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        豬細小病毒生物學研究進展

        2019-11-21 01:52:16陳玉梅馬麗萍周景明
        河南農業(yè)科學 2019年11期
        關鍵詞:衣殼毒株基因組

        陳玉梅,馬麗萍,周景明

        (鄭州大學 生命科學學院,河南 鄭州 450001)

        豬細小病毒(Porcine parvovirus,PPV)屬細小病毒科(Parvoviridae)、原細小病毒屬(Protoparvovirus)中的有蹄類原細小病毒1(Ungulateparvovirus1,UPV1)[1]。PPV最早于20世紀60年代末被確認為細小病毒科成員,是SMEDI綜合征(Stillbirths,mummification,embryonic death and infertility,SMEDI)即豬死胎、木乃伊化、胚胎死亡和不孕的病原體[2],對養(yǎng)豬業(yè)危害極大。一直以來,人們認為PPV的遺傳變異性很低,通過接種疫苗可以很好地控制該病毒的傳播。然而,隨著不能被經典PPV疫苗的抗血清有效中和的強毒株的出現,人們逐漸意識到該病毒的多樣性比先前預期的要大得多。因此,追蹤PPV研究的最新成果,全面更新對PPV生物學的理解,對于制定PPV的有效防控策略具有重要意義。

        1 PPV的分子生物學特性

        PPV是一種小的、無包膜的單鏈DNA病毒,基因組長4~6.3 kb[3]。病毒的2個末端序列形成大約120~200個堿基的復雜回文發(fā)夾結構(呈類似的“Y”或“T”形)[4]。PPV的緊湊型基因組只包含2個啟動子,共編碼7種蛋白質,并利用選擇性剪接技術來擴展基因組的編碼能力。2種非結構蛋白NS1和NS2是從p4啟動子轉錄而來,這些蛋白質對病毒復制特別是DNA復制很重要[4];另外,還可能含有1種假定的非結構蛋白NS3。PPV的2種結構蛋白(VP1和VP2)從p40啟動子轉錄。二者是從一組嵌套的編碼序列中翻譯出來的,它們的氨基末端不同,較小的VP2是從與較大的VP1相同的RNA模板中剪接產生的。VP1有729個氨基酸殘基,其中氨基末端前120個氨基酸是VP1特有的(VP1 unique region,VP1u)。而PPV的第3種結構蛋白VP3是VP2的翻譯后修飾產物。此外,晚期非結構蛋白(SAT)是由與VP2相同的mRNA啟動VP2起始密碼子下游的7個核苷酸表達而來的。PPV的外殼是由60個VP1或VP2結構蛋白分子組成的球形結構,呈二十面體對稱排列。每個衣殼亞單位由8條反平行β鏈及1個α螺旋和4個環(huán)組成(圖1)[4-5]。VP1蛋白大約占病毒粒子的10%,主要在病毒復制和感染細胞時發(fā)揮作用,VP2蛋白是PPV的主要結構蛋白,占病毒粒子的60%以上,也是病毒的主要免疫原性蛋白。VP1、VP2基因對于PPV的系統發(fā)育至關重要[6]。

        圖1 PPV VP2蛋白3D模型(A)及病毒衣殼結構(B)Fig.1 3D model of PPV VP2 with the cartoon technique(A) and the structure of PPV capsids(B)

        2 PPV發(fā)病機制

        PPV毒株毒力是由其可能引起的繁殖失敗的嚴重程度來定義的[7]。大多數情況下,未懷孕成年豬或仔豬單純感染PPV不會出現臨床癥狀,而胎兒感染的結果隨母豬妊娠的進展而變化,流行病學研究表明,母豬妊娠前半期PPV感染可導致生殖衰竭,PPV經口服途徑初次感染母豬后23~32 d穿過胎盤,經肌肉注射途徑感染時間稍短,約15 d[8]。研究發(fā)現,僅在胎兒產生抗體前發(fā)生的感染才會導致死亡和木乃伊化,妊娠70 d后,胎兒產生抗體反應,通常在這一時期以后的感染胎兒可以存活(圖2)[2]。除感染時間外,病毒的遺傳組成對胎兒感染的結果有決定性影響,低致病性毒株和疫苗株(如NADL-2和MSV)不能像高致病性毒株(如Kresse毒株和27A毒株)一樣有效地穿過胎盤屏障[7],因此,不易檢測到它們對妊娠的影響。然而,直接向羊水中注射NADL-2毒株可導致胎兒死亡[9]。而關于PPV如何通過胎盤屏障誘導生殖失敗還不清楚,沒有證據表明PPV可在子宮上皮中復制,因此,通過屏障復制理論不成立[7]。單核細胞和腹腔巨噬細胞可吞噬NADL-2,據此有研究者猜測PPV可通過母體巨噬細胞侵入胎兒[10]。事實上,目前并沒有任何直接證據表明巨噬細胞可以將PPV從母親直接傳遞到胎兒。

        用不同毒株PPV感染妊娠母豬的試驗表明,NADL-8毒株要達到可經胎盤妊娠感染所需的毒量是NADL-2毒株的10 000倍以上[11]。而PPV不同毒株感染的胚胎中病毒DNA的組織分布和數量存在顯著差異,在肝臟中通過原位雜交試驗檢測到Kresse毒株和NADL-8毒株,而在大腦和脾臟僅檢測到Kresse毒株[12]。實時熒光定量PCR檢測結果顯示,PPV 27a分離株在包括結腸、十二指腸、空腸、心臟、肝臟、肺臟、腎臟、脾臟、胸腺、性腺等10個不同胎兒器官中的病毒滴度在1011~1015拷貝/106個細胞,而毒性較小的PPV-143a毒株和疫苗株(NADL-2毒株和MSV毒株)主要在腎臟中檢出,且病毒滴度較低(<103拷貝/106個細胞)[9]。相關研究結果表明,PPV毒株的組織特異性及其在胚胎中感染起始能力的差異可能在胎兒感染及致病性方面發(fā)揮重要作用[9-12]。

        圖2 PPV感染和免疫應答的主要時間點Fig.2 Major time points of PPV infection and immune response

        3 PPV與細胞的相互作用

        在乳豬和老年豬體內靶細胞中檢測PPV比較困難。研究顯示,PPV可以在活化的淋巴細胞中復制,但不能在血液單核細胞中復制,而在巨噬細胞中的復制能力還存在爭議[2]。PCR檢測發(fā)現,PPV可在心臟、肺臟、腎臟、脾臟、子宮內膜和小腸的細胞中繁殖,然而,PCR檢測卻不能區(qū)分是器官自身細胞中產生的病毒還是通過血液循環(huán)系統運輸的病毒[9,13]。PPV進入細胞的第一步是病毒離子與細胞表面糖蛋白的末端唾液酸位點結合,胞吞作用抑制劑阻斷試驗結果表明,除了網格蛋白介導的內吞作用和大胞飲作用外,還有第3種未知的進入機制可能參與PPV入胞,而小窩蛋白(Caveolae)介導的內吞途徑不起任何作用,單個PPV顆粒傾向于通過網格蛋白介導的內吞作用進入胞內,而PPV聚集物傾向于大胞飲作用[14]。核內體易位到晚期核內體或溶酶體以及感染后2~10 h的酸化作用對PPV的有效感染至關重要[14]。研究表明,泛素化以及細胞質中蛋白酶體的相互作用是PPV有效感染必不可少的步驟,病毒顆粒向細胞核運動時涉及微管和肌動蛋白網絡。微管在感染前8~10 h至關重要,這表明微管在PPV向核周區(qū)的內質轉運中起重要作用。在感染后期(12~16 h)肌動蛋白活性對增殖性感染是必需的,它可能對傳入病毒的轉運以及對新合成蛋白質的核轉運都是必需的[14]。

        核定位序列(Nuclear localization signals,NLS)對蛋白質能被順利轉運進細胞核至關重要。腺相關病毒的衣殼蛋白具有4個潛在的NLS,分別為以下4個基本區(qū)域(Basic region,BR):BR1、BR2、BR3和BR4。類似于小鼠微小病毒(Minute virus of mice,MVM),PPV的VP1u含有5個潛在的NLS,即BR1 (3PPAKRAR9)、BR2 (86RAKR89)、BR3 (110RRSPRK115)、BR4 (124KR125)和BR5 (133KKKAK137)[15]。其中BR1是1個經典的含有7個氨基酸的NLS,而BR4和BR5是典型的二元核定位信號(Bipartite NLSs,B-NLSs),這2種NLSs都是病毒復制的必要條件[16],它們的突變不影響病毒的裝配,但可影響病毒增殖,表明它們在感染早期負責病毒的核轉運。另外,在PPV衣殼中還可能存在3個非線性核定位基序(Nuclear localization motif,NLM),包裝好的PPV衣殼表面的外部區(qū)域(包含R374、R393和R565)、PPV VP2三聚體內部區(qū)域的中心區(qū)域(包含K475、R477)及病毒衣殼內表面的內部區(qū)域(包含K272、K275、K487、R533、K535、R576)[15-16]。在所有原細小病毒中,VP1 NLS和VP2 NLM在病毒裝配過程中被內化到細胞核中,且不可接近轉運蛋白。研究證明,MVM是主動從核中運輸出來的[17]。據推測在原細小病毒粒子上,NLM或NLS的存在會干擾這種傳輸。然而,對PPV而言,目前并沒有任何證據表明組裝好的PPV病毒離子可以向細胞膜的任何囊泡轉運[2]。

        目前,已知的大多數影響PPV生物學特性的突變都是在衣殼蛋白上發(fā)現的,唯一例外的是NADL-2毒株NS1蛋白的I481L突變,該突變位點與VP2的N348H突變一起作用有助于NADL-2毒株在犬細胞系A72中產生細胞病變效應并以高滴度復制。NADL-2毒株和Kresse毒株的基因組在右端尾部發(fā)夾結構附近有13個核苷酸(Nucleotides,nt)和127 nt的重復序列。這2種病毒的結構蛋白之間只有6個氨基酸差異,其中5個氨基酸差異(I215T、D378G、H383Q、S436P和R565K)也存在于其他毒力毒株中。定位于衣殼表面的3個氨基酸差異(D378G、H383Q和S436P)使NADL-2毒株不能在原代牛睪丸細胞(TV)中復制,并將滴度和細胞病變效應降低到與豬源細胞系(PT和PFT)中Kresse毒株相當的水平[18],后來發(fā)現,S436P在體外不參與組織向性[3]。由于在毒力毒株(27a毒株)和無毒力毒株(143a毒株)的436位氨基酸均為蘇氨酸(Thr),進一步從側面證實VP2的D378G和H383Q的氨基酸突變可能改變PPV的致病性[7]。

        PPV感染后3 h可促進PK-15細胞中p53的積累,p53通過線粒體介導的凋亡途徑激活Caspase-9和Caspase-3,從而使線粒體釋放細胞色素C[19]。在PPV YL株感染60 h后的豬睪丸細胞(ST)和PK-15細胞中,凋亡細胞的比例可達50%,而在PPV Kresse毒株感染的PT細胞中,凋亡細胞的數量仍低于14%[2,20]。Kresse毒株感染期間PT細胞死亡的主要形式包括感染核腫脹、早期細胞膜衰竭(如碘化丙啶攝取)、乳酸脫氫酶快速釋放和病毒DNA自由釋放,這些形式最終均指向壞死[20]。即使PPV衣殼的微小突變也能改變其與宿主間的相互作用,并改變病毒的細胞病變效應[2,21]。PPV感染所引發(fā)的病變效應在很大程度上取決于毒株類型和細胞類型。然而,細胞早期解體加速了PPV的體外釋放和擴散,這些過程對體內病毒的生命周期有非常顯著的影響。在PPV中已經進化出一種可以促進細胞快速溶解和病毒釋放的小的選擇性翻譯蛋白(Small alternatively translated protein,SATp),該蛋白與VP2共用1套mRNA,其起始密碼子是VP2起始密碼子下游的7個核苷酸。SATp是一種內質網(ER)駐留的短膜蛋白(68AA),包含1個跨膜螺旋,可加速細胞死亡和病毒傳播[2]。無論是否存在SATp,在受感染的PT細胞中,PPV感染都會誘導未折疊蛋白反應(Unfolded protein response,UPR)。在感染后12~14 h,它還導致抗凋亡的內質網應激蛋白X盒結合蛋白1(X-box binding protein 1,XBP1)可逆地激活。在感染后期,SATp的存在通過使ER應激不可逆加速細胞凋亡。

        4 PPV的遺傳變異與進化

        一直以來,研究者認為PPV的基因組比其他細小病毒更保守[5]。然而,最近研究者發(fā)現,PPV的基因組并不是原以為的那么保守,通過系統研究野外分離株中VP蛋白的遺傳多樣性,PPV至少分為7個簇(Cluster),其中C和D簇中歐洲毒株占優(yōu)勢,而F簇中中國毒株占優(yōu)勢,未觀察到野豬分離株的分簇與地理分布的相似關系[4]。在同一地區(qū),從野豬種群中檢測到的PPV較家豬群中的PPV多樣性更豐富。相關研究表明,傳統的PPV疫苗株的抗血清不能有效中和D簇中一些新的強毒株[22]。據推測,這些突變體可能是逃避疫苗接種所帶來的免疫壓力而產生的。然而,根據現有的序列分析發(fā)現,在組織培養(yǎng)或接種牛群中存在抗體時,觀察到的PPV遺傳多樣性降低,而在疫苗株衣殼上發(fā)現的一些突變位點(NADL-2毒株 I320S、H383Q及Str.Challenge毒株S45T、P436S)也沒有出現在新的PPV突變體上[23]。因此,可以認為疫苗接種失敗和未接種動物(如野豬)種群對新出現的表型產生的影響可能比接種種群更重要。

        PPV分離株的系統發(fā)育與毒力之間沒有顯著的相關性。病毒毒力強弱可能直接或間接影響如組織特異性和長期/高滴度脫落等生物學特征,這也決定了PPV毒株在高度可變的田間條件下的適宜性。對田間毒株的NS和VP基因突變模式的研究表明,這2個編碼區(qū)的進化有明顯差異,VP基因的突變率是其中1個NS基因(10-5)的30~50倍(約3~5×10-4突變/核苷酸·年)[2]。這與在NS區(qū)域發(fā)現的非同義和同義取代率之間的負差異一起表明,允許NS蛋白質維持功能的核苷酸變化數量是有限的,同時純化選擇(Purifying selection)即負選擇(Negative selection)決定了該區(qū)域的進化。相反,早期的研究表明,VP1/VP2基因是在近中性模式(漂移)下進化的[2],但在決定細胞相互作用和免疫原性的衣殼外環(huán)上的幾個位置被正選擇(Positive selection)[24]。此外,大多數突變發(fā)生在表面環(huán),其中215、228、383、414、419、436位氨基酸似乎是衣殼中的主要可變位點[2,24]。普遍認為,小DNA病毒中CpG缺失的主要原因是來自復制優(yōu)勢和/或免疫逃逸的自然選擇。PPV基因組是CpG缺失的,CpG位點比PPV基因組中的GC或C和G位點更容易發(fā)生突變。因此,突變壓力而不是選擇力,是導致PPV基因組中CpG表達不足的原因[2]。

        5 PPV的檢測與預防

        PPV常用的檢測方法有分子生物學檢測方法、血清學檢測方法等,其中分子生物學檢測方法主要包括常規(guī)PCR、多重PCR、實時熒光定量PCR[25]、環(huán)介導等溫擴增技術(LAMP)、聚合酶重組酶擴增技術(RPA)[26]以及基因芯片檢測技術等[2]。由于PPV能凝集雞、豚鼠、小鼠、人、猴、鼠和貓的紅細胞,因此,血凝(Hemagglutination assays,HA)和血凝抑制試驗(Hemagglutination inhibition assays,HI)仍然是一種有效的PPV血清學檢測方法,在研究和實踐中廣泛使用。而酶聯免疫吸附試驗(ELISA)是最常用的檢測PPV特異性抗體的方法;血清學方法還包括病毒中和試驗、改良的直接補體結合(Modified direct complement-fixation,MCDF)試驗等。另外,還有基于NS1蛋白的區(qū)分感染動物和接種動物的重組DIVA(Differentiating infected from vaccinated animals)試驗等[2]。一旦感染PPV則很難清除,所以控制PPV流行的主要措施是接種疫苗。目前,使用較廣泛的疫苗是PPV滅活苗和弱毒苗,另外PPV病毒樣顆粒(VLPs)疫苗的研究也很多,PPV疫苗的應用在很大程度上控制了PPV的流行和傳播[27]。但由于PPV新的強毒株的出現及經典疫苗防治失敗的案例的出現對PPV疫苗提出來新的挑戰(zhàn)。

        6 小結

        隨著生物學技術的飛速發(fā)展,PPV的分子生物學相關研究已取得了很大進展,在PPV的檢測與預防方面也取得了進展,PPV疫苗的使用在很大程度上控制了PPV的流行和傳播。但是,依然會有因免疫失敗引發(fā)的PPV疫情報道。一直以來,人們認為該病毒的遺傳變異性很低,然而,隨后的研究揭示了該病毒的多樣性比先前預期的要大得多,PPV的核苷酸替換率大約為每年每個位點對NS1基因進行10-5次替換,每年每個位點對VP1和VP2基因進行10-4次替換,這些比率與RNA病毒中的核苷酸替代率相似[2,3,28]。因此,隨著時間的推移,常有新的PPV毒株出現,對養(yǎng)豬業(yè)造成潛在的威脅。在過去的幾年里,也有許多新的PPV毒株被報道,但是關于這些病毒在發(fā)生和流行的信息及其更深入的研究卻很缺乏。適時追蹤PPV研究前沿,密切監(jiān)測新毒株的出現,并對這些新毒株與經典流行毒株的致病性等特征進行深入研究,對于新型廣譜疫苗的研制及有效防控PPV新毒株的流行具有重要意義。

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