǒng)計結(jié)果如表2所示。

        為了通過對比分析驗證該方法的有效性,針對該數(shù)據(jù)源使用關(guān)聯(lián)規(guī)則Apriori算法進行挖掘,共獲取置信度大于70%的配伍規(guī)則42個,如表3所示為置信度較高的部分藥物組合統(tǒng)計結(jié)果。

        表2 復雜網(wǎng)絡改進COPRA方法挖掘結(jié)果統(tǒng)計

        表3 關(guān)聯(lián)規(guī)則Apriori算法挖掘結(jié)果統(tǒng)計

        3 討論

        分析結(jié)果表1中的數(shù)據(jù)結(jié)果可知,通過PageRank算法計算的藥物核心度可有效代表治療痰癥藥物的重要程度,其中半夏、茯苓、南星、瓜蔞等在祛痰方劑中經(jīng)常以君臣藥身份出現(xiàn),故權(quán)值較高,而甘草等經(jīng)常作為調(diào)和諸藥的佐使藥出現(xiàn),雖然其連接度較高,但核心度權(quán)值偏低,這根算法的初衷是一致的。通過分析表2的計算結(jié)果發(fā)現(xiàn),一方面,挖掘結(jié)果中的藥物組合以核心藥物為主,且許多結(jié)果與表3中的關(guān)聯(lián)規(guī)則算法的挖掘結(jié)果是一致的,符合臨床用藥的相關(guān)科學依據(jù),這也進一步證明了方法的可行性;另一方面,在本文介紹的方法挖掘結(jié)果中出現(xiàn)了很多利用關(guān)聯(lián)規(guī)則挖掘不到的藥物組合。如:{黃芩,南星,貝母}{橘紅,梔子}等,這些藥物組合被證明是合理的,具有進一步研究的參考價值。

        綜上所述,本文給出的一種復雜網(wǎng)絡用藥配伍規(guī)律分析方法可充分依托核心藥物進行用藥規(guī)律的發(fā)掘,并且可以通過調(diào)整算法中發(fā)現(xiàn)社團節(jié)點數(shù)目來控制藥物組合中藥物的數(shù)量,方法挖掘結(jié)果的數(shù)量和質(zhì)量整體優(yōu)于傳統(tǒng)數(shù)據(jù)挖掘方法。因此本方法研究成果可以為利用數(shù)據(jù)挖掘分析用藥規(guī)律提供一種的新的方法和工具,為揭示用藥規(guī)律和特點提供有力的支撐。

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