彭子艾,李丹丹,夏澳運,王加峰,黃翠紅,王 慧,郭 濤,陳志強
(華南農(nóng)業(yè)大學農(nóng)學院/國家植物航天育種工程技術(shù)研究中心,廣東廣州510642)
隨著納米生物技術(shù)的迅速發(fā)展,納米材料可作為基因載體,通過包裹、靜電吸附及化學鍵作用等方式負載外源基因[1-3],通過細胞吞噬作用將其傳送到細胞內(nèi),使基因成功表達[4]。與其他納米載體相比,磁性納米載體具有超順磁性優(yōu)勢[5],在磁場作用下可快速負載、運輸目的基因[6]。有研究表明外源基因成功整合到基因組中需要通過3個細胞屏障:細胞膜、溶酶體和細胞核[7],影響整合效率的關(guān)鍵因素是避開溶酶體的消化作用[8-9],納米載體的表面電荷[10]、粒徑大小[11]和修飾功能基團[12]等是影響整合效率的重要因素。有學者提出納米載體基因復合物可通過“質(zhì)子海綿效應”免受溶酶體的消化作用[13-14]。
納米載體基因傳輸技術(shù)為動植物遺傳育種提供了新思路,Wang 等[15]將磁性納米載體與精子介導的基因轉(zhuǎn)染相結(jié)合,獲得了轉(zhuǎn)基因小鼠。Zhao等[16]利用磁性納米顆粒(Magnetic nanoparticle,MNP)作為基因載體,負載pGBIF4ABCΔα 質(zhì)粒,在磁場作用下磁轉(zhuǎn)染棉花花粉,成功篩選到轉(zhuǎn)融合抗蟲基因的棉花。隨著CRISPR 基因編輯和修飾技術(shù)的使用,磁性納米顆粒會是將生物分子傳送到植物體內(nèi)進行基因編輯和修飾的最佳平臺[17]。
本研究選用MNP作為基因載體,負載質(zhì)粒pRGEB32,構(gòu)建了不同質(zhì)量比的納米載體?基因復合物MNP?pRGEB32。通過瓊脂糖凝膠電泳阻滯試驗評價和分析了MNP對pRGEB32 的結(jié)合和保護能力。通過納米粒度分析儀、Zeta 電位分析儀、透射電子顯微鏡和原子力顯微鏡對MNP 和MNP?pRGEB32復合物的粒徑、表面電位、形貌、分布等進行了檢測和觀察,研究了MNP?pRGEB32復合物的生物物理特性、基因負載形態(tài)與負載機理,以期為MNP負載CRISPR/Cas9表達載體的應用提供依據(jù)。
MNP poly MAG1000購自德國Chemicell公司;DNase I 購自TaKaRa 公司;無內(nèi)毒素質(zhì)粒大提試劑盒購自TIANGEN 生物技術(shù)有限公司;含CRISPR/Cas9表達載體pRGEB32[18]的大腸埃希菌EscherichiacoliDH5α 由國家植物航天育種工程技術(shù)研究中心保存;核酸染料GelRed 購自美國Biotium公司。
取pRGEB32(15 888 bp)大腸埃希菌菌液加入到含50 ng/μL卡那霉素的LB液體培養(yǎng)基(每升培養(yǎng)基含酵母提取物5 g、胰蛋白胨10 g、NaCl 10 g)中,于37℃、220 r/m in 培養(yǎng)16 h,按照TIANGEN無內(nèi)毒素質(zhì)粒大提試劑盒說明書提取質(zhì)粒。利用超微量紫外分光度計測定質(zhì)粒DNA 的濃度和純度,選取D260nm/D280 nm≈1.8的質(zhì)粒DNA 于?20℃貯存?zhèn)溆谩?/p>
pRGEB32質(zhì)量固定為4μg,將poly MAG1000和pRGEB32按照質(zhì)量比為1∶1、1∶4、1∶8、1∶16、1∶24、1∶40、1∶50混合,于37℃條件下培育30m in,連接制備MNP?DNA 復合物。
將MNP?pRGEB32復合物點樣在8 g/L 的瓊脂糖凝膠(含7μL 熒光染料GelRed)上,在TAE緩沖液中于130 V 電泳30m in,然后在凝膠成像儀上觀察,分析MNP對pRGEB32的負載能力;同時,將MNP?pRGEB32復合物在37℃分別用DNase I酶切4 h,用Hind III和BsaI 雙酶切16 h,然后電泳跑膠,分析對MNP對pRGEB32的保護能力。
將MNP和pRGEB32按照質(zhì)量比為1∶1、1∶4、1∶8制備的MNP?pRGEB32復合物分別用超純水稀釋至0.001μg/μL,采用納米粒度分析儀及Zeta電位分析儀分析粒度分布及Zeta 電位。
吸取MNP和MNP、pRGEB32質(zhì)量比為1∶1的MNP?pRGEB32復合物,用超純水分別稀釋至0.001μg/μL,各取10μL 均勻滴加到干凈的碳膜覆蓋的銅網(wǎng)上,用濾紙吸干多余的液體,靜置晾干30m in,用20 g/L的磷鎢酸負染1m in,置于干凈的培養(yǎng)皿中自然干燥,然后在透射電子顯微鏡下觀測形態(tài)并拍照。
吸取M NP和p RGEB 32質(zhì)量比為1∶1的MNP?pRGEB32 復合物,用超純水稀釋至0.01μg/μL,取10μL 均勻滴加到新剝離的云母片表面,置于干凈的培養(yǎng)皿中自然干燥,然后在原子力顯微鏡下掃描成像,用NanoScope Analysis 1.5在Height Sensor 模式下分析圖像。
2.1.1 磁性納米顆粒對質(zhì)粒DNA 的負載能力分析MNP和pRGEB 32質(zhì)量比為1∶1、1∶4、1∶8、1∶16時,MNP與pRGEB32完全結(jié)合,泳道中無游離的pRGEB32;質(zhì)量比為1∶24、1∶40、1∶50時,逐漸減少的MNP難以負載逐步增多的pRGEB32,形成的MNP?pRGEB32復合物較少,過量的pRGEB32在泳道中呈現(xiàn)明顯條帶(圖1)。結(jié)果表明MNP能有效裝載相當于自身質(zhì)量16倍的pRGEB32。
圖1 MNP?pRGEB32復合物電泳分析Fig.1 Electrophoreses analyses of MNP-pRGEB 32 complexes
2.1.2 磁性納米載體對pRGEB32的保護能力分析MNP?pRGEB32復合物用核酸酶DNase I處理4 h 后,質(zhì)量比為1∶1、1∶4、1∶8、1∶16的復合物樣品仍停留在點樣孔,純質(zhì)粒及質(zhì)量比為1∶24、1∶40、1∶50的復合物樣品中過量的DNA 被完全消化,完全結(jié)合的MNP?pRGEB32復合物停留在點樣孔(圖2)。MNP?pRGEB32復合物用Hind III 和BsaI 雙酶切16 h 后,純質(zhì)粒及質(zhì)量比為1∶24、1∶40、1∶50的復合物樣品中過量的DNA 隨電場遷移,被限制性內(nèi)切酶Hind III和BsaI切開形成2條線性質(zhì)粒條帶,MNP?pRGEB32復合物質(zhì)量比為1∶1、1∶4、1∶8、1∶16的泳道沒有DNA 痕跡,說明MNP?pRGEB32復合物沒有被酶切割(圖3)。結(jié)果證明MNP 能保護其負載的pRGEB32 免受酶促降解。
圖2 MNP?pRGEB32復合物用DNase I 酶切處理的電泳分析Fig.2 Electrophoresis analyses of MNP-pRGEB 32 complexes digested with DNase I
納米粒度及Zeta 電位分析儀結(jié)果顯示,MNP的平均疏水粒徑為127.5 nm,Zeta 電位為12.1m V,在結(jié)合帶負電的pRGEB32后,MNP?pRGEB32復合物的粒徑增大,Zeta 電位降低(圖4)。隨著結(jié)合的pRGEB32的量逐漸增加,MNP?pRGEB32復合物的粒徑也逐漸增加,Zeta 電位逐漸降低。結(jié)果說明MNP能通過靜電作用負載pRGEB32,并能有效地結(jié)合和負載pRGEB32形成納米載體基因復合物。
圖3 MNP?pRGEB32復合物用Hin d III 和Bsa I 雙酶切處理的電泳分析Fig.3 Electrophoresis analyses of MNP-pRGEB 32 complexes digested with Hin d III and Bsa I
圖4 MNP和MNP?pRGEB32復合物的粒徑及Zeta 電位分析Fig.4 Size distribution and Zeta potential of MNP and MNP-pRGEB32 complex
透射電鏡下MNP為規(guī)則球形,分散性較好,粒徑約10~150 nm(圖5a)。中心深色部分為磁性氧化鐵核心,外層附有陽離子PEI膜包裹(圖5b)。MNP與pRGEB32結(jié)合后大量的pRGEB32被壓縮、吸附、聚集在納米顆粒表面(圖5c和5d)。試驗表明MNP可攜帶大量的pRGEB32,從而作為外源基因轉(zhuǎn)移的載體。
原子力顯微鏡觀察到MNP周圍吸附了桿狀的pRGEB32,以載體顆粒為中心,越靠近中心濃度越高,呈放射狀向外擴展(圖6),與透射電鏡觀測的形態(tài)相符合。這種高濃度的聚集有利于載體顆粒攜帶大量的pRGEB32,從而通過細胞的吞噬作用將外源基因傳送至細胞內(nèi)部。
圖5 MNP和MNP?pRGEB32復合物的透射電鏡圖像Fig.5 Transmission electron microscope images of MNP and MNP-pRGEB32 complex
圖6 MNP?pRGEB32復合物的原子力顯微鏡圖像Fig.6 Atomic force microscope images of MNP and MNP-pRGEB32 complex
納米技術(shù)已經(jīng)與許多學科交叉研究,具有巨大的潛在價值,已經(jīng)廣泛應用于生物及醫(yī)學領(lǐng)域[19-21]。理想的基因載體應該能有效地負載外源核酸,具有較高的生物相容性,在細胞質(zhì)內(nèi)可以有效保護外源核酸免受酶促降解,使其最終能實現(xiàn)高效表達[22-23]。瓊脂糖凝膠電泳阻滯試驗顯示了MNP高效負載pRGEB32的能力,并能夠有效保護pRGEB32免受核酸酶降解作用。有研究推測可能是DNA 和納米載體結(jié)合后導致DNA 構(gòu)象發(fā)生變化,阻止M g2+、核酸酶與DNA 接觸,從而保護DNA 免受酶的消化作用[24-25]。通過粒度分布和Zeta 電位測試顯示MNP結(jié)合pRGEB32后,粒徑增大,電位降低,說明二者通過靜電相互作用形成了MNP?pRGEB32復合物。透射電鏡和原子力顯微鏡的觀測證實pRGEB32被吸附壓縮后聚集在MNP表面[26],這種壓縮和高濃度的聚集,使載體能夠有效地負載和保護pRGEB32。通過上述結(jié)果可知,M NP在負載、聚集和保護pRGEB32方面表現(xiàn)優(yōu)越,是一種理想的基因載體。
有研究通過磁性納米載體負載外源基因,將外源基因整合到生殖細胞中,外源基因能在后代穩(wěn)定遺傳[16]。同時有研究證明可以利用CRISPR/Cas9編輯性細胞基因組,如Chapman 等[27]利用CRISPR/Cas9直接編輯大鼠的精原細胞,產(chǎn)生純合非鑲嵌突變后代。若能將納米材料和CRISPR 基因編輯技術(shù)有效結(jié)合,直接對動植物生殖細胞定向編輯,將克服傳統(tǒng)方式中部分物種基因轉(zhuǎn)化困難、育種周期長等瓶頸問題。本試驗證實磁性納米載體能有效結(jié)合CRISPR 編輯系統(tǒng),為探索基于磁性納米載體定向編輯技術(shù)的研究奠定了基礎。