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        中國農(nóng)科院棉花所開放棉花資源和基因數(shù)據(jù)共享

        2020-01-08 18:41:54
        種業(yè)導(dǎo)刊 2020年2期
        關(guān)鍵詞:二倍體變異基因組

        近日,由中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院棉花研究所生物信息與分子設(shè)計中心構(gòu)建的棉花資源和網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站(http://grand.cricaas.com.cn)正式上線。

        該數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站(Gossypium Resource And Network Database,GRAND)目前主要功能有:棉花SNP變異和Indel變異,基因組注釋信息以及基因家族信息的可視化瀏覽、多重標(biāo)準(zhǔn)檢索,比較檢索,基因檢索,Marker檢索以及表型性狀檢索等多種檢索功能、引物設(shè)計、表達譜展示、數(shù)據(jù)下載與上傳等。近年來,棉花所完成了二倍體雷蒙德氏棉(D基因組)、二倍體亞洲棉(A基因組)及四倍體陸地棉(A/D組)全基因組測序及圖譜繪制工作,在棉花基因組測序領(lǐng)域占據(jù)國際領(lǐng)先地位。GRAND數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站整合和挖掘了棉花所完成的棉花全基因組測序數(shù)據(jù)及其他相關(guān)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),并向全球開放。

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