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        血液來(lái)源表皮葡萄球菌生物被膜形成能力及agr 基因多態(tài)性調(diào)查

        2019-12-25 08:28:14胡洪華黃文芳楊永長(zhǎng)
        關(guān)鍵詞:生物研究

        胡洪華 喻 華 黃文芳 楊永長(zhǎng)

        四川省醫(yī)學(xué)科學(xué)院·四川省人民醫(yī)院檢驗(yàn)科,四川成都 610072

        表皮葡萄球菌(Staphylococcus epidermidis,SE)是一種常定居于人體皮膚表面和黏膜表面的共生菌,通常被認(rèn)為是非致病菌[1]。近年來(lái),各種植入性醫(yī)用材料等在臨床應(yīng)用日益增多,SE 已成為院內(nèi)感染的重要致病菌。有統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)顯示,美國(guó)每年用于治療SE 引起的血流感染的費(fèi)用約20 億美元[2]。SE 的最主要致病因素是形成生物被膜,生物被膜的形成受多基因的調(diào)節(jié),附屬基因調(diào)節(jié)因子(accessory gene regulator,agr)是SE 生物被膜形成過(guò)程中重要的調(diào)控因子[3]。SE 形成生物被膜,導(dǎo)致持續(xù)性和反復(fù)性感染,已引起臨床高度重視。本研究以臨床分離血液來(lái)源SE 為研究對(duì)象,分析其agr 基因多態(tài)性和生物被膜的形成能力。

        1 材料與方法

        1.1 菌株收集

        SE 來(lái)自于2012 年3 月~2015 年2 月四川省人民醫(yī)院住院患者分離的血液來(lái)源菌株,無(wú)重復(fù)菌株,所有菌株采用全自動(dòng)微生物分析系統(tǒng)VITEK 2.0 鑒定。

        1.2 儀器和試劑

        PCR 反應(yīng)試劑盒(北京康為世紀(jì)公司,批號(hào):40111);DNA 提取液(達(dá)安基因公司,批號(hào):20190226);結(jié)晶紫(Baso 公司,批號(hào):419012);PTC-200 型PCR 擴(kuò)增儀(美國(guó)Bio-Rad 公司)。

        1.3 DNA 的提取

        常規(guī)復(fù)蘇菌株,接種于血平板,置37℃,5%CO2培養(yǎng)20 h,挑起單克隆于1 mL 的生理鹽水中,10 000 r/min離心5 min,離心機(jī)半徑9.5 cm,去上清,收集細(xì)菌。加入30 μL 的DNA 提取液,吹打混勻,100℃加熱10 min,冷卻后10 000 r/min 離心5 min,離心機(jī)半徑9.5 cm,上清液即為含有DNA 溶液。

        1.4 生物被膜表型分析

        生物被膜形成能力的檢測(cè)參照Vuong 等[4]的報(bào)道,接種于液體LB 培養(yǎng)基中,通過(guò)37℃,220 r/min 振搖培養(yǎng)20 h,用含0.25%葡萄糖的TSB 培養(yǎng)基于1∶200 稀釋配置成試驗(yàn)菌液,每孔200 μL 接種于96孔培養(yǎng)板,每個(gè)菌株重復(fù)8 孔,以空白TSB 培養(yǎng)基為對(duì)照,置于37℃培養(yǎng)箱,靜置培養(yǎng)48 h 后,棄菌液,每孔每次加入200 μL 超純水,洗3 次,60℃干燥1 h,配制0.1%結(jié)晶紫溶液每孔加入200 μL 染色10 min,每孔每次加入200 μL 超純水,洗3 次,去除未結(jié)合的染料,60℃干燥1 h,每孔加入5%乙酸溶液200 μL,溶解染料。在波長(zhǎng)為570 nm 處,通過(guò)酶標(biāo)儀測(cè)定吸光度,將每個(gè)菌株的平均吸光度值用于計(jì)算。生物被膜形成陽(yáng)性株的篩選條件為:將標(biāo)準(zhǔn)菌株(ATCC12228)的平均值A(chǔ)+3 倍標(biāo)準(zhǔn)差定義為界定值,如菌株的平均值A(chǔ)>界定值則認(rèn)為生物被膜陽(yáng)性。

        1.5 分子生物學(xué)鑒定

        根據(jù)Fredheim 等[5]的研究結(jié)果,SE 具有esp 特異基因,進(jìn)一步通過(guò)分子生物學(xué)鑒定臨床菌株的有效性。

        1.6 agr 基因多態(tài)性分析

        根據(jù)Lina 等[6]的研究報(bào)道,通過(guò)多重PCR 對(duì)菌株進(jìn)行agr 基因多態(tài)性分型。agr 分型所涉及的引物序列、PCR 產(chǎn)物長(zhǎng)度等相關(guān)信息見(jiàn)表1。PCR 反應(yīng)體系包含上下游引物10 μmol/L 各0.1 μL,2×Taq PCR Master Mixture 10 μL,細(xì)菌模板DNA 2 μL,加ddH2O 補(bǔ)充至20 μL。PCR 反應(yīng)條件為:95℃預(yù)變性5 min,30 個(gè)循環(huán)(94℃變性1 min,55℃退火1 min,72℃延伸1 min),最后72℃充分延伸10 min。

        表1 研究中用到的引物序列及PCR 實(shí)驗(yàn)

        2 結(jié)果

        2.1 分子生物學(xué)鑒定SE

        臨床分離血液來(lái)源的SE 共81 株,無(wú)重復(fù)菌株,所有菌株通過(guò)PCR 擴(kuò)增為esp 陽(yáng)性。部分PCR 產(chǎn)物電泳結(jié)果見(jiàn)圖1。

        圖1 8 株臨床分離的血液來(lái)源的SE 的分子生物學(xué)鑒定結(jié)果

        2.2 血液來(lái)源的SE 生物被膜形成能力

        通過(guò)半定量黏附試驗(yàn)檢測(cè)臨床分離血液來(lái)源的SE 菌株的生物被膜形成能力。以標(biāo)準(zhǔn)菌株ATCC-12228 為陰性對(duì)照,標(biāo)準(zhǔn)菌株ATCC35984 為陽(yáng)性對(duì)照,部分分析結(jié)果見(jiàn)圖2。ATCC12228 標(biāo)準(zhǔn)菌株的A 值為(0.28±0.01),則定義界定值為0.33,菌株A 值>界定值則為生物被膜形成陽(yáng)性菌株。根據(jù)半定量黏附試驗(yàn)結(jié)果,81 株SE 中,共有54 株陽(yáng)性,占66.67%。

        圖2 生物被膜形成能力檢測(cè)

        2.3 agr 基因多態(tài)性分析

        通過(guò)多重PCR 分析5 個(gè)菌株agr 基因多態(tài)性,PCR 產(chǎn)物經(jīng)的凝膠電泳結(jié)果見(jiàn)圖3。臨床分離血液來(lái)源的81 株SE 中,agr I 型51 株(62.96%),agr Ⅱ型6 株(7.41%),agr Ⅲ型7 株(8.64%),agr 未分型17 株(20.99%)。

        圖3 5 株SE 的agr 多態(tài)性分析結(jié)果

        3 討論

        根據(jù)2017 年中國(guó)細(xì)菌耐藥檢測(cè)(CHINET)數(shù)據(jù)顯示,80.3%的凝固酶陰性葡萄球菌為甲氧西林耐藥株,且表現(xiàn)為對(duì)絕大多數(shù)測(cè)試藥物耐藥[7]。SE 是最主要的凝固酶陰性葡萄球菌,近年來(lái)隨著中心靜脈導(dǎo)管、人工關(guān)節(jié)、人工心臟起搏器和人工心臟瓣膜等介入性醫(yī)療設(shè)施的臨床廣泛使用,生物被膜相關(guān)性感染越來(lái)越受到人們重視[8]。SE 的最主要的致病機(jī)制是在植入的醫(yī)療設(shè)備上形成生物被膜,生物膜中的細(xì)菌對(duì)抗生素的抵抗力是浮游細(xì)胞的500~1000 倍[9]。這將導(dǎo)致感染呈復(fù)發(fā)性或難治性,治療失敗[10]。SE 的生物被膜形成及相關(guān)感染已引起臨床高度重視,也給臨床治療帶來(lái)巨大的挑戰(zhàn)。

        SE 的agr 在生物被膜形成過(guò)程中起中心調(diào)節(jié)作用,是SE 最為重要的毒力因調(diào)節(jié)系統(tǒng)[11]。agr 是SE 最重要的群體感應(yīng)系統(tǒng),能調(diào)節(jié)細(xì)胞間的通訊和細(xì)菌的定殖,介導(dǎo)SE 毒力因子的表達(dá),與SE 的侵襲性和生物被膜中細(xì)菌的再傳播性密切相關(guān)。Dai 等[3]研究結(jié)果提示,抑制agr 表達(dá),可導(dǎo)致細(xì)胞自溶,生物被膜分散,使得生物被膜中的細(xì)菌擴(kuò)散,最終促進(jìn)新生物膜的形成。Patel 等[12]通過(guò)分析SE 的分子特征和生物被膜形成發(fā)現(xiàn),agr 可能是SE 致病力的一個(gè)重要分子標(biāo)記。Dufour 等[13]通過(guò)基因序列分析技術(shù)發(fā)現(xiàn)SE 一般可分三型(Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ型),但agr 不同基因型之間的相互作用,還有待進(jìn)一步研究[14-15]。Li等[16]發(fā)現(xiàn)致病菌和非致病菌的agr 型別不同,臨床致病的SE 以agr Ⅰ型為主,而皮膚表面分離的正常SE 以agr Ⅱ型為主,同時(shí)還發(fā)現(xiàn)具有大約15%的SE 有agr 自然突變。Hellmark 等[17]研究結(jié)果提示,導(dǎo)致人工關(guān)節(jié)感染的SE 主要是agr Ⅰ型和agr Ⅲ型。唐光敏等[18]研究發(fā)現(xiàn)臨床分離的金黃色葡萄球菌以agr Ⅰ型為主。但是,對(duì)于導(dǎo)致血流感染的SE 研究較少。本研究以血液來(lái)源的SE 為研究對(duì)象,分析菌株agr 多態(tài)性,為下一步的研究奠定基礎(chǔ)。研究發(fā)現(xiàn)81 株臨床分離的SE 中,agrⅠ型51 株(62.96%),agr Ⅱ型6 株(7.41%),agr Ⅲ型7 株(8.64%),agr 未分型17 株(20.99%)。提示血液來(lái)源SE 以agr Ⅰ型為主,agr 未分型較普遍。結(jié)果中agr未分型菌株為17 株,這可能是agr 自然突變導(dǎo)致。多種細(xì)菌和宿主因素等可影響agr 系統(tǒng)的活性,這些因素對(duì)葡萄球菌造成了巨大的選擇壓力,細(xì)菌可通過(guò)agr位點(diǎn)突變來(lái)應(yīng)對(duì)這種選擇[19]。Vuong 等[4]研究發(fā)現(xiàn),agr突變的SE 菌株,其生物膜的形成能力和初始黏附能力均增強(qiáng)。因此,進(jìn)一步研究17 株agr 未分型菌株的分子生物學(xué)特征和生物被膜的形成能力是非常有意義的課題。

        本研究通過(guò)分析臨床分離血液來(lái)源SE 的agr 多態(tài)性,為了解臨床分離血液來(lái)源SE 的分子特征與生物被膜形成奠定了基礎(chǔ)。臨床分離血液來(lái)源SE 具有較高的生物被膜形成能力,提示具備強(qiáng)致病率和院內(nèi)感染率,應(yīng)引起臨床重視。進(jìn)一步分析了臨床分離血液來(lái)源的SE 的生物被膜形成能力,發(fā)現(xiàn)81 株SE 中,有54 株生物被膜形成陽(yáng)性,占66.67%。提示臨床血液來(lái)源的SE 中有很強(qiáng)的生物被膜形成能力,即致病能力。近年來(lái),研究發(fā)現(xiàn)生物被膜的主要包含多糖細(xì)胞間黏附素、細(xì)胞錨定蛋白和胞外DNA 3 種組成,這3 種成分在生物被膜形成中具有重要作用[20-23]。在下一步的研究中,我們將進(jìn)一步研究臨床SE 的生物被膜形成機(jī)制。

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