中國農(nóng)科院棉花所開放棉花資源和基因數(shù)據(jù)共享
2020-01-08 18:41:54
種業(yè)導(dǎo)刊 2020年2期
關(guān)鍵詞：數(shù)據(jù)庫信息
近日，由中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院棉花研究所生物信息與分子設(shè)計(jì)中心構(gòu)建的棉花資源和網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站(http://grand.cricaas.com.cn)正式上線。
該數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站(Gossypium Resource And Network Database，GRAND)目前主要功能有：棉花SNP變異和Indel變異，基因組注釋信息以及基因家族信息的可視化瀏覽、多重標(biāo)準(zhǔn)檢索，比較檢索，基因檢索，Marker檢索以及表型性狀檢索等多種檢索功能、引物設(shè)計(jì)、表達(dá)譜展示、數(shù)據(jù)下載與上傳等。近年來，棉花所完成了二倍體雷蒙德氏棉(D基因組)、二倍體亞洲棉(A基因組)及四倍體陸地棉(A/D組)全基因組測序及圖譜繪制工作，在棉花基因組測序領(lǐng)域占據(jù)國際領(lǐng)先地位。GRAND數(shù)據(jù)庫網(wǎng)站整合和挖掘了棉花所完成的棉花全基因組測序數(shù)據(jù)及其他相關(guān)轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù)，并向全球開放。
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