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        LncRNA參與BMSCs成骨相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子及信號(hào)通路的研究進(jìn)展

        2020-02-16 00:57:30何薇許艷華
        醫(yī)學(xué)綜述 2020年12期
        關(guān)鍵詞:信號(hào)

        何薇,許艷華

        (昆明醫(yī)科大學(xué)附屬口腔醫(yī)院正畸科,昆明 650000)

        間充質(zhì)干細(xì)胞(mesenchymal stem cell,MSC)是一種多潛能干細(xì)胞,具有自我更新和多向分化的潛能,可分化為成骨細(xì)胞、脂肪細(xì)胞、軟骨細(xì)胞、肌腱細(xì)胞、成核細(xì)胞和肌細(xì)胞等多種細(xì)胞類(lèi)型[1]。MSC可以從多種類(lèi)型的間充質(zhì)組織中獲得,如骨髓、脂肪、臍帶、胎盤(pán)、肺、肝和皮膚等[2]。與長(zhǎng)骨相比,來(lái)源于頜骨的骨髓間充質(zhì)干細(xì)胞(bone mesenchymal stem cells,BMSCs)具有更強(qiáng)的成骨分化能力[3-4]。隨著對(duì)MSC生物學(xué)和分子遺傳學(xué)等其他領(lǐng)域了解不斷加深,發(fā)現(xiàn)MSC為骨科、自身免疫和缺血性疾病提供了新的治療選擇[5]。人類(lèi)基因組工程的完成,證實(shí)了93%的人類(lèi)基因組能夠轉(zhuǎn)錄成RNA,但只有2%能夠被翻譯成蛋白質(zhì),其余98%的RNA稱為非編碼RNA[6]。長(zhǎng)度超過(guò)200個(gè)核苷酸的非編碼RNA被定義為長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long non-coding RNA,lncRNA)。盡管許多l(xiāng)ncRNA被認(rèn)為可能是轉(zhuǎn)錄噪聲或RNA加工時(shí)的副產(chǎn)物,但越來(lái)越多的證據(jù)表明它們中的很大一部分是功能性的,且參與調(diào)控各種類(lèi)型細(xì)胞的生長(zhǎng)和分化[7-9]。提高BMSCs成骨分化能力是抑制骨吸收、促進(jìn)骨改建的關(guān)鍵。已有研究證實(shí),蛋白編碼基因和小的非編碼RNA參與了BMSCs向成骨細(xì)胞的分化[10]。雖然功能性lncRNA參與了BMSCs的成骨分化,但大多數(shù)lncRNA的功能尚不清楚。BMSCs的表達(dá)和分化是否依賴于LncRNA目前也不清楚?,F(xiàn)就lncRNA參與BMSCs成骨相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子及信號(hào)通路的研究進(jìn)展予以綜述。

        1 lncRNA概述

        近年來(lái),在RNA測(cè)序技術(shù)的幫助下,已經(jīng)確定了數(shù)以千計(jì)的短鏈和長(zhǎng)鏈非編碼RNA,揭示了大多數(shù)基因組實(shí)際上是轉(zhuǎn)錄的,但只有1%~2%的轉(zhuǎn)錄本編碼蛋白質(zhì)[8]。而lncRNA與信使RNA類(lèi)似,通常由RNA聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄并且被剪接和多腺苷酸化,但其沒(méi)有或只有很低編碼潛能。lncRNA主要表現(xiàn)為細(xì)胞類(lèi)型和發(fā)育階段特異性表達(dá)模式,在調(diào)節(jié)多種多樣的細(xì)胞功能方面發(fā)揮著重要作用。基于與附近蛋白質(zhì)編碼基因相關(guān)的基因組位置,可以將lncRNA分為有義、反義、內(nèi)含子、基因間和增強(qiáng)子lncRNA,同時(shí)lncRNA的功能也要復(fù)雜得多。lncRNA在不同的細(xì)胞類(lèi)型中表現(xiàn)出特異性和多樣化的亞細(xì)胞定位,這取決于它們的分子功能。與微RNA(microRNA,miRNA)不同,lncRNA的功能并不局限于與其他RNA相互作用,lncRNA也可與蛋白質(zhì)和DNA相互作用,在不同的細(xì)胞間隔中表現(xiàn)出非常不同的分子功能[11]。首先,lncRNA通過(guò)與蛋白質(zhì)的相互作用,可以作為蛋白質(zhì)復(fù)合物的支架,指導(dǎo)靶向蛋白質(zhì)復(fù)合物(如染色質(zhì)修飾物)到特定的位點(diǎn)[12],然后通過(guò)信號(hào)分子調(diào)控細(xì)胞進(jìn)程,根據(jù)蛋白的亞細(xì)胞定位將蛋白從染色質(zhì)中隔離[13]。其次,核lncRNA也可直接或間接與基因組DNA相互作用,招募表觀遺傳修飾到一個(gè)特定的位點(diǎn),而其他的lncRNA,如 XIST(long non-coding RNA X inactive specific transcript)和H19則結(jié)合鄰近的基因組位點(diǎn),啟動(dòng)基因組印跡[14]。最終,lncRNA通過(guò)控制細(xì)胞剪接、穩(wěn)定性和翻譯,調(diào)節(jié)蛋白質(zhì)編碼轉(zhuǎn)錄物直接與RNA相互作用而發(fā)揮功能[15]。

        2 與lncRNA相關(guān)的轉(zhuǎn)錄因子及信號(hào)通路

        BMSCs向成骨細(xì)胞分化涉及復(fù)雜的信號(hào)通路,且多種細(xì)胞因子參與其中。通過(guò)基因芯片技術(shù)可以分析基因組的序列信息以及基因組之間的差異表達(dá)。Wang等[16]采用基因芯片技術(shù)首次揭示了lncRNA在人BMSCs成骨分化中的表達(dá)譜,在BMSCs成骨分化過(guò)程中共鑒定出1 206個(gè)與成骨表達(dá)差異的lncRNA。同時(shí),有研究者使用微陣列的轉(zhuǎn)錄組譜分析BMSCs成骨分化過(guò)程中有差異表達(dá)的編碼和非編碼基因,并通過(guò)進(jìn)一步的生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),BMSCs成骨分化可能與多種信號(hào)通路相關(guān),且lncRNA參與其中[17]。

        2.1骨形態(tài)發(fā)生蛋白(bone morphogenetic protein,BMP)與lncRNA BMSCs成骨分化受多種細(xì)胞因子和生長(zhǎng)因子的調(diào)控,BMP-2是眾所周知的BMSCs成骨分化的有效誘導(dǎo)因子[18-19]。而 HOX轉(zhuǎn)錄反義RNA(HOX transcript antisense RNA,HOTAIR)是最早發(fā)現(xiàn)的反式作用lncRNA,在胃癌、乳腺癌、肝癌、卵巢癌、急性白血病等多種腫瘤組織和細(xì)胞中均存在HOTAIR的異常表達(dá)[20]。Wei等[21]研究了HOTAIR在非創(chuàng)傷性股骨頭壞死中的成骨分化和增殖作用,提取股骨頭壞死患者的股骨BMSCs,分析HOTAIR在BMP-2誘導(dǎo)的成骨分化過(guò)程中的表達(dá)情況,結(jié)果顯示,成骨細(xì)胞分化誘導(dǎo)因子BMP-2作用后,HOTAIR在BMSCs的表達(dá)顯著降低,提示HOTAIR可能是BMSCs分化過(guò)程中的重要因素;研究還顯示,HOTAIR下調(diào)導(dǎo)致BMP-2誘導(dǎo)的BMSCs中的 Ⅰ 型膠原α1鏈信使RNA表達(dá)增加,堿性磷酸酶(alkaline phosphatase,ALP)活性升高。這些數(shù)據(jù)證實(shí)HOTAIR是成骨分化的調(diào)節(jié)因子,也與股骨頭壞死疾病相關(guān)。Li等[22]也確定了一種lncRNA,即Bmncr,Bmncr在衰老過(guò)程中可以調(diào)節(jié)BMSCs的命運(yùn),Bmncr通過(guò)維持細(xì)胞外基質(zhì)蛋白纖維調(diào)節(jié)素和激活BMP-2途徑來(lái)調(diào)節(jié)BMSCs的成骨,Bmncr通過(guò)細(xì)胞外基質(zhì)蛋白纖維調(diào)節(jié)素介導(dǎo)的細(xì)胞黏附于骨表面,激活BMP-2通路,操縱BMSCs成骨穩(wěn)態(tài)環(huán)境,影響細(xì)胞成骨過(guò)程。

        與其他BMPs不同,BMP-1不屬于轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子-β(transforming growth factor-β,TGF-β)超家族,BMP-1可以誘導(dǎo)骨和軟骨發(fā)育。Zhang等[23]研究發(fā)現(xiàn),miR-29b-3p在骨質(zhì)疏松中高表達(dá),通過(guò)熒光素酶活性可以測(cè)定BMP-1是miR-29b-3p的靶基因;進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),lncRNA核富集轉(zhuǎn)錄體1(nuclear enriched transcript 1,NEAT1)對(duì)BMP-1具有正調(diào)節(jié)作用,同時(shí)lncRNA NEAT1對(duì)miR-29b-3p具有負(fù)調(diào)節(jié)作用,NEAT1通過(guò)調(diào)節(jié)miR-29b-3p/BMP軸促進(jìn)BMSCs的成骨分化。這項(xiàng)研究確定了BMP-1和NEAT1在骨質(zhì)疏松癥中的潛在作用,有助于了解骨質(zhì)疏松癥的發(fā)病機(jī)制,并找到治療骨質(zhì)疏松癥的新靶點(diǎn)。經(jīng)過(guò)進(jìn)一步的研究,利用生物信息軟件分析發(fā)現(xiàn),MSX1(muscle segment homeobox-1)、BMP-1和Smurf1這3個(gè)成骨基因周?chē)嬖谙嚓P(guān)聯(lián)的lncRNA,其中2個(gè)lncRNA(AF289591和uc003xbe)與成骨基因BMP-1相關(guān)[24]。

        BMP-4是BMP家族的另一個(gè)成員,對(duì)BMSCs生長(zhǎng)調(diào)節(jié)、分化和存活起關(guān)鍵作用[25]。BMP-4是神經(jīng)系統(tǒng)發(fā)育過(guò)程中重要的形成蛋白,研究發(fā)現(xiàn),BMP-4也參與成骨,lncRNA母系表述基因3(maternally expressed gene 3,MEG3)過(guò)表達(dá)可通過(guò)靶向調(diào)控BMP-4轉(zhuǎn)錄促進(jìn)BMSCs成骨分化,位于BMP-4基因附近的MEG3可以使轉(zhuǎn)錄因子SOX2(SRY related HMG box-2)與BMP-4啟動(dòng)子解離,從而影響細(xì)胞成骨,提示lncRNA MEG3的表達(dá)可以為治療多發(fā)性骨髓瘤提供新的證據(jù)[26]。

        2.2Runx蛋白家族與lncRNA Runx2屬于Runx蛋白家族,是一種能誘導(dǎo)BMSCs向成骨細(xì)胞分化和成熟的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子,在骨修復(fù)與重建中發(fā)揮重要作用[27]。使用lncRNA芯片分析糖皮質(zhì)激素處理的BMSCs中l(wèi)ncRNA TCONS_00041960的表達(dá)情況,發(fā)現(xiàn)TCONS_00041960的上調(diào)促進(jìn)了成骨基因Runx2的表達(dá)[28]。Zhuang等[29]對(duì)來(lái)自健康供體和青少年特發(fā)性脊柱側(cè)凸(adolescent idiopathic scoliosis,AIS)患者的BMSCs進(jìn)行微陣列分析,結(jié)果發(fā)現(xiàn),一種新的lncAIS(基因符號(hào):ENST00000453347)與AIS患者BMSCs成骨有關(guān),AIS BMSCs中的lncAIS下調(diào)不能募集核因子蛋白90,且消除了同源異形盒D8(homeobox gene D8,HOXD8)信使RNA的穩(wěn)定性,阻礙了Runx2轉(zhuǎn)錄,阻止了細(xì)胞成骨分化。Cui等[30]用不同濃度的葡萄球菌蛋白A對(duì)人BMSCs進(jìn)行處理,模擬體外炎癥微環(huán)境,使用lncRNA微陣列分析在葡萄球菌蛋白A觸發(fā)的炎癥微環(huán)境中BMSCs成骨分化期間lncRNA和信使RNA的完整表達(dá)譜,結(jié)果發(fā)現(xiàn),用NONHSAT009968慢病毒感染來(lái)沉默BMSCs中NONHSAT009968的表達(dá),Runx2的活性增加,表明lncRNA NONHSAT009968可能是促進(jìn)成骨細(xì)胞形成的新靶點(diǎn)。

        2.3Wnt/β聯(lián)蛋白(β-catenin)信號(hào)通路與lncRNA lncRNA可以通過(guò)調(diào)節(jié)信號(hào)通路激活BMSCs調(diào)節(jié)成骨。Wnt/β-catenin信號(hào)網(wǎng)絡(luò)與干細(xì)胞自我更新和分化密切相關(guān),可以控制干細(xì)胞的命運(yùn)[31-32]。lncRNA肝癌高表達(dá)轉(zhuǎn)錄本(highly up-reglated in liver cancer,HULC)是各種人類(lèi)疾病發(fā)展的重要調(diào)節(jié)因子,通過(guò)轉(zhuǎn)染改變BMSCs中HULC和miR-195的表達(dá),發(fā)現(xiàn)HULC過(guò)表達(dá)可下調(diào)miR-195,增強(qiáng)Wnt/β-catenin信號(hào)通路的表達(dá)[33]。lncRNA-p21與Wnt/β-catenin也密切相關(guān),Xia等[34]從8周齡和18個(gè)月大的雄性C57BL/6小鼠中分離出BMSCs,發(fā)現(xiàn)沉默老齡小鼠BMSCs中的lncRNA-p21后,通過(guò)Wnt/β-catenin途徑相互作用可以提高老齡化小鼠的BMSCs成骨能力。提示靶向調(diào)控lncRNA-p21可能對(duì)恢復(fù)老年個(gè)體中的內(nèi)源性MSC具有重要的治療意義。另一項(xiàng)研究抑制了腫瘤低表達(dá)lncRNA(low expression in tumor,LET),結(jié)果促進(jìn)了BMSCs增殖,LET可負(fù)調(diào)控BMSCs中TGF-β1的表達(dá),小濃度的TGF-β1通過(guò)激活Wnt/β-catenin途徑促進(jìn)BMSCs的增殖[35]。因此,可通過(guò)抑制LET上調(diào)TGF-β1的表達(dá),激活Wnt/β-catenin途徑,促進(jìn)BMSCs增殖[32]。含BED型鋅指蛋白3(zinc finger BED-type containing 3,ZBED3)是MSC中表達(dá)最高的lncRNA之一,具有促進(jìn)骨形成分化的能力。Hu等[36]成功建立了骨損傷模型,結(jié)果顯示,上調(diào)的ZBED3通過(guò)激活Wnt/β-catenin信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑降低白細(xì)胞介素-1β的表達(dá),從而促進(jìn)BMSCs的分化和增強(qiáng)骨再生。這些研究從不同層面驗(yàn)證了lncRNA參與了BMSCs的成骨分化,同時(shí)激活或抑制成骨相關(guān)蛋白的表達(dá)。

        2.4TGF-β與lncRNA TGF-β是BMP超家族成員之一,在骨基質(zhì)中高表達(dá),與成骨細(xì)胞分化和骨發(fā)育密切相關(guān),TGF-β對(duì)體外多種細(xì)胞的增殖和分化具有顯著影響,對(duì)骨吸收具有復(fù)雜的作用,可抑制破骨細(xì)胞的形成和破骨細(xì)胞活性[37]。SIRT1(sirtuin 1)能夠使β-catenin去乙?;源龠M(jìn)其在細(xì)胞核中的積累,這與BMSCs分化相關(guān)的基因轉(zhuǎn)錄有關(guān);此外,SIRT1在BMSCs向成骨細(xì)胞的分化中起關(guān)鍵作用,SIRT1激活及抑制化合物可分別增加和減少成骨細(xì)胞標(biāo)志物和骨礦化的表達(dá),提示SIRT1表達(dá)的變化與成骨細(xì)胞分化有關(guān);而且,TGF-β配體激活TGF-β受體啟動(dòng)Smad3信號(hào),Smad3信號(hào)又可以協(xié)同激活SIRT1轉(zhuǎn)錄[38]。缺氧誘導(dǎo)因子-1α(hypoxia inducible factor 1α,HIF-1α)是在缺氧感受與缺氧誘導(dǎo)方面發(fā)揮重要功能的轉(zhuǎn)錄因子,Xu等[39]研究人BMSCs中l(wèi)ncRNA HIF-1α成骨細(xì)胞分化,結(jié)果發(fā)現(xiàn),TGF-β可抑制BMSCs中SIRT1的表達(dá),低水平的SIRT1導(dǎo)致lncRNA HIF-1α上調(diào),相反SIRT1的過(guò)表達(dá)導(dǎo)致lncRNA HIF-1α-AS1下調(diào),通過(guò)促進(jìn)乙?;瘉?lái)增強(qiáng)同源異形盒D10(homeobox gene D10,HOXD10)的表達(dá),而HOXD10表達(dá)在促進(jìn)成骨細(xì)胞分化中起重要作用,因此TGF-β通過(guò)SIRT1和lncRNA HIF-1α-AS1導(dǎo)致BMSCs分化為成骨細(xì)胞。提示HIF-1α-AS1是成骨細(xì)胞分化的重要介質(zhì),并因此可以作為基因治療劑用于人骨疾病的治療。另外,lncRNA H19也與骨關(guān)節(jié)炎、骨質(zhì)疏松息息相關(guān),Huang等[40]發(fā)現(xiàn),人BMSCs成骨分化后lncRNA H19顯著上調(diào),H19可協(xié)調(diào)miR-675抑制TGF-β1信使RNA和蛋白的表達(dá),而TGF-β1下調(diào)后可抑制Smad3磷酸化,該研究發(fā)現(xiàn)了一條新途徑,即H19/miR-675/TGF-β1/Smad3/組蛋白去乙?;?histone deacetylase,HDAC)途徑,調(diào)節(jié)BMSCs的成骨分化。lncRNA H19作為競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源RNA還可以調(diào)節(jié)Wnt/β-catenin途徑,這也揭示了lncRNA在協(xié)調(diào)骨生成中的作用[41]。

        2.5促分裂原活化的蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)信號(hào)與lncRNA MAPK家族調(diào)控BMSCs的分化、礦化和增殖[42]。p38是MAPK通路的成員之一,是調(diào)節(jié)炎癥、細(xì)胞分化、細(xì)胞生長(zhǎng)、死亡等多種過(guò)程的重要調(diào)控因子[43]。目前已有研究證實(shí),p38 MAPK信號(hào)通路的激活是BMSCs成骨分化的關(guān)鍵觸發(fā)因子[44]。Zhang等[45]研究發(fā)現(xiàn),lncRNA分化拮抗非蛋白編碼RNA(discrimination antagonising non-protein coding RNA,DANCR)參與了人來(lái)源的BMSCs的成骨分化,DANCR通過(guò)p38 MAPK通路調(diào)控增殖和成骨分化;為了闡明p38 MAPK對(duì)DANCR相關(guān)細(xì)胞增殖和成骨分化的影響,將轉(zhuǎn)染si-DANCR的BMSCs用特異性p38抑制劑SB203580處理,結(jié)果發(fā)現(xiàn),DANCR上調(diào)導(dǎo)致p38 MAPK通路失活,DANCR與MAPK通路的關(guān)聯(lián)可能為骨形成分化調(diào)控機(jī)制提供新的見(jiàn)解。

        骨質(zhì)疏松癥是一種嚴(yán)重的慢性系統(tǒng)性骨質(zhì)疏松疾病,其特征在于低骨密度(bone mineral density,BMD)和結(jié)構(gòu)障礙。研究表明,BMSCs的異常分化是絕經(jīng)后婦女骨質(zhì)疏松癥發(fā)生的最根本原因,骨質(zhì)疏松癥患者BMD低表達(dá)和β-Ⅰ型膠原羧基端肽(β-carboxyl terminal peptide of typeⅠcollagen,β-CTx)高表達(dá)[46]。Jiang等[47]通過(guò)實(shí)驗(yàn)創(chuàng)建小鼠骨質(zhì)疏松模型,測(cè)量小鼠脊柱的BMD、血清β-CTX水平和ALP活性,結(jié)果發(fā)現(xiàn),BMD降低,β-CTx和核仁小分子RNA宿主基因1(small nucleolar RNA host gene 1,SNHG1)表達(dá)增加。在成骨誘導(dǎo)劑刺激的BMSCs中,ALP活性和磷酸化p38蛋白水平升高,SNHG1表達(dá)下調(diào);同時(shí)SNHG1過(guò)表達(dá)增強(qiáng)了神經(jīng)前體細(xì)胞表達(dá)下調(diào)因子4(neural precursor cell down-regulation factor 4,NEDD4)和磷酸化p38之間的相互作用,破壞了磷酸化p38的蛋白質(zhì)穩(wěn)定性,并促進(jìn)了磷酸化p38的泛素化,而泛素化又是一種重要的翻譯后調(diào)控機(jī)制,由泛素-活化酶(E1)、泛素綴合酶(E2)和泛素-連接酶(E3)介導(dǎo)[48]。已經(jīng)證實(shí),E3家族成員在成骨分化中發(fā)揮重要作用[49]。在E3泛素連接酶中,Nedd4可通過(guò)介導(dǎo)泛素化和降解骨肉瘤細(xì)胞抑制p38活化[50]。Jiang等[47]的實(shí)驗(yàn)證明,lncRNA SNHG1通過(guò)Nedd4介導(dǎo)的泛素化負(fù)向調(diào)節(jié)p38 MAPK信號(hào)通路的調(diào)節(jié)機(jī)制,從而抑制BMSCs的成骨分化。Zheng等[51]也成功建立了SD大鼠骨質(zhì)疏松模型,通過(guò)即時(shí)聚合酶鏈反應(yīng)檢測(cè)lncRNA肺腺癌轉(zhuǎn)移相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子1(metastasis-associated lung adenocarcinoma transcript 1,MALAT1)在骨質(zhì)疏松大鼠和正常大鼠中的表達(dá),培養(yǎng)并轉(zhuǎn)染BMSCs以建立MALAT1敲低模型,結(jié)果發(fā)現(xiàn),lncRNA MALAT1在骨質(zhì)疏松大鼠中低表達(dá);此外,lncRNA MALAT1通過(guò)增強(qiáng)MAPK信號(hào)通路的激活來(lái)抑制BMSCs的成骨分化,從而促進(jìn)骨質(zhì)疏松癥進(jìn)程。這些研究均表明lncRNA參與MAPK通路,從而影響B(tài)MSCs的成骨過(guò)程。

        3 小 結(jié)

        lncRNA在發(fā)育和分化過(guò)程中對(duì)基因表達(dá)的控制起著至關(guān)重要的作用。與miRNA不同,lncRNA可以折疊成復(fù)雜的二級(jí)結(jié)構(gòu)和高階結(jié)構(gòu),為蛋白質(zhì)和目標(biāo)識(shí)別提供更大的潛力和通用性。多種lncRNA參與了BMSCs的成骨分化,lncRNA在調(diào)節(jié)BMSCs增殖方面顯示出令人鼓舞的趨勢(shì),而且這些lncRNA與各種骨疾病有著不可分割的關(guān)系。通過(guò)闡述lncRNA相關(guān)的重要的成骨相關(guān)因子和信號(hào)通路,證明了lncRNA與BMSCs的成骨相關(guān),而且這些lncRNA也與骨相關(guān)疾病密切相關(guān)。然而,lncRNA參與BMSCs病理過(guò)程中的具體調(diào)節(jié)機(jī)制,還需要進(jìn)行深入的研究。

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