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        南亞實(shí)蠅氣味結(jié)合蛋白家族基因的篩選及克隆驗(yàn)證

        2020-03-23 01:24:38杜迎剛季清娥賴鐘雄
        關(guān)鍵詞:引誘劑實(shí)蠅南亞

        杜迎剛,季清娥,賴鐘雄

        (1.濰坊科技學(xué)院 山東省高校設(shè)施園藝實(shí)驗(yàn)室,山東 壽光 262700;2.福建農(nóng)林大學(xué) 亞熱帶果樹研究所,福建 福州 350002;3.福建農(nóng)林大學(xué) 植保學(xué)院,福建 福州 350002)

        南亞實(shí)蠅Bactroceratau(Walker),屬雙翅目(Diptera)實(shí)蠅科(Tephritidea)果實(shí)蠅屬(BactroceraMacquart),為害絲瓜、南瓜、苦瓜等13種瓜類,柑橘、杧果等共計(jì)70多種熱帶和亞熱帶瓜果,在中國大陸地區(qū)主要分布于廣東、廣西、海南、福建、云南、貴州、四川、湖北、浙江、江西等地,且為害面積逐年擴(kuò)大,加上其抗逆性強(qiáng),個(gè)體食量大,發(fā)育歷期短,產(chǎn)卵期長,給當(dāng)?shù)氐乃褪卟松a(chǎn)造成巨大經(jīng)濟(jì)損失[1-2],甚至在很多地區(qū)其危害已超過橘小實(shí)蠅B.dorsalis(Hendel)和瓜實(shí)蠅B.cucuribitae(Coquillett).

        嗅覺在昆蟲寄主定位與選擇、產(chǎn)卵等行為中發(fā)揮著感知寄主植物揮發(fā)物、昆蟲信息素等氣味信息物質(zhì)的重要作用.對昆蟲的嗅覺識(shí)別進(jìn)行有效干擾,是實(shí)現(xiàn)害蟲可持續(xù)治理極有潛力的一條途徑[3].這種方法從很久以前在實(shí)蠅防治和監(jiān)控上就已發(fā)揮著重要作用[4],在很多地區(qū)甚至是唯一的防治措施.但在防治過程中發(fā)現(xiàn)引誘劑(主要指甲基丁香酚(methyl eugenol,簡稱ME)和誘蠅酮(cuelure,簡稱CUE)這兩種副信息素[4])取食經(jīng)歷會(huì)對正常實(shí)蠅、輻照不育實(shí)蠅的交配行為和其對引誘劑的趨性行為產(chǎn)生很大影響[5-6].還有,引誘劑在野外開放環(huán)境條件下誘集不到雌蠅,但在室內(nèi)籠中卻誘集到15%左右的雌蠅[7-8].為科學(xué)指導(dǎo)引誘劑在實(shí)蠅監(jiān)控和防治上的應(yīng)用,筆者首次以對兩種主要實(shí)蠅類昆蟲引誘劑——甲基丁香酚和誘蠅酮都具趨性反應(yīng)的南亞實(shí)蠅[9]為研究對象,對其氣味結(jié)合蛋白(odorant-binding protein,簡稱OBP)整個(gè)家族基因進(jìn)行篩選和克隆驗(yàn)證.

        1 材料與方法

        1.1 材 料

        南亞實(shí)蠅為福建農(nóng)林大學(xué)益蟲研究所2013年建立的室內(nèi)大量飼養(yǎng)種群,初始種群采自漳州,為害絲瓜,該實(shí)驗(yàn)所用種群為同地點(diǎn)同類寄主上野生蟲源連續(xù)復(fù)壯3次后的蟲源.轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫為該種群不同狀態(tài)下(正常飼養(yǎng)、輻照處理、CUE/ME誘導(dǎo)的南亞實(shí)蠅在1日齡(對ME有觸角電位反應(yīng),但沒趨性[7])、5日齡(對ME開始有趨性反應(yīng),但性未成熟)、10日齡(性成熟、交配前后)、17日齡(產(chǎn)卵后)、19日齡(部分實(shí)蠅開始出現(xiàn)二次交配))的混合樣品,委托“北京百邁客生物科技有限公司”建立合格數(shù)據(jù)庫[10].用于基因克隆的RNA為轉(zhuǎn)錄組測序剩余樣品.

        1.2 方 法

        1.2.1 氣味結(jié)合蛋白相關(guān)基因的篩選

        用OBP/odorant-binding protein,PBP/pheromone-binding protein,ABPX /antennal-binding protein X,OB-PRPs /OBP-like/odorant binding protein-like為關(guān)鍵詞在轉(zhuǎn)錄組注釋數(shù)據(jù)庫中進(jìn)行unigene篩選,將這些候選unigene序列與NCBI登陸的相關(guān)序列進(jìn)行比對分析,初步篩選出南亞實(shí)蠅OBPs序列.

        1.2.2 引物設(shè)計(jì)與合成

        基于初步篩選出的南亞實(shí)蠅OBPs序列,各設(shè)計(jì)一對3′端引物和一對5′端引物,所用引物均為北京六合華大基因科技股份有限公司合成,見表1.

        表1 南亞實(shí)蠅OBPs基因克隆的引物列表

        續(xù)表1

        續(xù)表1

        1.2.3 基因克隆

        以轉(zhuǎn)錄組測序剩余的RNA為模板,用Thermo Scientific RevertAid First Strand cDNA Synthesis Kit(Fermentas, EU)試劑逆轉(zhuǎn)錄的cDNA用于保守區(qū)及3′非編碼區(qū)(3′UTR)的擴(kuò)增;用SMARTTMRACE cDNA Amplification kit(Takara,China)試劑逆轉(zhuǎn)錄的cDNA用于5′非編碼區(qū)(5′UTR)的擴(kuò)增.所用PCR體系為25 μL,擴(kuò)增程序和體系參照林麗霞等[11]的方法,退火溫度根據(jù)引物的Tm值做適當(dāng)調(diào)整,延伸時(shí)間按照1 kb需1 min的原則根據(jù)目的片段長度進(jìn)行調(diào)整.PCR產(chǎn)物經(jīng)過1.0%瓊脂糖凝膠電泳驗(yàn)證后,用EzgeneTMGel/PCR Extraction kit(BIOMIGA)試劑盒進(jìn)行目的條帶的回收純化,然后連接T載體,轉(zhuǎn)化后的大腸桿菌涂布于含100 mg·L-1氨芐霉素的 LB培養(yǎng)基中37 ℃黑暗倒置培養(yǎng)約12 h后,挑取單克隆搖菌后以M13F、M13R為引物進(jìn)行PCR檢測,選取陽性克隆菌液送北京六合華大基因科技股份有限公司測序.

        1.2.4 序列分析和進(jìn)化樹構(gòu)建

        對測序得到的基因序列進(jìn)行Blastx比對去載體,用 DNAMAN 6.0軟件拼接后,得到該基因的 cDNA全長.然后用DNAMAN軟件對獲得的OBPs序列進(jìn)行分析.

        對NCBI、公共數(shù)據(jù)庫進(jìn)行檢索,下載黑腹果蠅Drosophilamelanogaster、瓜實(shí)蠅B.cucuribitae、地中海實(shí)蠅Ceratitiscapitata、橘小實(shí)蠅B.dorsalis已公開發(fā)表的OBPs序列,用MEGA 5.0的neighbor-Joining方法構(gòu)建OBPs家族的系統(tǒng)進(jìn)化樹.

        2 結(jié)果與分析

        2.1 南亞實(shí)蠅OBPs的克隆鑒定

        轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫搜索共得到OBPs候選基因32條,進(jìn)一步克隆驗(yàn)證得到OBPs家族基因cDNA 全長26條,見表2.OBPs的典型特征是在二級序列中存在形成 3 對二硫鍵的6 個(gè)保守的半胱氨酸(Cys)殘基[12],根據(jù)Cys的數(shù)目及位置,OBPs分為Minus-OBPs、“Dimer”O(jiān)BPs、非典型 OBPs(Atypical OBPs)、“Plus-C”O(jiān)BPs和典型 OBPs (Classical OBPs)5種主要類型[13].結(jié)構(gòu)分析表明,BtauOBP16和BtauOBP22氨基酸序列缺少第2和第5個(gè)Cys殘基,屬于Minus-OBPs[13];BtauOBP24包含兩個(gè)類似于典型 OBP 的6個(gè)保守的Cys結(jié)構(gòu),為“Dimer”O(jiān)BPs;BtauOBP15與“Plus-C”O(jiān)BPs的結(jié)構(gòu)式Cys-X8-41-Cys-X3-Cys-X39-47Cys-X17-29-Cys4a-X9-Cys-X8-Cys-Pro-X9-11-Cys6a[14]或Cys-X20-41-Cys-X3-Cys-X41-46-Cys-X19-29-Cys4a-X9-Cys-X8-Cys-Pro-X9-10-Cys6a-X9-10[13,15]相吻合,為“Plus-C”O(jiān)BPs;BtauOBP9雖包含 9個(gè)Cys,但與非典型 OBPs的結(jié)構(gòu)式Cys-X26-27-Cys-X3-Cys-X36-38-Cys-X11-15-Cys-X8-Cys[13,16]不吻合,與黑腹果蠅中僅“Plus-C”O(jiān)BPs中Cys5與Cys6之間被9個(gè)氨基酸殘基隔開的特征吻合[15],認(rèn)為其為“Plus-C”O(jiān)BPs;其余OBPs都包含6個(gè)Cys殘基,且符合 Cys-X20-66-Cys-X3-Cys-X21-43-Cys-X8-14-Cys-X8-Cys,Cys-X15-39-Cys-X3-Cys-X21-44-Cys-X7-12-Cys-X8-Cys 或X22-68-Cys-X25-68-Cys-X3-Cys-X31-46-Cys-X8-29-Cys-X8-9-Cys-X5-71[15]的結(jié)構(gòu)特點(diǎn),為典型 OBPs,見圖1所示.

        表2 南亞實(shí)蠅氣味結(jié)合蛋白基因與最匹配的瓜實(shí)蠅氣味結(jié)合蛋白基因比較

        圖1 已克隆的南亞實(shí)蠅OBPs的序列比對圖

        2.2 南亞實(shí)蠅OBPs的同源性分析

        通過與NCBI、公共數(shù)據(jù)庫進(jìn)行比對,成功克隆的南亞實(shí)蠅OBPs序列和瓜實(shí)蠅的OBPs序列表現(xiàn)出高度保守性,如表2所示:僅有3條OBPs的相似度低于95%,分別為BtauOBP2-a (93%),BtauOBP5(92%),BtauOBP15(89%).

        2.3 南亞實(shí)蠅OBPs的進(jìn)化分析

        用MEGA5.0軟件對這26條OBPs序列與黑腹果蠅D.melanogaster(58條)、瓜實(shí)蠅B.cucuribitae(34條)、地中海實(shí)蠅C.capitata(28條)、橘小實(shí)蠅B.dorsalis(47條)OBPs序列進(jìn)行進(jìn)化樹構(gòu)建,1 000次重復(fù)的結(jié)果表明:南亞實(shí)蠅OBPs序列中有16條與瓜實(shí)蠅OBPs聚類數(shù)值達(dá)90以上,說明南亞實(shí)蠅與瓜實(shí)蠅親緣關(guān)系最近(圖2).

        ●表示BtauOBPs;○表示DemlOBPs;▲表示BcucOBPs;圖中分支點(diǎn)的數(shù)字表示Bootstrap驗(yàn)證中基于1 000次重復(fù)該節(jié)點(diǎn)可信度的百分比(%).圖2 MEGA5.0構(gòu)建的南亞實(shí)蠅與黑腹果蠅、地中海實(shí)蠅、橘小實(shí)蠅、瓜實(shí)蠅OBPs的系統(tǒng)發(fā)生關(guān)系

        3 結(jié)論與討論

        伴隨著高通量測序技術(shù)在昆蟲上的應(yīng)用[17-18]和轉(zhuǎn)錄組測序成本的降低,對昆蟲OBPs的研究得到迅速發(fā)展.就實(shí)蠅而言,得益于黑腹果蠅D.melanogaster全基因測序[19-20]的完成及其51個(gè)嗅覺和味覺基因的報(bào)道[15],在地中海實(shí)蠅[21]、蘋果實(shí)蠅、美國核桃實(shí)蠅[22]、橘小實(shí)蠅[23-24]等實(shí)蠅種類上OBPs的研究都得到了較大進(jìn)展,但對南亞實(shí)蠅這一中國危害較嚴(yán)重的4種實(shí)蠅(橘小實(shí)蠅B.dorsalis、瓜實(shí)蠅B.cucuribitae、南亞實(shí)蠅B.tau、柑橘大實(shí)蠅B.minax(Enderlein))中唯一對CUE、ME都有趨性反應(yīng)的實(shí)蠅卻缺乏相關(guān)研究.筆者首次從南亞實(shí)蠅轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)庫中篩選出32條OBPs候選基因,并成功克隆驗(yàn)證出26條,這為下一步研究其OBPs的高級結(jié)構(gòu)和功能提供了條件.同源性分析表明,南亞實(shí)蠅OBPs與瓜實(shí)蠅OBPs同源性很高,與南亞實(shí)蠅對瓜實(shí)蠅引誘劑CUE[8]和信息素[25]產(chǎn)生強(qiáng)烈行為反應(yīng)的研究一致,此為下一步南亞實(shí)蠅、瓜實(shí)蠅引誘劑的改進(jìn)提供了理論依據(jù),但兩種實(shí)蠅無論形態(tài)特征還是寄主譜等都差異很大,這說明要了解實(shí)蠅復(fù)雜的嗅覺機(jī)制只研究氣味結(jié)合蛋白是遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠的,也解釋了為什么自CUE/ME后實(shí)蠅引誘劑沒有實(shí)質(zhì)性突破的原因.

        昆蟲氣味結(jié)合蛋白(OBPs)是廣泛分布于昆蟲觸角感器淋巴液中的一種低分子量的水溶性蛋白[12],昆蟲對寄主植物揮發(fā)物、信息素等化學(xué)信號(hào)的感受,主要通過其還原型與氣味分子發(fā)生特異性結(jié)合,而將外界疏水性的氣味分子運(yùn)載到嗅覺神經(jīng)樹突膜上的感覺受體(olfactory receptor,簡稱OR)來實(shí)現(xiàn)[26].根據(jù)配體差異將OBPs分為GOBP/PBP,CRLBP(chemical-sense-related lipophilic-ligand-binding protein),ABPX(antennal-binding protein X)3類[13].從圖2聚類分析可以看出,BtauOBP3,BtauOBP10,BtauOBP13,BtauOBP20與CRLBP亞類的DemlOBP19d,DemlOBP28a[15]聚在一起,屬于CRLBP亞類;BtauOBP23,BtauOBP2-a,BtauOBP26與ABPX亞類的DemlOBP83a,DemlOBP83b[15]聚在了一起,屬于ABPX亞類.BtauOBP9在進(jìn)化分析中與黑腹果蠅中具有“Plus-C”結(jié)構(gòu)的DemlOBP84a聚在一起,這與結(jié)構(gòu)分析結(jié)果一致;同時(shí),結(jié)構(gòu)差異很大的BtauOBP8也與黑腹果蠅中具有“Plus-C”結(jié)構(gòu)的DemlOBP84a聚在一起,說明要全面了解BtauOBPs的功能必須對其結(jié)構(gòu)進(jìn)行深入研究,這也是筆者后續(xù)要研究的內(nèi)容.

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