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        哮喘患者IL-4基因單核苷酸多態(tài)性的病例對(duì)照研究

        2019-12-10 09:03:35史喜玉孫金霞馬桂芳楊李潘夢(mèng)丹
        科技資訊 2019年30期
        關(guān)鍵詞:核苷酸多態(tài)性位點(diǎn)

        史喜玉 孫金霞 馬桂芳 楊李 潘夢(mèng)丹

        摘 ?要:目的 ?分析過(guò)敏性哮喘(簡(jiǎn)稱哮喘)患者IL-4的表達(dá)及IL-4基因單核苷酸多態(tài)性(SNP)與哮喘遺傳易感性的關(guān)系。方法 ?應(yīng)用ELISA法檢測(cè)67例過(guò)敏性哮喘患者和85例對(duì)照組的血清中IL-4的表達(dá)情況,采用測(cè)序的方法檢測(cè)兩組中IL-4基因單核苷酸多態(tài)性(SNP)rs2227284、rs2070874、rs4986964、rs2243250位點(diǎn)的基因分型情況,并進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。結(jié)果 ?實(shí)驗(yàn)組患者血清IL-4的表達(dá)增高,P<0.05;4個(gè)SNP各基因型在實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組中沒(méi)有明顯差異,P>0.05。結(jié)論 ?患者血清中IL-4的表達(dá)增高,rs2227284、rs2070874、rs4986964、rs2243250多態(tài)性與IL-4的表達(dá)增高沒(méi)有明顯關(guān)聯(lián)。

        關(guān)鍵詞:哮喘 ?IL-4 ?ELISA ?SNP ?測(cè)序

        中圖分類號(hào):R562.25 ? 文獻(xiàn)標(biāo)識(shí)碼:A 文章編號(hào):1672-3791(2019)10(c)-0218-03

        過(guò)敏性哮喘是一種嚴(yán)重的過(guò)敏性疾病,是最常見(jiàn)慢性病之一。它的特點(diǎn)是氣管支氣管對(duì)多重刺激的反應(yīng)性增加,各種炎癥細(xì)胞特別是嗜酸性粒細(xì)胞浸潤(rùn)增加,氣道上皮細(xì)胞損傷、氣道平滑肌肥厚,且血清總IgE升高。哮喘往往在夜間加劇,可進(jìn)展為嚴(yán)重的氣流阻塞、呼吸急促、呼吸困難和吸氧不足。如不及時(shí)治療,會(huì)發(fā)生嚴(yán)重的后果,如缺氧癲癇發(fā)作,呼吸衰竭,甚至死亡[1],它也是當(dāng)今世界上最常見(jiàn)的慢性氣道炎癥性疾病。流行病學(xué)研究表明,全世界范圍內(nèi)呼吸道過(guò)敏的患病率高達(dá)15%~30%[1],哮喘影響了3.5%~20%的人群[2]。

        家系和雙子研究顯示哮喘的發(fā)病具有家族聚集性和明顯的遺傳傾向[3],其遺傳度可達(dá)60%~80%。IL-4是Th2細(xì)胞分泌的,常見(jiàn)哮喘患者IL-4表達(dá)增高。目前國(guó)際上有多篇文獻(xiàn)報(bào)道IL-4的單核苷酸多態(tài)性(SNP)和哮喘的相關(guān)研究,但結(jié)果存在分歧。該研究設(shè)計(jì)對(duì)照病例研究,挑選IL-4基因的啟動(dòng)子區(qū)rs2243250(-589T/C)和rs2227284、 rs2070874、rs4986964四個(gè)SNP位點(diǎn)進(jìn)行分析研究,探討IL-4基因多態(tài)性多哮喘遺傳易感性的影響。

        1 ?材料與方法

        1.1 材料

        研究材料為哮喘患者或正常對(duì)照外周血,取自鹽城周邊地區(qū)人群,病例組67例,平均年齡43.2±16.27,患者符合2009年中華醫(yī)學(xué)會(huì)呼吸病學(xué)會(huì)哮喘學(xué)組制定的診斷標(biāo)準(zhǔn)。正常對(duì)照組85例,平均年齡42.97±19.86,為同期健康體檢人員,無(wú)哮喘史,無(wú)過(guò)敏史。

        1.2 方法

        1.2.1 提取基因組DNA

        每例全血3~5mL,3000rpm,10min分離上清,血清轉(zhuǎn)移至離心管,-20℃儲(chǔ)存?zhèn)溆?。剩余血?xì)胞,采用全血DNA提取試劑盒(三博遠(yuǎn)志,離心柱型SG012)提取標(biāo)本血細(xì)胞DNA,1.5%瓊脂糖凝膠電泳鑒定,-20℃儲(chǔ)存?zhèn)溆谩?/p>

        1.2.2 ELISA法檢測(cè)血清IL-4的表達(dá)

        每孔加100?L實(shí)驗(yàn)血清,密封并室溫下孵化2h;加入二抗,密封并室溫下培養(yǎng)1h;洗板5次,且最后一次置厚吸水紙上拍干。加入生物素化抗體工作液100?L/孔,密封并室溫下孵化60min;洗板5次,且最后一次置厚吸水紙上拍干。加入酶結(jié)合工作液100?L/孔,用封板膠紙封住反應(yīng)孔,避光室溫孵育20min。洗板5次,最后一次置厚吸水紙上拍干。加入顯色劑TMB100?L/孔,避光室溫孵育20min;加入終止液50?L/孔,混勻后,用酶標(biāo)儀(450nm,Bio-Rad iMark) 即刻測(cè)定光密度(OD)值,測(cè)量OD450,并分析數(shù)據(jù)。應(yīng)用SPSS 19.0統(tǒng)計(jì)軟件對(duì)數(shù)據(jù)進(jìn)行處理。

        1.2.3 設(shè)計(jì)引物

        IL-4基因4個(gè)單核苷酸多態(tài)性SNP位點(diǎn)rs2227284、rs2070874、rs4986964、rs2243250位點(diǎn),設(shè)計(jì)相應(yīng)的引物,交由上海生工生物有限公司合成引物。

        1.2.4 PCR反應(yīng)進(jìn)行待測(cè)位點(diǎn)擴(kuò)增

        PCR反應(yīng)體系為:模板1μL,引物F1μL,引物R1μL,10mMdNTP1μL,TaqBuffer5μL,25mMMgCl25μL,5U/μLTaq酶l0.5μL,水35.5μL。PCR反應(yīng)條件為預(yù)變性95℃,3min,變性94℃,30s,退火55℃~60℃,35s;延伸72℃,40~50s,修復(fù)延伸72℃,循環(huán)35次。最后1%瓊脂糖電泳,150V、100m、A20min電泳觀察。采用PCR產(chǎn)物純化回收試劑盒(生工SK1141),然后進(jìn)行基因測(cè)序,鑒定位點(diǎn)的基因型。

        1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析

        將病例組和對(duì)照組基因型頻數(shù)進(jìn)行哈代-溫伯格平衡(Hardy-Weinberg equilibrium,HWE)檢驗(yàn),之后進(jìn)行采用SPSS 16.0軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)分析。所有的統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)均為雙側(cè)概率檢驗(yàn),P<0.05被認(rèn)為有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

        2 ?結(jié)果

        2.1 DNA提取后電泳結(jié)果

        收集哮喘患者及正常人體檢血液標(biāo)本,分離血清,血細(xì)胞。血清至于離心管中,-20℃保存。剩余血細(xì)胞,采用全血DNA提取試劑盒提取標(biāo)本血細(xì)胞DNA,電泳鑒定見(jiàn)圖1。

        2.2 ELISA法檢測(cè)患者及對(duì)照組血清IL-4的表達(dá)

        ELISA法檢測(cè)67例患者及85例對(duì)照IL-4的蛋白表達(dá),結(jié)果見(jiàn)表1。實(shí)驗(yàn)組IL-4的表達(dá)值為(0.75±0.19)pg/mL,對(duì)照組表達(dá)值為(0.39±0.13)pg/mL,P<0.05。

        2.3 IL-4基因SNP篩選及測(cè)序鑒定鑒定

        根據(jù)rs2227284、rs2070874、rs4986964、rs2243250位點(diǎn)的DNA序列,設(shè)計(jì)相應(yīng)的引物,結(jié)果見(jiàn)表2。之后進(jìn)行PCR反應(yīng),電泳驗(yàn)證后,用PCR產(chǎn)物純化回收試劑盒(生工SK1141),測(cè)序并分析(見(jiàn)表3)。在4個(gè)SNP位點(diǎn)在實(shí)驗(yàn)組和對(duì)照組中無(wú)明顯差異,P>0.05。

        3 ?討論

        基因多態(tài)性是指在人群中個(gè)體間基因的核苷酸序列存在差異,即人類染色體的某個(gè)位點(diǎn)上單個(gè)核苷酸變異,且在人群的發(fā)生頻率超過(guò)1%,稱為單核苷酸多態(tài)性(SNPs)。人類基因組中SNP數(shù)量眾多,平均每300~1000個(gè)堿基中就存在一個(gè)SNP。由于SNP分布廣泛并且相對(duì)穩(wěn)定,是人類個(gè)體差異主要的分子標(biāo)記,因此,常用于反應(yīng)個(gè)體表型差異、不同個(gè)體對(duì)疾病易感性以及不同個(gè)體對(duì)藥物敏感性的研究[4]。

        哮喘的主要免疫特征是過(guò)度的Th2反應(yīng)的Th1/Th2平衡紊亂作為重要的Th2因子,IL-4可以直接促進(jìn)IgE合成,因此在哮喘的病理生理過(guò)程中扮演重要角色[5]。

        該研究通過(guò)病例對(duì)照研究,發(fā)現(xiàn)患者血清IL-4的表達(dá)增高,通過(guò)檢測(cè)IL-4的4個(gè)多態(tài)性位點(diǎn)的基因型,發(fā)現(xiàn)在病例和對(duì)照中無(wú)明顯差異。但此次研究樣本量偏少,頻率低的基因位點(diǎn)檢測(cè)結(jié)果可能有偏頗,擴(kuò)大樣本量能更好地反映實(shí)際情況。

        參考文獻(xiàn)

        [1] 孫金霞,周鷹,楊李,等.粉塵螨變應(yīng)原Der f Mal f 6的克隆、表達(dá)及生物信息學(xué)分析[J].中國(guó)病原生物學(xué)雜志,2013,8(6):530-534.

        [2] 孫金霞,崔玉寶.哮喘的遺傳學(xué)研究進(jìn)展[J].醫(yī)學(xué)綜述,2014,20(1):3-7.

        [3] 楊李,周鷹,王運(yùn)剛,等.粉塵螨變應(yīng)原第1組分原核表達(dá)質(zhì)粒pCold-TF-Der f 1構(gòu)建及鑒定[J].中國(guó)媒介生物學(xué)及控制雜志,2012,23(4):289-291.

        [4] DA, Srinivasan M, Egholm M. The complete genome of an individual by massively parallel DNA sequeneing[J].Nature,2008,452(7189):872-876.

        [5] EI Biaze M,Boniface S,Koscher V,et al. T cell activation, from atopy to asthma: more a paradox than a paradigm[J].Allergy,2003,58(9):844-853.

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