杜新雅, 李曉宇, 謝春, 武斌, 宋光保, 杜野
1.深圳市龍華區(qū)人民醫(yī)院口腔科,廣東深圳(518000); 2.南方醫(yī)科大學(xué)口腔醫(yī)院特診中心,廣東廣州(510280)
Van der Woude 綜 合 征(Van der Woude sydrome,VWS)是一種常染色體顯性遺傳病,發(fā)病率為1~3/30 000,遺傳外顯率為80%~94%[1],特征是家族性下唇瘺伴唇裂或腭裂,部分患者伴有缺牙。本系列前期研究收集到14 個(gè)VWS 家系,37 例VWS 患者,致病基因?yàn)镮RF6 基因[2];在家系9 中,VWS 先證者伴先天缺牙,先證者父親未有唇腭裂或者下唇瘺,表現(xiàn)為先天缺牙。先天性缺牙是人類常見的發(fā)育異常疾病之一,其發(fā)病率1.6%~20%[3]。其中缺失6 顆和6 顆以上牙齒(不包括第三磨牙)稱為多數(shù)牙缺失(oligodontia);缺失6 個(gè)以下牙齒的稱為少數(shù)牙缺失(hypodontia)。臨床表現(xiàn)為散發(fā)性或家族性。遺傳和環(huán)境因素都可以導(dǎo)致先天性缺牙的發(fā)生,但是遺傳因素更為關(guān)鍵[3],遺傳學(xué)和分子生物學(xué)研究進(jìn)展表明,有超過300 個(gè)基因參與牙齒發(fā)育的不同階段。目前研究發(fā)現(xiàn)的與人類先天性缺牙相關(guān)的基 因有WNT10A[4],WNT10B[5],AXIN2[6],PAX9[7-8],MSX1[9-10]等。上述研究顯示多數(shù)牙先天缺失與PAX9、AXIN2 密切相關(guān)[11],而少數(shù)牙先天缺失主要與MSX1 基因突變或缺失有關(guān)[12]。然而,上述基因突變?cè)诨颊咧械臋z出率不高,這與非綜合征型先天缺牙可能是由多基因多因素共同調(diào)節(jié)控制有關(guān)[3],有一些基因的單核苷酸多態(tài)性與先天性牙缺失的研究,涉及到MSX1[13]、AXIN2[14]等基因。本研究對(duì)VWS9 家系中2 名先天性牙齒缺失患者缺牙數(shù)分別為2 顆、5顆,診斷為少數(shù)牙先天缺失;據(jù)此筆者進(jìn)行了MSX1 基因的檢測(cè),了解該家系少數(shù)牙先天缺失可能的致病基因。
為VWS 系列研究中的家系9,先證者為深圳市龍華區(qū)人民醫(yī)院住院唇腭裂病例中發(fā)現(xiàn)的,先證者表現(xiàn)為唇腭裂伴下唇瘺,先天缺牙。筆者對(duì)每個(gè)家系成員進(jìn)行了表型調(diào)查,對(duì)于2 名有缺失牙的成員行全景斷層攝片以明確缺牙情況。所有家系成員的臨床表型由2 名有經(jīng)驗(yàn)的口腔醫(yī)師獨(dú)立檢查確診。同時(shí)將家系中其他2 名健康成員和隨機(jī)選取的60 名體檢者作為健康對(duì)照組(所有血液樣本提供者均填寫知情同意書),本研究通過了深圳市龍華區(qū)人民醫(yī)院倫理委員會(huì)批準(zhǔn)。
按照受累個(gè)體的臨床表型進(jìn)行登記總結(jié),并繪制完整的系譜圖,明確可能的遺傳方式。系譜圖如圖1。對(duì)先證者及其父母進(jìn)行口內(nèi)、口外及全身系統(tǒng)檢查后,拍攝全頜曲面斷層片、采集上下頜印模,制取模型。
1.3.1 引物設(shè)計(jì)與合成 根據(jù)GenBank 人類基因組MSX1 基因序列設(shè)計(jì)。MSX1 基因由2 個(gè)外顯子,引物序列位于外顯子相鄰的內(nèi)含子區(qū)。為避免PCR 擴(kuò)增過程中出現(xiàn)錯(cuò)配,每個(gè)外顯子設(shè)計(jì)2 對(duì)引物。引物序列、擴(kuò)增片段長度見表1。引物由Takara 公司合成。
1.3.2 序列分析 應(yīng)用測(cè)序引物對(duì)家系中所有成員的PCR 產(chǎn)物在ABIPRISM377 自動(dòng)測(cè)序儀上(Takara)進(jìn)行正反向測(cè)序,將測(cè)序結(jié)果在DNAstar 軟件中進(jìn)行編輯和比較,并應(yīng)用在線軟件Blastn 與Gen-Bank 人類基因組MSX1 基因序列進(jìn)行對(duì)比分析。
Figure 1 Pedigree of the family圖1 家系圖
先證者(Ⅲ∶1),女,15 歲,身高1.54 米,體重41 kg,智力正常,左側(cè)完全型唇腭裂,齒槽突裂,下唇瘺;無汗腺、毛發(fā)、指甲等其它外胚層異常??趦?nèi)及全頜曲面斷層片檢查顯示先天性缺失牙為:右側(cè)下頜恒側(cè)切牙、尖牙、第二前磨牙、第二磨牙、上頜左側(cè)恒側(cè)切牙缺失。滯留乳牙為下頜右側(cè)第二前磨牙(圖2a~2c)。先證者父親(Ⅱ∶1),男,38歲。身高1.73 米,體重66 kg。智力正常,無汗腺、毛發(fā)、指甲等其它外胚層異常??趦?nèi)及全頜曲面斷層片檢查顯示先天性缺失牙為:兩顆下頜側(cè)切牙(圖2d、2e)。先證者的母親和兄弟表型正常,直系三代親屬未有類似畸形。
以基因組DNA 為模板,以MSX11aF/MSX11aR、MSX11bF/MSX11bR、MSX12aF/MSX12aR、MSX12bF/MSX12bR 為引物的PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物5 μL 經(jīng)1.5%瓊脂糖凝膠電泳后,在約277 bp、287 bp、333 bp、419 bp處出現(xiàn)清晰的陽性擴(kuò)增帶,與預(yù)期結(jié)果一致(圖3)。
PCR 擴(kuò)增產(chǎn)物DNA 序列結(jié)果顯示,患者Ⅱ:1和Ⅲ:1 的MSX1 第二外顯子出現(xiàn)雙峰(圖4),ivs2+68C >T,rs1095。其余序列與人類基因組結(jié)果相同。數(shù)據(jù)庫檢索發(fā)現(xiàn)為單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNP)。該變異在數(shù)據(jù)庫中顯示檢出率為0.02021,檢出頻率較低,在對(duì)照組中沒有檢出。
表1 MSX1 基因第1~2 外顯子引物序列及擴(kuò)增片段長度Table 1 MSX1 primer sequences and amplified fragment length
Figure 2 Dentition photo,panoramic radiograph and facial photo of the patient Ⅲ:1 and Ⅱ:1圖2 患者Ⅲ:1 和患者Ⅱ:1 臨床照片和全景片
Figure 3 PCR amplification of complete exon of MSX1 gene圖3 MSX1 基因完整外顯子的PCR 擴(kuò)增
此家系是研究VWS 家系時(shí)9 號(hào)家系;在家系9中,有2 個(gè)有口腔表型的成員,Ⅱ:1 僅下頜恒側(cè)切牙缺失2 顆,Ⅲ:1 的下頜右側(cè)側(cè)切牙、尖牙、第二前磨牙、第二磨牙(恒牙)和左上側(cè)切牙共5 顆牙缺失,伴有左側(cè)完全型唇腭裂,齒槽突裂和下唇瘺。而在VWS 致病基因IRF6 基因測(cè)序中,未發(fā)現(xiàn)患者Ⅱ:1 有 突 變,而 患 者Ⅲ:1 有 突 變:CC5.6GT(Ala2Gly);據(jù)此排除患者Ⅱ:1 為VWS 患者,其表型為另外一種遺傳性疾病的表現(xiàn):先天性少數(shù)牙缺失。雖然國際上報(bào)道的VWS 患者缺牙比例較高,但在本系列研究所有37 例VWS 患者中,除Ⅲ:1,僅有一個(gè)缺牙患者(VWS4Ⅱ:7,左上頜側(cè)切牙缺失),先天缺牙的患病率僅與正常人群的幾率相當(dāng),推測(cè)可能先天缺牙在我國并不是VWS 綜合征的表型。據(jù)此推斷VWS9 中Ⅱ:1 和Ⅲ:1 出現(xiàn)的先天缺牙為非綜合征性先天缺牙,此家系同時(shí)也是一個(gè)非綜合征性先天缺牙家系;由于缺牙數(shù)少于6顆,診斷為非綜合征性少數(shù)牙先天缺失。非綜合征性少數(shù)牙先天缺失與MSX1 基因突變或缺失有關(guān)。本研究對(duì)VWS9 家系患者檢測(cè)出MSX1 ivs2+68C>T 變異,檢索發(fā)現(xiàn)為多態(tài)。其他正常人員未見此多態(tài)。
Figure 4 VWS9 MSX1 exon 2 partial sequencing diagram圖4 VWS9 MSX1 外顯子2 部分測(cè)序圖
基因同源異型盒基因(Homeobox genes)為細(xì)胞核內(nèi)轉(zhuǎn)錄因子家族,編碼在胚胎發(fā)育過程中發(fā)揮重要作用的轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)蛋白,調(diào)節(jié)顱面及肢體形態(tài)發(fā)育。MSX1 為其主要成員之一,在多種組織中的表達(dá),主要集中于發(fā)育的早期階段,與組織、器官空間位置的確定和形態(tài)形成密切相關(guān);人類MSX1 基因位于第4 對(duì)染色體4p16.3~16.1,由2 個(gè)外顯子,編碼297 個(gè)氨基酸,在人類,MSX1 基因突變可引起:先天缺牙、非綜合征性唇腭裂等遺傳性疾病,主要表現(xiàn)為恒牙列先天性發(fā)育不全、唇腭裂、趾尖發(fā)育不全。多項(xiàng)研究表明,牙發(fā)育相關(guān)基因的SNP 可能與先天性牙缺失有關(guān)[13,15-16]。本研究發(fā)現(xiàn)兩例患者M(jìn)SX1 基因中的ivs2+68C >T 多態(tài),在正常對(duì)照組未篩查到;僅在兩例患者中發(fā)現(xiàn);患者的表型可能與此多態(tài)相關(guān)。為什么多態(tài)性位點(diǎn)能夠引起與突變相似的表現(xiàn),分析原因如下:基因多態(tài)性可以使基因的轉(zhuǎn)錄水平或活性增強(qiáng)或降低、改變遺傳密碼、啟動(dòng)子的突變及非轉(zhuǎn)錄區(qū)的突變、導(dǎo)致蛋白質(zhì)肽鏈中的片段缺失等。
不同基因突變引起不同的牙齒缺失類型一直是一個(gè)感興趣的話題;將牙缺失分為下前牙缺失和非下前牙缺失[13]?;颊撷颍? 為兩顆下中切牙缺失,Ⅲ:1 的下頜右側(cè)側(cè)切牙、尖牙、第二前磨牙、第二磨牙和左上側(cè)切牙缺失,缺牙較多,兩個(gè)患者檢測(cè)到的遺傳背景的區(qū)別在于Ⅲ:1 是VWS 患者,已檢測(cè)到IRF6 基因突變CC5.6GT(Ala2Gly);IRF6 基因在角質(zhì)細(xì)胞的遷移、上皮細(xì)胞的分化以及調(diào)控顱面部發(fā)育方面發(fā)揮著重要作用;對(duì)于患者Ⅲ:1的癥狀,唇腭裂、下唇瘺、牙缺失;唇腭裂、下唇瘺主要是由于IRF6 基因突變;其中缺失牙也不排除與IRF6 基因突變有關(guān),唇腭裂患者的非缺隙區(qū)缺牙[17]發(fā)病率高;MSX1 多態(tài)可能對(duì)此患者缺牙有協(xié)同作用。家系中兩個(gè)患者表型不同,第二個(gè)解釋則是環(huán)境因素。人體是一個(gè)復(fù)雜的開放系統(tǒng),當(dāng)一個(gè)人接觸了有害因素后,其不同的細(xì)胞、組織和器官都可能影響基因的表達(dá)。因此,牙齒的發(fā)育異??梢酝瑫r(shí)反映出環(huán)境和全身系統(tǒng)的不協(xié)調(diào)。許多環(huán)境因素如放射線、化療藥物都可以影響牙齒的發(fā)育[18]。通過以上可以解釋為什么基因的多態(tài)位點(diǎn)可以表現(xiàn)出明顯的牙齒缺失,但缺失的牙位、數(shù)量不同。
考慮到人類牙齒發(fā)育調(diào)控的復(fù)雜性,因此,患者的遺傳病因不一定僅是這個(gè)MSX1 的多態(tài),可能存在其他目前未知的新變異,也在患者牙齒和面部發(fā)育異常中起到了輔助作用。由于本研究僅研究了一個(gè)最可能的先天缺牙致病基因MSX1;隨著技術(shù)的發(fā)展,可考慮使用全外顯子測(cè)序技術(shù)[19],對(duì)其他可能的涉及到面部及牙齒發(fā)育的基因進(jìn)行檢測(cè)。必要時(shí)做基因功能研究。