李闖 文正 劉暢 鄔敏辰
(1. 江南大學(xué)生物工程學(xué)院,無錫 214122;2. 江南大學(xué)無錫醫(yī)學(xué)院,無錫 214122)
光學(xué)純環(huán)氧化物和鄰位二醇具有較高的附加值,是合成一些農(nóng)藥、醫(yī)藥以及材料等精細化學(xué)品的重要手性砌塊[1]。例如,(S)-環(huán)氧苯乙烷可以用來合成殺線蟲劑[2],而(R)-苯乙二醇是液晶材料制造過程中重要的手性添加劑[3]。利用(R)-對氯環(huán)氧苯乙烷制備的一種神經(jīng)保護劑(R)-依利羅地,較其S型對映體具有更強的療效[4]。本研究中所涉及到的(R)-間硝基苯乙二醇(m-nitrophenyl-1,2-ethanediol,mNPED)則是α-羥基酸以及具有阿爾茨海默病療效的β-分泌酶抑制劑的重要合成子[5-6]。
通過Jacobsen 環(huán)氧化及Sharpless 不對稱雙羥基化等傳統(tǒng)化學(xué)合成法制備的手性環(huán)氧化物和鄰位二醇,有時存在產(chǎn)物光學(xué)純度和產(chǎn)率低的問題[7]。此外,在反應(yīng)過程中通常需要使用有毒的高價重金屬催化劑,給環(huán)境帶來了嚴重的威脅[8]。近年來,生物制備法作為一種低成本且環(huán)境友好的補充或替代方案而備受關(guān)注[9],其符合國內(nèi)外社會所倡導(dǎo)的“綠色工業(yè)”和“可持續(xù)發(fā)展”,以及國家“十三五”規(guī)劃中關(guān)于“加快改善生態(tài)環(huán)境”的相關(guān)內(nèi)容。
環(huán)氧水解酶(Epoxide hydrolase,EH)廣泛存在于微生物與動、植物體內(nèi),能夠立體選擇性的催化廉價的外消旋(racemic,rac-)環(huán)氧化物發(fā)生開環(huán)水解,保留單一構(gòu)型的環(huán)氧化物和/或生成鄰位二醇[10]。但是,不同EH 與環(huán)氧化物的反應(yīng)組合往往表現(xiàn)出不同的立體選擇性。根據(jù)這種差異性,可以將EH 催化的不對稱反應(yīng)劃分為動力學(xué)拆分和對映歸一性水解兩大類[11],前者的理論產(chǎn)率僅有50%,而后者可達100%[12]。目前,基于EH 的歸一性水解反應(yīng)來制備手性鄰位二醇的途徑主要有:雙酶協(xié)同催化法[13-14]、酶與化學(xué)酸串聯(lián)催化法[15-16]及單酶催化法[17-18]。其中,僅利用單酶實現(xiàn)外消旋環(huán)氧化物的歸一性轉(zhuǎn)化被認為是一種理想的催化方法[19]。然而,這要求EH 針對于目標環(huán)氧化物S與R兩種對映體同時表現(xiàn)出高且互補的區(qū)域選擇性,即區(qū)域選擇性系數(shù)αS和βR均接近于100%[20]。因此,同拆分反應(yīng)相比,歸一性水解相關(guān)的報道則相對較少[21]。
本研究將菜豆來源的EH 基因pveh2 插入至冷休克表達載體,在大腸桿菌中實現(xiàn)酶的胞內(nèi)表達。隨后,以rac-間硝基環(huán)氧苯乙烷(m-nitrostyrene oxide,mNSO)為底物,利用工程菌E. coli/pveh2 全細胞測定其EH 活性和區(qū)域選擇性。將水溶性有機試劑作為底物助溶劑,并依據(jù)助溶劑的種類與劑量對全細胞EH 活性的影響,篩選出最適的緩沖液/助溶劑反應(yīng)體系,顯著提高了歸一性水解中底物rac-mNSO 的最高反應(yīng)濃度。
1.1.1 菌株、質(zhì)粒和培養(yǎng)基E. coliJM109、Rosetta(DE3)以及含有重組質(zhì)粒pET28a-pveh2 的工程菌E.coli/pET28a-pveh2 由實驗室保藏;克隆質(zhì)粒pUCm-T購自上海生工公司;表達質(zhì)粒pCold II 購于TaKaRa公司;Luria-Bertani(LB)液體培養(yǎng)基:蛋白胨10 g/L,氯化鈉10 g/L 和酵母提取物5 g/L,pH 7.0。
1.1.2 試劑盒與工具酶 柱式質(zhì)粒提取試劑盒和DNA 膠回收試劑盒均為康為世紀產(chǎn)品;限制性內(nèi)切酶NcoI、NdeI 和SalI,T4DNA 連接酶以及ExTaqDNA 聚合酶均購自于TaKaRa 公司。
1.2.1 基因擴增 以pET28a-pveh2 作為PCR 模板,pveh2-F(5′-CATATGGAATACATAGTACACAG AAC-3′,下劃線為NdeI 的酶切位點)和pveh2-R(5′-GTCGACTCAGAACTTGTTGATAAAATC-3′,下劃線為SalI 的酶切位點)為上下游引物進行擴增反應(yīng):94℃預(yù)變性5 min;94℃變性30 s,50℃退火30 s,72℃延伸60 s,30 個循環(huán);72℃充分延伸10 min。PCR 產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳純化后切膠回收目的基因pveh2,17℃與pUCm-T 連接10 h,利用熱激法轉(zhuǎn)化E. coliJM109感受態(tài)細胞,最后經(jīng)藍白斑篩選、NcoI 單酶切驗證和DNA 測序,將結(jié)果正確的重組質(zhì)粒命名為pUCm-T-pveh2。
1.2.2 基因表達 使用NdeI 和SalI 分別處理pUCm-T-pveh2 和pCold II,并混勻酶切產(chǎn)物進行連接反應(yīng),用連接液轉(zhuǎn)化E. coliRosetta(DE3)感受態(tài)細胞,經(jīng)過氨芐青霉素抗性平板篩選與DNA 測序,獲得重組工程菌E. coliRosetta(DE3)/pCold IIpveh2,即E. coli/pveh2。將E. coli/pveh2 的單菌落接種于含有0.1 mg/mL 氨芐青霉素的LB 培養(yǎng)基中,于37℃、220 r/min 培養(yǎng)10 h,之后按2%(V/V)的接種量轉(zhuǎn)接至新鮮LB培養(yǎng)基內(nèi),同樣于37℃振蕩培養(yǎng),并在OD600達到0.8-1.0 時加入異丙基-β-D-硫代半乳 糖 苷(isopropyl-β-D-thiogalactopyranoside,IPTG)至其終濃度為0.2 mmol/L,在15℃下誘導(dǎo)24 h 后低溫離心收集菌體。濕菌體再經(jīng)真空冷凍干燥處理,獲得的干細胞粉塊用于后續(xù)的生物催化實驗和十二烷基硫酸鈉-聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)分析。
1.2.3 細胞EH 活性的測定 用適量的Na2HPO4-NaH2PO4緩沖液(50 mmol/L,pH7.0)重新懸浮干細胞,配制成均勻的細胞懸浮液,從中量取500 μL 置于25℃下預(yù)熱5 min。然后加入rac-mNSO(終濃度為5 mmol/L)開始反應(yīng),10 min 后向體系中加入1.0 mL 乙酸乙酯(含有約8 mmol/L 正己醇作為內(nèi)標物質(zhì))進行萃取。上層有機相經(jīng)無水硫酸鎂脫水后,借助搭載有Chiralcel?OD-H 手性色譜柱(4.6 mm Φ×250 mm L)與Waters 2489 紫外檢測器的e2695 高效液相色譜(High performance liquid chromatography,HPLC)系統(tǒng)進行檢測和分析。檢測條件:流動相為正己烷∶異丙醇 = 9∶1(V/V),流速0.8 mL/min,柱溫30℃,檢測波長254 nm。HPLC 用于檢測樣品中底物rac-mNSO、水解產(chǎn)物(R)-與(S)-mNPED的含量,保留時間分別為9.65、16.24 和18.46 min左右。細胞的EH 活性則定義為每分鐘催化水解1.0 μmolrac-mNSO 所需要的細胞量。
1.2.4 區(qū)域選擇性系數(shù)的測定 向2.0 mL 適當稀釋的細胞懸浮液中加入rac-mNSO 至其終濃度達到5 mmol/L,于25℃下振蕩反應(yīng)2 h,期間從反應(yīng)混合物中定時取樣100 μL,然后按照1.2.3 所述方法處理樣品。樣品的分析采用氣相色譜(Gas chromatography,GC)儀2010 Plus(日本島津),配備有手性毛細色譜柱CP-ChiralSil-DEX CB(安捷倫)。檢測條件:檢測器和氣化室溫度250℃,載氣為氮氣,吹掃流量為3 mL/min,分流比為1∶40。檢測期間柱溫由100℃以5℃/min 的速率上升至190℃。GC 用于檢測底物rac-mNSO 中R與S兩種構(gòu)型的含量,其保留時間分別為14.01 和15.05 min 左右。最后,各構(gòu)型產(chǎn)物的含量由HPLC 檢測。
用來表征底物和產(chǎn)物光學(xué)純度的對映體過剩率(enantiomer excess,ee)分別為:ees=[(R-S)/(R+S)]×100% ;eep=[(Rd-Sd)/(Rd+Sd)]×100%。其中,R、S、Rd和Sd分別代表(R)-、(S)-mNSO 和(R)-、(S)-mNPED 的濃度。根據(jù)公式eep= αS+βR-1+[(βR-αS)×ees×(1-c)]·c-1, 以ees×(1-c)]·c-1為橫坐標,eep為縱坐標通過線性回歸法推導(dǎo)出區(qū)域選擇性系數(shù)αS與βR值[18],c代表底物rac-mNSO 的轉(zhuǎn)化率,為被水解消耗的racmNSO 與初始量的百分比。
1.2.5 緩沖液體系中的歸一性水解反應(yīng) 向4 組含有40 mg/mLE. coli/pveh2 干細胞的20 mL 磷酸鹽緩沖液中分別加入不同終濃度(5、10、15 和20 mmol/L)的rac-mNSO,于25℃反應(yīng)12 h,期間定時取樣,按照1.2.3 所述處理樣品,進行HPLC 檢測,計算不同時間點rac-mNSO 的c值。
1.2.6 助溶劑種類與劑量的篩選 選取5 種常見的水溶性有機試劑作為底物助溶劑:甲醇、二甲基亞砜(Dimethyl sulfoxide,DMSO)、二甲基甲酰胺(N,N-dimethylformamide,DMF)、異丙醇和丙三醇。利用磷酸鹽緩沖液分別配制含有2%、5%和8%(V/V)上述助溶劑的細胞懸浮液。按照1.2.3 所述方法測量細胞的EH 活性,對照組不添加任何助溶劑。
1.2.7 緩沖液/助溶劑體系中的歸一性水解反應(yīng) 在確定最適助溶劑與劑量后,構(gòu)建4 組含有40 mg/mL 干細胞的20 mL 緩沖液/助溶劑體系,將底物rac-mNSO 的濃度分別提高至20、30、40 和50 mmol/L,于25℃反應(yīng)12 h,按照1.2.3 所述處理樣品,進行HPLC 分析。產(chǎn)物(R)-mNPED 的產(chǎn)率 = 反應(yīng)終止時產(chǎn)物濃度/底物初始濃度×100%。
根據(jù)pveh2 的測序結(jié)果,在GenBank 數(shù)據(jù)庫中查找到編碼PvEH2 的基因組DNA 序列(圖1),其位于菜豆(品種G19833)第6 號染色體上,包含兩段長度分別為465 bp 和239 bp 的內(nèi)含子以及951 bp的開放閱讀框,共編碼316 個氨基酸。利用BDGP啟動子在線分析工具Promoter 預(yù)測的轉(zhuǎn)錄起始位點是位于起始密碼子ATG 中腺嘌呤上游143 bp 處的鳥嘌呤。使用程序PlantCARE 預(yù)測在轉(zhuǎn)錄起始位點-30 和-135 處分別存在真核生物典型的TATA-box(TATAAAT)和CAAT-box(CAATTA)序列。此外,PvEH2 基因的啟動子中還存在與誘導(dǎo)作用相關(guān)的元件ARE、GCN4 和circadian,在-617 位存在增強子(TA-rich region),以及sp1、GT1 和GAG 等多個光感應(yīng)調(diào)控元件。以上預(yù)測結(jié)果表明該基因的轉(zhuǎn)錄水平可能受植物體外環(huán)境脅迫及光信號誘導(dǎo)的影響。
圖1 PvEH2 基因組DNA 序列和氨基酸序列
以rac-mNSO 為底物測得E. coli/pveh2 的EH 活性 為15.4 U/g干細胞, 較E. coli/pET28a-pveh2 的8.1 U/g干細胞有了較為顯著的提高,而經(jīng)IPTG 誘導(dǎo)后的E. coli/pCold II(含有pCold II 空質(zhì)粒的E. coli轉(zhuǎn)化子)未檢測出EH 活性。SDS-PAGE 結(jié)果(圖2)顯示,相較于E. coli/pCold II,E. coli/pET28a-pveh2 與E. coli/pveh2 均在約38.1 kD 處存在明顯的特異蛋白條帶,與預(yù)測的重組PvEH2 的理論值37898 Da 基本一致。此外,E. coli/pveh2 產(chǎn)酶活性的升高可能與PvEH2 表達量的提高有關(guān)(泳道2 和3)。
圖2 重組E. coli 轉(zhuǎn)化子的SDS-PAGE 分析
2.3.1E. coli/pveh2 的區(qū)域選擇性 由線性回歸分析推導(dǎo)出水解反應(yīng)的區(qū)域選擇性系數(shù)αS和βR分別為90.3% 和96.4%,即PvEH2 以90.3% 的 概 率 進攻(S)-mNSO 含氧三元環(huán)上的α 碳原子,使構(gòu)型在反應(yīng)前后發(fā)生翻轉(zhuǎn),生成(R)-mNPED。相反地,針對(R)-mNSO 的情況,PvEH2 則以96.4%的概率進攻β 碳原子,使構(gòu)型得以保持,同樣生成(R)-mNPED(圖3)。說明E. coli/pveh2 或PvEH2 擁有歸一性水解rac-mNSO 的優(yōu)良特性。
圖3 E. coli/pveh2 針對于(R)-和(S)-mNSO 的區(qū)域選擇性
2.3.2 緩沖液體系中底物濃度對轉(zhuǎn)化率的影響 不同rac-mNSO 濃度下的轉(zhuǎn)化率c隨反應(yīng)進程的變化趨勢見圖4。當反應(yīng)進行到6 h 時,10 mmol/L 的racmNSO 幾乎完全水解,即c值在95.0%以上,生成82.4%eep的(R)-mNPED。然而,當?shù)孜餄舛壤^續(xù)提高至15 和20 mmol/L 時,即使反應(yīng)延長至12 h,rac-mNSO 也不能被完全地轉(zhuǎn)化。因此,需要篩選合適的水解體系。
圖4 緩沖液體系中不同濃度底物轉(zhuǎn)化率隨時間的變化
2.3.3 底物助溶劑對全細胞EH 活性的影響 測定E. coli/pveh2 在不同緩沖液/助溶劑體系中的EH 活性,以對照組的相對活性作為100%,結(jié)果如圖5 所示??傮w上,按照E. coli/pveh2 的EH 活性由高到低依次為含有丙三醇、異丙醇、DMSO、DMF 和甲醇的緩沖液。其中,5%和8%(V/V)的丙三醇均使E.coli/pveh2的EH活性較對照組略微提高8.2%和8.9%。綜合考慮后選擇含有5%(V/V)丙三醇的緩沖液作為反應(yīng)體系。
圖5 底物助溶劑對E. coli/pveh2 全細胞EH 活性的影響
2.3.4 緩沖液/丙三醇體系中的歸一性水解 基于上述篩選的結(jié)果,構(gòu)建含有5%(V/V)丙三醇的緩沖液反應(yīng)體系,并研究了20-50 mmol/Lrac-mNSO 的水解情況(表1)。當反應(yīng)進行到12 h 時,40 mmol/L及以下濃度底物的c值超過95.0%,且(R)-mNPED的產(chǎn)率均超過90.0%。但是,當rac-mNSO 繼續(xù)提升至50 mmol/L 時,高細胞濃度(40 mg干細胞/mL 約相當于250 mg濕細胞/mL)的E. coli/pveh2 無法有效將其水解。因此,在緩沖液/丙三醇體系內(nèi),最高底物濃度由原先單緩沖液體系的10 mmol/L 提高至40 mmol/L。另外,底物在歸一性水解反應(yīng)進程中的代表性HPLC 色譜圖如圖6 所示。
表1 緩沖液/丙三醇體系中各濃度底物在12 h 時的水解結(jié)果
圖6 底物rac-mNSO(40 mmol/L)的c 值分別達到0%(a),45.0%(b)和95.2%(c)時的HPLC 譜圖
絕大多數(shù)植物來源的EH 屬于α/β 折疊型水解酶超家族[22],盡管在氨基酸組成和三維結(jié)構(gòu)等方面存在一定的相似性,但是這些植物EH 的底物譜各具特色,其中也不乏擁有良好立體選擇性的野生型酶與環(huán)氧化物底物的反應(yīng)組合。例如,赤豆EH 與苯基縮水甘油醚[8]、綠豆EH 與對硝基環(huán)氧苯乙烷[17]以及馬鈴薯EH 與環(huán)氧苯乙烷[23]等。
大多數(shù)已報道的組合是關(guān)于環(huán)氧化物的拆分反應(yīng),而借助于單酶實現(xiàn)特定環(huán)氧化物歸一性水解的案例則相對較少[21]。就rac-mNSO 而言,利用經(jīng)過突變改造后的菜豆PvEH1 進行10 mmol/L 底物的反應(yīng),也僅使(R)-mNPED 的eep從14.7%提升至52.3%[12]。使用同樣是菜豆來源的野生型PvEH2 作為催化劑,所得二醇的eep可超過80.0%,這主要歸因于該酶針對S和R型底物高且互補的區(qū)域選擇性(αS=90.3%,βR=96.4%),均好于PvEH3(αS=64.4%,βR=71.5%)[20]、mbEHA(αS=82.0%,βR=93.0%)[24]和VrEH3(αS=74.2%,βR=89.0%)[25]。 迄 今 為止,也僅有很少的借助于生物法制備(R)-mNPED的 報 道。Jin 等[26]利用100 mg/mL 表達有EH 的Aspergillus niger濕細胞水解12.1 mmol/Lrac-mNSO,但是(R)-mNPED 的產(chǎn)率和eep僅有48%和66%。本研究采用全細胞代替其破碎液或純酶作為催化劑,主要是由于前者容易獲得且一般情況下比后者穩(wěn)定[27-28]。目前已有很多使用表達有EH 的全細胞來轉(zhuǎn)化環(huán)氧化物的報道[13,25,29]。此外,由實驗中的對照組可知,宿主E.coli/Rosetta(DE3)中未檢測到rac-mNSO 的水解活性,結(jié)果與先前報道相一致[30-31]。
由EH 介導(dǎo)的不對稱水解被認為是一種頗具研究與應(yīng)用價值的生物催化途徑,但是目前能夠?qū)崿F(xiàn)大規(guī)模催化的反應(yīng)卻很少[32],其主要問題在于環(huán)氧化物底物在水中的溶解度低以及底物、產(chǎn)物對EH的抑制作用等[33-35]。為了克服上述瓶頸,一些有機試劑被添加到水相反應(yīng)體系內(nèi),作為底物的助溶劑。憎水性的有機試劑與水相形成雙相體系[36-37],而一定量的親水性有機試劑則與水互溶保持為單相體系[38-39]。在雙相體系內(nèi),有機試劑分子和相界面的毒性容易使酶失活[40]。向反應(yīng)體系中加入適量的親水性有機試劑是一種較為溫和而有效的策略。本研究基于E. coli/pveh2 的催化活性,從預(yù)先構(gòu)建好的15 種含有不同種類和劑量親水性有機試劑的緩沖液中,篩選到最適的反應(yīng)體系為緩沖液/5%(V/V)丙三醇。這可能是由于體系內(nèi)的丙三醇一方面起到了助溶底物的作用;另一方面增加了酶的穩(wěn)定性。在相同的反應(yīng)條件下,將rac-mNSO 的最高反應(yīng)濃度較原先的緩沖液體系提高了3 倍。
PvEH2 的基因來源于菜豆中,其轉(zhuǎn)錄水平可能與植物體外環(huán)境條件的誘導(dǎo)有關(guān)。SDS-PAGE 與全細胞EH 的測定結(jié)果表明,冷休克表達體系能夠提高PvEH2 在E. coli中的表達量,進而提高了重組工程菌的EH 活性。區(qū)域選擇性分析顯示,E.coli/pveh2 或PvEH2 針對于R和S兩種構(gòu)型的底物同時表現(xiàn)出高且互補的區(qū)域選擇性,結(jié)合底物的水解結(jié)果,證實了E. coli/pveh2 具有很好的對映歸一性水解rac-mNSO 的能力。針對磷酸緩沖液中底物濃度低的問題,本研究構(gòu)建并優(yōu)化了一種緩沖液/有機助溶劑體系,顯著的提高了底物的最高反應(yīng)濃度。