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        小葉茶染色體級別基因組圖譜首次完成

        2020-01-18 21:33:41
        中國食品學(xué)報 2020年1期
        關(guān)鍵詞:碧云基因組學(xué)小葉

        近日,生物學(xué)預(yù)印本服務(wù)器(www.biorxiv.org)在線發(fā)表了中美科學(xué)家聯(lián)合研究團隊的最新成果,該團隊采用單分子實時測序(SMRT)和Hi-C技術(shù),在20多個代表性小葉茶品種中選用雜合度較低的小葉茶良種“碧云”,將組裝獲得的約2.85Gb的基因組序列掛載到了15條假染色體上,在國際上首次獲得了達到染色體級別的茶樹中國茶變種的參考基因組序列。

        論文通訊作者高立志告訴《中國科學(xué)報》,通過與基于基因組二代測序技術(shù)發(fā)表的小葉茶舒茶早基因組草圖比較基因組學(xué)分析表明,該研究獲得的基因組圖譜scaffold N50長度高達195.68 Mb,在組裝準確性與完整性上都得到了極大的提升;解析獲得了包括茶多酚、茶氨酸和咖啡因生物合成相關(guān)基因在內(nèi)的40812個蛋白編碼基因的準確序列,首次及時地為全世界茶學(xué)研究者提供了準確的茶樹基因信息。

        “染色體級別的茶樹‘碧云’參考基因組圖譜的獲得,讓我們第一次看到了茶樹基因組大小變異的動態(tài)歷史與成因的真實面目?!备吡⒅颈硎荆萌鷾y序技術(shù)獲得的“碧云”茶樹參考基因組使我們追溯到,在過去100萬年中迅速擴增導(dǎo)致了龐大的茶樹基因組。

        這張圖譜的繪制,將進一步推進決定茶葉適制性、風(fēng)味和品質(zhì)以及茶樹全球生態(tài)適應(yīng)性遺傳基礎(chǔ)的認識;加速茶樹功能基因組學(xué)研究、性狀解析、優(yōu)異新基因發(fā)掘以及旨在提高茶葉品質(zhì)和適應(yīng)性的茶樹新品種培育,為茶葉深加工產(chǎn)業(yè)又快又好地發(fā)展提供科技支撐;也將促進茶樹起源與馴化這一重大科學(xué)問題的回答并推動全球野生茶樹種質(zhì)資源的遺傳保護。

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