陳 琳
天津市第二人民醫(yī)院檢驗科 300192
肝癌是全球范圍內(nèi)最常見一種侵襲性的腫瘤,發(fā)病率在全世界范圍內(nèi)排名第五,是亞洲范圍內(nèi)死亡率的第二位。肝癌發(fā)生的分子機制是相當復雜的,包括細胞周期的失調(diào),凋亡,癌細胞的侵襲和轉(zhuǎn)移。盡管現(xiàn)在肝癌診斷和治療的水平都比較先進,但是肝癌的發(fā)生率和死亡率卻在不斷地增長。因此闡明肝癌發(fā)生的分子機制對提高肝癌的診斷、治療和預后至關重要。
lncRNA是一類轉(zhuǎn)錄本長度超200核苷酸的RNA 分子,它們并不編碼蛋白質(zhì)。lncRNA可以通過多種方式與DNA、RNA、蛋白質(zhì)相互作用從而調(diào)節(jié)DNA的表達和蛋白質(zhì)的合成。它們可以通過激活基因的表達對細胞網(wǎng)絡和發(fā)育進程進行調(diào)節(jié)。很多文獻發(fā)現(xiàn)lncRNA的異常調(diào)節(jié)作用與很多疾病有關,比如心血管疾病,家族遺傳病,神經(jīng)系統(tǒng)疾病,免疫系統(tǒng)失常和癌癥。根據(jù)lcRNA在基因組中的定位將其分為基因內(nèi)、基因間、正義、反義lncRNA。根據(jù)功能其分為信號、誘餌、引導、骨架lncRNA。信號lncRNA主要是作為一種轉(zhuǎn)錄因子或在多種信號通路中起到調(diào)節(jié)作用。誘餌lncRNA作為“分子海綿”通過結(jié)合或隔離轉(zhuǎn)錄因子,使其不能與靶基因結(jié)合。引導lncRNA通過招募染色質(zhì)修飾酶進行染色質(zhì)重塑從而調(diào)節(jié)基因的表達。骨架lncRNA作為招募染色質(zhì)修飾物的支架,與核糖核蛋白(RNP)形成復合物從而調(diào)節(jié)下游信號通路。
在高通量測序和基因芯片技術的幫助下,很多l(xiāng)ncRNA被鑒定出來。它們大多在腫瘤中異常表達,如肝癌、肺癌、乳腺癌、結(jié)腸癌等?,F(xiàn)在文獻已經(jīng)報道了lncRNA參與調(diào)節(jié)細胞增殖、上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化、血管形成、轉(zhuǎn)移、自噬等。在臨床標本像血,尿中可特異性檢測出lncRNA的存在,從而使其具有成為腫瘤標志物的潛在可能。因此,更好的理解肝癌特異性的lncRNA對肝癌的診斷和治療具有很大幫助。
2.1 肝癌高表達轉(zhuǎn)錄本(Highly upregulated in liver cancer, HULC) HULC是一個500堿基對的lncRNA,最早是在肝癌中高表達而被發(fā)現(xiàn),不僅是在肝癌組織,在肝癌細胞系和肝癌病人的血清中HULC也顯著的升高,使其具有成為肝癌生物標志物的潛能。HULC調(diào)節(jié)很多細胞進程,包括增殖、上皮間質(zhì)轉(zhuǎn)化、血管形成、自噬和耐藥性。另外,HULC的過表達與腫瘤的大小、臨床TNM分期、復發(fā)、生存率有關。
Wang等人報道了一個起誘餌作用的HULC,在肝癌細胞中它通過“分子海綿”的功能下調(diào)miR-372的表達[1],間接促進miR-372的靶基因蛋白激酶A催化亞單位β(PRKACB)的表達升高,PRKACB進而活化CAMP效應反應原件結(jié)合蛋白(CREB),CREB又可以反過來誘導HULC的表達,這樣就形成了一個CREB-HULC-miR372-PRKACB的正反饋調(diào)節(jié)通路[1],從而使HULC在肝癌維持高表達水平。研究報道了肝癌中許多HULC這樣類似的調(diào)節(jié)通路,促進肝癌的發(fā)生,如:通過HULC/USP22/Sirt1通路誘導細胞自噬[2]。由此可見HULC具有成為肝癌診斷生物標志物的潛在可能。
2.2 肺腺癌轉(zhuǎn)移相關轉(zhuǎn)錄本1(Metastasis-associated lung adenocarcinoma transcript 1,MALAT1) MALAT1是最早在研究非小細胞肺癌的轉(zhuǎn)移時被發(fā)現(xiàn)的長約8 700個核苷酸的lncRNA,編碼基因位于染色11q13,又被稱作核富集常染色體轉(zhuǎn)錄本2(Nuclera-enriched autosomal transcript 2, NEAT2)。MALAT1在肝癌組織和細胞中均高表達,并且與肝移植后腫瘤復發(fā)有關,暗示了MALAT1在肝癌復發(fā)中起著重要的作用。研究發(fā)現(xiàn)MALAT1與肝癌細胞的多種表型都有關,它可以促進肝癌細胞的生長、侵襲、轉(zhuǎn)移、自噬及耐藥性。MALAT1可以作為內(nèi)源性競爭RNA,與miR-195競爭EGFR結(jié)合,從消除miR-195對表皮生長因子受體(EGFR)的調(diào)控作用,失去調(diào)控的EGFR通過對PI3K/AKT和 JAK/STAT 信號通路的激活,從而促進肝癌細胞的增殖[3]。由此可見,MALAT1可以通過誘餌或內(nèi)源競爭作用調(diào)節(jié)肝癌細胞的進程,暗示著它將來成為肝癌的治療靶位的可能。
3.1 母系表達基因3(Maternally expressed gene 3,MEG3) MEG3第一個被發(fā)現(xiàn)具有腫瘤抑制作用的lncRNA,在很多正常組織中都有表達。最近研究發(fā)現(xiàn)miR-26a和MEG3在肝癌組織中的表達比癌旁正常組織中的表達下降,在肝癌細胞中上調(diào)miR-26a的表達可以使肝癌細胞的增殖、侵襲和遷移能力顯著降低,他們認為DNA甲基轉(zhuǎn)移酶3b(DNMT3B)是miR-26a的直接靶基因,過表達miR-26a抑制了DNMT3B的表達,而封閉DNMT3B的表達則會使MEG3的表達水平升高。另外,在肝癌組織中高水平的DNMT3B和低水平的miR-26a和MEG3呈負相關,這些研究證明了肝癌進展中的一個新機制即miR-26a/DNMT3B/MEG3的調(diào)節(jié)軸的存在[4]。研究證明,TF和NF-κB可以結(jié)合到MEG3的啟動子區(qū)域,影響其轉(zhuǎn)錄,而MEG3的過表達可通過“海綿”作用與miR-664競爭,去除其對乙醇脫氫酶4(ADH4)的抑制作用,從而抑制肝癌細胞的增殖[5]。這些結(jié)果證明MEG3可以作為預測肝癌預后的生物標志物。
3.2 生長停滯特異基因5(Growth arrest specific 5,GAS5) 有研究顯示GAS5在肝癌組織中的表達水平要比癌旁正常組織中的低。GAS5的過表達可以抑制肝癌細胞的增殖、侵襲、促進肝癌細胞的凋亡,并能下調(diào)波形蛋白和上調(diào)E鈣黏素的表達水平[6]。GAS5的過表達可以降低肝癌細胞的遷移和侵襲,而miR-21則可以消除GAS5對肝癌細胞遷移侵襲的影響作用,這意味著GAS5作為一種腫瘤抑制因子是通過負向調(diào)節(jié)miR-21的表達實現(xiàn)的[7]。
越來越多的證據(jù)證明,許多l(xiāng)ncRNA在肝癌發(fā)生中起到了關鍵的作用,或者作為癌基因或是作為抑癌基因。lncRNA的異常表達和癌癥的生長、轉(zhuǎn)移、總體生存率、無病生存率、無復發(fā)生成率和腫瘤的TNM分期都有著顯著的聯(lián)系。多變量分析進一步揭示lncRNA可以獨立的預測肝癌的復發(fā)和轉(zhuǎn)歸。隨著分子診斷學的高速發(fā)展,如測序技術、實時定量PCR、基因芯片技術、RNA免疫共沉淀技術等,使得lncRNA能夠簡單地在各種體液中檢測到,這就為lncRNA作為新型的肝癌診斷和預后標志物打下了基礎。例如,癌基因HULC在肝癌患者的組織和血漿中的表達都異常升高,它就可能成為一種新型的肝癌診斷生物標志物。除了在血漿中,血清和外泌體中也可以用于lncRNA的檢測[8]。例如,HEIH,一種癌基因lncRNA,在肝癌組織中高表達,并且在肝癌患者的血清和外泌體中也一樣表達升高[9]。lncRNA作為癌基因或抑癌基因,在肝癌中異常表達,進而影響到許多下游靶基因及其相關信號通路。使這些異常表達的lncRNA恢復到正常水平是一種值得思考的治療方法,尤其是為那些對化療藥物產(chǎn)生耐受的患者多出一種可選擇的治療方式。因此,明確lncRNA特異性的作用分子機制將會大大提升以lncRNA為基礎的肝癌診斷和治療水平。
肝癌是常見的惡性腫瘤,它的惡性程度高,預后比較差,并且具有很強的侵襲和轉(zhuǎn)移能力。盡管現(xiàn)在有多種治療肝癌的手段,但其臨床療效,復發(fā)率和生存率并不理想。lncRNA在肝癌中的研究越來越多,許多研究證明lncRNA在肝癌發(fā)生,發(fā)展和治療方面都起著重要作用。這種功能使得lncRNA有望成為肝癌診斷和治療的手段,雖然關于lncRNA的研究報道越來越多,使我們了解到許多l(xiāng)ncRNA及其作用的分子機制,然而還需進一步研究去開啟更多關于lncRNA的研究方法,更進一步的證明lncRNA在生物制藥方面的可能性。相信在不久的將來,一些與肝癌相關的lncRNA可能成為肝癌的診斷和預后的生物學標志和治療靶點應用于臨床。