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        環(huán)狀RNA與肺癌相關(guān)性及其篩選驗(yàn)證的研究進(jìn)展

        2020-01-06 08:28:23鮑綠地
        中國(guó)典型病例大全 2020年10期
        關(guān)鍵詞:生物標(biāo)志物肺癌

        鮑綠地

        摘要:過(guò)去的十年,肺癌的發(fā)病率和死亡率顯著增加,嚴(yán)重威脅著人類健康。因缺乏敏感和有效的早期診斷指標(biāo)以及發(fā)生轉(zhuǎn)移和復(fù)發(fā)、化療耐藥等影響,肺癌患者總體5年生存率并不樂(lè)觀?,F(xiàn)在有研究發(fā)現(xiàn),在肺癌的相關(guān)生物樣本中能篩選驗(yàn)證出諸多差異表達(dá)的環(huán)狀RNA,并且環(huán)狀RNA在肺癌的發(fā)生發(fā)展過(guò)程中發(fā)揮著重要作用,有望作為肺癌早期診斷及預(yù)測(cè)治療預(yù)后的一種新型生物標(biāo)志物。環(huán)狀RNA的篩選驗(yàn)證技術(shù)也在不斷地被探索研究。本文結(jié)合最新的研究,對(duì)環(huán)狀RNA與肺癌相關(guān)性及其篩選驗(yàn)證的研究進(jìn)展做一綜述。

        關(guān)鍵詞:環(huán)狀RNA;肺癌;生物標(biāo)志物;篩選驗(yàn)證

        【中圖分類號(hào)】R56;R737.9 【文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼】A 【文章編號(hào)】1673-9026(2020)10-174-02

        據(jù)報(bào)道,在過(guò)去的十年里肺癌的發(fā)病率和死亡率呈顯著增加,嚴(yán)重威脅著人類健康。肺癌中,非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)是肺癌最常見(jiàn)的組織病理學(xué)亞型,包括大細(xì)胞肺癌(LCC)、肺鱗狀細(xì)胞癌(LSCC)和肺腺癌(LAD)。如今NSCLC的治療取得了很大進(jìn)展,早期NSCLC經(jīng)手術(shù)治療后患者5年生存率可達(dá)70%-90% ,但因缺乏敏感和有效的早期診斷指標(biāo)以及發(fā)生轉(zhuǎn)移和復(fù)發(fā)、化療耐藥影響,約75%的患者在就診時(shí)已是進(jìn)展期或晚期,錯(cuò)過(guò)了最佳治療時(shí)間,使得非小細(xì)胞肺癌患者的總體5年生存率很低,而小細(xì)胞肺癌( SCLC)在肺癌中僅占約15%,但是SCLC更具侵襲性,超過(guò)90%的患者在診斷時(shí)已是晚期,患者5年生存率僅為5%[1]。為此,迫切需要尋找肺癌早期診斷和治療的生物標(biāo)志物,以供臨床能實(shí)施早期并且準(zhǔn)確的干預(yù),讓肺癌患者的預(yù)后得到有效地改善。

        1肺癌中的環(huán)狀RNA

        1.1肺癌組織細(xì)胞的環(huán)狀RNA

        1.1.1非小細(xì)胞肺癌

        差異表達(dá)的環(huán)狀RNA作為一種競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源性核糖核酸(ceRNA)在非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)的發(fā)生和發(fā)展中起著重要作用。張韶巖等[2]對(duì)NSCLC癌組織與癌旁組織的表達(dá)譜變化進(jìn)行篩選后,發(fā)現(xiàn)差異表達(dá)的circRNA共有171種,高表達(dá)的circRNA有148種,低表達(dá)的有23種,其中高表達(dá)差異3倍以上的37種,低表達(dá)差異3倍以上的有2種。另外,經(jīng)篩選驗(yàn)證在非小細(xì)胞肺癌的組織細(xì)胞中,CCIRC_ZKSKAN1[1],hsa_circ_0014130[3],circ_ABCB10[4],circFOXM1[5],circNT5E[6],circAcAcA[7],Circ_CMPK1[8],circHIPK3[9],Hsa_circ_0003998[10]表達(dá)上調(diào),可促進(jìn)非小細(xì)胞肺癌的進(jìn)展。circ 0072309[11],circ_0078767[12]表達(dá)上調(diào),可阻斷非小細(xì)胞肺癌的進(jìn)展。circRNA circPIP5K1A[13],Has_circ_0014130[14],has_circ_0079530[14],circ0003645[15]表達(dá)上調(diào),與非小細(xì)胞肺癌的預(yù)后有關(guān) 。這些環(huán)狀RNA都有望成為非小細(xì)胞肺癌有前途的生物標(biāo)志物。

        肺腺癌(LAD)約占所有肺癌亞型的40%,是全世界與癌癥相關(guān)的死亡的最常見(jiàn)原因。LAD患者的平均生存率很低,為4%至17%[16]?,F(xiàn)有研究表明,在肺腺癌組織細(xì)胞中,circ_CRIM1[17]表達(dá)上調(diào),會(huì)抑制肺腺癌細(xì)胞的遷移、侵襲、轉(zhuǎn)移,hsa_circ_0000326[18],Circ_ZNF609[19],CDR1_AS[20],CircCRIM1[21],circ_CAMK2A[22],circ0012673[23],hsa_circ_0014130[24]表達(dá)上調(diào),會(huì)影響肺腺癌細(xì)胞的增殖、遷移和凋亡,預(yù)后。這些環(huán)狀RNA可以成為肺腺癌有前途的生物標(biāo)志物。

        肺鱗狀細(xì)胞癌(LSCC)是非小細(xì)胞肺癌的主要亞型. 有研究證實(shí),hsa_circ_0077837和hsa_circ_0001821可以作為L(zhǎng)AD和LSCC的潛在生物標(biāo)志物,而hsa_circ_0001495可能是LSCC的診斷生物標(biāo)志物[25]。

        1.1.2小細(xì)胞肺癌

        與非小細(xì)胞肺癌相比,小細(xì)胞肺癌(SCLC)具有惡性度高、容易轉(zhuǎn)移等特點(diǎn)。目前對(duì)小細(xì)胞肺癌相關(guān)環(huán)狀RNA的研究較少見(jiàn)報(bào)道。最近Li 等研究表明,F(xiàn)LI1外顯子circRNA(FECR)是SCLC的致癌因素,F(xiàn)ECR1(外顯子4-2-3)和FECR2(外顯子5-2-3-4)在SCLC組織細(xì)胞中表達(dá)異常上調(diào),并且與淋巴結(jié)呈正相關(guān)轉(zhuǎn)移,F(xiàn)LI1該基因可能通過(guò)編碼FLI1癌蛋白并產(chǎn)生FECRs在SCLC的發(fā)病過(guò)程中起雙重作用,可用作追蹤SCLC疾病進(jìn)展的生物標(biāo)志物[26]。

        1.2肺癌血液外泌體的環(huán)狀RNA

        外泌體是一類納米級(jí)的(30-150 nm)細(xì)胞外囊泡,能被大多數(shù)類型的細(xì)胞脫落并在體液(如血液,尿液,唾液和母乳)中循環(huán),其內(nèi)容物廣泛,有各種生長(zhǎng)因子、蛋白質(zhì)、脂質(zhì)、核酸、長(zhǎng)的非編碼RNA和環(huán)狀RNA(circRNA)組成。外泌體作為細(xì)胞間的重要載體,可將蛋白質(zhì)、核糖核酸和其他成分從細(xì)胞傳遞到細(xì)胞外空間,通過(guò)在細(xì)胞通訊中起重要信使作用,對(duì)疾病的病理生理過(guò)程起著重要影響。Li等[27]發(fā)現(xiàn),環(huán)狀RNA在血清外泌體中是穩(wěn)定存在的,其形態(tài)仍然是完整的圓形環(huán)狀,而且大部分circRNA的半衰期長(zhǎng)于mRNA,大多數(shù)物種的circRNA半衰期超過(guò)了48 小時(shí)。也有研究表明,環(huán)狀RNA在體液(包括血清外體、血漿和唾液)中更加豐富和穩(wěn)定,在人唾液和外周血中,數(shù)百種環(huán)狀RNA比同源線性mRNA表達(dá)更高,更容易檢測(cè)。肺癌患者的血漿外泌體中也存在環(huán)狀RNA差異表達(dá),環(huán)狀RNA有可能是非侵入性檢查中較理想的生物標(biāo)志物。

        1.2.1非小細(xì)胞肺癌

        經(jīng)篩選驗(yàn)證發(fā)現(xiàn),有一種由主要位于細(xì)胞質(zhì)中的EML4-ALK融合基因產(chǎn)生的融合環(huán)狀RNA(F-circEA),明確存在于EML4-ALK陽(yáng)性非小細(xì)胞肺癌患者血漿中,F(xiàn)-circEA可能是非小細(xì)胞肺癌的新型液體活檢生物標(biāo)志物[28]。非小細(xì)胞肺癌患者血漿circFARSA 的含量也高于健康對(duì)照組,circFARSA 可能成為 NSCLC 的潛在生物標(biāo)志物[29]。

        此外,在研究肺腺癌患者血漿外泌體中的差異表達(dá)環(huán)狀RNA(circRNA)時(shí),Chen等[30]共篩選了182種差異表達(dá)的外泌體circRNA,與對(duì)照組相比,LAD患者血漿中有105個(gè)上調(diào)和78個(gè)下調(diào),包括circ_0001492,circ_0001346,circ_0000690和circ_0001439在內(nèi)的四個(gè)上調(diào)的circRNA與qRT-PCR的測(cè)序數(shù)據(jù)相同,揭示了LAD患者血漿樣品中外體circRNA表達(dá)的改變,并支持了探索其作為生物標(biāo)志物的潛力和肺癌的病理效應(yīng)的需求。

        Wang等[31]也提出,hsa_circ_0014235和hsa_circ_0025580可作為(LSCC)的新型診斷生物標(biāo)志物,經(jīng)臨床研究后他們首次揭示了外泌體circRNA在肺鱗狀細(xì)胞癌中的表達(dá)譜,并顯示了circRNA在肺鱗狀細(xì)胞癌中的重要診斷潛力。

        1.2.2小細(xì)胞肺癌

        有研究顯示,與對(duì)照組相比,小細(xì)胞肺癌(SCLC)中的血清外體circRNA(FECR1)異常上調(diào),血清外泌體FECR1表達(dá)水平伴隨著小細(xì)胞肺癌的臨床化療改變,血清外體FECR1可以作為追蹤SCLC疾病進(jìn)展的有前途的生物標(biāo)記[26]。

        2環(huán)狀 RNA 的篩選驗(yàn)證

        環(huán)狀 RNA的篩選驗(yàn)證技術(shù)一直在被探索研究,但目前對(duì)環(huán)狀RNA的研究仍然還存在困難,如環(huán)狀 RNA因結(jié)構(gòu)特殊沒(méi)有游離的 3′和 5′端,無(wú)法用傳統(tǒng)的分子生物學(xué)技術(shù)進(jìn)行篩選驗(yàn)證;標(biāo)本中環(huán)狀RNA通常表達(dá)量較低,不便于檢測(cè)。大量RNA測(cè)序數(shù)據(jù)顯示,可在測(cè)序結(jié)果中尋找兩個(gè)重排外顯子之間的結(jié)點(diǎn),來(lái)篩選可能存在的環(huán)狀 RNA。隨著科技發(fā)展也出現(xiàn)了許多商業(yè)化篩選技術(shù),如高通量測(cè)序又名二代測(cè)序、基因芯片。其中高通量測(cè)序成本較高,但可以發(fā)現(xiàn)新的環(huán)狀 RNA,而基因芯片成本相對(duì)較低,只能篩選已知的環(huán)狀 RNA。

        目前在實(shí)驗(yàn)室中主要有以下幾種環(huán)狀 RNA驗(yàn)證方法:(1) RT-PCR 定量法:針對(duì)環(huán)狀 RNA 的反向剪接位點(diǎn)設(shè)計(jì)一對(duì)發(fā)散引物,使環(huán)狀RNA按預(yù)期擴(kuò)增,然后對(duì)擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行 Sanger 測(cè)序確認(rèn)環(huán)狀RNA。(2)探針雜交法:RNase H 是一個(gè)可以降解 RNA-DNA中RNA分子的核酸內(nèi)切酶。當(dāng)兩個(gè)短的 DNA 探針雜交至目的RNA分子時(shí),若該RNA分子為線性,則在 RNase H 消化后電泳出現(xiàn)三條帶;若該RNA分子為環(huán)狀,則為兩條帶,根據(jù)電泳條帶即可驗(yàn)證環(huán)狀RNA。(3)二維變性聚丙烯酰胺凝膠(2D-PAGE)電泳:根據(jù)環(huán)狀RNA的遷移率比線性 RNA 分子要慢,在2D-PAGE中線性RNA沿對(duì)角線遷移而環(huán)狀 RNA 則弧向遷移來(lái)鑒別驗(yàn)證。在實(shí)際研究中往往需結(jié)合以上多種方法來(lái)驗(yàn)證環(huán)狀RNA。

        另外,近年來(lái)發(fā)展起來(lái)的一些RNA檢測(cè)技術(shù)也可以為環(huán)狀RNA篩選驗(yàn)證的研究和未來(lái)發(fā)展提供新思路。如依賴核酸序列的擴(kuò)增(NASBA)技術(shù)和CRISPR基因編輯技術(shù)。NASBA技術(shù),是檢測(cè)RNA的一種新型等溫?cái)U(kuò)增技術(shù),適用于很多RNA樣品的分析。而基于CRISPR的聯(lián)合檢測(cè)工具可以整合常見(jiàn)分子診斷技術(shù)的優(yōu)勢(shì),既有qPCR、數(shù)字PCR等其它分子診斷技術(shù)的卓越性能,也比其他等溫?cái)U(kuò)增技術(shù)具有更好的靈敏度和特異性。

        3 討論與展望

        近些年環(huán)狀 RNA的研究掀起了肺癌研究領(lǐng)域的熱點(diǎn),已有研究證實(shí),環(huán)狀 RNA在肺癌中穩(wěn)定異常表達(dá),具有良好的靈敏度與特異性,與肺癌不良預(yù)后相關(guān),為肺癌的早期診斷與預(yù)后標(biāo)記物的開(kāi)發(fā)提供了新希望。

        但目前環(huán)狀 RNA與肺癌相關(guān)性的研究還處于基礎(chǔ)階段,仍存在一些局限性:(1)大多數(shù)研究?jī)H限于NSCLC,circRNA在SCLC患者中的價(jià)值研究較少。(2)大多數(shù)研究集中于腫瘤組織與正常鄰近組織之間的差異表達(dá)比較,其他生物樣本,如血清、血漿或痰液中circRNA的表達(dá)與診斷價(jià)值研究較少。(3)研究多數(shù)僅基于單中心、小樣本的單個(gè)circRNA研究。需要針對(duì)多個(gè)circRNA構(gòu)建肺癌相關(guān)的circRNA組(circRNA panel)進(jìn)行研究才更具臨床價(jià)值。不過(guò)隨著生物學(xué)技術(shù)發(fā)展,相信circRNA的研究會(huì)出現(xiàn)廣闊的應(yīng)用前景,很有可能成為肺癌潛在的早期診斷、預(yù)測(cè)預(yù)后及治療的標(biāo)志物。同時(shí)隨著環(huán)狀RNA篩選驗(yàn)證技術(shù)的研究發(fā)展,環(huán)狀RNA將為肺癌的精準(zhǔn)治療提供新策略。

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