余永佳,梁倫,黃瑋,石琦
(1.廣西醫(yī)科大學(xué)第一附屬醫(yī)院神經(jīng)外科,南寧530021; 2.中山大學(xué)腫瘤防治中心 華南腫瘤學(xué)國家重點實驗室,廣州 510060)
膠質(zhì)瘤作為中樞神經(jīng)系統(tǒng)最常見、最危險且最具侵略性的原發(fā)性腦腫瘤,是一種來源于神經(jīng)外胚層的神經(jīng)腫瘤,好發(fā)于5~8歲的兒童,具有明顯的性別特異性,男童的發(fā)病風(fēng)險約是女童的1.3倍[1]。由于膠質(zhì)瘤細胞常浸潤周圍正常組織的淋巴結(jié),因此手術(shù)切除成功率較低。術(shù)后腫瘤細胞的浸潤擴散一直是患兒死亡、復(fù)發(fā)的主要原因,探求膠質(zhì)瘤細胞進展、復(fù)發(fā)的分子機制對于臨床治療具有重要意義。雖然腦膠質(zhì)瘤的分子機制、遺傳機制以及相關(guān)通路已被廣泛研究,但其確切的發(fā)病機制仍未闡明[2]。在基因水平以及分子水平掌握腦膠質(zhì)瘤的發(fā)生機制,可為腦膠質(zhì)瘤的治療提供新途徑,是目前學(xué)者關(guān)注的焦點。近年來的研究顯示,一些長鏈非編碼RNA(long noncoding RNA,LncRNA)的異常表達與腦膠質(zhì)瘤的復(fù)發(fā)以及臨床預(yù)后密切相關(guān)[3],其可作為膠質(zhì)瘤潛在的生物標志、預(yù)后指標,甚至治療靶點?,F(xiàn)就目前報道的LncRNA對腦膠質(zhì)瘤的調(diào)控作用進行綜述,進一步探討LncRNA在腦膠質(zhì)瘤診斷、治療中的應(yīng)用前景。
1.1LncRNA概述 非編碼RNA包括短小RNA[如微RNA(microRNA,miRNA)、小干擾RNA和Piwi互作RNA等]和LncRNA。隨著研究的深入,以前認為不具有生物學(xué)功能的LncRNA也逐漸被人們所認識,并發(fā)現(xiàn)具有某些生物調(diào)節(jié)功能,包括腫瘤的發(fā)生發(fā)展、胚胎發(fā)育以及物質(zhì)代謝等[4]。近年來研究發(fā)現(xiàn),LncRNA可調(diào)節(jié)基因表達,其對基因表達的調(diào)節(jié)主要通過DNA、RNA以及蛋白質(zhì)間的相互作用實現(xiàn)[5]。LncRNA有助于蛋白質(zhì)的激活以及去激活,而這種調(diào)節(jié)作用通過DNA與蛋白質(zhì)結(jié)合實現(xiàn)[6]。
1.2LncRNA的作用機制及其功能 LncRNA在細胞中具有如下功能。①信號調(diào)控:LncRNA的轉(zhuǎn)錄調(diào)控具有暫時性和明顯的組織特性,其作為分子信號可對基因進行選擇性表達調(diào)控。②分子導(dǎo)向:LncRNA對靶基因具有調(diào)控作用,引導(dǎo)核糖體蛋白復(fù)合體與特定的染色體位點結(jié)合。③分子誘導(dǎo):LncRNA通過招募相應(yīng)的RNA結(jié)合蛋白調(diào)控靶基因轉(zhuǎn)錄[7]。研究顯示,人第10號染色體缺失的磷酸酶及張力蛋白同源的基因(phosphatase and tensin homologue deleted on chromosome ten gene,PTEN)的假基因可與PTEN競爭性結(jié)合miRNA,從而調(diào)控PTEN的表達,具備這種作用的LncRNA又被稱為ceRNA。④分子支架:LncRNA可提供相應(yīng)的分子支架,從而為蛋白質(zhì)復(fù)合體的形成提供裝配平臺,激活或抑制基因的轉(zhuǎn)錄。
2.1促癌基因
2.1.1HOX轉(zhuǎn)錄反義RNA(HOX transcript antisense RNA,HOTAIR) HOTAIR是腫瘤轉(zhuǎn)化過程中具有重要作用的LncRNA。研究顯示,級別越高的膠質(zhì)瘤HOTAIR的表達水平越高,多變量Cox回歸分析顯示,HOTAIR是腦膠質(zhì)瘤的一個獨立預(yù)后因素,HOTAIR的表達與膠質(zhì)瘤分子亞型及惡性等級呈正相關(guān)[8]。此外,HOTAIR的表達也參與膠質(zhì)瘤的細胞周期進程,抑制HOTAIR的表達可抑制膠質(zhì)瘤細胞的克隆增殖,將細胞阻滯于G0/G1期,從而有效抑制原位腫瘤的生長;反之,HOTAIR的高表達可促進膠質(zhì)瘤細胞生長,導(dǎo)致腦膠質(zhì)瘤患者生存期縮短[9]。HOTAIR主要通過以下機制發(fā)揮作用[10]:①作為小分子RNA的前體分子發(fā)揮作用;②與鄰近基因上游啟動子轉(zhuǎn)錄區(qū)作用,干擾蛋白編碼基因,同時與基因轉(zhuǎn)錄本形成互補雙鏈,調(diào)控基因的表達;③抑制RNA聚合酶Ⅱ或介導(dǎo)染色質(zhì)重構(gòu),從而調(diào)控基因的表達??傊?,HOTAIR表達上調(diào)可從多方面促進腦膠質(zhì)瘤的生長,成為影響患者臨床預(yù)后的因素之一。
2.1.2抗一氧化氮合酶2A(anti nitric oxide synthetase 2A,anti-NOS2A) 在多種腫瘤細胞中檢出anti-NOS2A的表達,其通過有效調(diào)節(jié)相鄰基因一氧化氮合酶2A(nitric oxide synthetase 2A,NOS2A)的表達,參與胚胎干細胞的神經(jīng)分化[11]。研究顯示,腦膠質(zhì)瘤患者中NOS2A呈高表達,且表達水平與腫瘤惡性程度密切相關(guān)[12];此外,NOS2A可促進膠質(zhì)瘤干細胞增殖,同時提示anti-NOS2A可通過調(diào)控NOS2A的表達,參與腫瘤的惡性生長過程。
2.1.3H19 H19是多種腫瘤潛在的致癌LncRNA之一。H19作為miRNA的前體基因,可促進腦膠質(zhì)瘤細胞生長。研究顯示,H19外顯子miR-675可顯著抑制周期蛋白依賴性激酶6的表達,而周期蛋白依賴性激酶6作為調(diào)節(jié)細胞周期的關(guān)鍵因子之一,參與腦膠質(zhì)瘤細胞的生長過程,因此H19可促進腦膠質(zhì)瘤細胞的增殖和遷移[13]。有報道顯示,H19在腦膠質(zhì)瘤中的表達與腫瘤細胞的耐藥性密切相關(guān),使用替莫唑治療腦膠質(zhì)瘤時,H19處于低表達狀態(tài),同時膠質(zhì)瘤存活細胞減少[14]。腫瘤干細胞具有自我更新能力,并可促進腫瘤的發(fā)生發(fā)展,同時腫瘤干細胞具有誘導(dǎo)腫瘤耐藥性增加的作用。H19作為胎盤中表達量最高的一種LncRNA,在胎盤內(nèi)胚層和中胚層中具有較高的表達水平,而胎兒出生后H19表達明顯降低[15]。因此有學(xué)者認為H19是保持干細胞能力的重要調(diào)控因子,也是維持腫瘤干細胞功能的重要基因。進一步研究顯示,H19在腦膠質(zhì)瘤細胞中過表達,而這種過表達促進了膠質(zhì)瘤的發(fā)生發(fā)展以及侵襲轉(zhuǎn)移,H19可作為腦膠質(zhì)瘤的治療靶點之一[16]。目前對于H19的確切作用機制尚未完全闡明,仍有待深入研究。
2.1.4肺腺癌轉(zhuǎn)移相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子1(metastasis-associated lung adenocarcinoma transcript 1,MALAT1) MALAT1是最早發(fā)現(xiàn)的與人類腫瘤發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)的LncRNA之一,最初在肺癌組織中發(fā)現(xiàn)MALAT1的高表達,并與肺癌患者的生存預(yù)后密切相關(guān)[17]。近年來,在結(jié)直腸癌、胃癌、膽囊癌以及鼻咽癌等多種惡性腫瘤組織中也檢出MALAT1的異常表達[18]。有學(xué)者檢測了正常腦組織、低級別膠質(zhì)瘤以及高級別膠質(zhì)瘤中MALAT1的表達情況,結(jié)果顯示,MALAT1的表達與膠質(zhì)瘤級別以及腫瘤大小密切相關(guān),同時也是影響患者預(yù)后的獨立危險因素[19]。研究證實,MALAT1可通過調(diào)控轉(zhuǎn)錄后修飾,誘導(dǎo)基質(zhì)金屬蛋白酶9表達,促進腫瘤侵襲,進而影響患者預(yù)后,并認為MALAT1的作用機制與激活胞外信號調(diào)節(jié)激酶/促分裂原活化的蛋白激酶信號通路有關(guān);同時,MALAT1可與未甲基化的染色盒同源物4相互作用,調(diào)控基因定位,決定基因的表達[20]。
2.1.5核富含豐富的轉(zhuǎn)錄本1(nuclear enriched abundant transcript 1,NEAT1) NEAT1位于人類第11號染色體上一個被稱為多發(fā)性內(nèi)分泌瘤?、裥偷幕蛭稽c,由RNA聚合酶Ⅱ轉(zhuǎn)錄而來,與胃腺癌、結(jié)核病、卵巢癌、肝癌、鼻咽癌等多種疾病的發(fā)生發(fā)展密切相關(guān)[21]。在腦膠質(zhì)瘤患者中也檢出LncRNA NEAT1的異常表達,高表達LncRNA NEAT1者5年生存率顯著降低,認為LncRNA NEAT1可作為預(yù)測膠質(zhì)瘤患者預(yù)后的潛在生物學(xué)標志物之一[3]。
2.1.6結(jié)直腸癌差異性表達相關(guān)基因(colorectal neoplasia differentially expressed,CRNDE) CRNDE是結(jié)直腸腫瘤的非編碼RNA,是一種具有多種生物學(xué)功能的LncRNA。在神經(jīng)膠質(zhì)瘤組織中發(fā)現(xiàn)了129個LncRNA差異表達,其中LncRNA CRNDE被認為是具有正向調(diào)節(jié)能力的LncRNA[22]。LncRNA CRNDE在腦膠質(zhì)瘤組織中高表達,且不同組織亞型的腦膠質(zhì)瘤中CRNDE表達水平也不同[23]。研究顯示,CRNDE高表達與表皮生長因子基因的表達密切相關(guān),表皮生長因子高表達的腫瘤同時伴隨著CRNDE的高表達,但兩者在腦膠質(zhì)瘤細胞分化中的作用機制尚不明確[24]。
有學(xué)者認為神經(jīng)膠質(zhì)瘤干細胞的增殖與CRNDE的過表達有關(guān),在膠質(zhì)瘤細胞中CRNDE呈高表達,同時檢出表皮生長因子的過度擴增,這種異常表達一定程度上調(diào)控了神經(jīng)膠質(zhì)瘤干細胞的增殖[25]。此外,CRNDE可調(diào)控其靶基因X連鎖凋亡抑制蛋白和p21活化激酶7的表達,進一步促進神經(jīng)膠質(zhì)瘤干細胞的增殖。Wang等[26]研究顯示,在神經(jīng)膠質(zhì)瘤細胞中CRNDE過表達,并可能通過哺乳動物雷帕霉素靶蛋白信號轉(zhuǎn)導(dǎo)路徑促進腫瘤細胞生長。綜上,CRDNE可通過多種信號途徑促進膠質(zhì)瘤的發(fā)生以及進展。
2.1.7X-無效的特異性轉(zhuǎn)錄物(X-inactive specific transcript,XIST) XIST是一種調(diào)節(jié)X染色體失活的重要基因。在人類細胞分化、增殖以及基因組修復(fù)過程中XIST發(fā)揮著重要作用,XIST表達異??赏苿影┌Y進展。對人惡性膠質(zhì)瘤干細胞中XIST基因進行分析發(fā)現(xiàn),在膠質(zhì)瘤細胞中XIST呈高表達,采用生物技術(shù)敲除XIST基因后,腫瘤細胞可出現(xiàn)增殖抑制、誘導(dǎo)凋亡等生物學(xué)效應(yīng),發(fā)揮腫瘤抑制作用[27]。
2.2抑癌基因
2.2.1母系表達基因3(maternally expressed gene 3,MEG3) MEG3在人體正常組織中均有表達,在腦和垂體中表達程度最高。研究顯示,MEG3是腦膠質(zhì)瘤發(fā)生發(fā)展過程中的重要調(diào)節(jié)和控制因子,是一種對腫瘤發(fā)生發(fā)展有明顯抑制作用的LncRNA[28]。MRG3在正常腦組織中高表達,在腦膠質(zhì)瘤中低表達,當(dāng)膠質(zhì)瘤細胞株過表達MEG3后可有效抑制腫瘤細胞的增殖,促進腫瘤細胞凋亡,并認為這種抗增殖作用與p53信號通路的激活有關(guān)[28]。Islam等[29]建立了MEG3基因敲除小鼠模型,認為MEG3敲除后可導(dǎo)致腦微血管形成增加,從而有利于腫瘤細胞的生長和增殖。綜上,MEG3基因可能成為未來人類腦膠質(zhì)瘤治療的潛在靶點。
2.2.2金屬肽酶含血小板反應(yīng)蛋白1型基序9反義RNA2(ADAM metallopeptidase with thrombospondin type 1 motif 9 antisense RNA 2,ADAMTS9-AS2)
ADAMT-S9是一種重要的抗血管生成因子,其通過抑制血管內(nèi)皮生長因子和成纖維細胞生長因子,從而有效抑制腫瘤細胞的轉(zhuǎn)移[30]。研究顯示,ADAMT-AS2在乳腺癌、鼻咽癌、胃癌等多種腫瘤中發(fā)揮抑癌作用,抑制ADAMT-AS2的靶物質(zhì)可延緩膠質(zhì)瘤侵襲[31]。在腫瘤組織中,惡性程度越高的腫瘤,ADAMTS9-AS2的表達水平越低,而ADAMTS9-AS2的高表達對腦膠質(zhì)瘤進展有明顯的抑制作用[32]。ADAMTS9-AS2有望成為腦膠質(zhì)瘤治療的潛在靶點之一。
腫瘤與正常組織間LncRNA的表達存在差異,這為LncRNA在膠質(zhì)瘤診斷和預(yù)測中的應(yīng)用提供了依據(jù)。不同病理亞型的膠質(zhì)瘤細胞LncRNA的表達存在差異。星形膠質(zhì)瘤與少突細胞膠質(zhì)瘤之間存在多種LncRNA的差異表達,通過這些差異表達的LncRNA可以將星形細胞膠質(zhì)瘤與少突細胞膠質(zhì)瘤區(qū)分開來[33]。通過分析TCGA(The Cancer Genome Atlas)數(shù)據(jù)庫中患者的資料,確定了6種LncRNA與患者的總體生存期密切相關(guān),分別為KIAA0495、GAS5、PART1、MGC21881、MIAT、PAR5[34]。以上研究提示LncRNA在腦膠質(zhì)瘤診斷和預(yù)后預(yù)測中具有價值。
研究顯示,MALAT1的表達與膠質(zhì)瘤患者的臨床病理特征有一定的聯(lián)系,MALAT1在膠質(zhì)瘤組織中高表達,且表達水平與腫瘤分級及腫瘤體征呈正相關(guān),推測MALAT1的過表達可加速膠質(zhì)瘤的生長[35]。此外,MALAT1的表達與腦膠質(zhì)瘤患者的總體生存期呈負相關(guān)[33]。
HOTAIR的表達與腦膠質(zhì)瘤的級別以及預(yù)后密切相關(guān),多變量Cox回歸分析顯示,HOTAIR是預(yù)測膠質(zhì)瘤患者預(yù)后的獨立因素,進一步證實HOTAIR的表達與膠質(zhì)瘤分子亞型以及癌癥基因組圖譜之間具有密切聯(lián)系,膠質(zhì)瘤細胞中HOTAIR的表達與腫瘤惡性程度呈正相關(guān),而惡性程度越高,臨床預(yù)后越差[36]。此外,HOTAIR的表達也參與了膠質(zhì)瘤細胞周期進程,其中HOTAIR低表達可抑制腫瘤細胞增殖,將腫瘤細胞阻滯于G0/G1期,從而抑制原位腫瘤的生長;反之,HOTAIR高表達會促進膠質(zhì)瘤細胞生長,導(dǎo)致患者生存期縮短[37]。因此,HOTAIR可作為評估惡性腦膠質(zhì)瘤患者預(yù)后的指標。HOTAIR的表達在惡性腦膠質(zhì)瘤組織中上調(diào),HOTAIR敲除可發(fā)揮腫瘤抑制功能,其機制可能為miR-326作為HOTAIR的作用靶點,當(dāng)HOTAIR低表達時可導(dǎo)致miR-326基因表達上調(diào),從而激活磷脂酰肌醇-3-激酶/蛋白激酶B信號通路,減少成纖維細胞因子-1的表達,即HOTAIR可通過miR-326介導(dǎo)膠質(zhì)瘤細胞的惡性生物學(xué)行為[38]。
LncRNA在惡性膠質(zhì)瘤的發(fā)生、發(fā)展、侵襲以及轉(zhuǎn)移等生物學(xué)過程中發(fā)揮著重要作用,可作為惡性膠質(zhì)瘤診斷、治療、預(yù)后預(yù)測的潛在生物學(xué)標志物,是近年來惡性膠質(zhì)瘤研究的焦點。通過研究LncRNA的作用機制,深入了解LncRNA在惡性膠質(zhì)瘤生長、增殖、凋亡中的調(diào)控作用,有可能為惡性膠質(zhì)瘤的診治提供新的生物學(xué)靶點。目前學(xué)者主要關(guān)注依據(jù)LncRNA的表觀遺傳學(xué)功能改善腫瘤耐藥性及設(shè)計新型化療藥物等方向,但將LncRNA作為惡性腫瘤新的治療靶點及診斷預(yù)后標志物仍需要學(xué)者進行大量的基礎(chǔ)及臨床研究。