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        循環(huán)腫瘤DNA在腎細(xì)胞癌中的應(yīng)用研究進(jìn)展

        2020-02-13 18:32:58越,董
        檢驗醫(yī)學(xué) 2020年9期
        關(guān)鍵詞:血漿水平檢測

        師 越,董 冬

        (天津醫(yī)科大學(xué)腫瘤醫(yī)院檢驗科 國家腫瘤臨床醫(yī)學(xué)研究中心 天津市“腫瘤防治”重點實驗室天津市惡性腫瘤臨床醫(yī)學(xué)研究中心,天津 300060)

        腎細(xì)胞癌(renal cell carcinoma,RCC)是全球第七大最常見癌癥,占全世界成人惡性腫瘤的2.4%,且發(fā)病率呈逐年上升趨勢[1]。目前,RCC的診斷主要依賴影像學(xué)和病理學(xué)檢查。但是這些檢查方法均具有明顯缺點:影像學(xué)檢查雖然可以檢測到腎臟的占位性病變,但不足以判斷病變的組織學(xué)類型;組織病理學(xué)檢查屬有創(chuàng)性檢查,需要有嚴(yán)格的醫(yī)學(xué)指征。此外,影像學(xué)和病理學(xué)檢查在評估腫瘤的轉(zhuǎn)移風(fēng)險和疾病的進(jìn)展,以及在監(jiān)測腫瘤療效方面均沒有太大的應(yīng)用價值。同其他實體腫瘤不同,目前RCC尚未發(fā)現(xiàn)可適用于臨床的腫瘤標(biāo)志物,故不利于對高危人群的篩查和疾病的早期診斷。

        由于早期RCC缺乏臨床癥狀,30%的患者被診斷時已是疾病中晚期。晚期RCC患者的預(yù)后普遍較差,5年總生存率僅為8%[2]。此外,在接受根治性腎切除術(shù)后,超過30%的RCC會復(fù)發(fā)或轉(zhuǎn)移[2]。在過去的幾年中,針對晚期或轉(zhuǎn)移性腎細(xì)胞癌(metastatic renal cell carcinoma,mRCC)患者的治療策略發(fā)展迅速。例如,免疫療法[抗程序性細(xì)胞死亡1(programmed death-1,PD-1)抗體納武單抗和抗細(xì)胞毒性T淋巴細(xì)胞相關(guān)蛋白4抗體伊匹單抗][3]、蛋白酶抑制劑[哺乳動物雷帕霉素靶蛋白(mammalian target of rapamycin,mTOR)抑制劑依維莫司][4]以及酪氨酸激酶抑制劑(舒尼替尼、索拉非尼、帕唑帕尼和阿西替尼)[5],均可以使晚期RCC或mRCC患者顯著獲益。然而,這些治療措施均需要一定的免疫學(xué)或分子生物學(xué)指征,藥物的耐受仍是限制療效的關(guān)鍵問題。在這種情況下,迫切需要針對RCC可靠且無創(chuàng)的生物標(biāo)志物,以進(jìn)行疾病早期診斷,指導(dǎo)靶向藥物的選擇,監(jiān)測治療效果,發(fā)現(xiàn)并評估藥物耐受情況,以便及時調(diào)整治療方案。

        循環(huán)腫瘤DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)是存在于血液或體液中由腫瘤細(xì)胞衍生出的片段化DNA,是一種特征性的腫瘤生物標(biāo)志物。通過分析ctDNA的各項特征,可獲得與該腫瘤相關(guān)的多方面信息。ctDNA檢測的核心優(yōu)勢在于其能反映整個腫瘤基因組的信息[6-7],而且具有實時性、易獲得性。因此,近年來在抗擊癌癥中的應(yīng)用價值受到了極大的關(guān)注,但ctDNA在RCC臨床診治中的應(yīng)用仍處于探索的早期階段。深入研究其臨床應(yīng)用價值對各個階段的RCC患者均有益,并有助于提供個性化的mRCC治療方案。本綜述對ctDNA在RCC診斷、預(yù)后評估、疾病復(fù)發(fā)監(jiān)測、治療效果監(jiān)測及獲得性耐藥等方面的臨床研究進(jìn)展進(jìn)行介紹。

        1 ctDNA含量與片段化

        先拋開序列信息不談,RCC患者外周血中ctDNA的含量和片段大小本身就具有一定的臨床應(yīng)用價值。有研究發(fā)現(xiàn),mRCC患者外周血中ctDNA的含量與腫瘤負(fù)荷相關(guān),在53%的mRCC患者外周血中檢測到了ctDNA,這些患者的腫瘤體積顯著大于未檢測到ctDNA的患者[8]。WAN等[9]的研究則進(jìn)一步證實,血漿ctDNA的水平與RCC的復(fù)發(fā)相關(guān),腎切除術(shù)前血漿ctDNA水平高的患者腫瘤復(fù)發(fā)率明顯高于血漿ctDNA水平低的患者。ctDNA的水平在治療監(jiān)測中同樣具有重要作用,F(xiàn)ENG等[10]在不同時間點對18例接受索拉非尼治療的mRCC患者血漿ctDNA水平進(jìn)行定量檢測,發(fā)現(xiàn)在治療過程中血漿ctDNA水平與預(yù)后呈負(fù)相關(guān)。

        YAMAMOTO等[11]進(jìn)行了更為深入的研究,發(fā)現(xiàn)RCC患者血漿中ctDNA中位數(shù)水平要顯著高于健康對照組。此外,血漿ctDNA的水平隨著腫瘤TNM分期和Fuhrman分級的增高而增加;伴有淋巴管浸潤患者的ctDNA水平也顯著高于不伴浸潤的患者;與健康對照組相比,即便是早期(cT1aN0M0)RCC患者,其血漿ctDNA水平也會顯著升高。該研究團(tuán)隊還揭示了ctDNA的片段化水平同樣具有臨床應(yīng)用價值,即RCC患者血漿ctDNA片段長度要顯著短于健康對照組,而且ctDNA片段大小與RCC患者的疾病無進(jìn)展生存率呈負(fù)相關(guān)[11]。不僅如此,在較高的Fuhrman分級和淋巴管浸潤陽性的患者中,ctDNA的平均長度更短[11-12]。以上這些研究結(jié)果均提示,ctDNA的含量及片段化水平對于RCC患者的診斷、疾病分期和分級,以及預(yù)后判斷均具有重要的潛在價值。

        2 ctDNA的突變

        ctDNA來源于基因組DNA,其所攜帶的堿基突變數(shù)量與患者腫瘤細(xì)胞的突變負(fù)荷直接相關(guān),檢測ctDNA的突變譜有助于預(yù)測患者是否能夠從免疫學(xué)檢查點抑制劑治療中獲益[13]。納武單抗是一種針對PD-1的單克隆抗體,最近被批準(zhǔn)用于治療伴有錯配修復(fù)缺陷的惡性腫瘤[14],而mRCC屬于其治療適應(yīng)癥。目前,免疫檢查點抑制劑在mRCC的治療中起著極其重要的作用,并且預(yù)計在不久的將來會有越來越多的相關(guān)藥物被批準(zhǔn)用于mRCC的治療。此外,多種免疫學(xué)檢查點抑制劑的聯(lián)合使用有望成為mRCC的一線療法[15-17]。ctDNA中堿基突變數(shù)量可以預(yù)測RCC患者對免疫治療的反應(yīng),這更顯示出了ctDNA突變檢測所具有的臨床應(yīng)用價值。

        除此之外,RCC的突變特征也與治療應(yīng)答和療效密切相關(guān)。有研究發(fā)現(xiàn),RCC小鼠血漿中可檢測到帶有耐甲氧戊二烯(methoprenetolerant,MET)突變的ctDNA,其水平與原發(fā)腫瘤的體積相關(guān),并隨著卡博替尼的治療而改變[18]。血管內(nèi)皮生長因子受體1(vascular endothelial growth factor receptor 1,VEGFR1)基因上的rs9582036突變能夠預(yù)測舒尼替尼治療的效果,有望成為一個重要的預(yù)測生物標(biāo)志物[19]。PAL等[20]檢測了220例mRCC患者的ctDNA突變譜并進(jìn)行分類,評估不同ctDNA突變類型患者對靶向治療的反應(yīng)性是否存在顯著差異,發(fā)現(xiàn)ctDNA中p53基因突變水平的升高與舒尼替尼、帕唑帕尼及貝伐珠單抗等靶向藥物的耐藥產(chǎn)生相關(guān)。

        由腫瘤異質(zhì)性引起的耐藥性是限制腫瘤治療效果的根本原因,RCC也不例外[21]。在腫瘤組織中,哪怕只有極少數(shù)的癌細(xì)胞帶有耐藥突變,那么在治療過程中,這些細(xì)胞都可能存活下來,進(jìn)而形成耐藥腫瘤組織[22]。這些腫瘤細(xì)胞在最初的病理活檢中會因數(shù)量少或空間分布等原因而被漏檢,ctDNA可以提供更具代表性的腫瘤遺傳多樣性“全視圖”,從而可以在一定程度上彌補(bǔ)這個缺憾,這對指導(dǎo)RCC的治療決策具有重要意義。

        3 ctDNA甲基化

        ctDNA甲基化標(biāo)志物已成為腫瘤臨床治療研究的熱點,這不只是因為甲基化改變是腫瘤發(fā)生的一個早期而獨立的事件,更是因為外周血ctDNA的甲基化圖譜恰似腫瘤細(xì)胞的指紋,具有高度的腫瘤特異性和個體特異性。由Epigenomics公司研發(fā)的外周血Sept9甲基化檢測試劑盒已經(jīng)獲得美國食品與藥品監(jiān)督管理局批準(zhǔn)上市,用于結(jié)直腸癌的篩查和早期診斷,并且在腫瘤復(fù)發(fā)監(jiān)測、預(yù)后判斷,以及治療監(jiān)測中均具有重要的臨床應(yīng)用價值[23-24]。

        ctDNA甲基化已成為多種腫瘤診斷和預(yù)后評估的非常有前途的表觀遺傳標(biāo)志物,對RCC來說亦是如此。大量研究結(jié)果表明,DNA甲基化參與RCC的發(fā)生和發(fā)展,并且能夠反映患者對治療的反應(yīng)性[25-26]。DNA甲基化通常發(fā)生在癌癥的早期,這使DNA甲基化生物標(biāo)志物成為早期檢測的理想靶標(biāo)。SKRYPKINA等[27]的研究發(fā)現(xiàn),RCC患者血漿DNA中可以檢測到Ras區(qū)相關(guān)域家族1A(ras association domain family 1A,RASSF1A)、脆性組氨酸三聯(lián)體(fragile histidine triad,F(xiàn)HIT)和結(jié)腸腺瘤樣息肉蛋白(adenomatous polyposis coli,APC)的甲基化,對于RCC的診斷具有重要價值。此外,DNA甲基化通常與治療藥物的耐藥性和敏感性有關(guān)。因此,甲基化生物標(biāo)志物既適用于在藥物治療前對患者進(jìn)行有效性分層,也適用于在治療過程中監(jiān)測疾病的進(jìn)展。

        JUNG等[28]檢測了RCC組織及血漿樣品中身材矮小同源盒蛋白2(short stature homeobox protein 2,SHOX2)的甲基化水平,并對其臨床意義進(jìn)行了評估,發(fā)現(xiàn)通過檢測治療前ctDNA中SHOX2甲基化水平可以鑒別出腎切除術(shù)后仍具有高死亡風(fēng)險的RCC患者,通過早期干預(yù),這些患者可能受益于輔助治療或早期進(jìn)行的姑息治療。另一項研究發(fā)現(xiàn),血清中原鈣黏蛋白17(protocadherin-17 precursor,PCDH17)甲基化是RCC中的常見事件,并能夠提示預(yù)后不良,有可能成為術(shù)后RCC患者預(yù)后的生物標(biāo)志物[29]。除了血液樣本,RCC患者尿液樣本中的PCDH17甲基化也有可能成為泌尿系統(tǒng)腫瘤的生物標(biāo)志物,包括膀胱癌、RCC和前列腺癌[30]。在RCC患者尿液樣本中挖掘出的另一種甲基化生物標(biāo)志物是轉(zhuǎn)錄因子21(transcription factor 21,TCF21),該基因在RCC患者尿液中的水平與其在腫瘤組織中的水平呈正相關(guān),且對RCC具有一定診斷價值[31]。COSTA等[30]的研究進(jìn)一步印證了這一結(jié)論。事實上,在組織學(xué)水平上,很多基因的甲基化水平與腎癌患者的預(yù)后緊密相關(guān),但是這些基因在血漿中的甲基化水平是否也與腎癌患者的預(yù)后相關(guān)還有待深入研究。理論上特定基因在腫瘤組織中的甲基化水平應(yīng)該與血漿或者尿液中的水平是一致或相關(guān)的[31],這些基因在外周血或尿液中的甲基化水平在疾病預(yù)后中的臨床價值也應(yīng)該得到關(guān)注。

        4 其他

        4.1 多態(tài)性

        自噬在RCC的發(fā)生及進(jìn)展中發(fā)揮了重要的調(diào)控作用。SANTONI等[32]對外周血中自噬基因的基因型進(jìn)行了分析,以評估其與腎透明細(xì)胞癌患病風(fēng)險以及預(yù)后的相關(guān)性。他們選取的自噬相關(guān)基因包括自噬相關(guān)家族基因(autophagyrelated gene,ATG)中的ATG4A、ATG4B、ATG4C、ATG5、ATG16L1、ATG16L2和IRGM,并在40例接受帕唑帕尼治療的mRCC患者中對這些基因的單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)與普通人群相比,mRCC患者ATG16L2-rs10751215的發(fā)生率顯著降低,ATG4A-rs7880351、ATG4C-rs6670694和ATG5-rs490010與接受帕唑帕尼的治療RCC患者的疾病無進(jìn)展生存期相關(guān)。

        4.2 線粒體

        LU等[33]調(diào)查了基因組和線粒體來源的ctDNA片段在RCC患者診斷和預(yù)后中的應(yīng)用潛力,他們從40名健康對照者和229例RCC患者(145例RCC和84例mRCC)中提取ctDNA并進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)2個線粒體片段(65 bp和175 bp)能夠?qū)⒔】祵φ照?、RCC和mRCC患者進(jìn)行有效的區(qū)分;同時還發(fā)現(xiàn),有1個基因組ctDNA片段(306 bp)能夠?qū)CC患者和健康對照者進(jìn)行區(qū)分。該研究表結(jié)果明,基因組和線粒體ctDNA片段可能有助于早期診斷mRCC,這在RCC輔助治療中可能具有重要的應(yīng)用價值。

        5 問題與展望

        RCC患者外周血ctDNA有其自身特點,與其他實體瘤(如胰腺癌、卵巢癌、結(jié)直腸癌、膀胱癌等)相比,RCC患者的ctDNA水平相對較低[34-35]。RCC患者的ctDNA水平與疾病進(jìn)展相關(guān),具有高腫瘤負(fù)荷的RCC患者傾向于具有更高水平的ctDNA[34]。而對于早期RCC患者來說,需要具有更高靈敏度的檢測方法進(jìn)行檢測。

        作為液體活檢的一個重要分支,ctDNA檢測具有改變癌癥治療前景的潛力。但是,這種新方法的廣泛使用仍面臨著諸多挑戰(zhàn),包括:如何改進(jìn)技術(shù)以提高早期RCC患者外周血中ctDNA檢測的敏感性和特異性;如何制定統(tǒng)一、規(guī)范的操作流程以使不同實驗室的檢測結(jié)果具有可比性;如何降低檢測成本以使該檢測適用于疾病的早期篩查。作為腫瘤診斷的金標(biāo)準(zhǔn),組織病理檢查仍具有不可替代的作用。隨著研究的深入,ctDNA檢測在RCC診斷、預(yù)后評估、疾病復(fù)發(fā)監(jiān)測、治療效果監(jiān)測及獲得性耐藥等方面的作用日益受到重視。作為一種非侵入性的檢測方法,ctDNA檢測能夠使患者容易耐受,并能夠滿足臨床對于實時性和連續(xù)性取材的要求。因此,ctDNA檢測將可能成為組織活檢不可或缺的補(bǔ)充手段,其臨床應(yīng)用價值得期待。

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