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        不同地方豬種背部皮下脂肪中m iR-206差異表達(dá)研究

        2020-02-19 04:18:04顧以韌楊雪梅何志平鐘志君楊躍奎陳曉暉龔建軍應(yīng)三成呂學(xué)斌
        養(yǎng)豬 2020年1期
        關(guān)鍵詞:皮下脂肪豬種四川省

        陶 璇,顧以韌,楊雪梅,梁 艷,何志平,鐘志君,楊躍奎,曾 凱,陳曉暉,王 言,龔建軍,應(yīng)三成,呂學(xué)斌

        (四川省畜牧科學(xué)研究院動(dòng)物遺傳育種四川省重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,四川 成都 610066)

        miRNA是一類長(zhǎng)度約為22個(gè)核苷酸的內(nèi)源性非編碼單鏈RNA,通過(guò)結(jié)合靶基因mRNA的3′UTR,降解靶miRNA或阻止蛋白質(zhì)翻譯,在轉(zhuǎn)錄后負(fù)調(diào)控基因的表達(dá),是基因表達(dá)的重要調(diào)控因子,在細(xì)胞增殖、分化、發(fā)育、代謝、凋亡和腫瘤轉(zhuǎn)移等多種生物學(xué)過(guò)程中起著重要作用[1]。近年來(lái)研究發(fā)現(xiàn),miRNAs與豬脂肪細(xì)胞的生長(zhǎng)、分化和增殖密切相關(guān)[2]。其中,miR-206主要參與細(xì)胞生長(zhǎng)、增殖、凋亡以及細(xì)胞遷移等的調(diào)控,是肌肉特異表達(dá)的miR-1家族成員之一,早期的研究表明,miR-206參與肌肉的生成[3],近年來(lái)發(fā)現(xiàn)miR-206與多種腫瘤的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān),可作為一種腫瘤抑制基因[4];但miR-206與脂肪細(xì)胞的分化、增殖相關(guān)的研究還未見報(bào)道。

        鑒于此,本試驗(yàn)以四川省6個(gè)地方豬種丫杈豬、內(nèi)江豬、成華豬、青峪豬、雅南豬、藏豬為研究對(duì)象,采用熒光定量PCR技術(shù)檢測(cè)miR-206在不同豬種背部皮下脂肪中的表達(dá)差異情況,為進(jìn)一步探明不同豬種脂肪沉積能力及肉質(zhì)差異形成的分子機(jī)制提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)。

        1 材料與方法

        1.1 試驗(yàn)材料

        試驗(yàn)于2015年4—10月在四川省畜牧科學(xué)研究院種豬科研基地進(jìn)行。6個(gè)四川省地方豬種包括丫杈豬、內(nèi)江豬、青峪豬、雅南豬、成華豬、藏豬,每個(gè)豬種隨機(jī)選取3頭健康斷奶仔豬(30日齡),共計(jì)18頭,同一時(shí)間開始組建群體,相同品種同欄飼養(yǎng),采用相同營(yíng)養(yǎng)水平和飼喂方式,達(dá)到6月齡進(jìn)行屠宰,屠宰前停食24 h,自由飲水。屠宰后迅速采集倒數(shù)3~4肋骨間對(duì)應(yīng)處的背部皮下脂肪組織。

        1.2總RNA提取和QRT-PCR

        脂肪組織的RNA按照miRNeasy Mini Kit(Qiagen,China)的操作說(shuō)明書提取,QRT-PCR采用miScriptⅡRT Kit(Qiagen,China)根據(jù)操作說(shuō)明將RNA轉(zhuǎn)錄成cDNA,采用miScript SYBR?Green PCR Kit(Qiagen,China)在CFX96 Real-Time PCR Detection System(Bio-Rad,USA)儀器上進(jìn)行熒光定量檢測(cè),每個(gè)反應(yīng)體系20μL。以5S、18S和U6作為熒光定量PCR的內(nèi)參基因,引物信息見表1。所有目的mRNA定量結(jié)果均通過(guò)熔解曲線分析驗(yàn)證PCR產(chǎn)物的特異性,確保產(chǎn)物無(wú)引物二聚體,每個(gè)樣本重復(fù)3次,每次檢測(cè)含3個(gè)陰性對(duì)照。采用2-ΔΔCt法計(jì)算目的miRNA的相對(duì)表達(dá)量。

        表1 引物信息

        1.3 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析

        運(yùn)用GeNorm軟件計(jì)算看家基因的歸一化因子NF(Normalization factor)值,以目的基因的拷貝數(shù)與對(duì)應(yīng)樣本的NF值的比值表示基因的相對(duì)表達(dá)量。采用SigmaPlot 12.5軟件對(duì)性狀指標(biāo)和基因相對(duì)表達(dá)量進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析(ANOVA),結(jié)果以“平均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差”表示。

        2 結(jié)果與分析

        由表2可知,藏豬miR-206相對(duì)表達(dá)量最高,成華豬次之,青峪豬最低;藏豬miR-206相對(duì)表達(dá)量顯著高于內(nèi)江豬(P<0.05),極顯著高于丫杈豬和青峪豬(P<0.01)。

        表2 不同豬種背部皮下脂肪miR-206相對(duì)表達(dá)量

        3 討論

        脂肪組織不僅是動(dòng)物機(jī)體能量?jī)?chǔ)存的一種形式,還參與調(diào)節(jié)包括食欲和能量消耗等多個(gè)機(jī)體功能,對(duì)繁殖、炎癥和免疫反應(yīng)等多個(gè)復(fù)雜的生理過(guò)程也有重要調(diào)控作用[5]。此外,脂肪還是影響豬經(jīng)濟(jì)價(jià)值和肉質(zhì)風(fēng)味的重要因素[6-7]。因此,研究豬的脂肪代謝不僅有利于改善胴體和肉質(zhì)性能,還有助于推動(dòng)人類肥胖和代謝性疾病的研究。

        為探明豬脂肪沉積性狀相關(guān)基因或調(diào)控因子差異表達(dá)的分子遺傳機(jī)理,近年來(lái)育種學(xué)家已在豬脂肪沉積的調(diào)控機(jī)理方面做了大量研究[8-9],但這些研究主要集中在DNA和mRNA水平的編碼基因,隨著miRNA的發(fā)現(xiàn)和功能研究的深入,從轉(zhuǎn)錄后的miRNA水平探索豬脂肪沉積形成的分子機(jī)理成為了研究的熱點(diǎn)[2],但相關(guān)報(bào)道仍然較少。研究發(fā)現(xiàn),miR-193b、miR-365、miR-196a、miR-133a/b、miR-455在棕色脂肪形成中有重要作用[10-11],miR-128也可通過(guò)靶向基因抑制前體脂肪細(xì)胞的增殖和分化[12-14]。Wang等[15]研究發(fā)現(xiàn),miR-206在1日齡榮昌豬背部皮下脂肪組織中高表達(dá),之后30、90、240日齡表達(dá)水平急劇下降。

        本試驗(yàn)對(duì)四川省6個(gè)地方豬種背部皮下脂肪中miR-206的表達(dá)差異情況進(jìn)行了研究,研究結(jié)果可為進(jìn)一步探明miRNA在豬脂肪沉積中的作用提供參考。

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