隨著二代測序的產(chǎn)生和快速發(fā)展,特別是RNA 測序的應(yīng)用,長鏈非編碼RNA(LncRNA)逐漸成為生命科學(xué)領(lǐng)域的研究熱點。目前LncRNA在心血管疾病方面的研究相對較少,但某些特定LncRNA可能與冠心病的發(fā)生發(fā)展息息相關(guān)?,F(xiàn)就目前國內(nèi)外對LncRNA的功能機制研究及幾種特定的LncRNA在冠心病發(fā)生發(fā)展中的作用進行綜述。
1.1 LncRNA的功能特性 LncRNA由大于200個核苷酸組成,但不具有蛋白質(zhì)編碼功能的RNA轉(zhuǎn)錄序列。位于細胞核或細胞質(zhì)中,在哺乳動物基因組中被普遍轉(zhuǎn)錄。目前關(guān)于LncRNA尚無統(tǒng)一的分類標準[1]。LncRNA的重要特性:①重復(fù)序列較少,一旦轉(zhuǎn)錄終止,LncRNA會迅速降解;②LncRNA結(jié)合位點單一[2-3]。
例如,Tsix和RepA/Xist都只有單一的靶點。LncRNA只有一個內(nèi)含子,轉(zhuǎn)錄活性較弱,并且在進化上保守性較差。
1.2 LncRNA的來源及作用機制 LncRNA的來源[4-5]:①蛋白編碼基因斷裂后形成;②染色質(zhì)重排過程中,兩個分開且相距甚遠的區(qū)域合并形成;③非編碼基因通過在相關(guān)酶的作用下反轉(zhuǎn)錄形成;④小非編碼RNA中的某段序列通過連續(xù)重復(fù)事件而復(fù)制形成;⑤蛋白編碼基因在轉(zhuǎn)錄過程中插入一段序列形成。LncRNA的作用機制:LncRNA主要通過染色質(zhì)調(diào)控,轉(zhuǎn)錄后調(diào)控,蛋白復(fù)合物的組織,細胞信號傳導(dǎo)和蛋白質(zhì)變構(gòu)調(diào)節(jié)來調(diào)控轉(zhuǎn)錄[6]。
2.1 ANRIL與冠心病 2007年,全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)在以歐洲為主的冠心病和心肌梗死人群中首次發(fā)現(xiàn)染色體9p21(Chr9p21)與冠心病之間有著密切聯(lián)系,這是心血管疾病遺傳學(xué)領(lǐng)域一個里程碑的發(fā)現(xiàn)[7]。研究發(fā)現(xiàn)盡管Chr9p21與冠心病相關(guān)聯(lián)的基因組區(qū)域是“基因沙漠”,沒有蛋白質(zhì)編碼基因,但該區(qū)域含有長的基因間非編碼RNA,在INK4基因座(位于Chr9p21)中這種長鏈非編碼RNA被稱為反義非編碼RNA,簡稱ANRIL或CDKN2BAS ,其表達與冠心病相關(guān)[8-9],且獨立于大多數(shù)傳統(tǒng)的冠心病危險因素[10]。研究證實,ANRIL在多種與動脈粥樣硬化相關(guān)細胞系中表達,包括血管內(nèi)皮細胞、單核細胞衍生的巨噬細胞和冠狀動脈平滑肌細胞,并在動脈粥樣硬化斑塊內(nèi)表達水平升高,其轉(zhuǎn)錄本水平與動脈粥樣硬化的嚴重程度直接相關(guān)[11-12]。與冠心病關(guān)聯(lián)性最強的幾個單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)經(jīng)鑒定被定位于在ANRIL中或ANRIL(rs1333049:C>G)的一個SNP位點與急性心肌梗死顯著相關(guān)[13-15]。Wang等[16]通過相關(guān)薈萃分析論證了ANRIL的另一個SNP位點(rs2383207)與冠心病患病風(fēng)險明顯相關(guān)。關(guān)于ANRIL的作用機制:Jarinova等[17]研究發(fā)現(xiàn),ANRIL可以影響P15INK4b表達,P15INK4b 為一種腫瘤抑制因子,可促進血管重建,抑制病理性血管內(nèi)膜的增生,從而延緩動脈粥樣硬化(AS)的形成。ANRIL可以通過抑制P15INK4b 的表達而發(fā)揮促AS的作用。目前認為冠心病為一種炎性疾病,Zhou等[18]研究發(fā)現(xiàn),ANRIL的轉(zhuǎn)錄受血管內(nèi)皮細胞(endothelial cell,EC)中促炎癥因子腫瘤壞死因子-α(TNF-α)的誘導(dǎo),ANRIL可調(diào)節(jié)NF-κB信號下游炎性基因的表達,即ANRIL參與TNF-α/NF-κB信號傳導(dǎo)以調(diào)節(jié)內(nèi)皮細胞中的炎癥反應(yīng),從而參與冠心病的發(fā)生發(fā)展,該研究還發(fā)現(xiàn)ANRIL與冠心病病人的促炎因子TNF-α/ 白介素-6(IL-6)/ 白介素-8(IL-8)相關(guān)聯(lián)。Holdt等[19]通過細胞培養(yǎng)研究發(fā)現(xiàn),ANRIL中的Alu基序(Alu elements)對于促動脈粥樣硬化功能至關(guān)重要,并且這種功能在人體受試者中同樣存在。
2.2 LincRNA-p21與冠心病 LincRNA-p21又叫腫瘤蛋白p53通路共抑制劑1 (tumor protein p53 pathway corepressor 1, TP53COR1),為一種長鏈非編碼RNA,在p53依賴性基因轉(zhuǎn)錄反應(yīng)中起阻遏物的作用[20]。有研究發(fā)現(xiàn)在apoE敲除小鼠的動脈硬化斑塊中LincRNA-p21的表達明顯下降,LincRNA-p21在體外可抑制與AS相關(guān)的血管平滑肌細胞(VSMCs)和單核巨噬細胞的細胞增殖并誘導(dǎo)細胞凋亡,并且研究還發(fā)現(xiàn)在冠心病病人中冠狀動脈組織及外周血中LincRNA-p21表達均下降;該研究表明LincRNA-p21是AS過程中細胞增殖和凋亡的關(guān)鍵調(diào)節(jié)因子,推測在動脈粥樣硬化和冠心病的發(fā)展中可發(fā)揮一定的抗AS作用[21]。有研究發(fā)現(xiàn),中國漢族人群中LincRNA-p21基因的單倍型G-A-A-G(rs9380586-rs4713998-rs6930083-rs6931097)可能與冠心病和心肌梗死的患病風(fēng)險降低相關(guān),在年齡較小的受試者(≤60歲)中影響更為顯著[22]。
2.3 MIAT與心肌梗死 通過使用52 608個單倍型的SNP標記,在來自3 435個心肌梗死病人和3 774個對照的大樣本病例對照關(guān)聯(lián)研究中,首先鑒定了一種LncRNA,稱為心肌梗死相關(guān)轉(zhuǎn)錄本(myocardial infarction associated transcript ,MIAT),其位于22q12.1染色體上的心肌梗死易感基因位點,該研究表明,MIAT可能在心肌梗死的發(fā)病機制中發(fā)揮部分作用[23]。Vausort等[24]通過對414例心肌梗死病人與86名健康對照者全血細胞中包括MIAT在內(nèi)的5種LncRNA表達水平研究得出結(jié)論,與健康志愿者相比,急性心肌梗死病人HIF1a-AS2、KCNQ1OT1和MALAT1升高,ANRIL降低,HIF1a-AS2水平因胸痛發(fā)作時間而異,此外,MIAT與吸煙有相關(guān)性,與血液中淋巴細胞計數(shù)呈正相關(guān),與中性粒細胞計數(shù)、血小板計數(shù)呈負相關(guān),且ANRIL、KCNQ1OT1、MIAT和MALAT1對區(qū)分ST段抬高心肌梗死(STEMI)和非ST段抬高心肌梗死(NSTEMI)具有良好的預(yù)測能力。另外,有研究通過手術(shù)結(jié)扎成年雄性C57/BL6小鼠冠狀動脈造成急性心肌梗死24 h后,發(fā)現(xiàn)小鼠的心臟中有2種LncRNA、MIAT1與 MIAT2升高最為明顯(分別升高5倍和13倍),并在時間進程分析中發(fā)現(xiàn),這兩種LncRNA的表達在心肌梗死后24 h達到峰值,并在2 d后返回到基線[24]。進一步研究發(fā)現(xiàn),MIAT1與MIAT2的表達水平和梗死面積呈負相關(guān)(r=-0.80),和射血分數(shù)(EF)之間可能存在正相關(guān)性(r值分別為0.85和0.80),且MIAT1、MIAT2與已知參與左心室重塑的基因具有相關(guān)性,研究提示MIAT1與MIAT2可能抑制心肌梗死后左心室重塑。另外一項細胞實驗研究發(fā)現(xiàn),AS病人的血清和氧化型低密度脂蛋白(ox-LDL)誘導(dǎo)的AS細胞模型中MIAT表達上調(diào),microRNA-181b(miR-181b)表達下調(diào)。MIAT促進細胞增殖,加速細胞周期進程并抑制ox-LDL誘導(dǎo)的AS細胞系中的細胞凋亡,而miR-181b表達可部分逆轉(zhuǎn)這種作用。該研究表明,MIAT通過“分子海綿”的作用隔離miR-181b,來增強STAT3的表達,從而發(fā)揮促AS作用,這為MIAT在AS治療中的潛在應(yīng)用提供了新的視角[25]。
2.4 其他與冠心病相關(guān)的LncRNA Yang等[26]研究發(fā)現(xiàn)血漿中長鏈非編碼RNA AC100865.1(簡稱CoroMarker),可作為冠心病的一個穩(wěn)定敏感及特異的生物學(xué)標志物。Gao等[27]研究發(fā)現(xiàn),LncRNA-H19多態(tài)性與中國人冠心病的嚴重程度相關(guān)。Wang等[28]發(fā)現(xiàn)LncRNA自噬促進因子(autophagy promoting factor,APF),可通過靶向調(diào)節(jié)miR-188-3p和ATG7抑制細胞自噬和心肌梗死,APF水平的調(diào)節(jié)可以作為心肌梗死和心力衰竭的新型治療策略和診斷工具。
盡管LncRNAs與冠心病及相關(guān)心血管疾病之間的關(guān)聯(lián)已經(jīng)得到了廣泛的關(guān)注及研究,但仍有許多問題尚未解決,極大地限制了其臨床應(yīng)用。第一,因為1個LncRNA可能的靶向基因有數(shù)十個甚至數(shù)百個,所以LncRNA的人工干預(yù)可能導(dǎo)致眾多的下游目標基因出現(xiàn)不可預(yù)期的改變;第二,經(jīng)過化學(xué)修飾的LncRNA的毒性作用尚未確定,其脫靶效應(yīng)尚不清楚;第三,目前關(guān)于LncRNAs代謝的藥代動力學(xué)知識仍然不足。因此,需要進一步重點研究LncRNA的功能和作用機制,為LncRNA的臨床應(yīng)用提供可靠的證據(jù),相信在不久的將來,會有更多的LncRNAs被發(fā)現(xiàn)參與心血管疾病發(fā)生發(fā)展,并且LncRNA會作為臨床動脈粥樣硬化和相關(guān)心血管疾病的新型預(yù)測因子及新的治療靶點。