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        鳳梨內(nèi)生菌篩選鑒定及拮抗效果評價

        2020-04-09 02:08:26劉惠英朱志強陳嘉敏羅美林熊玉杰易璐瑤魏蜜
        關(guān)鍵詞:鳳梨內(nèi)生病原

        劉惠英,朱志強,陳嘉敏,羅美林,熊玉杰,易璐瑤,魏蜜

        (1.湖北工程學(xué)院生命科學(xué)技術(shù)學(xué)院,特色果蔬質(zhì)量安全控制湖北省重點實驗室,湖北 孝感 432000;2.湖北大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院,湖北 武漢 430062)

        0 引言

        鳳梨(Ananascomosus)又名菠蘿,屬鳳梨科(Bromeliaceae)鳳梨屬(Ananas)多年生草本果樹植物,營養(yǎng)生長迅速,生產(chǎn)周期短,是世界重要的果樹之一.在我國華南沿海一帶分布廣泛.作為熱帶地區(qū)特色水果,葉片細(xì)長的單子葉植物.不僅具有觀賞價值,可作為室內(nèi)常綠觀賞花卉,還可以吸收污染物,從而作為空氣污染指示植物[1].內(nèi)生菌在植物中看起來微不足道,但內(nèi)生菌可通過自身代謝物或通過信號傳導(dǎo)對植物產(chǎn)生作用.有內(nèi)生菌存在的植物一般比無內(nèi)生菌植物生長迅速.一方面是:內(nèi)生菌可分泌IAA、吲哚乙酸、激動素等促生長激素;另一方面是:增強植物對營養(yǎng)元素氮、磷、鉀的吸收[2].在一株植物中,并非只有一種內(nèi)生菌,眾多的內(nèi)生菌協(xié)調(diào)的存在于宿主體內(nèi),通過它們的共同作用,促進植物的生長[3].另外,內(nèi)生菌之間也相互制約,一種內(nèi)生菌可能會影響一種甚至多種內(nèi)生菌在宿主植物中的生存,進而達到微環(huán)境的動態(tài)平衡[4].

        本課題以鳳梨為原料,對內(nèi)生菌進行篩選和鑒定,通過平板對峙培養(yǎng)法篩選出3株對蔬菜軟腐病菌菊迪基氏菌有拮抗效果的生防細(xì)菌,并通過形態(tài)學(xué)、生理生化和分子手段對其進行鑒定.評價了篩選的生防菌對常見細(xì)菌性病害和真菌病害的拮抗作用,并進一步評價了其解磷固氮和產(chǎn)纖維素酶能力,這對生防菌的選用及植物抗病促生提供了理論基礎(chǔ)及參考,為拓展生物防治的微生物資源奠定了一定的基礎(chǔ).

        1 材料與方法

        1.1 材料

        1.1.1 供試葉片 鳳梨葉片于2018年10月采自湖北省孝感市孝南區(qū)臥龍鄉(xiāng)鳳梨種植基地.

        1.1.2 供試菌株 病原細(xì)菌:蔬菜軟腐病菌菊迪基氏菌DickeyachrysanthemiHBEU-9、胡蘿卜果膠桿菌PectobacteriumcarotovorumZX-1、丁香假單胞菌PseudomonassyringaeG1、黃單胞菌XanthomonasarboricolaDW3F3.

        病原真菌:燕麥鐮孢菌FusariumavenaceumRot2、膠孢炭疽菌ColletotrichumgloeosporioidesPearE、互隔交鏈孢霉Alternariaalternatezzha.

        以上所有菌株均由湖北工程學(xué)院特色果蔬質(zhì)量安全控制湖北省重點實驗室提供.

        1.1.3 主要培養(yǎng)基 LB培養(yǎng)基[5]:NaCl 10 g,蛋白胨10 g,酵母粉5 g,瓊脂18 g,加入蒸餾水定容至1 000 mL,pH 7.0~7.2;PDA培養(yǎng)基[5]:馬鈴薯200 g,葡萄糖20 g,瓊脂20 g,加蒸餾水定容至1 000 mL;PD則不加瓊脂.

        生理生化鑒定所需培養(yǎng)基:參照《常見細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊》[6].

        PVK培養(yǎng)基:葡萄糖10 g,酵母浸膏0.5 g,NaCl 0.2 g,Ca3(PO4)25 g,(NH4)2SO40.5 g,KCl 0.2 g,MgSO4·7H2O 0.1 g,F(xiàn)eSO4·7H2O 0.002 g,瓊脂粉18 g,0.4%溴酚藍(lán)(pH6.7)6 mL,加蒸餾水定容至1 000 mL;Asnby培養(yǎng)基:KH2PO40.2 g,MgSO4·7H2O 0.2 g,NaCl 0.2 g,CaCO35 g,甘露醇10.0 g,CaSO4·2H2O 0.1 g,瓊脂18 g,加蒸餾水定容至1 000 mL;纖維素酶培養(yǎng)基:CMC 10 g,蛋白胨10 g,酵母粉10 g,NaCl 5 g,KH2PO41 g,瓊脂18 g,加蒸餾水定容至1 000 mL,pH 7.0.

        以上所有藥品試劑均購于生工生物工程(上海)股份有限公司,馬鈴薯則購于孝感當(dāng)?shù)爻?

        1.2 方法

        1.2.1 鳳梨拮抗內(nèi)生菌的分離與篩選 將鳳梨葉片洗凈涼干后于超凈工作臺上進行表面消毒處理[7]:70%乙醇中浸泡2~3 s后,用0.1% 酸性升汞水溶液處理1~3 min,再用無菌水清洗3次.

        對表面已消毒的材料采用研磨法[6]分離內(nèi)生菌.所得研磨勻漿適當(dāng)稀釋,涂布于 LB、PDA平板上于28 ℃培養(yǎng)2~7 d.待長出菌落后采用培養(yǎng)皿稀釋培養(yǎng)法[7]和平板劃線分離法[7]進行內(nèi)生菌的分離純化,直到得到單菌落,然后將菌落形態(tài)特征不同的單菌落分別挑取并及時分離編號,4 ℃保存?zhèn)溆?

        初篩:采用點接法[6]進行初步篩選.量取100 μLD.chrysanthemiHBEU-9病原細(xì)菌發(fā)酵液,在LB平板上進行涂布,待干燥后用接種針分別挑取各內(nèi)生菌點于平板上,每皿采用十字交叉法點接一種內(nèi)生菌,對照不接種,30 ℃下培養(yǎng)3~7 d,觀察有無抑菌圈及抑菌圈直徑,測量抑菌圈直徑.

        復(fù)篩:采用發(fā)酵液打孔法[6]進行再次篩選.量取100 μLD.chrysanthemiHBEU-9病原細(xì)菌發(fā)酵液,在LB平板上進行涂布,待干燥后采用十字交叉法在平板上打4個對稱的4 mm小孔,每孔接種20 μL的內(nèi)生菌發(fā)酵液,對照不接種,30 ℃下培養(yǎng)3~7 d,觀察有無抑菌圈及抑菌圈直徑,測量抑菌圈的直徑.

        1.2.2 鳳梨內(nèi)生菌的鑒定

        1)形態(tài)學(xué)鑒定.菌落形態(tài)觀察[6]:將內(nèi)生菌發(fā)酵液稀釋涂布于LB平板上30 ℃培養(yǎng)24 h,觀察菌落生長情況、顏色和大小、性狀、邊緣、表面、透明度等.

        革蘭氏染色[6]:參照Hucker修改法[5]對獲得的內(nèi)生菌進行革蘭氏染色,顯微鏡下觀察染色結(jié)果,判斷其為革蘭氏陽性或陰性菌.

        2)分子生物學(xué)鑒定.參考左山等[8]的分子生物學(xué)實驗方法,進行內(nèi)生菌菌株DNA提取,使用引物F27(AGAGTTTGA-TCCTGGCTCAG)和R1492(TACGGCTACC-TTGTTACGACTT)進行PCR擴增.反應(yīng)條件為:在94 ℃變性4 min;94 ℃變性30 s;然后55 ℃進行退火30 s,72 ℃進行延伸1 min,一共34個循環(huán);最后在72 ℃下進行延伸10 min.得到的產(chǎn)物通過瓊脂糖凝膠電泳檢測后,送天一輝遠(yuǎn)有限公司測序,得到測序結(jié)果后在NCBI網(wǎng)站上經(jīng)過BLAST同源性比較,使用MEGA6.0構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹.

        1.2.3 拮抗效果測定 內(nèi)生菌發(fā)酵液制備[7]:取1%接種量把內(nèi)生菌F-2、F-3-1、F-3-2分別接種于LB液體培養(yǎng)基,在180 r/min,30 ℃條件下?lián)u床培養(yǎng)12~18 h.

        抑制病原細(xì)菌拮抗效果測定[9]:采用平板對峙法[5],在無菌超凈工作臺上,取病原細(xì)菌D.chrysanthemiHBEU-9、P.syringaeG1、X.arboricolaDW3F3、P.carotovorumZX-1發(fā)酵液100 μL在LB平板上涂布,內(nèi)生菌接種方法參照對內(nèi)生菌的篩選實驗,對照不接種,30 ℃下培養(yǎng)3~7 d,每隔12 h觀察是否產(chǎn)生抑菌圈,測量并記錄抑菌直徑.

        抑制病原真菌拮抗效果測定[10]:采用平板對抗法[5],在無菌超凈工作臺上,將病原菌F.avenaceumRot2、C.gloeosporioidesPearE、A.alternatezzha菌塊用打孔器接種于PDA培養(yǎng)基中央,內(nèi)生菌接種方法參照對病原細(xì)菌的拮抗實驗,對照不接種,28 ℃條件下培養(yǎng)3~7 d,測量各篩選的內(nèi)生菌菌落邊緣與病原真菌菌落邊緣的抑菌圈并記錄.

        1.2.4 部分生化指標(biāo)鑒定 生理生化鑒定參照《伯杰細(xì)菌鑒定手冊》[11]和《常見細(xì)菌系統(tǒng)鑒定手冊》[6]進行.

        溶磷能力測定:分別在PVK培養(yǎng)基上點接所得內(nèi)生菌,于30 ℃培養(yǎng),每隔12 h觀察一次,待出現(xiàn)解磷圈及時記錄.

        固氮能力測定:分別在Asnby培養(yǎng)基上采用劃線法接種所得內(nèi)生菌,于30 ℃培養(yǎng),每隔12 h觀察一次,記錄菌株的生長狀況.

        產(chǎn)纖維素酶能力測定:分別于纖維素酶培養(yǎng)基上點接所得內(nèi)生菌,于30 ℃培養(yǎng),每隔12 h觀察記錄平板上菌落的生長情況.

        2 結(jié)果與分析

        2.1 鳳梨拮抗內(nèi)生菌的分離與篩選將分離到的內(nèi)生菌進行拮抗效果篩選.根據(jù)所獲得的菌株與病原菌進行平板對峙分析,結(jié)果表明有3株內(nèi)生細(xì)菌對以上4種病原細(xì)菌和3種病原真菌均有一定的抑制效果,將其編號為F-2、F-3-1、F-3-2.但本實驗未篩選到對上述病原細(xì)菌和真菌有抑制效果的內(nèi)生真菌.

        2.2 鳳梨內(nèi)生菌的鑒定

        2.2.1 形態(tài)學(xué)鑒定 如圖1所示,通過觀察發(fā)現(xiàn)3株內(nèi)生細(xì)菌菌體呈桿狀,F(xiàn)-2和F-3-2芽胞為橢圓形到柱狀,F(xiàn)-3-1芽胞呈橢圓狀.3株內(nèi)生菌幼齡菌落均為圓形,表面及邊緣較為光滑,均呈白色,培養(yǎng)24 h后菌落表面變得干燥且起皺,但邊緣仍保持光滑,菌落顏色也任然為白色.通過革蘭氏染色,顯微觀察3株菌均為紫色,故為3株內(nèi)生菌均為革蘭氏陽性菌.

        圖1 各菌株菌落及顯微形態(tài)

        2.2.2 分子生物學(xué)鑒定 3株內(nèi)生菌16S rDNA區(qū)域經(jīng)過PCR擴增產(chǎn)物,均獲得了1 445 bp左右的堿基序列,在GenBank數(shù)據(jù)庫中均能找到同源性很高的相似菌株序列.使用MEGA6.0對3株內(nèi)生菌進行同源性分析,同時構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹.發(fā)現(xiàn)F-2與Bacillusamyloliquefaciensstrain 13(登錄號HM1070806.1)菌株序列相似度為95%(如圖2),確定F-2菌株為解淀粉芽胞桿菌(B.amyloliquefaciens).F-3-1與Bacillusmegateriumstrain NBRC 15308(T)(登錄號MK424276.1)菌株序列相似度為97%(如圖3),確定F-3-1菌株為巨大芽胞桿菌(B.megaterium).F-3-2與Bacillussubtilisstrain JCM 1465(登錄號MH145363.1)菌株序列相似度為94%(如圖4),確定F-3-2菌株為枯草芽胞桿菌(B.subtilis).

        圖3 內(nèi)生菌F-3-1基因序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹

        圖4 內(nèi)生菌F-3-2基因序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹

        2.3 拮抗效果測定3株目標(biāo)內(nèi)生菌與8株病原菌拮抗實驗表明,F(xiàn)-2對病原細(xì)菌D.chrysanthemiHBEU-9、P.syringaeG1、X.arboricolaDW3F3、P.carotovorumZX-1均有不錯的拮抗效果,尤其對P.syringaeG1的抑菌直徑達到28.83 mm,但是F-2對3株供試病原真菌均無明顯拮抗作用(如圖5,圖6);F-3-1對病原真菌F.avenaceumRot2、C.gloeosporioidesPearE、A.alternatezzhazzha均有極強的抑制作用,抑菌率分別為:70.83%、91.67%、65.56%(如表1),僅對病原細(xì)菌D.chrysanthemiHBEU-9、P.syringaeG1、X.arboricolaDW3F3有拮抗效果,抑菌直徑平均為13.25 mm左右(如圖6);F-3-2對病原真菌的拮抗效果遠(yuǎn)不如F-3-1,且僅對C.gloeosporioidesPearE、A.alternatezzhazzha有抑制作用,抑菌率為31.67%、23.88%,其對病原細(xì)菌的拮抗效果強于F-3-1,對X.arboricolaDW3F3、P.carotovorumZX-1的抑菌直徑分別為20.70 mm、13.33 mm均高于F-2,而對D.chrysanthemiHBEU-9、P.syringaeG1的抑制效果則低于F-2(如表2).即F-3-1表現(xiàn)出對多種病原真菌極強的抑制效果,可以開發(fā)為真菌的生防菌.F-2與F-3-2對真菌抑制效果較差,但對多種病原細(xì)菌表現(xiàn)出拮抗效果.可見不同的菌株的抗菌譜存在顯著差異.在利用內(nèi)生菌進行生物防治時可以有針對性的使用一種或多種菌聯(lián)用來達到抗病害的效果.

        表1 各菌株與不同病原真菌的抑菌率 %

        表2 各菌株對病原細(xì)菌的抑菌直徑 mm

        表中抑菌直徑小于5.00 mm的均記為0.00 mm

        圖5 內(nèi)生菌 F-3-1對各病原真菌的拮抗效果

        圖6 3株內(nèi)生菌對各病原細(xì)菌的拮抗效果

        2.4 內(nèi)生菌部分促生能力測定

        2.4.1 內(nèi)生菌解磷能力測定 分離的3株內(nèi)生菌點接于PVK平板上,觀察解磷圈.從圖7可知,F(xiàn)-2、F-3-1、F-3-2均具有解磷能力,且F-2的解磷能力強于后者.說明F-2從磷酸三鈣中釋放游離磷酸的能力更強,能更好地利用環(huán)境中的磷元素.

        圖7 3株內(nèi)生菌在PVK培養(yǎng)基上的生長情況

        2.4.2 內(nèi)生菌固氮能力測定 將所得的3株內(nèi)生菌接種在Asnby培養(yǎng)基(無氮)上,通過觀察其能否在無氮源的環(huán)境中生長,來測定其是否具有固氮能力.實驗結(jié)果如圖8所示,F(xiàn)-2無固氮能力,F(xiàn)-3-1、F-3-2均能在無氮源培養(yǎng)基上生長,說明其具有固氮能力.

        圖8 3株內(nèi)生菌在Asnby培養(yǎng)基(無氮)上的生長情況

        2.4.3 內(nèi)生菌產(chǎn)纖維素酶能力測定 在纖維素酶培養(yǎng)基上點接獲得的內(nèi)生菌,觀察透明圈,即可判斷3株內(nèi)生菌能否產(chǎn)生纖維素酶,實驗結(jié)果如圖9所示.3株內(nèi)生菌都能產(chǎn)生透明圈,F(xiàn)-2、F-3-1、F-3-2均可以生成纖維素酶,并能分解纖維素.但從透明圈的大小判斷F-2和F-3-2的纖維素酶活性高于F-3-1.

        圖9 各菌株在纖維素酶培養(yǎng)基上的生長情況

        3 結(jié)論與討論

        本課題探究了鳳梨內(nèi)生菌對常見病原菌的生防效果,并從生理生化層面、形態(tài)學(xué)層面、分子生物學(xué)層面對所獲得3株內(nèi)生菌進行鑒定.通過細(xì)菌真菌篩選方法,從鳳梨中篩選出18株內(nèi)生菌,通過平板對峙最終得到3株優(yōu)良內(nèi)生菌,分子生物學(xué)鑒定3株菌分別為BacillusamyloliquefaciensF-2,BacillusmegateriumF-3-1,BacillussubtilisF-3-2.為了明確其生防效果,又進一步進行了抑菌直徑的觀察,發(fā)現(xiàn)F-2和F-3-2對常見病原細(xì)菌有不錯的拮抗效果抑菌直徑平均為10 mm以上,F(xiàn)-3-1對常見病原真菌有極強的拮抗效果,平均抑菌率為76 %.同時,為了探究內(nèi)生菌促進植物生長的特性,采用篩選培養(yǎng)基對3株內(nèi)生菌進行溶磷固氮及產(chǎn)酶分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn)3株菌解磷,產(chǎn)纖維素酶能力較好,F(xiàn)-3-1和F-3-2具有較好的固氮能力.

        參考協(xié)同演化(co-evolution)理論,內(nèi)生菌中內(nèi)生真菌能與宿主植物建立更穩(wěn)定的長期共生關(guān)系,因而,內(nèi)生真菌資源的發(fā)掘利用有待探索[12].從防治鳳梨黑斑病出發(fā),本實驗獲得了具有高效防治效果的3株內(nèi)生細(xì)菌不僅可以促進宿主植物抗病害能力,更能通過改善生長環(huán)境中的磷源促進植物生長.內(nèi)生菌區(qū)別于普通拮抗菌,具有更大的利用潛力.雖然對內(nèi)生菌的多個指標(biāo)進行了測定,但是缺乏對這3株芽胞桿菌的深層抗菌基因簇的研究,鑒定獲得的內(nèi)生菌為芽胞桿菌,我們查閱文獻發(fā)現(xiàn),芽胞桿菌已發(fā)現(xiàn)的抑菌物質(zhì)包括:豐源素、伊枯草素等非核糖體途徑產(chǎn)生的脂肽類抗生素[13],以及核糖體途徑產(chǎn)生的脂肽類如類羊毛硫抗生素等,脂肽類物質(zhì)是芽胞桿菌的主要抗菌物質(zhì),其表現(xiàn)為較強的抗真菌和極弱的抗細(xì)菌效果[14],另芽胞桿菌可分泌聚酮類物質(zhì)亦有抗菌作用,研究表明聚酮針對細(xì)菌有很強的抑制作用[15-16],結(jié)合我們的內(nèi)生菌F-3-1主要拮抗病原真菌的特性,推測其抗菌活性和脂肽類物質(zhì)有關(guān);F-2和F-3-2的拮抗細(xì)菌作用與聚酮類物質(zhì)有關(guān).因此對內(nèi)生菌的研究還有待深入,進一步明確其基因?qū)用婵咕鷻C理.

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