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        小葉茶染色體級(jí)別基因組圖譜首次完成

        2020-01-18 21:33:41
        中國(guó)食品學(xué)報(bào) 2020年1期
        關(guān)鍵詞:碧云基因組學(xué)小葉

        近日,生物學(xué)預(yù)印本服務(wù)器(www.biorxiv.org)在線發(fā)表了中美科學(xué)家聯(lián)合研究團(tuán)隊(duì)的最新成果,該團(tuán)隊(duì)采用單分子實(shí)時(shí)測(cè)序(SMRT)和Hi-C技術(shù),在20多個(gè)代表性小葉茶品種中選用雜合度較低的小葉茶良種“碧云”,將組裝獲得的約2.85Gb的基因組序列掛載到了15條假染色體上,在國(guó)際上首次獲得了達(dá)到染色體級(jí)別的茶樹中國(guó)茶變種的參考基因組序列。

        論文通訊作者高立志告訴《中國(guó)科學(xué)報(bào)》,通過與基于基因組二代測(cè)序技術(shù)發(fā)表的小葉茶舒茶早基因組草圖比較基因組學(xué)分析表明,該研究獲得的基因組圖譜scaffold N50長(zhǎng)度高達(dá)195.68 Mb,在組裝準(zhǔn)確性與完整性上都得到了極大的提升;解析獲得了包括茶多酚、茶氨酸和咖啡因生物合成相關(guān)基因在內(nèi)的40812個(gè)蛋白編碼基因的準(zhǔn)確序列,首次及時(shí)地為全世界茶學(xué)研究者提供了準(zhǔn)確的茶樹基因信息。

        “染色體級(jí)別的茶樹‘碧云’參考基因組圖譜的獲得,讓我們第一次看到了茶樹基因組大小變異的動(dòng)態(tài)歷史與成因的真實(shí)面目。”高立志表示,利用三代測(cè)序技術(shù)獲得的“碧云”茶樹參考基因組使我們追溯到,在過去100萬(wàn)年中迅速擴(kuò)增導(dǎo)致了龐大的茶樹基因組。

        這張圖譜的繪制,將進(jìn)一步推進(jìn)決定茶葉適制性、風(fēng)味和品質(zhì)以及茶樹全球生態(tài)適應(yīng)性遺傳基礎(chǔ)的認(rèn)識(shí);加速茶樹功能基因組學(xué)研究、性狀解析、優(yōu)異新基因發(fā)掘以及旨在提高茶葉品質(zhì)和適應(yīng)性的茶樹新品種培育,為茶葉深加工產(chǎn)業(yè)又快又好地發(fā)展提供科技支撐;也將促進(jìn)茶樹起源與馴化這一重大科學(xué)問題的回答并推動(dòng)全球野生茶樹種質(zhì)資源的遺傳保護(hù)。

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